MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008269	GTC	2	6	515190	515195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12502	NC_008269	GTG	2	6	515200	515205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025327
12503	NC_008269	CGG	2	6	515223	515228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025327
12504	NC_008269	CCG	2	6	515306	515311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025327
12505	NC_008269	CGACC	2	10	515382	515391	20 %	0 %	20 %	60 %	111025327
12506	NC_008269	GCA	3	9	515405	515413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12507	NC_008269	TGC	2	6	515458	515463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12508	NC_008269	CGA	2	6	515465	515470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12509	NC_008269	GGA	2	6	515512	515517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025327
12510	NC_008269	TCG	2	6	515518	515523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12511	NC_008269	GGC	2	6	515540	515545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025327
12512	NC_008269	CAC	2	6	515549	515554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025327
12513	NC_008269	GCCG	2	8	515595	515602	0 %	0 %	50 %	50 %	111025327
12514	NC_008269	TGA	2	6	515611	515616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025327
12515	NC_008269	CG	3	6	515647	515652	0 %	0 %	50 %	50 %	111025327
12516	NC_008269	CGT	2	6	515705	515710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12517	NC_008269	GGT	2	6	515730	515735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025327
12518	NC_008269	CGTGGC	2	12	515759	515770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111025327
12519	NC_008269	GTC	2	6	515859	515864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025327
12520	NC_008269	CGGGGA	2	12	515915	515926	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111025327
12521	NC_008269	GCC	2	6	516035	516040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12522	NC_008269	GGAC	2	8	516096	516103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12523	NC_008269	GGC	2	6	516104	516109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_008269	AAAC	2	8	516132	516139	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_008269	GT	3	6	516157	516162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_008269	GCTC	2	8	516220	516227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_008269	GGTC	2	8	516257	516264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12528	NC_008269	CGGG	2	8	516332	516339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_008269	TCCG	2	8	516341	516348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_008269	GAT	2	6	516356	516361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_008269	TGTA	2	8	516418	516425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_008269	GTC	2	6	516497	516502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_008269	CGTGG	2	10	516541	516550	0 %	20 %	60 %	20 %	111025328
12534	NC_008269	TGT	2	6	516564	516569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025328
12535	NC_008269	AGG	2	6	516633	516638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025328
12536	NC_008269	GCA	2	6	516676	516681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025328
12537	NC_008269	TG	3	6	516750	516755	0 %	50 %	50 %	0 %	111025328
12538	NC_008269	CGG	2	6	516810	516815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025328
12539	NC_008269	GC	3	6	516829	516834	0 %	0 %	50 %	50 %	111025328
12540	NC_008269	CTA	2	6	516840	516845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025328
12541	NC_008269	CGT	2	6	516869	516874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025328
12542	NC_008269	GTG	2	6	516884	516889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025328
12543	NC_008269	TGG	2	6	516933	516938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025328
12544	NC_008269	CCG	2	6	516960	516965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025328
12545	NC_008269	CG	3	6	517025	517030	0 %	0 %	50 %	50 %	111025328
12546	NC_008269	CGG	2	6	517075	517080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025328
12547	NC_008269	TGC	3	9	517083	517091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025328
12548	NC_008269	GAA	2	6	517139	517144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025328
12549	NC_008269	TGTCG	2	10	517162	517171	0 %	40 %	40 %	20 %	111025328
12550	NC_008269	CGC	2	6	517201	517206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025328
12551	NC_008269	GC	3	6	517205	517210	0 %	0 %	50 %	50 %	111025328
12552	NC_008269	TGC	2	6	517272	517277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025328
12553	NC_008269	AGT	2	6	517381	517386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_008269	ACG	2	6	517399	517404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_008269	GCAC	2	8	517454	517461	25 %	0 %	25 %	50 %	111025329
12556	NC_008269	CGG	2	6	517477	517482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12557	NC_008269	GCGA	2	8	517590	517597	25 %	0 %	50 %	25 %	111025329
12558	NC_008269	CGC	2	6	517605	517610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12559	NC_008269	CGG	3	9	517616	517624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12560	NC_008269	GTCGAC	2	12	517638	517649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12561	NC_008269	CAC	2	6	517673	517678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025329
12562	NC_008269	GGC	2	6	517713	517718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12563	NC_008269	GGC	2	6	517727	517732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12564	NC_008269	GCGCC	2	10	517756	517765	0 %	0 %	40 %	60 %	111025329
12565	NC_008269	ACT	3	9	517825	517833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025329
12566	NC_008269	CG	3	6	517840	517845	0 %	0 %	50 %	50 %	111025329
12567	NC_008269	CAC	2	6	517848	517853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025329
12568	NC_008269	GCG	2	6	517872	517877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12569	NC_008269	ATG	2	6	517878	517883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025329
