MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008269	CCGG	2	8	643688	643695	0 %	0 %	50 %	50 %	111025446
15502	NC_008269	GGCC	2	8	643726	643733	0 %	0 %	50 %	50 %	111025446
15503	NC_008269	CGA	2	6	643762	643767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025446
15504	NC_008269	TAC	2	6	643832	643837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025446
15505	NC_008269	CGAGG	2	10	643909	643918	20 %	0 %	60 %	20 %	111025446
15506	NC_008269	GCAC	2	8	644040	644047	25 %	0 %	25 %	50 %	111025446
15507	NC_008269	GCCG	2	8	644080	644087	0 %	0 %	50 %	50 %	111025446
15508	NC_008269	GTG	3	9	644111	644119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025446
15509	NC_008269	CCG	2	6	644153	644158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025446
15510	NC_008269	TGC	2	6	644222	644227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15511	NC_008269	GC	3	6	644231	644236	0 %	0 %	50 %	50 %	111025447
15512	NC_008269	GAC	2	6	644278	644283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15513	NC_008269	CTG	2	6	644284	644289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15514	NC_008269	GCT	2	6	644364	644369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15515	NC_008269	TGC	2	6	644405	644410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15516	NC_008269	GGT	2	6	644442	644447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025447
15517	NC_008269	CGA	2	6	644460	644465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15518	NC_008269	CGGG	2	8	644484	644491	0 %	0 %	75 %	25 %	111025447
15519	NC_008269	TGC	2	6	644519	644524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15520	NC_008269	GCC	2	6	644542	644547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15521	NC_008269	GGTG	2	8	644589	644596	0 %	25 %	75 %	0 %	111025447
15522	NC_008269	GCG	2	6	644693	644698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15523	NC_008269	CGC	2	6	644761	644766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15524	NC_008269	G	6	6	644803	644808	0 %	0 %	100 %	0 %	111025447
15525	NC_008269	CTG	2	6	644809	644814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15526	NC_008269	CGT	2	6	644838	644843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15527	NC_008269	CCG	2	6	644870	644875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15528	NC_008269	TGC	2	6	644876	644881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15529	NC_008269	GGGC	2	8	644889	644896	0 %	0 %	75 %	25 %	111025447
15530	NC_008269	GGTCGG	2	12	644904	644915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111025447
15531	NC_008269	TCG	2	6	644933	644938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15532	NC_008269	CGC	2	6	645003	645008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15533	NC_008269	TGG	2	6	645053	645058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025447
15534	NC_008269	GCT	2	6	645081	645086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15535	NC_008269	GAC	2	6	645094	645099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15536	NC_008269	CTG	3	9	645115	645123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15537	NC_008269	GCT	2	6	645165	645170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15538	NC_008269	GGC	2	6	645171	645176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15539	NC_008269	CGG	2	6	645200	645205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15540	NC_008269	TGC	2	6	645212	645217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15541	NC_008269	CGG	2	6	645224	645229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15542	NC_008269	CGC	2	6	645356	645361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15543	NC_008269	GTG	2	6	645421	645426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025447
15544	NC_008269	CG	3	6	645429	645434	0 %	0 %	50 %	50 %	111025447
15545	NC_008269	TCG	2	6	645449	645454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15546	NC_008269	GGC	2	6	645549	645554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15547	NC_008269	GGT	2	6	645633	645638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025447
15548	NC_008269	GCG	2	6	645643	645648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025447
15549	NC_008269	GCT	2	6	645654	645659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025447
15550	NC_008269	GCC	2	6	645674	645679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15551	NC_008269	CCG	2	6	645701	645706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025447
15552	NC_008269	AC	3	6	645764	645769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15553	NC_008269	CGC	2	6	645808	645813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025448
15554	NC_008269	CGA	2	6	645849	645854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025448
15555	NC_008269	TCG	2	6	645873	645878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025448
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15558	NC_008269	GCA	2	6	645948	645953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025448
