MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008269	GCG	2	6	535539	535544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025344
13002	NC_008269	TCC	2	6	535560	535565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025344
13003	NC_008269	GCC	2	6	535570	535575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025344
13004	NC_008269	CAG	2	6	535594	535599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025344
13005	NC_008269	TCA	2	6	535605	535610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025344
13006	NC_008269	CG	3	6	535733	535738	0 %	0 %	50 %	50 %	111025344
13007	NC_008269	GA	3	6	535769	535774	50 %	0 %	50 %	0 %	111025344
13008	NC_008269	GTTG	2	8	535824	535831	0 %	50 %	50 %	0 %	111025344
13009	NC_008269	CAC	2	6	535869	535874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025344
13010	NC_008269	CGA	2	6	535875	535880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025344
13011	NC_008269	GT	3	6	535894	535899	0 %	50 %	50 %	0 %	111025344
13012	NC_008269	CGG	2	6	536010	536015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025344
13013	NC_008269	AG	3	6	536066	536071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_008269	GGT	2	6	536094	536099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_008269	GA	3	6	536135	536140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_008269	TGC	2	6	536220	536225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_008269	CGG	2	6	536243	536248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_008269	TGG	2	6	536283	536288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_008269	CACCT	2	10	536302	536311	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13020	NC_008269	ACCG	2	8	536368	536375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_008269	TCG	2	6	536400	536405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_008269	CAGT	2	8	536412	536419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_008269	GTG	2	6	536506	536511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_008269	TAG	2	6	536512	536517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_008269	CGGGT	2	10	536619	536628	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13026	NC_008269	GGC	2	6	536662	536667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13027	NC_008269	CGG	4	12	536676	536687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13028	NC_008269	CGG	2	6	536691	536696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13029	NC_008269	CGC	2	6	536713	536718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13030	NC_008269	CCA	2	6	536721	536726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025345
13031	NC_008269	GGGT	2	8	536764	536771	0 %	25 %	75 %	0 %	111025345
13032	NC_008269	CGA	2	6	536793	536798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13033	NC_008269	CCG	2	6	536819	536824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13034	NC_008269	TGC	2	6	536836	536841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13035	NC_008269	CGG	2	6	536847	536852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13036	NC_008269	GAC	2	6	536854	536859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13037	NC_008269	GGC	2	6	536860	536865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13038	NC_008269	GCC	2	6	536902	536907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13039	NC_008269	GTG	2	6	537071	537076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025345
13040	NC_008269	CCG	2	6	537129	537134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13041	NC_008269	CCG	2	6	537174	537179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13042	NC_008269	GGC	2	6	537205	537210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13043	NC_008269	CGA	2	6	537216	537221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13044	NC_008269	ACC	2	6	537257	537262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025345
13045	NC_008269	CGT	2	6	537295	537300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13046	NC_008269	GGC	2	6	537301	537306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13047	NC_008269	GCG	2	6	537419	537424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13048	NC_008269	GCA	2	6	537450	537455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13049	NC_008269	TGG	3	9	537471	537479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025345
13050	NC_008269	TCCGA	2	10	537587	537596	20 %	20 %	20 %	40 %	111025345
13051	NC_008269	TGG	2	6	537597	537602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025345
13052	NC_008269	CGGTGA	2	12	537615	537626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025345
13053	NC_008269	CGACCG	2	12	537726	537737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111025345
13054	NC_008269	GCG	2	6	537751	537756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13055	NC_008269	CGC	2	6	537772	537777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13056	NC_008269	GCG	2	6	537829	537834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13057	NC_008269	CAG	2	6	537871	537876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13058	NC_008269	CAG	2	6	537892	537897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13059	NC_008269	CGC	2	6	538003	538008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13060	NC_008269	GCC	2	6	538038	538043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13061	NC_008269	CGCGG	2	10	538069	538078	0 %	0 %	60 %	40 %	111025345
13062	NC_008269	GCC	2	6	538085	538090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13063	NC_008269	CCG	2	6	538134	538139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13064	NC_008269	CAC	2	6	538144	538149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025345
13065	NC_008269	CGC	2	6	538153	538158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13066	NC_008269	GGC	2	6	538159	538164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13067	NC_008269	CAC	3	9	538198	538206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025345
13068	NC_008269	CGA	3	9	538212	538220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13069	NC_008269	CCG	2	6	538244	538249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13070	NC_008269	CACCGC	2	12	538258	538269	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111025345
13071	NC_008269	GC	3	6	538316	538321	0 %	0 %	50 %	50 %	111025345
13072	NC_008269	CGA	2	6	538340	538345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13073	NC_008269	GCC	2	6	538349	538354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13074	NC_008269	CCG	2	6	538355	538360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13075	NC_008269	GCG	2	6	538493	538498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
