MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008269	GCC	2	6	578069	578074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025384
14002	NC_008269	CAA	2	6	578077	578082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025384
14003	NC_008269	CAC	2	6	578095	578100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025384
14004	NC_008269	ATCGA	2	10	578205	578214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14005	NC_008269	ATT	2	6	578221	578226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008269	AC	3	6	578233	578238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_008269	TCA	2	6	578360	578365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_008269	CCGG	2	8	578373	578380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_008269	GCA	2	6	578404	578409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025385
14010	NC_008269	GCC	2	6	578449	578454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025385
14011	NC_008269	GA	3	6	578531	578536	50 %	0 %	50 %	0 %	111025385
14012	NC_008269	GACC	2	8	578556	578563	25 %	0 %	25 %	50 %	111025385
14013	NC_008269	GTT	2	6	578606	578611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025385
14014	NC_008269	GAC	2	6	578728	578733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025385
14015	NC_008269	CGCCC	2	10	578768	578777	0 %	0 %	20 %	80 %	111025385
14016	NC_008269	CCCCG	2	10	578784	578793	0 %	0 %	20 %	80 %	111025385
14017	NC_008269	ATC	2	6	578798	578803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025385
14018	NC_008269	CG	3	6	578808	578813	0 %	0 %	50 %	50 %	111025385
14019	NC_008269	TCAG	2	8	578836	578843	25 %	25 %	25 %	25 %	111025386
14020	NC_008269	GTGC	2	8	578868	578875	0 %	25 %	50 %	25 %	111025386
14021	NC_008269	GC	3	6	578883	578888	0 %	0 %	50 %	50 %	111025386
14022	NC_008269	GAT	2	6	578947	578952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025386
14023	NC_008269	GCC	2	6	578988	578993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025386
14024	NC_008269	GGC	2	6	578994	578999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025386
14025	NC_008269	CGC	2	6	579020	579025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025386
14026	NC_008269	GCTT	2	8	579040	579047	0 %	50 %	25 %	25 %	111025386
14027	NC_008269	CG	3	6	579136	579141	0 %	0 %	50 %	50 %	111025386
14028	NC_008269	G	6	6	579194	579199	0 %	0 %	100 %	0 %	111025386
14029	NC_008269	AGG	2	6	579211	579216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025386
14030	NC_008269	GCT	2	6	579238	579243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025386
14031	NC_008269	CGG	2	6	579266	579271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025386
14032	NC_008269	G	6	6	579309	579314	0 %	0 %	100 %	0 %	111025386
14033	NC_008269	CGTC	2	8	579327	579334	0 %	25 %	25 %	50 %	111025386
14034	NC_008269	GCGTC	2	10	579342	579351	0 %	20 %	40 %	40 %	111025386
14035	NC_008269	GGA	2	6	579362	579367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025386
14036	NC_008269	TTG	2	6	579418	579423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025386
14037	NC_008269	GAT	2	6	579431	579436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025386
14038	NC_008269	TCG	2	6	579461	579466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025386
14039	NC_008269	TCG	2	6	579503	579508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025386
14040	NC_008269	CGT	2	6	579548	579553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025386
14041	NC_008269	CCG	2	6	579590	579595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025387
14042	NC_008269	TCGC	2	8	579637	579644	0 %	25 %	25 %	50 %	111025387
14043	NC_008269	CTT	2	6	579687	579692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025387
14044	NC_008269	TTC	2	6	579715	579720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025387
14045	NC_008269	CGG	3	9	579731	579739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025387
14046	NC_008269	CGG	2	6	579782	579787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025387
14047	NC_008269	CG	3	6	579885	579890	0 %	0 %	50 %	50 %	111025387
14048	NC_008269	GCGG	2	8	579960	579967	0 %	0 %	75 %	25 %	111025387
14049	NC_008269	TCG	2	6	579997	580002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025387
14050	NC_008269	GAG	2	6	580017	580022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025387
14051	NC_008269	GACT	2	8	580104	580111	25 %	25 %	25 %	25 %	111025387
14052	NC_008269	GCG	2	6	580165	580170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025387
14053	NC_008269	TCGG	2	8	580229	580236	0 %	25 %	50 %	25 %	111025387
14054	NC_008269	GGGT	2	8	580244	580251	0 %	25 %	75 %	0 %	111025387
14055	NC_008269	CTG	2	6	580338	580343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025387
14056	NC_008269	ACG	2	6	580354	580359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025387
14057	NC_008269	CGA	2	6	580403	580408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025387
14058	NC_008269	GCA	2	6	580543	580548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_008269	TGA	2	6	580645	580650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_008269	TGA	2	6	580816	580821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_008269	GTT	2	6	581010	581015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_008269	CG	3	6	581049	581054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14063	NC_008269	CG	3	6	581066	581071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_008269	AGG	2	6	581126	581131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_008269	CGAGCG	2	12	581206	581217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_008269	GGC	2	6	581243	581248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_008269	CTTTCG	2	12	581472	581483	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_008269	ACC	2	6	581494	581499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14069	NC_008269	TGAGA	2	10	581504	581513	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_008269	AAG	2	6	581548	581553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_008269	CAG	2	6	581976	581981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_008269	TG	3	6	582003	582008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_008269	CGG	2	6	582010	582015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_008269	CAC	2	6	582067	582072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025388
