MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008269	GCT	2	6	745614	745619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025555
18003	NC_008269	GAT	2	6	745660	745665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025555
18004	NC_008269	GGTGA	2	10	745700	745709	20 %	20 %	60 %	0 %	111025555
18005	NC_008269	CAG	2	6	745786	745791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025555
18006	NC_008269	CCGC	2	8	745792	745799	0 %	0 %	25 %	75 %	111025555
18007	NC_008269	CGG	2	6	745833	745838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025555
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18009	NC_008269	TGC	2	6	745863	745868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025555
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18094	NC_008269	GGTGC	2	10	749235	749244	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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18122	NC_008269	TTC	2	6	750543	750548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025561
18123	NC_008269	CGC	2	6	750554	750559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025561
18124	NC_008269	CCG	2	6	750562	750567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025561
18125	NC_008269	TGA	2	6	750613	750618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025561
18126	NC_008269	CCA	2	6	750628	750633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025561
18127	NC_008269	CTC	2	6	750672	750677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025561
18128	NC_008269	CGATC	2	10	750686	750695	20 %	20 %	20 %	40 %	111025561
18129	NC_008269	CGGAC	2	10	750699	750708	20 %	0 %	40 %	40 %	111025561
18130	NC_008269	TTC	2	6	750720	750725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025561
18131	NC_008269	CCG	2	6	750745	750750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025561
18132	NC_008269	CT	3	6	750768	750773	0 %	50 %	0 %	50 %	111025561
18133	NC_008269	GCC	2	6	750774	750779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025561
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18142	NC_008269	CAGG	2	8	751089	751096	25 %	0 %	50 %	25 %	111025561
18143	NC_008269	CTC	2	6	751110	751115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025561
18144	NC_008269	CGC	2	6	751184	751189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18145	NC_008269	CAAC	2	8	751313	751320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18146	NC_008269	CAT	2	6	751330	751335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025562
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18148	NC_008269	AAT	2	6	751397	751402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111025562
18149	NC_008269	A	6	6	751407	751412	100 %	0 %	0 %	0 %	111025562
18150	NC_008269	GGC	2	6	751442	751447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025562
18151	NC_008269	GAT	2	6	751488	751493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025562
18152	NC_008269	CGA	2	6	751499	751504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025562
18153	NC_008269	CGG	2	6	751526	751531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025562
18154	NC_008269	CTG	2	6	751581	751586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025562
18155	NC_008269	GCAGGT	2	12	751649	751660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025562
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18159	NC_008269	CGA	2	6	751866	751871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18160	NC_008269	TGC	2	6	751931	751936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18161	NC_008269	TCT	2	6	751948	751953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18162	NC_008269	GAT	2	6	751961	751966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18163	NC_008269	GC	3	6	752030	752035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18164	NC_008269	GGA	2	6	752092	752097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18165	NC_008269	GGA	2	6	752157	752162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18166	NC_008269	TCGGTG	2	12	752241	752252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111025563
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18169	NC_008269	GC	3	6	752383	752388	0 %	0 %	50 %	50 %	111025563
18170	NC_008269	GCG	2	6	752444	752449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025563
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18175	NC_008269	TGG	2	6	752716	752721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18176	NC_008269	GCCG	2	8	752793	752800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18177	NC_008269	CCGT	2	8	752839	752846	0 %	25 %	25 %	50 %	111025564
18178	NC_008269	CGA	2	6	752902	752907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025564
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18182	NC_008269	CGG	2	6	752940	752945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025564
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18186	NC_008269	CCG	2	6	753078	753083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025564
18187	NC_008269	CCGGT	2	10	753117	753126	0 %	20 %	40 %	40 %	111025564
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18194	NC_008269	TGC	2	6	753440	753445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025565
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18206	NC_008269	CTG	2	6	754312	754317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18216	NC_008269	GT	3	6	754837	754842	0 %	50 %	50 %	0 %	111025567