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13079	NC_008269	CCG	2	6	538611	538616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025345
13080	NC_008269	GCA	4	12	538665	538676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
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13082	NC_008269	GCG	2	6	538715	538720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
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13085	NC_008269	CTG	2	6	538849	538854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025345
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13087	NC_008269	TGC	2	6	538910	538915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025345
13088	NC_008269	CGA	2	6	538935	538940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025345
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13091	NC_008269	CGG	2	6	538977	538982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025345
13092	NC_008269	CGGT	2	8	539126	539133	0 %	25 %	50 %	25 %	111025345
13093	NC_008269	TGG	2	6	539136	539141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025345
13094	NC_008269	GAG	2	6	539176	539181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025345
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13096	NC_008269	GAG	2	6	539215	539220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025345
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13099	NC_008269	GCCAGG	2	12	539264	539275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025345
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13101	NC_008269	GGT	2	6	539304	539309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025346
13102	NC_008269	GGC	2	6	539327	539332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025346
13103	NC_008269	CGC	2	6	539333	539338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025346
13104	NC_008269	ACC	2	6	539345	539350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025346
13105	NC_008269	GTC	2	6	539376	539381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025346
13106	NC_008269	CGGTG	2	10	539453	539462	0 %	20 %	60 %	20 %	111025346
13107	NC_008269	CG	3	6	539500	539505	0 %	0 %	50 %	50 %	111025346
13108	NC_008269	TCC	2	6	539560	539565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025346
13109	NC_008269	GCC	2	6	539570	539575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025346
13110	NC_008269	CGCCCG	2	12	539616	539627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025346
13111	NC_008269	AGC	2	6	539642	539647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025346
13112	NC_008269	ACC	2	6	539719	539724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025346
13113	NC_008269	CGG	2	6	539743	539748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025346
13114	NC_008269	CG	3	6	539908	539913	0 %	0 %	50 %	50 %	111025346
13115	NC_008269	GCA	2	6	539954	539959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025346
13116	NC_008269	CCGGC	2	10	539960	539969	0 %	0 %	40 %	60 %	111025346
13117	NC_008269	TCA	2	6	539993	539998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025346
13118	NC_008269	CCG	2	6	540049	540054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025347
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13120	NC_008269	CAC	2	6	540093	540098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025347
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13122	NC_008269	TCG	2	6	540156	540161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025347
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13152	NC_008269	GCA	2	6	541348	541353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13153	NC_008269	AGC	2	6	541359	541364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13220	NC_008269	AG	3	6	544136	544141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13221	NC_008269	AGC	2	6	544169	544174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13222	NC_008269	CGAT	2	8	544193	544200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13223	NC_008269	CGCT	2	8	544223	544230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13224	NC_008269	CACC	2	8	544241	544248	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13225	NC_008269	CGC	2	6	544251	544256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13226	NC_008269	GAA	2	6	544272	544277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_008269	ACCG	2	8	544282	544289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13228	NC_008269	GCG	2	6	544323	544328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13229	NC_008269	TCT	2	6	544360	544365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13230	NC_008269	CGA	2	6	544411	544416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13231	NC_008269	GCG	2	6	544500	544505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13232	NC_008269	GCC	2	6	544508	544513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13233	NC_008269	CGA	2	6	544649	544654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13234	NC_008269	ACG	2	6	544754	544759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025352
13235	NC_008269	GCG	2	6	544760	544765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025352
13236	NC_008269	GC	3	6	544776	544781	0 %	0 %	50 %	50 %	111025352
13237	NC_008269	GCC	2	6	544805	544810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025352
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13239	NC_008269	GCT	2	6	544892	544897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025352
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13241	NC_008269	GTCA	2	8	544912	544919	25 %	25 %	25 %	25 %	111025352
13242	NC_008269	AAGA	2	8	544935	544942	75 %	0 %	25 %	0 %	111025352
13243	NC_008269	ACC	2	6	545021	545026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025353
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13245	NC_008269	ACC	3	9	545076	545084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025353
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13247	NC_008269	GCA	2	6	545183	545188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025353
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13254	NC_008269	TCG	2	6	545340	545345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025353
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13260	NC_008269	GAG	2	6	545533	545538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13281	NC_008269	TCG	2	6	546416	546421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
13282	NC_008269	TCG	2	6	546467	546472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
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13352	NC_008269	CAG	3	9	549389	549397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13354	NC_008269	GCT	2	6	549529	549534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025358
