MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008269	CGAGGG	3	18	431237	431254	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111025241
10502	NC_008269	CGT	2	6	431267	431272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025241
10503	NC_008269	GGC	2	6	431380	431385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025242
10504	NC_008269	CGGCGA	2	12	431455	431466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025242
10505	NC_008269	TGCG	2	8	431538	431545	0 %	25 %	50 %	25 %	111025242
10506	NC_008269	GAT	2	6	431554	431559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025242
10507	NC_008269	CGG	2	6	431603	431608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025242
10508	NC_008269	CGG	3	9	431618	431626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025242
10509	NC_008269	GAC	2	6	431637	431642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025242
10510	NC_008269	GAC	2	6	431648	431653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025242
10511	NC_008269	GTAC	2	8	431669	431676	25 %	25 %	25 %	25 %	111025242
10512	NC_008269	CA	3	6	431728	431733	50 %	0 %	0 %	50 %	111025242
10513	NC_008269	GTG	2	6	431766	431771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025243
10514	NC_008269	CAG	2	6	431789	431794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025243
10515	NC_008269	TCC	2	6	431884	431889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025243
10516	NC_008269	ACA	2	6	431925	431930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025243
10517	NC_008269	GTC	2	6	431986	431991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025243
10518	NC_008269	CGG	2	6	432000	432005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025243
10519	NC_008269	CGA	2	6	432121	432126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025243
10520	NC_008269	CGTCGA	2	12	432182	432193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025243
10521	NC_008269	GACACC	2	12	432195	432206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111025243
10522	NC_008269	GAA	2	6	432246	432251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025243
10523	NC_008269	CCA	2	6	432313	432318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025243
10524	NC_008269	CAA	2	6	432344	432349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025243
10525	NC_008269	CCG	2	6	432440	432445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_008269	GAA	2	6	432480	432485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_008269	GCA	2	6	432491	432496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_008269	GTC	2	6	432594	432599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025244
10529	NC_008269	GCCG	2	8	432602	432609	0 %	0 %	50 %	50 %	111025244
10530	NC_008269	GCC	2	6	432617	432622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025244
10531	NC_008269	CCGC	2	8	432642	432649	0 %	0 %	25 %	75 %	111025244
10532	NC_008269	TGC	2	6	432675	432680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025244
10533	NC_008269	CGA	2	6	432694	432699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025244
10534	NC_008269	CTC	2	6	432714	432719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025244
10535	NC_008269	GCG	3	9	432728	432736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025244
10536	NC_008269	CGC	2	6	432796	432801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025244
10537	NC_008269	CGT	2	6	432829	432834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025244
10538	NC_008269	AAG	2	6	432879	432884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025244
10539	NC_008269	CCAC	2	8	432891	432898	25 %	0 %	0 %	75 %	111025244
10540	NC_008269	CCA	2	6	432931	432936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025244
10541	NC_008269	CGG	2	6	433100	433105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_008269	ATCACC	2	12	433113	433124	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10543	NC_008269	CAAAA	2	10	433151	433160	80 %	0 %	0 %	20 %	111025245
10544	NC_008269	GCC	2	6	433184	433189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025245
10545	NC_008269	GTT	2	6	433215	433220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025245
10546	NC_008269	CCA	2	6	433240	433245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025245
10547	NC_008269	GCG	2	6	433299	433304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025245
10548	NC_008269	CTC	2	6	433314	433319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025245
10549	NC_008269	ACC	2	6	433327	433332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025245
10550	NC_008269	TGA	2	6	433333	433338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025245
10551	NC_008269	TCG	2	6	433342	433347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025245
10552	NC_008269	CGA	2	6	433375	433380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025245
10553	NC_008269	GAT	2	6	433449	433454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025246
10554	NC_008269	TTCG	2	8	433473	433480	0 %	50 %	25 %	25 %	111025246
10555	NC_008269	GGCCC	2	10	433502	433511	0 %	0 %	40 %	60 %	111025246
10556	NC_008269	GGC	2	6	433560	433565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025246
10557	NC_008269	TGC	2	6	433589	433594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025246
10558	NC_008269	ATC	2	6	433641	433646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025246
10559	NC_008269	GGTG	3	12	433686	433697	0 %	25 %	75 %	0 %	111025246
10560	NC_008269	CCAA	2	8	433703	433710	50 %	0 %	0 %	50 %	111025246
10561	NC_008269	CGAC	2	8	433721	433728	25 %	0 %	25 %	50 %	111025246
10562	NC_008269	TCG	2	6	433762	433767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025246
10563	NC_008269	GTC	2	6	433770	433775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025246
10564	NC_008269	GAC	2	6	433875	433880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025246
10565	NC_008269	TTGC	2	8	433908	433915	0 %	50 %	25 %	25 %	111025246
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10567	NC_008269	CTCGA	2	10	434055	434064	20 %	20 %	20 %	40 %	111025246
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10572	NC_008269	TTC	2	6	434208	434213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025246
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10574	NC_008269	CCG	2	6	434393	434398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025246
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10576	NC_008269	CGGAC	2	10	434576	434585	20 %	0 %	40 %	40 %	111025246
10577	NC_008269	CGT	2	6	434633	434638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025246
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10579	NC_008269	TCT	2	6	434692	434697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025246
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10581	NC_008269	GTC	2	6	434791	434796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10584	NC_008269	TGGG	2	8	435088	435095	0 %	25 %	75 %	0 %	111025247
10585	NC_008269	CGC	2	6	435135	435140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025247
10586	NC_008269	TGTA	2	8	435176	435183	25 %	50 %	25 %	0 %	111025247
10587	NC_008269	TCG	2	6	435257	435262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025247
10588	NC_008269	CGA	2	6	435336	435341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025247
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10591	NC_008269	TGG	2	6	435552	435557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025247
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10603	NC_008269	TGG	2	6	436162	436167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025247
10604	NC_008269	GCC	2	6	436226	436231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025247
10605	NC_008269	GTTG	2	8	436246	436253	0 %	50 %	50 %	0 %	111025247
10606	NC_008269	GCC	2	6	436350	436355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025247
10607	NC_008269	C	6	6	436354	436359	0 %	0 %	0 %	100 %	111025247
10608	NC_008269	GT	3	6	436428	436433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_008269	CG	3	6	436605	436610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_008269	TTC	2	6	436616	436621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_008269	CAA	2	6	436680	436685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_008269	ATG	2	6	436726	436731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10614	NC_008269	GC	3	6	436827	436832	0 %	0 %	50 %	50 %	111025248
10615	NC_008269	TG	3	6	436897	436902	0 %	50 %	50 %	0 %	111025248
10616	NC_008269	AGTC	2	8	437071	437078	25 %	25 %	25 %	25 %	111025248
10617	NC_008269	CT	3	6	437169	437174	0 %	50 %	0 %	50 %	111025248
10618	NC_008269	GGT	2	6	437371	437376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025248
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10737	NC_008269	CGA	2	6	442588	442593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025253
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10979	NC_008269	CCG	2	6	452445	452450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025260
10980	NC_008269	CCGC	2	8	452475	452482	0 %	0 %	25 %	75 %	111025260
10981	NC_008269	CTC	2	6	452492	452497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025260
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10983	NC_008269	GCA	2	6	452555	452560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10984	NC_008269	CCG	2	6	452566	452571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10985	NC_008269	GA	3	6	452589	452594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10988	NC_008269	CGGG	2	8	452702	452709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10989	NC_008269	GCC	4	12	452851	452862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025261
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