MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_008268	GGC	2	6	1150804	1150809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018095
29003	NC_008268	GTC	2	6	1150840	1150845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018095
29004	NC_008268	GC	3	6	1150897	1150902	0 %	0 %	50 %	50 %	111018095
29005	NC_008268	GTC	2	6	1150936	1150941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018095
29006	NC_008268	CCTT	2	8	1150997	1151004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29007	NC_008268	GCG	2	6	1151008	1151013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29008	NC_008268	ACGC	2	8	1151120	1151127	25 %	0 %	25 %	50 %	111018096
29009	NC_008268	CG	3	6	1151214	1151219	0 %	0 %	50 %	50 %	111018096
29010	NC_008268	TCT	2	6	1151224	1151229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018096
29011	NC_008268	ATCG	2	8	1151261	1151268	25 %	25 %	25 %	25 %	111018096
29012	NC_008268	CGA	2	6	1151306	1151311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018096
29013	NC_008268	CCG	2	6	1151355	1151360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018096
29014	NC_008268	GCA	3	9	1151389	1151397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018096
29015	NC_008268	CGT	2	6	1151435	1151440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018096
29016	NC_008268	CG	3	6	1151444	1151449	0 %	0 %	50 %	50 %	111018096
29017	NC_008268	CGA	2	6	1151461	1151466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018096
29018	NC_008268	CGCT	2	8	1151469	1151476	0 %	25 %	25 %	50 %	111018096
29019	NC_008268	ATGG	2	8	1151486	1151493	25 %	25 %	50 %	0 %	111018096
29020	NC_008268	TTG	2	6	1151523	1151528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018096
29021	NC_008268	CACCG	2	10	1151553	1151562	20 %	0 %	20 %	60 %	111018096
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29024	NC_008268	CG	3	6	1151661	1151666	0 %	0 %	50 %	50 %	111018096
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29031	NC_008268	TCG	2	6	1151841	1151846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29032	NC_008268	ATCC	2	8	1151868	1151875	25 %	25 %	0 %	50 %	111018097
29033	NC_008268	CCG	2	6	1151882	1151887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018097
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29036	NC_008268	GGAA	2	8	1152058	1152065	50 %	0 %	50 %	0 %	111018097
29037	NC_008268	CGC	2	6	1152087	1152092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018097
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29039	NC_008268	CGATGC	2	12	1152194	1152205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111018097
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29041	NC_008268	CGG	2	6	1152230	1152235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018097
29042	NC_008268	TCG	3	9	1152250	1152258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018097
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29044	NC_008268	CGT	2	6	1152315	1152320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018097
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29054	NC_008268	GCG	2	6	1152676	1152681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018098
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29057	NC_008268	CG	3	6	1152776	1152781	0 %	0 %	50 %	50 %	111018098
29058	NC_008268	CCGG	2	8	1152823	1152830	0 %	0 %	50 %	50 %	111018098
29059	NC_008268	CGGG	2	8	1152831	1152838	0 %	0 %	75 %	25 %	111018098
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29084	NC_008268	TGCG	2	8	1153429	1153436	0 %	25 %	50 %	25 %	111018098
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29096	NC_008268	GC	3	6	1153935	1153940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29097	NC_008268	CACCG	2	10	1154005	1154014	20 %	0 %	20 %	60 %	111018099
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29101	NC_008268	AGC	2	6	1154134	1154139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018099
29102	NC_008268	GGC	2	6	1154200	1154205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018099
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29105	NC_008268	GCC	2	6	1154340	1154345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018099
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29107	NC_008268	ACG	2	6	1154362	1154367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018099
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29109	NC_008268	CG	4	8	1154420	1154427	0 %	0 %	50 %	50 %	111018099
29110	NC_008268	GCA	2	6	1154483	1154488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018099
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29112	NC_008268	CGC	2	6	1154544	1154549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018099
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29114	NC_008268	CGA	2	6	1154597	1154602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018099
29115	NC_008268	CCACGA	2	12	1154612	1154623	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111018099
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29117	NC_008268	GCC	2	6	1154666	1154671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29348	NC_008268	GCG	2	6	1162390	1162395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018105
29349	NC_008268	CCA	2	6	1162405	1162410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018105
29350	NC_008268	TCG	2	6	1162416	1162421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29351	NC_008268	ACC	2	6	1162439	1162444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018105
29352	NC_008268	CCG	2	6	1162450	1162455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018105
29353	NC_008268	GCG	2	6	1162488	1162493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018105
29354	NC_008268	TCGCG	2	10	1162495	1162504	0 %	20 %	40 %	40 %	111018105
29355	NC_008268	GAC	2	6	1162544	1162549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29356	NC_008268	GAGG	2	8	1162577	1162584	25 %	0 %	75 %	0 %	111018105