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13359	NC_008269	CGGT	2	8	549903	549910	0 %	25 %	50 %	25 %	111025359
13360	NC_008269	GTC	2	6	549911	549916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025359
13361	NC_008269	GTCG	2	8	549921	549928	0 %	25 %	50 %	25 %	111025359
13362	NC_008269	GCGCC	2	10	549934	549943	0 %	0 %	40 %	60 %	111025359
13363	NC_008269	CCT	2	6	549972	549977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025359
13364	NC_008269	TCG	2	6	550001	550006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025359
13365	NC_008269	GTC	2	6	550102	550107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025359
13366	NC_008269	GGC	2	6	550123	550128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025359
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13368	NC_008269	GTC	2	6	550147	550152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025359
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13377	NC_008269	CGGCCG	2	12	550374	550385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13378	NC_008269	AAC	2	6	550390	550395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13379	NC_008269	CCG	2	6	550413	550418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13380	NC_008269	CGCA	2	8	550443	550450	25 %	0 %	25 %	50 %	111025360
13381	NC_008269	CG	3	6	550462	550467	0 %	0 %	50 %	50 %	111025360
13382	NC_008269	CCA	2	6	550524	550529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025360
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13386	NC_008269	GGTC	2	8	550576	550583	0 %	25 %	50 %	25 %	111025360
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13391	NC_008269	CCG	2	6	550797	550802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025360
13392	NC_008269	CGC	2	6	550897	550902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025360
13393	NC_008269	CAT	2	6	550912	550917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025360
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13396	NC_008269	CTC	2	6	551014	551019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13397	NC_008269	AAC	2	6	551064	551069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13398	NC_008269	GC	3	6	551183	551188	0 %	0 %	50 %	50 %	111025361
13399	NC_008269	ATC	2	6	551284	551289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025361
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13401	NC_008269	GCT	2	6	551316	551321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025361
13402	NC_008269	GCC	2	6	551348	551353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025361
13403	NC_008269	GCC	2	6	551428	551433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13404	NC_008269	CGC	2	6	551455	551460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13405	NC_008269	GGC	2	6	551502	551507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13406	NC_008269	TGA	2	6	551576	551581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13408	NC_008269	TCC	2	6	551612	551617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13424	NC_008269	TGG	2	6	552330	552335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13425	NC_008269	GC	3	6	552373	552378	0 %	0 %	50 %	50 %	111025363
13426	NC_008269	AGAT	2	8	552388	552395	50 %	25 %	25 %	0 %	111025363
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13433	NC_008269	GTG	2	6	552727	552732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025364
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13448	NC_008269	GAT	2	6	553449	553454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13460	NC_008269	GAT	3	9	554211	554219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13461	NC_008269	GGAT	2	8	554264	554271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13462	NC_008269	CGG	2	6	554344	554349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13463	NC_008269	CGA	2	6	554359	554364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13464	NC_008269	CGG	2	6	554397	554402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13465	NC_008269	CGC	2	6	554422	554427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13466	NC_008269	C	6	6	554444	554449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13467	NC_008269	CGC	2	6	554465	554470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13468	NC_008269	GCA	2	6	554523	554528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13470	NC_008269	CGC	2	6	554659	554664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13471	NC_008269	GTC	2	6	554670	554675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13472	NC_008269	GA	3	6	554800	554805	50 %	0 %	50 %	0 %	111025366
13473	NC_008269	CAA	2	6	554833	554838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025366
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13475	NC_008269	CGGATC	2	12	554885	554896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025366
13476	NC_008269	GGTG	2	8	554898	554905	0 %	25 %	75 %	0 %	111025366
13477	NC_008269	GGA	2	6	554976	554981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025366
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13479	NC_008269	GCC	2	6	555009	555014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025366
13480	NC_008269	GTT	3	9	555015	555023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025366
13481	NC_008269	GATTC	2	10	555116	555125	20 %	40 %	20 %	20 %	111025366
13482	NC_008269	CGA	2	6	555158	555163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13483	NC_008269	GTG	2	6	555170	555175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_008269	GTT	2	6	555188	555193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_008269	TCG	2	6	555291	555296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13486	NC_008269	GCG	2	6	555320	555325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_008269	GCT	2	6	555361	555366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025367
13488	NC_008269	GAT	2	6	555367	555372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025367
13489	NC_008269	CGGGAC	2	12	555389	555400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025367
13490	NC_008269	CGT	2	6	555475	555480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025367
13491	NC_008269	GTCG	2	8	555490	555497	0 %	25 %	50 %	25 %	111025367
13492	NC_008269	GCGG	2	8	555517	555524	0 %	0 %	75 %	25 %	111025367
13493	NC_008269	CCG	2	6	555594	555599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025367
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13500	NC_008269	CGC	2	6	555809	555814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025367

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