MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008269	GCC	2	6	188659	188664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024976
4502	NC_008269	GCC	2	6	188677	188682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024976
4503	NC_008269	AGG	2	6	188714	188719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024976
4504	NC_008269	CGG	2	6	188784	188789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024976
4505	NC_008269	CAA	2	6	188795	188800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024976
4506	NC_008269	GAC	2	6	188809	188814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4507	NC_008269	CA	3	6	188928	188933	50 %	0 %	0 %	50 %	111024976
4508	NC_008269	TCG	2	6	188963	188968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4509	NC_008269	CAC	2	6	188982	188987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024976
4510	NC_008269	TCC	2	6	189008	189013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024976
4511	NC_008269	CCT	2	6	189045	189050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024976
4512	NC_008269	GTG	2	6	189082	189087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024976
4513	NC_008269	CTT	2	6	189108	189113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024976
4514	NC_008269	CCT	2	6	189137	189142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024976
4515	NC_008269	CCA	2	6	189158	189163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024976
4516	NC_008269	GCC	2	6	189187	189192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024976
4517	NC_008269	GCG	2	6	189233	189238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024976
4518	NC_008269	GAG	2	6	189274	189279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024976
4519	NC_008269	GCT	2	6	189294	189299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4520	NC_008269	TCG	2	6	189350	189355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4521	NC_008269	CGA	3	9	189414	189422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4522	NC_008269	CGT	2	6	189474	189479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4523	NC_008269	TCG	2	6	189524	189529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4524	NC_008269	TGG	2	6	189587	189592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024976
4525	NC_008269	ATC	2	6	189610	189615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024976
4526	NC_008269	GA	3	6	189623	189628	50 %	0 %	50 %	0 %	111024976
4527	NC_008269	GAC	2	6	189706	189711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4528	NC_008269	TCG	2	6	189899	189904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024976
4529	NC_008269	CG	3	6	189913	189918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_008269	CGT	3	9	189934	189942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_008269	CTT	2	6	189969	189974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_008269	CGA	2	6	189991	189996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_008269	TCG	2	6	189997	190002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008269	TTC	2	6	190011	190016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008269	CAC	2	6	190028	190033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_008269	AGG	2	6	190046	190051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_008269	GCT	2	6	190133	190138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4538	NC_008269	CTGC	2	8	190139	190146	0 %	25 %	25 %	50 %	111024977
4539	NC_008269	TTC	2	6	190212	190217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024977
4540	NC_008269	ATC	2	6	190218	190223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024977
4541	NC_008269	GGCT	2	8	190227	190234	0 %	25 %	50 %	25 %	111024977
4542	NC_008269	CAC	2	6	190247	190252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024977
4543	NC_008269	GCT	2	6	190265	190270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4544	NC_008269	TGG	2	6	190284	190289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024977
4545	NC_008269	GAT	2	6	190295	190300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024977
4546	NC_008269	GTG	2	6	190326	190331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024977
4547	NC_008269	CGG	2	6	190469	190474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024977
4548	NC_008269	CCTC	2	8	190522	190529	0 %	25 %	0 %	75 %	111024977
4549	NC_008269	CAG	2	6	190554	190559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4550	NC_008269	CCG	3	9	190561	190569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024977
4551	NC_008269	CCT	2	6	190586	190591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024977
4552	NC_008269	TGC	2	6	190693	190698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4553	NC_008269	CGC	2	6	190724	190729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024977
4554	NC_008269	TGG	2	6	190779	190784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024977
4555	NC_008269	CAA	2	6	190856	190861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024977
4556	NC_008269	CG	3	6	190878	190883	0 %	0 %	50 %	50 %	111024977
4557	NC_008269	CTG	2	6	190908	190913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4558	NC_008269	GTC	2	6	190956	190961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4559	NC_008269	CAC	2	6	190991	190996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024977
4560	NC_008269	GTG	2	6	191004	191009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024977
4561	NC_008269	CGC	2	6	191018	191023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024977
4562	NC_008269	CTT	2	6	191132	191137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024977
4563	NC_008269	GTG	2	6	191184	191189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024977
4564	NC_008269	CCGAC	2	10	191234	191243	20 %	0 %	20 %	60 %	111024977
4565	NC_008269	CTG	2	6	191256	191261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4566	NC_008269	GTC	2	6	191288	191293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024977
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4569	NC_008269	TCA	2	6	191350	191355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024977
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4572	NC_008269	AGA	2	6	191425	191430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024977
4573	NC_008269	CCG	2	6	191431	191436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024977
4574	NC_008269	TGA	2	6	191479	191484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024977
4575	NC_008269	CGA	2	6	191495	191500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024977
4576	NC_008269	GAT	2	6	191531	191536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024977
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4579	NC_008269	TCA	2	6	191638	191643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024977
4580	NC_008269	CTA	2	6	191729	191734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024977
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4589	NC_008269	CTC	2	6	192073	192078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024978
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4593	NC_008269	GGT	2	6	192219	192224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024978
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4600	NC_008269	CGG	2	6	192453	192458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024978
4601	NC_008269	GTTCG	2	10	192483	192492	0 %	40 %	40 %	20 %	111024978
4602	NC_008269	GTC	2	6	192498	192503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024978
4603	NC_008269	CG	4	8	192555	192562	0 %	0 %	50 %	50 %	111024978
4604	NC_008269	CGG	2	6	192612	192617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024978
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4606	NC_008269	GGCC	2	8	192661	192668	0 %	0 %	50 %	50 %	111024978
4607	NC_008269	CGCC	2	8	192692	192699	0 %	0 %	25 %	75 %	111024978
4608	NC_008269	GGC	2	6	192805	192810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024978
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4612	NC_008269	GCA	2	6	192942	192947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024978
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4617	NC_008269	TCCG	2	8	193196	193203	0 %	25 %	25 %	50 %	111024978
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4622	NC_008269	CCGCG	2	10	193311	193320	0 %	0 %	40 %	60 %	111024978
4623	NC_008269	GA	3	6	193438	193443	50 %	0 %	50 %	0 %	111024979
4624	NC_008269	CCG	2	6	193468	193473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024979
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4626	NC_008269	CGA	2	6	193499	193504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024979
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4989	NC_008269	CGG	2	6	209745	209750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4990	NC_008269	CTCTTC	2	12	209819	209830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4991	NC_008269	CGC	2	6	209831	209836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4992	NC_008269	GCG	2	6	209841	209846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4993	NC_008269	CAC	2	6	209873	209878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4994	NC_008269	GCCA	2	8	209951	209958	25 %	0 %	25 %	50 %	111024993
4995	NC_008269	GTT	2	6	210067	210072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024993
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4998	NC_008269	ATC	2	6	210323	210328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024993
4999	NC_008269	GGC	2	6	210382	210387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024993
5000	NC_008269	GAT	2	6	210397	210402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024993

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