18217	NC_008269	GTC	2	6	754858	754863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025567
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18222	NC_008269	GCTCG	2	10	755077	755086	0 %	20 %	40 %	40 %	111025567
18223	NC_008269	GTC	2	6	755141	755146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025567
18224	NC_008269	CACCT	2	10	755168	755177	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18225	NC_008269	TTG	2	6	755209	755214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18226	NC_008269	TGA	2	6	755266	755271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18229	NC_008269	CGA	2	6	755587	755592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18230	NC_008269	CG	3	6	755597	755602	0 %	0 %	50 %	50 %	111025568
18231	NC_008269	CGG	2	6	755650	755655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025568
18232	NC_008269	CGC	2	6	755720	755725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025568
18233	NC_008269	ATC	2	6	755747	755752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025568
18234	NC_008269	TGA	2	6	755791	755796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025568
18235	NC_008269	GAT	2	6	755812	755817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025568
18236	NC_008269	TCCG	2	8	755851	755858	0 %	25 %	25 %	50 %	111025568
18237	NC_008269	GGT	2	6	755885	755890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025568
18238	NC_008269	TCGT	2	8	755899	755906	0 %	50 %	25 %	25 %	111025568
18239	NC_008269	CGT	2	6	755923	755928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18240	NC_008269	CGC	2	6	755941	755946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025568
18241	NC_008269	CGT	2	6	755970	755975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18242	NC_008269	GCT	2	6	755984	755989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18243	NC_008269	GTC	2	6	756053	756058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18244	NC_008269	GATC	2	8	756078	756085	25 %	25 %	25 %	25 %	111025568
18245	NC_008269	CAACGG	2	12	756088	756099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025568
18246	NC_008269	CGAT	2	8	756171	756178	25 %	25 %	25 %	25 %	111025568
18247	NC_008269	GCG	3	9	756179	756187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025568
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18344	NC_008269	GTCC	2	8	759930	759937	0 %	25 %	25 %	50 %	111025571
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18347	NC_008269	GCG	2	6	759986	759991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18348	NC_008269	TTG	2	6	760034	760039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18349	NC_008269	GTGC	2	8	760059	760066	0 %	25 %	50 %	25 %	111025572
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18351	NC_008269	GC	3	6	760126	760131	0 %	0 %	50 %	50 %	111025572
18352	NC_008269	CCT	2	6	760156	760161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025572
18353	NC_008269	TGA	2	6	760204	760209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025572
18354	NC_008269	GGC	2	6	760220	760225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025572
18355	NC_008269	GT	3	6	760304	760309	0 %	50 %	50 %	0 %	111025572
18356	NC_008269	CGCGG	2	10	760337	760346	0 %	0 %	60 %	40 %	111025572
18357	NC_008269	GAC	2	6	760349	760354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025572
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18359	NC_008269	ATC	2	6	760503	760508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025572
18360	NC_008269	CGA	2	6	760510	760515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025572
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18482	NC_008269	TCG	2	6	764477	764482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025575
18483	NC_008269	CCG	2	6	764513	764518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025575
18484	NC_008269	AGCGGC	2	12	764526	764537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025575
18485	NC_008269	CCG	2	6	764573	764578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025575
18486	NC_008269	GTC	2	6	764656	764661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025575
18487	NC_008269	GAT	2	6	764683	764688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025575
18488	NC_008269	CGC	2	6	764703	764708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025575
18489	NC_008269	CCG	2	6	764822	764827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025575
18490	NC_008269	GAC	2	6	764833	764838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025575
18491	NC_008269	GGCG	2	8	764841	764848	0 %	0 %	75 %	25 %	111025575
18492	NC_008269	GCG	3	9	764846	764854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025575
18493	NC_008269	TGCA	2	8	764918	764925	25 %	25 %	25 %	25 %	111025575
18494	NC_008269	AGC	3	9	764975	764983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025575
18495	NC_008269	TCC	2	6	765032	765037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025575
18496	NC_008269	GCCAG	2	10	765040	765049	20 %	0 %	40 %	40 %	111025575
18497	NC_008269	GCGG	2	8	765130	765137	0 %	0 %	75 %	25 %	111025575
18498	NC_008269	CCCG	2	8	765168	765175	0 %	0 %	25 %	75 %	111025575
18499	NC_008269	GTT	2	6	765198	765203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025575
18500	NC_008269	CGG	2	6	765299	765304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025575

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