MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008269	CCT	2	6	453263	453268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025261
11002	NC_008269	GGCG	2	8	453270	453277	0 %	0 %	75 %	25 %	111025261
11003	NC_008269	GCA	2	6	453298	453303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025261
11004	NC_008269	GCG	2	6	453314	453319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11005	NC_008269	GTC	2	6	453370	453375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025261
11006	NC_008269	GGC	2	6	453393	453398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11007	NC_008269	GGC	2	6	453450	453455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11008	NC_008269	CTT	2	6	453459	453464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025261
11009	NC_008269	GGCG	2	8	453492	453499	0 %	0 %	75 %	25 %	111025261
11010	NC_008269	GGC	2	6	453513	453518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11011	NC_008269	TGG	2	6	453584	453589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025261
11012	NC_008269	CCT	2	6	453626	453631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025261
11013	NC_008269	CTT	2	6	453654	453659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025261
11014	NC_008269	GGC	2	6	453664	453669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11015	NC_008269	TCC	2	6	453742	453747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025261
11016	NC_008269	GCC	2	6	453764	453769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025261
11017	NC_008269	TGC	2	6	453773	453778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025261
11018	NC_008269	GAA	2	6	453812	453817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025261
11019	NC_008269	GGC	2	6	453834	453839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025261
11020	NC_008269	GC	4	8	453838	453845	0 %	0 %	50 %	50 %	111025261
11021	NC_008269	GCC	2	6	453897	453902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_008269	ACGC	2	8	453904	453911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_008269	CCT	2	6	453916	453921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_008269	CCT	2	6	454025	454030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_008269	ATTC	2	8	454059	454066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11026	NC_008269	TCAC	2	8	454067	454074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_008269	GTC	2	6	454143	454148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_008269	AGC	2	6	454232	454237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_008269	GC	3	6	454236	454241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_008269	CAC	2	6	454270	454275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_008269	ATC	2	6	454281	454286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_008269	CCA	2	6	454350	454355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_008269	ACC	2	6	454421	454426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_008269	TCC	2	6	454427	454432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_008269	GCGCC	2	10	454451	454460	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11036	NC_008269	GCT	2	6	454531	454536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025262
11037	NC_008269	GACG	2	8	454589	454596	25 %	0 %	50 %	25 %	111025262
11038	NC_008269	GTA	2	6	454628	454633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025262
11039	NC_008269	CGG	2	6	454745	454750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025262
11040	NC_008269	GCG	2	6	454796	454801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025262
11041	NC_008269	GCC	2	6	454802	454807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025262
11042	NC_008269	CGACG	2	10	454810	454819	20 %	0 %	40 %	40 %	111025262
11043	NC_008269	CCA	2	6	454873	454878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025262
11044	NC_008269	TCT	2	6	454925	454930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025263
11045	NC_008269	CGG	2	6	454933	454938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11046	NC_008269	CAG	2	6	454950	454955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11047	NC_008269	TCG	2	6	454987	454992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11048	NC_008269	TGT	3	9	455009	455017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025263
11049	NC_008269	GGA	2	6	455024	455029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025263
11050	NC_008269	GCC	2	6	455038	455043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025263
11051	NC_008269	CGAGC	2	10	455067	455076	20 %	0 %	40 %	40 %	111025263
11052	NC_008269	GAG	2	6	455103	455108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025263
11053	NC_008269	TCG	3	9	455110	455118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11054	NC_008269	GCTGA	2	10	455245	455254	20 %	20 %	40 %	20 %	111025263
11055	NC_008269	TCG	2	6	455329	455334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11056	NC_008269	CGG	2	6	455345	455350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11057	NC_008269	TCG	2	6	455353	455358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11058	NC_008269	GCCG	2	8	455365	455372	0 %	0 %	50 %	50 %	111025263
11059	NC_008269	GCG	2	6	455386	455391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11060	NC_008269	GCGG	2	8	455463	455470	0 %	0 %	75 %	25 %	111025263
11061	NC_008269	GC	3	6	455513	455518	0 %	0 %	50 %	50 %	111025263
11062	NC_008269	AGC	2	6	455602	455607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11063	NC_008269	CGG	2	6	455617	455622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11064	NC_008269	GGC	2	6	455651	455656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11065	NC_008269	TCG	2	6	455668	455673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11066	NC_008269	CGG	2	6	455750	455755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11067	NC_008269	CGG	3	9	455767	455775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11068	NC_008269	GAG	2	6	455787	455792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025263
