MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008268	GAC	2	6	154394	154399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4002	NC_008268	CGA	2	6	154451	154456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4003	NC_008268	GCG	2	6	154465	154470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4004	NC_008268	TCG	2	6	154492	154497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4005	NC_008268	CTG	2	6	154505	154510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4006	NC_008268	CGG	2	6	154519	154524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4007	NC_008268	GTC	2	6	154535	154540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4008	NC_008268	GTG	3	9	154590	154598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
4009	NC_008268	GCG	2	6	154614	154619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4010	NC_008268	CCG	2	6	154645	154650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4011	NC_008268	GCC	3	9	154676	154684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4012	NC_008268	CAG	2	6	154700	154705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4013	NC_008268	GAT	2	6	154709	154714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
4014	NC_008268	CCA	2	6	154744	154749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
4015	NC_008268	TCC	2	6	154836	154841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017163
4016	NC_008268	CGG	2	6	154924	154929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4017	NC_008268	CGG	2	6	154960	154965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4018	NC_008268	ACG	2	6	155092	155097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4019	NC_008268	TCCT	2	8	155132	155139	0 %	50 %	0 %	50 %	111017163
4020	NC_008268	CGG	2	6	155188	155193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4021	NC_008268	GTT	2	6	155231	155236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017163
4022	NC_008268	AGC	2	6	155247	155252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4023	NC_008268	GCG	2	6	155263	155268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4024	NC_008268	CGA	2	6	155302	155307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4025	NC_008268	TGG	2	6	155331	155336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
4026	NC_008268	GGACC	2	10	155354	155363	20 %	0 %	40 %	40 %	111017163
4027	NC_008268	GCC	2	6	155388	155393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4028	NC_008268	GCA	2	6	155410	155415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4029	NC_008268	GTC	2	6	155444	155449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4030	NC_008268	CGGC	2	8	155466	155473	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4031	NC_008268	CAG	2	6	155519	155524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4032	NC_008268	TGG	2	6	155557	155562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
4033	NC_008268	GC	3	6	155573	155578	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4034	NC_008268	CGC	2	6	155582	155587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4035	NC_008268	CCG	2	6	155605	155610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4036	NC_008268	CTG	2	6	155645	155650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4037	NC_008268	CGGT	2	8	155664	155671	0 %	25 %	50 %	25 %	111017163
4038	NC_008268	TCG	2	6	155757	155762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4039	NC_008268	CAG	2	6	155765	155770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4040	NC_008268	GCGG	2	8	155843	155850	0 %	0 %	75 %	25 %	111017163
4041	NC_008268	CAC	2	6	155915	155920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
4042	NC_008268	GTC	2	6	155936	155941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4043	NC_008268	CGA	2	6	156049	156054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4044	NC_008268	ACC	2	6	156090	156095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
4045	NC_008268	CGT	2	6	156109	156114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4046	NC_008268	CGTC	2	8	156157	156164	0 %	25 %	25 %	50 %	111017163
4047	NC_008268	GC	3	6	156171	156176	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4048	NC_008268	TGT	2	6	156223	156228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017163
4049	NC_008268	GCC	2	6	156231	156236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4050	NC_008268	GAC	2	6	156237	156242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4051	NC_008268	TCG	2	6	156397	156402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4052	NC_008268	GCG	2	6	156459	156464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4053	NC_008268	CCG	2	6	156489	156494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4054	NC_008268	GAA	2	6	156500	156505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017163
4055	NC_008268	GTC	2	6	156509	156514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4056	NC_008268	GTG	2	6	156543	156548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
4057	NC_008268	GT	3	6	156564	156569	0 %	50 %	50 %	0 %	111017163
4058	NC_008268	CGG	2	6	156584	156589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4059	NC_008268	GTC	2	6	156596	156601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4060	NC_008268	GCC	2	6	156633	156638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4061	NC_008268	ATG	2	6	156684	156689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
4062	NC_008268	TG	3	6	156703	156708	0 %	50 %	50 %	0 %	111017163
4063	NC_008268	GCA	2	6	156712	156717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4065	NC_008268	GCA	2	6	156772	156777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4068	NC_008268	GCG	2	6	156852	156857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4069	NC_008268	CG	3	6	156957	156962	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4070	NC_008268	CGA	2	6	157012	157017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4071	NC_008268	CGCT	2	8	157020	157027	0 %	25 %	25 %	50 %	111017163
4072	NC_008268	CGC	2	6	157144	157149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
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4074	NC_008268	ATG	2	6	157209	157214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
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4079	NC_008268	CAG	2	6	157469	157474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4085	NC_008268	GCCG	2	8	157768	157775	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4086	NC_008268	GAAC	2	8	157864	157871	50 %	0 %	25 %	25 %	111017163
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4092	NC_008268	GGC	2	6	158066	158071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
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4102	NC_008268	GCC	2	6	158687	158692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4103	NC_008268	CGA	2	6	158791	158796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4105	NC_008268	AGC	2	6	158847	158852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4106	NC_008268	CTC	2	6	158858	158863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017163
4107	NC_008268	GC	3	6	158877	158882	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
4108	NC_008268	CA	3	6	158886	158891	50 %	0 %	0 %	50 %	111017163
4109	NC_008268	TGC	2	6	158908	158913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4113	NC_008268	TGA	2	6	159055	159060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
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4118	NC_008268	TCG	2	6	159264	159269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4121	NC_008268	ACGGC	2	10	159337	159346	20 %	0 %	40 %	40 %	111017163
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4242	NC_008268	GCG	2	6	163788	163793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
4243	NC_008268	GCACCG	2	12	163795	163806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017163
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4361	NC_008268	CAG	2	6	168410	168415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4362	NC_008268	CCG	2	6	168432	168437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
4363	NC_008268	CCA	3	9	168454	168462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
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4365	NC_008268	GAC	3	9	168608	168616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4367	NC_008268	TGC	2	6	168720	168725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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4467	NC_008268	GCG	2	6	172411	172416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4468	NC_008268	CGC	2	6	172419	172424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4469	NC_008268	CTG	2	6	172540	172545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4470	NC_008268	CA	3	6	172570	172575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4471	NC_008268	GAA	2	6	172609	172614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_008268	GACC	2	8	172624	172631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4473	NC_008268	AGGT	2	8	172656	172663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4474	NC_008268	CTA	2	6	172682	172687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4475	NC_008268	TCT	2	6	172715	172720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4476	NC_008268	GGT	2	6	172798	172803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4477	NC_008268	CAC	2	6	172851	172856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4478	NC_008268	CAAAC	2	10	172861	172870	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4479	NC_008268	GCG	2	6	172886	172891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4480	NC_008268	GTC	2	6	172931	172936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4482	NC_008268	CGGC	2	8	172976	172983	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4483	NC_008268	GGTGC	2	10	172999	173008	0 %	20 %	60 %	20 %	111017166
4484	NC_008268	CGT	2	6	173030	173035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4485	NC_008268	GCGTC	2	10	173047	173056	0 %	20 %	40 %	40 %	111017166
4486	NC_008268	TCG	2	6	173067	173072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4487	NC_008268	CAG	2	6	173097	173102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4488	NC_008268	CGT	2	6	173125	173130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4489	NC_008268	GCG	2	6	173136	173141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4490	NC_008268	GAA	2	6	173144	173149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017166
4491	NC_008268	GCC	2	6	173250	173255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4492	NC_008268	CGA	2	6	173266	173271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4496	NC_008268	TCG	2	6	173325	173330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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