12570	NC_008269	GGC	2	6	517895	517900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12571	NC_008269	CGC	2	6	517936	517941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12572	NC_008269	C	6	6	517999	518004	0 %	0 %	0 %	100 %	111025329
12573	NC_008269	ACT	2	6	518023	518028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025329
12574	NC_008269	C	6	6	518052	518057	0 %	0 %	0 %	100 %	111025329
12575	NC_008269	TCAGCC	2	12	518062	518073	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111025329
12576	NC_008269	GCC	2	6	518190	518195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12577	NC_008269	CGA	2	6	518228	518233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12578	NC_008269	GCAC	2	8	518259	518266	25 %	0 %	25 %	50 %	111025329
12579	NC_008269	GCG	2	6	518283	518288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12580	NC_008269	GGT	2	6	518289	518294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025329
12581	NC_008269	TTC	2	6	518308	518313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025329
12582	NC_008269	GCG	2	6	518350	518355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12583	NC_008269	GCA	2	6	518385	518390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12584	NC_008269	CAGG	2	8	518492	518499	25 %	0 %	50 %	25 %	111025329
12585	NC_008269	ACC	2	6	518541	518546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025329
12586	NC_008269	AGCTG	2	10	518642	518651	20 %	20 %	40 %	20 %	111025329
12587	NC_008269	GCCA	2	8	518652	518659	25 %	0 %	25 %	50 %	111025329
12588	NC_008269	CCG	2	6	518663	518668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12589	NC_008269	CGC	2	6	518693	518698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12590	NC_008269	CGG	2	6	518707	518712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12591	NC_008269	CGATC	2	10	518792	518801	20 %	20 %	20 %	40 %	111025329
12592	NC_008269	TCGA	2	8	518806	518813	25 %	25 %	25 %	25 %	111025329
12593	NC_008269	CGC	2	6	518915	518920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12594	NC_008269	GCG	3	9	518967	518975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12595	NC_008269	GGTC	2	8	519004	519011	0 %	25 %	50 %	25 %	111025329
12596	NC_008269	GATCG	2	10	519060	519069	20 %	20 %	40 %	20 %	111025329
12597	NC_008269	GCG	2	6	519088	519093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
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12599	NC_008269	CCGGG	2	10	519190	519199	0 %	0 %	60 %	40 %	111025329
12600	NC_008269	GCT	2	6	519236	519241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12601	NC_008269	CCGG	2	8	519283	519290	0 %	0 %	50 %	50 %	111025329
12602	NC_008269	GTC	2	6	519303	519308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12603	NC_008269	CCA	2	6	519311	519316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025329
12604	NC_008269	CG	3	6	519373	519378	0 %	0 %	50 %	50 %	111025329
12605	NC_008269	CGC	2	6	519428	519433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12606	NC_008269	TGG	3	9	519454	519462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025329
12607	NC_008269	CCG	2	6	519465	519470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025329
12608	NC_008269	CGG	2	6	519479	519484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12609	NC_008269	GGC	2	6	519494	519499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
12610	NC_008269	CGA	2	6	519509	519514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12611	NC_008269	CTG	2	6	519528	519533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12612	NC_008269	CGA	2	6	519575	519580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025329
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12615	NC_008269	CGG	2	6	519641	519646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025329
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12618	NC_008269	GCA	2	6	519719	519724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025329
12619	NC_008269	GTG	2	6	519765	519770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025329
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12853	NC_008269	ACC	2	6	529220	529225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12854	NC_008269	TGA	2	6	529233	529238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12863	NC_008269	CGG	2	6	529886	529891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025338
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12977	NC_008269	CGCAGT	2	12	534710	534721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025343
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12981	NC_008269	CGT	2	6	534841	534846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025343
12982	NC_008269	GGT	2	6	534851	534856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025343
12983	NC_008269	CGC	2	6	534859	534864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025343
12984	NC_008269	CCA	2	6	534877	534882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025343
12985	NC_008269	TTC	2	6	534891	534896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025343
12986	NC_008269	GCG	2	6	535000	535005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025343
12987	NC_008269	GATC	2	8	535061	535068	25 %	25 %	25 %	25 %	111025343
12988	NC_008269	GCA	2	6	535108	535113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025343
12989	NC_008269	CAT	2	6	535133	535138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025343
12990	NC_008269	CAC	2	6	535181	535186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025343
12991	NC_008269	GCT	2	6	535193	535198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025343
12992	NC_008269	CGG	2	6	535222	535227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025343
12993	NC_008269	CCG	2	6	535303	535308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025343
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12996	NC_008269	CGA	2	6	535394	535399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12998	NC_008269	CGAC	2	8	535428	535435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12999	NC_008269	CTG	2	6	535448	535453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13000	NC_008269	GTCGC	2	10	535497	535506	0 %	20 %	40 %	40 %	111025344

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