MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008269	CGATG	2	10	407533	407542	20 %	20 %	40 %	20 %	111025217
10002	NC_008269	GCA	2	6	407551	407556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025217
10003	NC_008269	AGC	2	6	407567	407572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025217
10004	NC_008269	CGA	2	6	407640	407645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025217
10005	NC_008269	GCG	2	6	407657	407662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025217
10006	NC_008269	CGA	2	6	407668	407673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025217
10007	NC_008269	CAAC	2	8	407697	407704	50 %	0 %	0 %	50 %	111025217
10008	NC_008269	CGT	2	6	407712	407717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025217
10009	NC_008269	GCGAC	2	10	407741	407750	20 %	0 %	40 %	40 %	111025217
10010	NC_008269	CCA	2	6	407774	407779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025217
10011	NC_008269	CGG	2	6	407840	407845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025217
10012	NC_008269	ACCC	2	8	407881	407888	25 %	0 %	0 %	75 %	111025217
10013	NC_008269	ACC	2	6	408011	408016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025218
10014	NC_008269	CGG	2	6	408118	408123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025218
10015	NC_008269	GCA	2	6	408181	408186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025218
10016	NC_008269	CGC	2	6	408190	408195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025218
10017	NC_008269	GGT	2	6	408236	408241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025218
10018	NC_008269	GGA	2	6	408329	408334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025218
10019	NC_008269	CCG	2	6	408385	408390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025218
10020	NC_008269	GCGAA	2	10	408409	408418	40 %	0 %	40 %	20 %	111025218
10021	NC_008269	GTC	2	6	408446	408451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025218
10022	NC_008269	TCGA	2	8	408488	408495	25 %	25 %	25 %	25 %	111025218
10023	NC_008269	GTT	2	6	408554	408559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_008269	GGT	2	6	408629	408634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_008269	CCG	2	6	408739	408744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025219
10026	NC_008269	TCG	2	6	408859	408864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10027	NC_008269	TAGGTG	2	12	408867	408878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	111025219
10028	NC_008269	TCGACT	2	12	409014	409025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111025219
10029	NC_008269	GCG	2	6	409053	409058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025219
10030	NC_008269	TGA	2	6	409090	409095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025219
10031	NC_008269	TGA	2	6	409153	409158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025219
10032	NC_008269	GCG	2	6	409191	409196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025219
10033	NC_008269	CCG	2	6	409215	409220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025219
10034	NC_008269	CTG	2	6	409233	409238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10035	NC_008269	GGCG	2	8	409372	409379	0 %	0 %	75 %	25 %	111025219
10036	NC_008269	CAA	2	6	409453	409458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025219
10037	NC_008269	CGT	2	6	409471	409476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10038	NC_008269	TCG	2	6	409524	409529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10039	NC_008269	GAC	2	6	409542	409547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10040	NC_008269	ACG	2	6	409590	409595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025219
10041	NC_008269	GCGGAC	2	12	409598	409609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025219
10042	NC_008269	GGCC	2	8	409612	409619	0 %	0 %	50 %	50 %	111025219
10043	NC_008269	GCC	2	6	409664	409669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025219
10044	NC_008269	GT	3	6	409675	409680	0 %	50 %	50 %	0 %	111025219
10045	NC_008269	CTC	2	6	409704	409709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_008269	TGCC	2	8	409771	409778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_008269	TCG	3	9	409834	409842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10048	NC_008269	GTA	2	6	409860	409865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025220
10049	NC_008269	GCG	2	6	409866	409871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025220
10050	NC_008269	GC	3	6	409911	409916	0 %	0 %	50 %	50 %	111025220
10051	NC_008269	GTC	2	6	409988	409993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10052	NC_008269	CCT	2	6	410001	410006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025220
10053	NC_008269	CCG	2	6	410007	410012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025220
10054	NC_008269	CGA	2	6	410032	410037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10055	NC_008269	ATC	2	6	410148	410153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025220
10056	NC_008269	TCGATG	2	12	410154	410165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111025220
10057	NC_008269	GGT	2	6	410222	410227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025220
10058	NC_008269	GTG	2	6	410294	410299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025220
10059	NC_008269	CTGA	2	8	410324	410331	25 %	25 %	25 %	25 %	111025220
10060	NC_008269	GCCCTC	2	12	410339	410350	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111025220
