MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12121	NC_008269	GCG	2	6	500125	500130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025313
12122	NC_008269	TGG	2	6	500134	500139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025313
12123	NC_008269	GGC	2	6	500177	500182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025313
12124	NC_008269	TGCG	2	8	500183	500190	0 %	25 %	50 %	25 %	111025313
12125	NC_008269	TCG	2	6	500248	500253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025313
12126	NC_008269	GCG	2	6	500301	500306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025313
12127	NC_008269	CAC	2	6	500386	500391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025313
12128	NC_008269	GCCG	2	8	500429	500436	0 %	0 %	50 %	50 %	111025313
12129	NC_008269	TGA	2	6	500452	500457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025313
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12131	NC_008269	GTG	2	6	500550	500555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12132	NC_008269	GCC	2	6	500592	500597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025314
12133	NC_008269	TGT	2	6	500614	500619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025314
12134	NC_008269	CGA	2	6	500627	500632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025314
12135	NC_008269	CTG	2	6	500703	500708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025314
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12139	NC_008269	GTCG	2	8	500802	500809	0 %	25 %	50 %	25 %	111025314
12140	NC_008269	TCG	2	6	500830	500835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025314
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12145	NC_008269	GAT	2	6	500943	500948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025314
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12156	NC_008269	GCG	2	6	501166	501171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025314
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12158	NC_008269	GCA	2	6	501272	501277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025314
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12163	NC_008269	CAG	2	6	501429	501434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025314
12164	NC_008269	TCGG	2	8	501457	501464	0 %	25 %	50 %	25 %	111025314
12165	NC_008269	ACC	2	6	501481	501486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025314
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12167	NC_008269	CAC	2	6	501652	501657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12168	NC_008269	CAC	2	6	501686	501691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12169	NC_008269	ATC	2	6	501743	501748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12174	NC_008269	GCCGG	2	10	501993	502002	0 %	0 %	60 %	40 %	111025315
12175	NC_008269	GAT	2	6	502073	502078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025315
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12182	NC_008269	GCG	2	6	502300	502305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025315
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12198	NC_008269	CTG	2	6	502849	502854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025315
12199	NC_008269	CCCG	2	8	502933	502940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12200	NC_008269	TCG	2	6	503058	503063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025316
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12224	NC_008269	CAA	2	6	504153	504158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_008269	CTG	2	6	504216	504221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12226	NC_008269	GCG	2	6	504230	504235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12227	NC_008269	CGA	2	6	504257	504262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12228	NC_008269	CTGGC	2	10	504279	504288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12229	NC_008269	CTG	2	6	504321	504326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12230	NC_008269	CGGG	2	8	504358	504365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12231	NC_008269	GAA	2	6	504422	504427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_008269	GGC	2	6	504546	504551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12233	NC_008269	TTAAG	2	10	504574	504583	40 %	40 %	20 %	0 %	111025318
12234	NC_008269	GCGCC	2	10	504620	504629	0 %	0 %	40 %	60 %	111025318
12235	NC_008269	GAC	2	6	504633	504638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12236	NC_008269	TG	3	6	504672	504677	0 %	50 %	50 %	0 %	111025318
12237	NC_008269	AAC	2	6	504766	504771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025318
12238	NC_008269	TCGG	2	8	504795	504802	0 %	25 %	50 %	25 %	111025318
12239	NC_008269	CAG	2	6	504855	504860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12240	NC_008269	AGC	3	9	504898	504906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12241	NC_008269	CA	3	6	504915	504920	50 %	0 %	0 %	50 %	111025318
12242	NC_008269	GCA	2	6	504921	504926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12243	NC_008269	G	6	6	504967	504972	0 %	0 %	100 %	0 %	111025318
12244	NC_008269	CCA	2	6	505007	505012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025318
12245	NC_008269	CGAT	2	8	505028	505035	25 %	25 %	25 %	25 %	111025318
12246	NC_008269	GCG	2	6	505045	505050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025318
12247	NC_008269	CGGC	2	8	505085	505092	0 %	0 %	50 %	50 %	111025318
12248	NC_008269	GGT	2	6	505115	505120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025318