29357	NC_008268	CCGCGG	2	12	1162593	1162604	0 %	0 %	50 %	50 %	111018105
29358	NC_008268	GTCCGC	2	12	1162634	1162645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111018105
29359	NC_008268	GTT	2	6	1162676	1162681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018105
29360	NC_008268	CGA	2	6	1162699	1162704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29361	NC_008268	CGG	2	6	1162726	1162731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018105
29362	NC_008268	CCG	2	6	1162759	1162764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018105
29363	NC_008268	CGA	2	6	1162777	1162782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29364	NC_008268	GC	4	8	1162818	1162825	0 %	0 %	50 %	50 %	111018105
29365	NC_008268	CGG	2	6	1162849	1162854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018105
29366	NC_008268	GAC	2	6	1162922	1162927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29367	NC_008268	ACCG	2	8	1162940	1162947	25 %	0 %	25 %	50 %	111018105
29368	NC_008268	GC	3	6	1162949	1162954	0 %	0 %	50 %	50 %	111018105
29369	NC_008268	CCG	2	6	1162984	1162989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018105
29370	NC_008268	CGG	2	6	1163047	1163052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018105
29371	NC_008268	CGT	2	6	1163110	1163115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018105
29372	NC_008268	CGC	2	6	1163122	1163127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018105
29373	NC_008268	GCGA	2	8	1163144	1163151	25 %	0 %	50 %	25 %	111018105
29374	NC_008268	ATC	2	6	1163163	1163168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018105
29375	NC_008268	TCC	2	6	1163173	1163178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018106
29376	NC_008268	GTC	2	6	1163215	1163220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29377	NC_008268	GCCT	2	8	1163290	1163297	0 %	25 %	25 %	50 %	111018106
29378	NC_008268	GTC	2	6	1163437	1163442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29379	NC_008268	TGA	2	6	1163445	1163450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018106
29380	NC_008268	CAG	2	6	1163452	1163457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29381	NC_008268	CAC	2	6	1163463	1163468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018106
29382	NC_008268	CGC	2	6	1163514	1163519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018106
29383	NC_008268	GCGAC	2	10	1163537	1163546	20 %	0 %	40 %	40 %	111018106
29384	NC_008268	CGA	2	6	1163610	1163615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29385	NC_008268	CCCGG	2	10	1163652	1163661	0 %	0 %	40 %	60 %	111018106
29386	NC_008268	CG	3	6	1163694	1163699	0 %	0 %	50 %	50 %	111018106
29387	NC_008268	GCGA	2	8	1163732	1163739	25 %	0 %	50 %	25 %	111018106
29388	NC_008268	GTG	2	6	1163804	1163809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018106
29389	NC_008268	GTC	2	6	1163897	1163902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29390	NC_008268	CGT	2	6	1163952	1163957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29391	NC_008268	AGT	2	6	1164027	1164032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018106
29392	NC_008268	GGT	2	6	1164057	1164062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018106
29393	NC_008268	ACG	2	6	1164149	1164154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29394	NC_008268	GCG	2	6	1164201	1164206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018106
29395	NC_008268	GTC	2	6	1164215	1164220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29396	NC_008268	CGG	2	6	1164236	1164241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018106
29397	NC_008268	GTC	2	6	1164278	1164283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29398	NC_008268	CGG	2	6	1164291	1164296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018106
29399	NC_008268	CGA	2	6	1164309	1164314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29400	NC_008268	GTC	3	9	1164323	1164331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29401	NC_008268	TCT	2	6	1164366	1164371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018106
29402	NC_008268	GCCG	2	8	1164378	1164385	0 %	0 %	50 %	50 %	111018106
29403	NC_008268	CGC	2	6	1164414	1164419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018106
29404	NC_008268	GTC	2	6	1164424	1164429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29405	NC_008268	TCG	2	6	1164485	1164490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29406	NC_008268	CGG	2	6	1164525	1164530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018106
29407	NC_008268	GC	3	6	1164546	1164551	0 %	0 %	50 %	50 %	111018106
29408	NC_008268	CGA	2	6	1164585	1164590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018106
29409	NC_008268	CGG	2	6	1164633	1164638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018106
29410	NC_008268	GGGCG	2	10	1164708	1164717	0 %	0 %	80 %	20 %	111018106
29411	NC_008268	CTGT	2	8	1164722	1164729	0 %	50 %	25 %	25 %	111018106
29412	NC_008268	GCGG	2	8	1164756	1164763	0 %	0 %	75 %	25 %	111018106
29413	NC_008268	CTC	2	6	1164782	1164787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29414	NC_008268	GCA	2	6	1164958	1164963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29415	NC_008268	GCA	2	6	1165009	1165014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29416	NC_008268	TGT	2	6	1165027	1165032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018107
29417	NC_008268	GCG	2	6	1165039	1165044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018107
29418	NC_008268	CGG	2	6	1165045	1165050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018107
29419	NC_008268	GCC	2	6	1165055	1165060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018107
29420	NC_008268	CGA	2	6	1165102	1165107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29421	NC_008268	AGT	2	6	1165153	1165158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018107