10061	NC_008269	GGA	2	6	410446	410451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025220
10062	NC_008269	GAC	2	6	410477	410482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10063	NC_008269	CAT	2	6	410483	410488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025220
10064	NC_008269	CTG	2	6	410492	410497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10065	NC_008269	GGTC	2	8	410518	410525	0 %	25 %	50 %	25 %	111025220
10066	NC_008269	ATC	2	6	410538	410543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025220
10067	NC_008269	TCG	4	12	410604	410615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025220
10068	NC_008269	TGG	2	6	410638	410643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025220
10069	NC_008269	GCG	2	6	410836	410841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025220
10070	NC_008269	GGT	2	6	410943	410948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025220
10071	NC_008269	CGG	2	6	410998	411003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025220
10072	NC_008269	CTT	2	6	411047	411052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025220
10073	NC_008269	GGT	2	6	411097	411102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_008269	AGT	2	6	411106	411111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_008269	TCG	2	6	411122	411127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_008269	CCA	2	6	411302	411307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025221
10077	NC_008269	GTA	2	6	411330	411335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025221
10078	NC_008269	GTG	2	6	411382	411387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025221
10079	NC_008269	GCC	2	6	411454	411459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025221
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10081	NC_008269	CGT	2	6	411523	411528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10082	NC_008269	AGT	3	9	411557	411565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025221
10083	NC_008269	CG	3	6	411583	411588	0 %	0 %	50 %	50 %	111025221
10084	NC_008269	ACC	2	6	411605	411610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025221
10085	NC_008269	GAT	3	9	411687	411695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025221
10086	NC_008269	CGT	2	6	411731	411736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10087	NC_008269	TGGG	2	8	411787	411794	0 %	25 %	75 %	0 %	111025221
10088	NC_008269	TGT	2	6	411833	411838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025221
10089	NC_008269	CGC	2	6	411876	411881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025221
10090	NC_008269	GTC	2	6	411885	411890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10091	NC_008269	GAG	2	6	411891	411896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025221
10092	NC_008269	CGT	3	9	411932	411940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10093	NC_008269	CGA	2	6	411959	411964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025221
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10097	NC_008269	CCG	2	6	412066	412071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025221
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10099	NC_008269	GTC	2	6	412140	412145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10100	NC_008269	ATG	2	6	412153	412158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025221
10101	NC_008269	AGGAC	2	10	412202	412211	40 %	0 %	40 %	20 %	111025221
10102	NC_008269	GGT	2	6	412227	412232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025221
10103	NC_008269	CGG	2	6	412290	412295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025221
10104	NC_008269	TCG	2	6	412318	412323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10105	NC_008269	TGG	2	6	412349	412354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025221
10106	NC_008269	CGC	2	6	412361	412366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025221
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10108	NC_008269	GCA	2	6	412421	412426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025221
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10110	NC_008269	AC	3	6	412581	412586	50 %	0 %	0 %	50 %	111025221
10111	NC_008269	CTGT	2	8	412631	412638	0 %	50 %	25 %	25 %	111025221
10112	NC_008269	GCA	2	6	412649	412654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025221
10113	NC_008269	G	6	6	412762	412767	0 %	0 %	100 %	0 %	111025221
10114	NC_008269	CAG	2	6	412829	412834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025222
10115	NC_008269	ACG	2	6	412836	412841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025222
10116	NC_008269	GTG	2	6	413016	413021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025222
10117	NC_008269	CAG	2	6	413048	413053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025222
10118	NC_008269	CCG	2	6	413058	413063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025222
10119	NC_008269	GCG	2	6	413085	413090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025222
10120	NC_008269	GTG	2	6	413094	413099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025222
10121	NC_008269	GCC	2	6	413150	413155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025222
10122	NC_008269	AGG	2	6	413229	413234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025222
10123	NC_008269	CGGGAT	2	12	413237	413248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025222
10124	NC_008269	TGT	2	6	413293	413298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025222
