MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_008268	CAT	2	6	1242790	1242795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018179
31502	NC_008268	CCCAG	2	10	1243071	1243080	20 %	0 %	20 %	60 %	111018179
31503	NC_008268	CGGA	2	8	1243092	1243099	25 %	0 %	50 %	25 %	111018179
31504	NC_008268	CGA	2	6	1243110	1243115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018179
31505	NC_008268	CCGGG	2	10	1243128	1243137	0 %	0 %	60 %	40 %	111018179
31506	NC_008268	CTC	2	6	1243230	1243235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018180
31507	NC_008268	TTG	2	6	1243249	1243254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018180
31508	NC_008268	GAA	2	6	1243260	1243265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018180
31509	NC_008268	CCA	2	6	1243295	1243300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018180
31510	NC_008268	GC	3	6	1243325	1243330	0 %	0 %	50 %	50 %	111018180
31511	NC_008268	GGCGC	2	10	1243365	1243374	0 %	0 %	60 %	40 %	111018180
31512	NC_008268	CGT	2	6	1243397	1243402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018180
31513	NC_008268	CGG	2	6	1243413	1243418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018180
31514	NC_008268	GAG	2	6	1243458	1243463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018180
31515	NC_008268	CGACG	3	15	1243514	1243528	20 %	0 %	40 %	40 %	111018180
31516	NC_008268	GGAC	2	8	1243578	1243585	25 %	0 %	50 %	25 %	111018180
31517	NC_008268	CGG	2	6	1243595	1243600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018180
31518	NC_008268	TGGT	2	8	1243648	1243655	0 %	50 %	50 %	0 %	111018180
31519	NC_008268	GC	3	6	1243834	1243839	0 %	0 %	50 %	50 %	111018180
31520	NC_008268	CCT	2	6	1243859	1243864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018180
31521	NC_008268	GAC	2	6	1243866	1243871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018180
31522	NC_008268	TCA	2	6	1243883	1243888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018180
31523	NC_008268	CTG	2	6	1243935	1243940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018180
31524	NC_008268	GTG	2	6	1243956	1243961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018180
31525	NC_008268	CGG	2	6	1244011	1244016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018180
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31527	NC_008268	CGG	2	6	1244066	1244071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018180
31528	NC_008268	CGG	2	6	1244076	1244081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018180
31529	NC_008268	AGC	2	6	1244138	1244143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018180
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31531	NC_008268	GCA	2	6	1244180	1244185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018180
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31533	NC_008268	GCGG	2	8	1244244	1244251	0 %	0 %	75 %	25 %	111018180
31534	NC_008268	GCA	2	6	1244282	1244287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018180
31535	NC_008268	CTC	2	6	1244379	1244384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018180
31536	NC_008268	CGT	2	6	1244692	1244697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
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31538	NC_008268	ACG	2	6	1244721	1244726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31539	NC_008268	CGAG	2	8	1244752	1244759	25 %	0 %	50 %	25 %	111018181
31540	NC_008268	GTC	2	6	1244817	1244822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31541	NC_008268	ACG	3	9	1244826	1244834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31542	NC_008268	CGG	2	6	1244837	1244842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018181
31543	NC_008268	GCG	2	6	1244866	1244871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018181
31544	NC_008268	GCG	2	6	1244911	1244916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018181
31545	NC_008268	CGT	2	6	1244935	1244940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31546	NC_008268	GCC	2	6	1244952	1244957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018181
31547	NC_008268	CGA	2	6	1244983	1244988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31548	NC_008268	CG	3	6	1244990	1244995	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
31549	NC_008268	CGG	2	6	1245005	1245010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018181
31550	NC_008268	CGT	2	6	1245040	1245045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31551	NC_008268	CGT	2	6	1245064	1245069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31552	NC_008268	GC	3	6	1245072	1245077	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
31553	NC_008268	AGC	2	6	1245102	1245107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
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31555	NC_008268	CTG	2	6	1245182	1245187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31556	NC_008268	CG	3	6	1245220	1245225	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
31557	NC_008268	GGT	2	6	1245230	1245235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018181
31558	NC_008268	CGGC	2	8	1245238	1245245	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
31559	NC_008268	CGA	2	6	1245262	1245267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31560	NC_008268	GCT	2	6	1245322	1245327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
31561	NC_008268	GCC	2	6	1245372	1245377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018181
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31564	NC_008268	CGAGC	2	10	1245473	1245482	20 %	0 %	40 %	40 %	111018181
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31567	NC_008268	TCCG	2	8	1245642	1245649	0 %	25 %	25 %	50 %	111018181
31568	NC_008268	CG	3	6	1245648	1245653	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
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31584	NC_008268	CGTCC	2	10	1246114	1246123	0 %	20 %	20 %	60 %	111018181
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31588	NC_008268	CG	3	6	1246286	1246291	0 %	0 %	50 %	50 %	111018181
31589	NC_008268	TCA	2	6	1246333	1246338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018181
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31599	NC_008268	CGA	2	6	1246648	1246653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018182
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31601	NC_008268	CGT	2	6	1246675	1246680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018182
31602	NC_008268	GTG	2	6	1246703	1246708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018182
31603	NC_008268	AGG	2	6	1246779	1246784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018182
31604	NC_008268	GCG	2	6	1246812	1246817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018182
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31607	NC_008268	GGCA	2	8	1246852	1246859	25 %	0 %	50 %	25 %	111018182
31608	NC_008268	CTCG	2	8	1246903	1246910	0 %	25 %	25 %	50 %	111018182
31609	NC_008268	CGC	2	6	1246939	1246944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018182
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31611	NC_008268	CGT	2	6	1246996	1247001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018182
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31614	NC_008268	CGG	2	6	1247235	1247240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018182
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31616	NC_008268	GGC	2	6	1247356	1247361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018183
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31733	NC_008268	CGC	2	6	1251832	1251837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018189
31734	NC_008268	CGT	2	6	1251856	1251861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189
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31845	NC_008268	CGT	2	6	1256177	1256182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
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31848	NC_008268	CCGGTT	2	12	1256233	1256244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
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31950	NC_008268	GAT	2	6	1259866	1259871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018198
31951	NC_008268	GAT	2	6	1259893	1259898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018198
31952	NC_008268	CGT	2	6	1259932	1259937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018198
31953	NC_008268	GCA	2	6	1259938	1259943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018198
31954	NC_008268	GTGGG	2	10	1259978	1259987	0 %	20 %	80 %	0 %	111018198
31955	NC_008268	ACT	2	6	1260120	1260125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018198
31956	NC_008268	CGG	2	6	1260136	1260141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018198
31957	NC_008268	CGA	2	6	1260148	1260153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018198
31958	NC_008268	GC	3	6	1260163	1260168	0 %	0 %	50 %	50 %	111018198
31959	NC_008268	CTCC	2	8	1260190	1260197	0 %	25 %	0 %	75 %	111018198
31960	NC_008268	ACG	2	6	1260264	1260269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018198
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31962	NC_008268	GGCCGA	2	12	1260331	1260342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111018198
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31998	NC_008268	CCCA	2	8	1261918	1261925	25 %	0 %	0 %	75 %	111018201
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32000	NC_008268	CGCGT	2	10	1261993	1262002	0 %	20 %	40 %	40 %	111018201

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