11069	NC_008269	GGCG	2	8	455870	455877	0 %	0 %	75 %	25 %	111025263
11070	NC_008269	TCGG	2	8	455898	455905	0 %	25 %	50 %	25 %	111025263
11071	NC_008269	GTC	3	9	455946	455954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025263
11072	NC_008269	CGG	2	6	456026	456031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11073	NC_008269	GAG	2	6	456051	456056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025263
11074	NC_008269	CGG	2	6	456058	456063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11075	NC_008269	GCG	2	6	456082	456087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11076	NC_008269	AGATC	2	10	456167	456176	40 %	20 %	20 %	20 %	111025263
11077	NC_008269	CGGT	2	8	456265	456272	0 %	25 %	50 %	25 %	111025263
11078	NC_008269	TGG	2	6	456308	456313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025263
11079	NC_008269	GTCGAG	2	12	456318	456329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025263
11080	NC_008269	GCG	2	6	456351	456356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11081	NC_008269	CGG	2	6	456362	456367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11082	NC_008269	GCG	2	6	456372	456377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11083	NC_008269	GGTCGG	2	12	456404	456415	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111025263
11084	NC_008269	CGG	2	6	456424	456429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11085	NC_008269	GCG	2	6	456430	456435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11086	NC_008269	GCG	2	6	456456	456461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11087	NC_008269	CGG	2	6	456473	456478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025263
11088	NC_008269	CTC	2	6	456483	456488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025263
11089	NC_008269	GTT	2	6	456494	456499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025263
11090	NC_008269	TGG	2	6	456500	456505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025263
11091	NC_008269	GGATC	2	10	456524	456533	20 %	20 %	40 %	20 %	111025263
11092	NC_008269	TCA	2	6	456566	456571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025263
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11094	NC_008269	GT	3	6	456750	456755	0 %	50 %	50 %	0 %	111025264
11095	NC_008269	CGC	2	6	456795	456800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025264
11096	NC_008269	TGC	2	6	456887	456892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025264
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11098	NC_008269	GTC	2	6	456922	456927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025264
11099	NC_008269	GCT	2	6	456928	456933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025264
11100	NC_008269	TCAT	2	8	457004	457011	25 %	50 %	0 %	25 %	111025264
11101	NC_008269	GTG	2	6	457070	457075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025265
11102	NC_008269	GGTG	2	8	457091	457098	0 %	25 %	75 %	0 %	111025265
11103	NC_008269	CGGTG	2	10	457197	457206	0 %	20 %	60 %	20 %	111025265
11104	NC_008269	CCAG	2	8	457210	457217	25 %	0 %	25 %	50 %	111025265
11105	NC_008269	GAC	2	6	457227	457232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025265
11106	NC_008269	TGGTCG	2	12	457282	457293	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111025265
11107	NC_008269	GTC	2	6	457302	457307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025265
11108	NC_008269	ACCT	2	8	457359	457366	25 %	25 %	0 %	50 %	111025265
11109	NC_008269	ACG	2	6	457378	457383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025265
11110	NC_008269	GAA	2	6	457404	457409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_008269	CAG	2	6	457410	457415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_008269	ATT	2	6	457448	457453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_008269	GAC	2	6	457496	457501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_008269	GC	3	6	457562	457567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_008269	GTTG	2	8	457587	457594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_008269	TGG	2	6	457667	457672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025266
11117	NC_008269	GACT	2	8	457703	457710	25 %	25 %	25 %	25 %	111025266
11118	NC_008269	CGA	2	6	457779	457784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11119	NC_008269	GCA	2	6	457844	457849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11120	NC_008269	GTC	2	6	457866	457871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11121	NC_008269	TGC	2	6	457892	457897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11122	NC_008269	GGC	2	6	457934	457939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025266
11123	NC_008269	CGA	2	6	457992	457997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11124	NC_008269	GCT	2	6	458058	458063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11125	NC_008269	GAC	2	6	458113	458118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025266
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11127	NC_008269	TGT	2	6	458246	458251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025266
11128	NC_008269	GCT	2	6	458313	458318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025266
11129	NC_008269	GCTGC	2	10	458391	458400	0 %	20 %	40 %	40 %	111025266
11130	NC_008269	CCG	2	6	458501	458506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025266
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11132	NC_008269	CGG	2	6	458648	458653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025266
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11146	NC_008269	CGT	2	6	459380	459385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025267
11147	NC_008269	CGA	2	6	459425	459430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025267
11148	NC_008269	GCT	2	6	459440	459445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025267
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11150	NC_008269	CCGG	2	8	459511	459518	0 %	0 %	50 %	50 %	111025267
11151	NC_008269	CCCGC	2	10	459524	459533	0 %	0 %	20 %	80 %	111025267