15559	NC_008269	GCT	2	6	645954	645959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025448
15560	NC_008269	TGG	2	6	646051	646056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025448
15561	NC_008269	CGGT	2	8	646060	646067	0 %	25 %	50 %	25 %	111025448
15562	NC_008269	TCGC	2	8	646084	646091	0 %	25 %	25 %	50 %	111025448
15563	NC_008269	GCG	2	6	646096	646101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025448
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15566	NC_008269	CG	4	8	646273	646280	0 %	0 %	50 %	50 %	111025449
15567	NC_008269	CGT	2	6	646302	646307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025449
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15570	NC_008269	CGGG	2	8	646336	646343	0 %	0 %	75 %	25 %	111025449
15571	NC_008269	GGT	2	6	646353	646358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025449
15572	NC_008269	CGA	2	6	646371	646376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025449
15573	NC_008269	CGCC	2	8	646425	646432	0 %	0 %	25 %	75 %	111025449
15574	NC_008269	TCGA	2	8	646444	646451	25 %	25 %	25 %	25 %	111025449
15575	NC_008269	CGG	2	6	646464	646469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025449
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15582	NC_008269	GCG	2	6	646771	646776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15583	NC_008269	GTA	2	6	646859	646864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_008269	TGG	2	6	646873	646878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_008269	CCG	2	6	646895	646900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15586	NC_008269	TGG	2	6	646916	646921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025451
15587	NC_008269	GACC	2	8	646938	646945	25 %	0 %	25 %	50 %	111025451
15588	NC_008269	CTG	2	6	646951	646956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025451
15589	NC_008269	CTG	2	6	646981	646986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025451
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15592	NC_008269	CAGC	2	8	647091	647098	25 %	0 %	25 %	50 %	111025451
15593	NC_008269	CGGC	2	8	647122	647129	0 %	0 %	50 %	50 %	111025451
15594	NC_008269	GAG	2	6	647218	647223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025451
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15599	NC_008269	GGT	2	6	647372	647377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_008269	CGG	2	6	647381	647386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15601	NC_008269	GCT	2	6	647388	647393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_008269	CGG	2	6	647453	647458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
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15604	NC_008269	CGG	2	6	647613	647618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
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15606	NC_008269	GGTG	2	8	647629	647636	0 %	25 %	75 %	0 %	111025452
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15608	NC_008269	GGT	2	6	647737	647742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025452
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15614	NC_008269	GC	3	6	648053	648058	0 %	0 %	50 %	50 %	111025452
15615	NC_008269	GGC	2	6	648100	648105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
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15620	NC_008269	GTCC	2	8	648365	648372	0 %	25 %	25 %	50 %	111025452
15621	NC_008269	GCC	2	6	648377	648382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
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15979	NC_008269	CGA	3	9	664712	664720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025469
15980	NC_008269	TG	3	6	664783	664788	0 %	50 %	50 %	0 %	111025469
15981	NC_008269	GGCG	2	8	664824	664831	0 %	0 %	75 %	25 %	111025469
15982	NC_008269	CGGCCG	2	12	664841	664852	0 %	0 %	50 %	50 %	111025469
15983	NC_008269	GTC	3	9	664924	664932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025469
15984	NC_008269	CCG	2	6	664946	664951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025469
15985	NC_008269	AGG	2	6	664974	664979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025469
15986	NC_008269	GGC	2	6	665025	665030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025469
15987	NC_008269	CACC	2	8	665064	665071	25 %	0 %	0 %	75 %	111025469
15988	NC_008269	GCGGG	2	10	665101	665110	0 %	0 %	80 %	20 %	111025469
15989	NC_008269	CTCG	2	8	665126	665133	0 %	25 %	25 %	50 %	111025470
15990	NC_008269	GTGC	2	8	665135	665142	0 %	25 %	50 %	25 %	111025470
15991	NC_008269	CGG	2	6	665189	665194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025470
15992	NC_008269	GGCG	2	8	665207	665214	0 %	0 %	75 %	25 %	111025470
15993	NC_008269	CGG	2	6	665221	665226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025470
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15996	NC_008269	GC	3	6	665339	665344	0 %	0 %	50 %	50 %	111025470
15997	NC_008269	GGCT	2	8	665359	665366	0 %	25 %	50 %	25 %	111025470
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