12249	NC_008269	CGA	2	6	505136	505141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12250	NC_008269	GGCC	2	8	505229	505236	0 %	0 %	50 %	50 %	111025318
12251	NC_008269	CGAG	2	8	505265	505272	25 %	0 %	50 %	25 %	111025318
12252	NC_008269	GC	3	6	505274	505279	0 %	0 %	50 %	50 %	111025318
12253	NC_008269	AAG	2	6	505303	505308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025318
12254	NC_008269	GGC	2	6	505346	505351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025318
12255	NC_008269	GC	3	6	505350	505355	0 %	0 %	50 %	50 %	111025318
12256	NC_008269	TCTG	2	8	505367	505374	0 %	50 %	25 %	25 %	111025318
12257	NC_008269	GGT	2	6	505402	505407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025318
12258	NC_008269	GCG	2	6	505418	505423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025318
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12261	NC_008269	CGG	2	6	505550	505555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025318
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12263	NC_008269	GAGC	2	8	505586	505593	25 %	0 %	50 %	25 %	111025318
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12265	NC_008269	ACC	2	6	505648	505653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025318
12266	NC_008269	GCA	2	6	505676	505681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
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12268	NC_008269	CAG	2	6	505740	505745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12269	NC_008269	CAG	2	6	505758	505763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12270	NC_008269	ACGC	2	8	505778	505785	25 %	0 %	25 %	50 %	111025318
12271	NC_008269	GCC	2	6	505794	505799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025318
12272	NC_008269	CGGTCG	2	12	505870	505881	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111025318
12273	NC_008269	CGT	2	6	505887	505892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12274	NC_008269	CGG	2	6	505896	505901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025318
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12276	NC_008269	GCA	2	6	505955	505960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
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12284	NC_008269	ACG	2	6	506260	506265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
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12287	NC_008269	ACG	2	6	506431	506436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025318
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12290	NC_008269	GACG	2	8	506512	506519	25 %	0 %	50 %	25 %	111025318
12291	NC_008269	CCGGA	2	10	506523	506532	20 %	0 %	40 %	40 %	111025318
12292	NC_008269	GTG	2	6	506542	506547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025318
12293	NC_008269	CGT	2	6	506611	506616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025318
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12295	NC_008269	TGC	2	6	506738	506743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025318
12296	NC_008269	CGGT	2	8	506746	506753	0 %	25 %	50 %	25 %	111025318
12297	NC_008269	GCC	2	6	506763	506768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025318
12298	NC_008269	CCA	2	6	507083	507088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12299	NC_008269	CGAA	2	8	507096	507103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12300	NC_008269	GTC	2	6	507107	507112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12301	NC_008269	GCAC	2	8	507121	507128	25 %	0 %	25 %	50 %	111025319
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12303	NC_008269	GCA	2	6	507152	507157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025319
12304	NC_008269	CG	3	6	507194	507199	0 %	0 %	50 %	50 %	111025319
12305	NC_008269	CAC	2	6	507226	507231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025319
12306	NC_008269	ATC	2	6	507270	507275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025319
12307	NC_008269	GCC	2	6	507293	507298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025319
12308	NC_008269	CATGAG	2	12	507378	507389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111025319
12309	NC_008269	GCC	2	6	507450	507455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025319
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12311	NC_008269	CGT	2	6	507571	507576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025320
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12314	NC_008269	GTGACC	2	12	507712	507723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025320
12315	NC_008269	GCG	2	6	507727	507732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025320
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12318	NC_008269	CACGGT	2	12	507756	507767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025321
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12320	NC_008269	ATC	2	6	507813	507818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025321
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12324	NC_008269	GCGCC	2	10	507881	507890	0 %	0 %	40 %	60 %	111025321
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12328	NC_008269	GCT	2	6	508029	508034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025321
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12342	NC_008269	GCG	2	6	508594	508599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025321
12343	NC_008269	GGT	2	6	508614	508619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025321
12344	NC_008269	TCGGGG	2	12	508690	508701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111025322
12345	NC_008269	CGG	2	6	508743	508748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025322