29422	NC_008268	TCGAGT	2	12	1165159	1165170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111018107
29423	NC_008268	CTG	2	6	1165193	1165198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29424	NC_008268	CTGAT	2	10	1165218	1165227	20 %	40 %	20 %	20 %	111018107
29425	NC_008268	CGG	2	6	1165237	1165242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018107
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29427	NC_008268	TCG	2	6	1165344	1165349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29428	NC_008268	TCCG	2	8	1165362	1165369	0 %	25 %	25 %	50 %	111018107
29429	NC_008268	CGT	2	6	1165423	1165428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29430	NC_008268	GCA	2	6	1165459	1165464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29431	NC_008268	C	6	6	1165509	1165514	0 %	0 %	0 %	100 %	111018107
29432	NC_008268	TCC	2	6	1165617	1165622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018107
29433	NC_008268	CGA	2	6	1165658	1165663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29434	NC_008268	AC	3	6	1165726	1165731	50 %	0 %	0 %	50 %	111018107
29435	NC_008268	TTG	2	6	1165818	1165823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018107
29436	NC_008268	TTG	2	6	1165884	1165889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018107
29437	NC_008268	CCG	2	6	1165966	1165971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018107
29438	NC_008268	CTG	3	9	1166012	1166020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29439	NC_008268	GTA	2	6	1166024	1166029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018107
29440	NC_008268	CCG	2	6	1166074	1166079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018107
29441	NC_008268	CGA	2	6	1166221	1166226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29442	NC_008268	GGC	2	6	1166231	1166236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018107
29443	NC_008268	GC	3	6	1166333	1166338	0 %	0 %	50 %	50 %	111018107
29444	NC_008268	GTC	2	6	1166354	1166359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29445	NC_008268	GCG	2	6	1166394	1166399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018107
29446	NC_008268	CCT	2	6	1166482	1166487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018107
29447	NC_008268	TTCC	2	8	1166492	1166499	0 %	50 %	0 %	50 %	111018107
29448	NC_008268	CGGT	2	8	1166565	1166572	0 %	25 %	50 %	25 %	111018107
29449	NC_008268	GGT	3	9	1166603	1166611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018107
29450	NC_008268	CGC	2	6	1166621	1166626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018107
29451	NC_008268	GAC	2	6	1166770	1166775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018107
29452	NC_008268	CCG	2	6	1166804	1166809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018108
29453	NC_008268	GTC	2	6	1166822	1166827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018108
29454	NC_008268	GGT	2	6	1166833	1166838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018108
29455	NC_008268	GCG	2	6	1166901	1166906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018108
29456	NC_008268	GC	3	6	1166909	1166914	0 %	0 %	50 %	50 %	111018108
29457	NC_008268	CGT	3	9	1166923	1166931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018108
29458	NC_008268	TGGG	2	8	1166969	1166976	0 %	25 %	75 %	0 %	111018108
29459	NC_008268	GCG	2	6	1166994	1166999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018108
29460	NC_008268	CGA	2	6	1167033	1167038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018108
29461	NC_008268	GAC	2	6	1167061	1167066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018108
29462	NC_008268	TCC	2	6	1167113	1167118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018108
29463	NC_008268	GCC	2	6	1167164	1167169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018108
29464	NC_008268	TCC	2	6	1167173	1167178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018108
29465	NC_008268	GCGA	2	8	1167179	1167186	25 %	0 %	50 %	25 %	111018108
29466	NC_008268	GCGG	2	8	1167199	1167206	0 %	0 %	75 %	25 %	111018108
29467	NC_008268	CGG	2	6	1167228	1167233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018108
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29475	NC_008268	CCT	2	6	1167480	1167485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018109
29476	NC_008268	TTCT	2	8	1167491	1167498	0 %	75 %	0 %	25 %	111018109
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29480	NC_008268	ACG	2	6	1167703	1167708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018109
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29485	NC_008268	TGC	2	6	1167873	1167878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018109
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29487	NC_008268	CG	3	6	1167900	1167905	0 %	0 %	50 %	50 %	111018109
29488	NC_008268	CTC	2	6	1167945	1167950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018109
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29491	NC_008268	TCGA	2	8	1168057	1168064	25 %	25 %	25 %	25 %	111018109
29492	NC_008268	TCG	2	6	1168087	1168092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018109
29493	NC_008268	GAG	2	6	1168102	1168107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018109
29494	NC_008268	CGT	2	6	1168184	1168189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018109
29495	NC_008268	GCCG	2	8	1168232	1168239	0 %	0 %	50 %	50 %	111018109
29496	NC_008268	CCG	2	6	1168324	1168329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018109
29497	NC_008268	CAG	2	6	1168398	1168403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018109
29498	NC_008268	TCG	2	6	1168405	1168410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018109
29499	NC_008268	CCA	2	6	1168478	1168483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018109
29500	NC_008268	GTG	2	6	1168506	1168511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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