MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008269	CGC	2	6	348101	348106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025151
8502	NC_008269	GC	3	6	348223	348228	0 %	0 %	50 %	50 %	111025151
8503	NC_008269	GCCG	2	8	348230	348237	0 %	0 %	50 %	50 %	111025151
8504	NC_008269	CCAC	2	8	348349	348356	25 %	0 %	0 %	75 %	111025152
8505	NC_008269	GCC	2	6	348468	348473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025152
8506	NC_008269	GCC	2	6	348499	348504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025152
8507	NC_008269	CGT	2	6	348520	348525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025152
8508	NC_008269	GGCA	2	8	348625	348632	25 %	0 %	50 %	25 %	111025152
8509	NC_008269	CGA	2	6	348656	348661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025152
8510	NC_008269	ACC	2	6	348724	348729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025152
8511	NC_008269	CGT	2	6	348758	348763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025152
8512	NC_008269	GCG	2	6	348787	348792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_008269	ACC	2	6	348797	348802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_008269	CAC	3	9	348857	348865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_008269	CCG	2	6	348883	348888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_008269	CCGG	2	8	348906	348913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8517	NC_008269	CGC	2	6	348947	348952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_008269	TG	3	6	348957	348962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_008269	CCGGC	2	10	348964	348973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8520	NC_008269	GGGC	2	8	348997	349004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_008269	CGC	3	9	349013	349021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_008269	CGC	2	6	349028	349033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_008269	CCG	3	9	349039	349047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_008269	CCA	2	6	349158	349163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_008269	CCG	2	6	349176	349181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_008269	CCG	2	6	349191	349196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_008269	CGC	2	6	349213	349218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_008269	CGA	2	6	349228	349233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_008269	CGA	2	6	349240	349245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_008269	CGA	2	6	349263	349268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_008269	GAG	2	6	349337	349342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_008269	CTG	3	9	349373	349381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_008269	CGG	2	6	349393	349398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_008269	CGG	2	6	349402	349407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_008269	CGC	3	9	349448	349456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_008269	GGCCGC	2	12	349457	349468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8537	NC_008269	CGG	2	6	349486	349491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_008269	G	6	6	349501	349506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_008269	GCC	2	6	349532	349537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025153
8540	NC_008269	GTCC	2	8	349582	349589	0 %	25 %	25 %	50 %	111025153
8541	NC_008269	TGC	2	6	349602	349607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025153
8542	NC_008269	GTC	2	6	349610	349615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025153
8543	NC_008269	CGA	2	6	349618	349623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025153
8544	NC_008269	CCCGG	2	10	349630	349639	0 %	0 %	40 %	60 %	111025153
8545	NC_008269	CCT	2	6	349654	349659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025153
8546	NC_008269	CGC	3	9	349675	349683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025153
8547	NC_008269	CCGC	2	8	349710	349717	0 %	0 %	25 %	75 %	111025153
8548	NC_008269	GCC	2	6	349773	349778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025153
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8550	NC_008269	CGC	2	6	349838	349843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025153
8551	NC_008269	CA	3	6	349864	349869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8552	NC_008269	CGG	2	6	349942	349947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_008269	CGGAC	2	10	350000	350009	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8554	NC_008269	CAC	2	6	350038	350043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8555	NC_008269	CGA	2	6	350097	350102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_008269	CCG	2	6	350155	350160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_008269	GAG	2	6	350162	350167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8560	NC_008269	AGC	2	6	350235	350240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_008269	ACC	2	6	350307	350312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_008269	ACGA	2	8	350321	350328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8563	NC_008269	GCC	2	6	350368	350373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_008269	CTG	2	6	350419	350424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025154
8565	NC_008269	GGGT	2	8	350436	350443	0 %	25 %	75 %	0 %	111025154
8566	NC_008269	TCG	2	6	350475	350480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025154
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8569	NC_008269	CGT	2	6	350553	350558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025154
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8573	NC_008269	ACCG	2	8	350734	350741	25 %	0 %	25 %	50 %	111025154
8574	NC_008269	GGTC	2	8	350902	350909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8575	NC_008269	CGC	2	6	350920	350925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8576	NC_008269	CA	3	6	350972	350977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8577	NC_008269	GATC	2	8	350983	350990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8578	NC_008269	CTAAG	2	10	351022	351031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8579	NC_008269	CGGT	2	8	351053	351060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8581	NC_008269	GCCC	2	8	351083	351090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8582	NC_008269	GCCG	2	8	351107	351114	0 %	0 %	50 %	50 %	111025155
8583	NC_008269	GGA	2	6	351116	351121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025155
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8588	NC_008269	GCA	2	6	351365	351370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025155
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8597	NC_008269	ACC	3	9	351615	351623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025155
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8599	NC_008269	GCA	2	6	351652	351657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025155
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8601	NC_008269	CCGA	2	8	351722	351729	25 %	0 %	25 %	50 %	111025156
8602	NC_008269	TCG	2	6	351735	351740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025156
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8607	NC_008269	CCGG	2	8	351963	351970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_008269	GGGT	2	8	351991	351998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_008269	CGG	2	6	352078	352083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_008269	CGA	2	6	352095	352100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_008269	CGG	2	6	352113	352118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_008269	CGC	2	6	352119	352124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8613	NC_008269	GCG	2	6	352160	352165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_008269	GTC	2	6	352199	352204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_008269	CCGCGG	2	12	352258	352269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_008269	CGGG	2	8	352272	352279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8617	NC_008269	GCGGG	7	35	352275	352309	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8618	NC_008269	CGG	2	6	352334	352339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_008269	ATCCG	2	10	352369	352378	20 %	20 %	20 %	40 %	111025157
8620	NC_008269	ACCCG	2	10	352385	352394	20 %	0 %	20 %	60 %	111025157
8621	NC_008269	GACGA	2	10	352407	352416	40 %	0 %	40 %	20 %	111025157
8622	NC_008269	CCCGA	2	10	352425	352434	20 %	0 %	20 %	60 %	111025157
8623	NC_008269	TGG	2	6	352449	352454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025157
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8625	NC_008269	GCACC	2	10	352494	352503	20 %	0 %	20 %	60 %	111025157
8626	NC_008269	CCG	2	6	352525	352530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025157
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8993	NC_008269	CTG	2	6	366704	366709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025174
8994	NC_008269	CGA	2	6	366718	366723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025174
8995	NC_008269	TGA	2	6	366819	366824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025174
8996	NC_008269	CTA	2	6	366874	366879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025174
8997	NC_008269	GCC	2	6	366925	366930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025175
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8999	NC_008269	TCG	2	6	366983	366988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025175
9000	NC_008269	GGCG	2	8	367014	367021	0 %	0 %	75 %	25 %	111025175

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