12346	NC_008269	TGC	2	6	508762	508767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12347	NC_008269	GAC	3	9	508785	508793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12348	NC_008269	CGC	2	6	508826	508831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025322
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12350	NC_008269	CAT	2	6	508976	508981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025322
12351	NC_008269	TGC	2	6	509026	509031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12352	NC_008269	TCC	2	6	509056	509061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025322
12353	NC_008269	CCCGG	2	10	509071	509080	0 %	0 %	40 %	60 %	111025322
12354	NC_008269	CGGG	2	8	509096	509103	0 %	0 %	75 %	25 %	111025322
12355	NC_008269	TGC	2	6	509104	509109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12356	NC_008269	TGG	2	6	509173	509178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025322
12357	NC_008269	CTCG	2	8	509246	509253	0 %	25 %	25 %	50 %	111025322
12358	NC_008269	CTG	2	6	509271	509276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12359	NC_008269	GCA	2	6	509282	509287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12360	NC_008269	GGCC	2	8	509321	509328	0 %	0 %	50 %	50 %	111025322
12361	NC_008269	CGC	2	6	509354	509359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025322
12362	NC_008269	CGGGC	2	10	509364	509373	0 %	0 %	60 %	40 %	111025322
12363	NC_008269	TCA	2	6	509395	509400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025322
12364	NC_008269	GGC	3	9	509453	509461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025322
12365	NC_008269	GCA	2	6	509465	509470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025322
12366	NC_008269	GCC	2	6	509480	509485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025322
12367	NC_008269	CGC	2	6	509579	509584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025322
12368	NC_008269	ACCG	2	8	509585	509592	25 %	0 %	25 %	50 %	111025322
12369	NC_008269	CG	3	6	509591	509596	0 %	0 %	50 %	50 %	111025322
12370	NC_008269	CG	3	6	509615	509620	0 %	0 %	50 %	50 %	111025322
12371	NC_008269	CGC	2	6	509630	509635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025322
12372	NC_008269	TGG	2	6	509703	509708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025322
12373	NC_008269	GTG	2	6	509724	509729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025322
12374	NC_008269	CCT	2	6	509747	509752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025322
12375	NC_008269	ACCGAG	3	18	509811	509828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025322
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12388	NC_008269	TC	3	6	510289	510294	0 %	50 %	0 %	50 %	111025322
12389	NC_008269	ATG	2	6	510315	510320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025322
12390	NC_008269	GGGT	2	8	510326	510333	0 %	25 %	75 %	0 %	111025322
12391	NC_008269	TGG	2	6	510448	510453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025322
12392	NC_008269	ACC	2	6	510462	510467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025322
12393	NC_008269	GGC	2	6	510575	510580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025322
12394	NC_008269	CTGGG	2	10	510621	510630	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12395	NC_008269	G	6	6	510703	510708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12396	NC_008269	C	6	6	510713	510718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12397	NC_008269	GCT	2	6	510767	510772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025323
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12400	NC_008269	GGC	2	6	510849	510854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025323
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12421	NC_008269	G	6	6	512028	512033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12422	NC_008269	AAG	2	6	512097	512102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12423	NC_008269	GCGG	2	8	512103	512110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12424	NC_008269	GCT	2	6	512146	512151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12425	NC_008269	CTC	2	6	512224	512229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12427	NC_008269	CCA	2	6	512268	512273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12428	NC_008269	TGTA	2	8	512302	512309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12429	NC_008269	GGA	3	9	512350	512358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12430	NC_008269	CCG	2	6	512412	512417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025325
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12433	NC_008269	GCCG	2	8	512632	512639	0 %	0 %	50 %	50 %	111025325
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12472	NC_008269	CGTC	2	8	514301	514308	0 %	25 %	25 %	50 %	111025326
12473	NC_008269	CGG	2	6	514347	514352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025326
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12477	NC_008269	GGC	2	6	514504	514509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025326
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12479	NC_008269	TGG	2	6	514541	514546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025326
12480	NC_008269	CGT	2	6	514605	514610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025326
12481	NC_008269	GCT	2	6	514626	514631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025326
12482	NC_008269	CG	4	8	514640	514647	0 %	0 %	50 %	50 %	111025326
12483	NC_008269	CGGGC	2	10	514660	514669	0 %	0 %	60 %	40 %	111025326
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