MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008269	CAGC	2	8	665491	665498	25 %	0 %	25 %	50 %	111025470
16002	NC_008269	AGG	2	6	665505	665510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025470
16003	NC_008269	GCG	2	6	665526	665531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025470
16004	NC_008269	CGGG	2	8	665585	665592	0 %	0 %	75 %	25 %	111025470
16005	NC_008269	TCG	2	6	665622	665627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16006	NC_008269	T	7	7	665644	665650	0 %	100 %	0 %	0 %	111025470
16007	NC_008269	TCCT	2	8	665666	665673	0 %	50 %	0 %	50 %	111025470
16008	NC_008269	GCCG	2	8	665684	665691	0 %	0 %	50 %	50 %	111025470
16009	NC_008269	GA	3	6	665800	665805	50 %	0 %	50 %	0 %	111025470
16010	NC_008269	ATG	2	6	665823	665828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025470
16011	NC_008269	CAG	2	6	665921	665926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16012	NC_008269	CGA	2	6	665935	665940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16013	NC_008269	ATC	2	6	665979	665984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025470
16014	NC_008269	AGC	2	6	666069	666074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16015	NC_008269	CCTTG	2	10	666169	666178	0 %	40 %	20 %	40 %	111025470
16016	NC_008269	GTC	2	6	666227	666232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16017	NC_008269	CTT	2	6	666248	666253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025470
16018	NC_008269	CTG	3	9	666299	666307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16019	NC_008269	GTC	2	6	666401	666406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16020	NC_008269	GTC	2	6	666416	666421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16021	NC_008269	GTC	2	6	666506	666511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16022	NC_008269	CTG	2	6	666527	666532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16023	NC_008269	CAG	2	6	666545	666550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16024	NC_008269	GTGC	2	8	666619	666626	0 %	25 %	50 %	25 %	111025470
16025	NC_008269	GAG	2	6	666705	666710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025470
16026	NC_008269	CGG	2	6	666757	666762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025470
16027	NC_008269	TTGGT	2	10	666774	666783	0 %	60 %	40 %	0 %	111025470
16028	NC_008269	GCGGCC	2	12	666798	666809	0 %	0 %	50 %	50 %	111025470
16029	NC_008269	GTCGGT	2	12	666845	666856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111025470
16030	NC_008269	GC	3	6	666870	666875	0 %	0 %	50 %	50 %	111025470
16031	NC_008269	GGCC	2	8	666919	666926	0 %	0 %	50 %	50 %	111025470
16032	NC_008269	GGT	2	6	666935	666940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025470
16033	NC_008269	CTGG	2	8	666971	666978	0 %	25 %	50 %	25 %	111025470
16034	NC_008269	CGGGG	2	10	667019	667028	0 %	0 %	80 %	20 %	111025470
16035	NC_008269	TCG	2	6	667032	667037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025470
16036	NC_008269	GCC	2	6	667053	667058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025470
16037	NC_008269	CGA	2	6	667078	667083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025470
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16040	NC_008269	GTG	2	6	667221	667226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025470
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16050	NC_008269	GTC	2	6	667576	667581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
16051	NC_008269	TCG	2	6	667688	667693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
16052	NC_008269	AAC	2	6	667697	667702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025471
16053	NC_008269	GCCA	2	8	667745	667752	25 %	0 %	25 %	50 %	111025471
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16055	NC_008269	GAG	2	6	667805	667810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025471
16056	NC_008269	CAGGC	2	10	667834	667843	20 %	0 %	40 %	40 %	111025471
16057	NC_008269	GTC	2	6	667879	667884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
16058	NC_008269	GCT	2	6	667956	667961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
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16069	NC_008269	CGC	2	6	668279	668284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025471
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16073	NC_008269	GAC	2	6	668452	668457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
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16119	NC_008269	TGT	2	6	670154	670159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025471
16120	NC_008269	CGG	2	6	670174	670179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025471
16121	NC_008269	CGG	2	6	670189	670194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025471
16122	NC_008269	CACCGG	2	12	670198	670209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111025471
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16167	NC_008269	CG	3	6	672345	672350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16168	NC_008269	TCA	2	6	672457	672462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16220	NC_008269	CGC	3	9	674382	674390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16222	NC_008269	CGC	2	6	674412	674417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16223	NC_008269	ACCC	2	8	674418	674425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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16229	NC_008269	TGGC	2	8	674583	674590	0 %	25 %	50 %	25 %	111025476
16230	NC_008269	GAG	2	6	674601	674606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025476
16231	NC_008269	GCC	2	6	674643	674648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025476
16232	NC_008269	ATC	2	6	674667	674672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025476
16233	NC_008269	AAGGC	2	10	674686	674695	40 %	0 %	40 %	20 %	111025476
16234	NC_008269	CGTC	2	8	674764	674771	0 %	25 %	25 %	50 %	111025476
16235	NC_008269	CGG	2	6	674780	674785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025476
16236	NC_008269	CGA	2	6	674854	674859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025477
16237	NC_008269	CGA	2	6	675036	675041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025477
16238	NC_008269	GGA	2	6	675085	675090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025477
16239	NC_008269	CGC	2	6	675188	675193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025477
16240	NC_008269	GGC	2	6	675211	675216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025477
16241	NC_008269	ATC	2	6	675224	675229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025477
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16243	NC_008269	CGA	2	6	675345	675350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025477
16244	NC_008269	CGG	2	6	675460	675465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025477
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16250	NC_008269	TCG	2	6	675648	675653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025477
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16261	NC_008269	GGACC	2	10	675907	675916	20 %	0 %	40 %	40 %	111025477
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16269	NC_008269	GAA	2	6	676205	676210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16339	NC_008269	CGC	2	6	678743	678748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025480
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16342	NC_008269	CGGCG	2	10	678951	678960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16343	NC_008269	CG	3	6	678965	678970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16344	NC_008269	CCGGAA	2	12	678982	678993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16345	NC_008269	GACC	2	8	679009	679016	25 %	0 %	25 %	50 %	111025481
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16352	NC_008269	CGT	3	9	679288	679296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025481
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16479	NC_008269	AC	3	6	684371	684376	50 %	0 %	0 %	50 %	111025485
16480	NC_008269	TC	3	6	684377	684382	0 %	50 %	0 %	50 %	111025485
16481	NC_008269	ACA	2	6	684493	684498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025485
16482	NC_008269	GTCTAC	2	12	684516	684527	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111025485
16483	NC_008269	CGA	2	6	684566	684571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025485
16484	NC_008269	GGC	2	6	684647	684652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025485
16485	NC_008269	GCT	2	6	684659	684664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025485
16486	NC_008269	CT	3	6	684663	684668	0 %	50 %	0 %	50 %	111025485
16487	NC_008269	CGG	2	6	684683	684688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025485
16488	NC_008269	CGCC	2	8	684755	684762	0 %	0 %	25 %	75 %	111025485
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16500	NC_008269	GCA	2	6	685191	685196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025486

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