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10133	NC_008269	CGT	2	6	413786	413791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025222
10134	NC_008269	GGT	2	6	413802	413807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025222
10135	NC_008269	GT	3	6	413806	413811	0 %	50 %	50 %	0 %	111025222
10136	NC_008269	TCGA	2	8	413848	413855	25 %	25 %	25 %	25 %	111025223
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10140	NC_008269	GTTG	2	8	414105	414112	0 %	50 %	50 %	0 %	111025223
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10145	NC_008269	GTG	2	6	414289	414294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025223
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10151	NC_008269	TCG	2	6	414620	414625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025223
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10157	NC_008269	TGCG	2	8	414968	414975	0 %	25 %	50 %	25 %	111025223
10158	NC_008269	TGG	2	6	414996	415001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025223
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10161	NC_008269	CGG	3	9	415376	415384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025224
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10211	NC_008269	AGG	3	9	417890	417898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10212	NC_008269	CCT	3	9	417920	417928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10213	NC_008269	CTCC	2	8	417980	417987	0 %	25 %	0 %	75 %	111025226
10214	NC_008269	ACGAGT	2	12	418052	418063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111025226
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10220	NC_008269	CAG	2	6	418344	418349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025226
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10238	NC_008269	AGC	2	6	419026	419031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025227
10239	NC_008269	CCA	2	6	419064	419069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025227
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10253	NC_008269	CGA	2	6	419938	419943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025228
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10268	NC_008269	CGG	2	6	420907	420912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10269	NC_008269	CAT	2	6	420976	420981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025229
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10353	NC_008269	CCGCC	2	10	424853	424862	0 %	0 %	20 %	80 %	161353733
10354	NC_008269	CGA	3	9	424985	424993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10355	NC_008269	CGG	2	6	425026	425031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10356	NC_008269	GC	3	6	425119	425124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10357	NC_008269	GAG	2	6	425126	425131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10358	NC_008269	CCGGA	2	10	425173	425182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10359	NC_008269	GGC	2	6	425240	425245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10360	NC_008269	CGA	2	6	425384	425389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025233
10361	NC_008269	CGA	2	6	425424	425429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025233
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10465	NC_008269	CGA	2	6	429951	429956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025240
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10479	NC_008269	CCG	2	6	430603	430608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025240
10480	NC_008269	CCG	2	6	430652	430657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025240
10481	NC_008269	CGC	2	6	430678	430683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025240
10482	NC_008269	GCC	2	6	430690	430695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025240
10483	NC_008269	TGGACC	2	12	430708	430719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025240
10484	NC_008269	TCGAGG	2	12	430778	430789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10485	NC_008269	GCC	3	9	430831	430839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025241
10486	NC_008269	CGG	2	6	430958	430963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025241
10487	NC_008269	CGA	2	6	430968	430973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025241
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10489	NC_008269	CGA	2	6	431004	431009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025241
10490	NC_008269	CGG	2	6	431025	431030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025241
10491	NC_008269	CG	3	6	431039	431044	0 %	0 %	50 %	50 %	111025241
10492	NC_008269	GCC	2	6	431050	431055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025241
10493	NC_008269	CGC	2	6	431065	431070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025241
10494	NC_008269	GAC	2	6	431071	431076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025241
10495	NC_008269	GCT	2	6	431085	431090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025241
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10497	NC_008269	CAGGC	2	10	431132	431141	20 %	0 %	40 %	40 %	111025241
10498	NC_008269	GCC	2	6	431175	431180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025241
10499	NC_008269	GAC	2	6	431217	431222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025241
10500	NC_008269	GCT	2	6	431231	431236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025241

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