14075	NC_008269	ACC	2	6	582105	582110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025388
14076	NC_008269	GCGTA	2	10	582119	582128	20 %	20 %	40 %	20 %	111025388
14077	NC_008269	GAC	2	6	582139	582144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14078	NC_008269	ATG	2	6	582155	582160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025388
14079	NC_008269	TTCCG	2	10	582222	582231	0 %	40 %	20 %	40 %	111025388
14080	NC_008269	CGA	2	6	582237	582242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14081	NC_008269	CGA	2	6	582267	582272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14082	NC_008269	TCG	2	6	582278	582283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14083	NC_008269	GGCG	2	8	582444	582451	0 %	0 %	75 %	25 %	111025388
14084	NC_008269	GGTG	2	8	582482	582489	0 %	25 %	75 %	0 %	111025388
14085	NC_008269	CGGT	2	8	582534	582541	0 %	25 %	50 %	25 %	111025388
14086	NC_008269	CGA	2	6	582633	582638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14087	NC_008269	CGA	2	6	582674	582679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14088	NC_008269	AGCG	2	8	582689	582696	25 %	0 %	50 %	25 %	111025388
14089	NC_008269	TGT	2	6	582719	582724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025388
14090	NC_008269	GCG	2	6	582828	582833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025388
14091	NC_008269	TCA	2	6	582871	582876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025388
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14093	NC_008269	GGT	2	6	582924	582929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025388
14094	NC_008269	GTC	2	6	582950	582955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14095	NC_008269	CCA	2	6	582975	582980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025388
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14098	NC_008269	CTG	2	6	583199	583204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025388
14099	NC_008269	GGGC	2	8	583334	583341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14100	NC_008269	TTCG	2	8	583366	583373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14101	NC_008269	CGAA	2	8	583399	583406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14102	NC_008269	TCG	2	6	583476	583481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_008269	TGA	2	6	583508	583513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025389
14104	NC_008269	CGG	2	6	583688	583693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025389
14105	NC_008269	GCG	3	9	583707	583715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025389
14106	NC_008269	CGA	2	6	583815	583820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025389
14107	NC_008269	TCGC	2	8	583823	583830	0 %	25 %	25 %	50 %	111025389
14108	NC_008269	GTT	2	6	583845	583850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025389
14109	NC_008269	TGC	2	6	584050	584055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025389
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14111	NC_008269	GCTC	2	8	584124	584131	0 %	25 %	25 %	50 %	111025389
14112	NC_008269	TGG	2	6	584168	584173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025389
14113	NC_008269	TGC	2	6	584186	584191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025389
14114	NC_008269	CTG	2	6	584221	584226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025389
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14117	NC_008269	TCCGA	2	10	584353	584362	20 %	20 %	20 %	40 %	111025389
14118	NC_008269	CAGG	2	8	584363	584370	25 %	0 %	50 %	25 %	111025389
14119	NC_008269	AGA	2	6	584388	584393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025389
14120	NC_008269	CGCC	2	8	584447	584454	0 %	0 %	25 %	75 %	111025389
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14122	NC_008269	ATCG	2	8	584548	584555	25 %	25 %	25 %	25 %	111025389
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14126	NC_008269	CGTA	2	8	584746	584753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14127	NC_008269	CGG	2	6	584785	584790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14238	NC_008269	GGA	2	6	589822	589827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14239	NC_008269	CA	3	6	589832	589837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14240	NC_008269	TCT	2	6	589944	589949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14241	NC_008269	CAT	2	6	589962	589967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14243	NC_008269	A	6	6	590048	590053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_008269	GC	3	6	590214	590219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14248	NC_008269	CGG	2	6	590455	590460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14249	NC_008269	GGTG	2	8	590483	590490	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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14252	NC_008269	GTG	2	6	590596	590601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14489	NC_008269	CAT	2	6	600299	600304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025403
14490	NC_008269	GGT	2	6	600341	600346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025403
14491	NC_008269	GCG	2	6	600387	600392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025403
14492	NC_008269	CGC	2	6	600473	600478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025403
14493	NC_008269	GGA	2	6	600557	600562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025403
14494	NC_008269	CGA	2	6	600634	600639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025403
14495	NC_008269	TGT	2	6	600670	600675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025403
14496	NC_008269	TCG	3	9	600856	600864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025403
14497	NC_008269	GGCG	2	8	600886	600893	0 %	0 %	75 %	25 %	111025403
14498	NC_008269	GGCGG	2	10	600917	600926	0 %	0 %	80 %	20 %	111025403
14499	NC_008269	GGA	2	6	600944	600949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025403
14500	NC_008269	GAT	2	6	600966	600971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025403

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