11152	NC_008269	ACC	2	6	459550	459555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025267
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11154	NC_008269	CGA	2	6	459647	459652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025267
11155	NC_008269	GCCAC	2	10	459700	459709	20 %	0 %	20 %	60 %	111025267
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11157	NC_008269	CTG	2	6	459738	459743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025267
11158	NC_008269	CGC	2	6	459755	459760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025267
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11161	NC_008269	CGC	2	6	459908	459913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025268
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11185	NC_008269	AGC	2	6	460896	460901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025268
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11188	NC_008269	CGTCGA	2	12	460963	460974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025268
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11192	NC_008269	CCGC	2	8	461304	461311	0 %	0 %	25 %	75 %	111025269
11193	NC_008269	GC	3	6	461317	461322	0 %	0 %	50 %	50 %	111025269
11194	NC_008269	TCG	2	6	461343	461348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025269
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11197	NC_008269	CAC	2	6	461599	461604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025269
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11200	NC_008269	GACG	2	8	461886	461893	25 %	0 %	50 %	25 %	111025269
11201	NC_008269	CGT	2	6	461970	461975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025269
11202	NC_008269	TGC	2	6	461983	461988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025269
11203	NC_008269	TCG	2	6	462035	462040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025269
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11211	NC_008269	CGC	2	6	462640	462645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025270
11212	NC_008269	GTC	2	6	462673	462678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025270
11213	NC_008269	CGA	2	6	462687	462692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025270
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11215	NC_008269	TGC	2	6	462789	462794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025270
11216	NC_008269	GTCG	2	8	462843	462850	0 %	25 %	50 %	25 %	111025270
11217	NC_008269	CG	3	6	462895	462900	0 %	0 %	50 %	50 %	111025270
11218	NC_008269	CAG	2	6	462916	462921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025270
11219	NC_008269	GTC	2	6	463006	463011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025270
11220	NC_008269	GCA	2	6	463014	463019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025270
11221	NC_008269	TCAC	2	8	463028	463035	25 %	25 %	0 %	50 %	111025270
11222	NC_008269	TCC	2	6	463043	463048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11223	NC_008269	CCG	2	6	463078	463083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11224	NC_008269	GAG	2	6	463145	463150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025271
11225	NC_008269	GTT	2	6	463159	463164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025271
11226	NC_008269	GGC	2	6	463265	463270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025271
11227	NC_008269	TGG	2	6	463313	463318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025271
11228	NC_008269	GTC	2	6	463380	463385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025271
11229	NC_008269	GCG	2	6	463404	463409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025271
11230	NC_008269	GAC	2	6	463413	463418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025271
11231	NC_008269	GCG	2	6	463426	463431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025271
11232	NC_008269	GGC	2	6	463434	463439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025271
11233	NC_008269	AAT	2	6	463531	463536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_008269	GC	3	6	463585	463590	0 %	0 %	50 %	50 %	111025272
11235	NC_008269	GCA	2	6	463615	463620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025272
11236	NC_008269	GCC	2	6	463744	463749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025272
11237	NC_008269	CGA	2	6	463792	463797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025272
11238	NC_008269	AGCA	2	8	463835	463842	50 %	0 %	25 %	25 %	111025272
11239	NC_008269	GCG	2	6	463843	463848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025272
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11485	NC_008269	TCG	2	6	474122	474127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11486	NC_008269	GAA	2	6	474144	474149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025284
11487	NC_008269	GATC	2	8	474261	474268	25 %	25 %	25 %	25 %	111025284
11488	NC_008269	CGA	2	6	474333	474338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11489	NC_008269	CGA	2	6	474350	474355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11490	NC_008269	GAT	3	9	474372	474380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025284
11491	NC_008269	GGT	2	6	474413	474418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025284
11492	NC_008269	GTG	2	6	474476	474481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025284
11493	NC_008269	GCGCC	2	10	474540	474549	0 %	0 %	40 %	60 %	111025284
11494	NC_008269	GCG	2	6	474599	474604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025284
11495	NC_008269	GTC	2	6	474640	474645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11496	NC_008269	GCT	2	6	474684	474689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11497	NC_008269	CCG	2	6	474693	474698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025284
11498	NC_008269	CGA	2	6	474714	474719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025284
11499	NC_008269	CTA	2	6	474726	474731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025284
11500	NC_008269	CCG	2	6	474746	474751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025284

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