MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_008268	CGA	2	6	1131192	1131197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28503	NC_008268	GTGC	2	8	1131210	1131217	0 %	25 %	50 %	25 %	111018078
28504	NC_008268	CCG	2	6	1131251	1131256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018078
28505	NC_008268	ACCG	2	8	1131259	1131266	25 %	0 %	25 %	50 %	111018078
28506	NC_008268	CGG	2	6	1131312	1131317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018078
28507	NC_008268	TGCCC	2	10	1131324	1131333	0 %	20 %	20 %	60 %	111018078
28508	NC_008268	CGT	2	6	1131348	1131353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28509	NC_008268	TCG	2	6	1131369	1131374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28510	NC_008268	CCG	2	6	1131382	1131387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018078
28511	NC_008268	CGG	2	6	1131393	1131398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018078
28512	NC_008268	GCAGCG	2	12	1131404	1131415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111018078
28513	NC_008268	CGT	2	6	1131417	1131422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28514	NC_008268	CGA	2	6	1131447	1131452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28515	NC_008268	CGC	2	6	1131456	1131461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018078
28516	NC_008268	GC	3	6	1131465	1131470	0 %	0 %	50 %	50 %	111018078
28517	NC_008268	CAC	2	6	1131586	1131591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018078
28518	NC_008268	GCCG	2	8	1131592	1131599	0 %	0 %	50 %	50 %	111018078
28519	NC_008268	GAC	2	6	1131661	1131666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28520	NC_008268	CGA	2	6	1131709	1131714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018078
28521	NC_008268	GCTC	2	8	1131720	1131727	0 %	25 %	25 %	50 %	111018078
28522	NC_008268	CG	3	6	1131892	1131897	0 %	0 %	50 %	50 %	111018079
28523	NC_008268	TCA	2	6	1131973	1131978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018079
28524	NC_008268	CAACGC	2	12	1131989	1132000	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111018079
28525	NC_008268	GCCC	2	8	1132015	1132022	0 %	0 %	25 %	75 %	111018079
28526	NC_008268	CGA	2	6	1132069	1132074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28527	NC_008268	CGT	2	6	1132084	1132089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28528	NC_008268	CGG	2	6	1132140	1132145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018079
28529	NC_008268	CCG	2	6	1132171	1132176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28530	NC_008268	CCA	2	6	1132222	1132227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018079
28531	NC_008268	CAG	2	6	1132319	1132324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28532	NC_008268	CCG	2	6	1132335	1132340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28533	NC_008268	ACC	2	6	1132356	1132361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018079
28534	NC_008268	TGCC	2	8	1132362	1132369	0 %	25 %	25 %	50 %	111018079
28535	NC_008268	GC	3	6	1132372	1132377	0 %	0 %	50 %	50 %	111018079
28536	NC_008268	CCG	2	6	1132445	1132450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28537	NC_008268	GC	3	6	1132472	1132477	0 %	0 %	50 %	50 %	111018079
28538	NC_008268	GTCG	2	8	1132502	1132509	0 %	25 %	50 %	25 %	111018079
28539	NC_008268	CGT	3	9	1132519	1132527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28540	NC_008268	GTC	2	6	1132535	1132540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28541	NC_008268	CGC	2	6	1132550	1132555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28542	NC_008268	GCT	2	6	1132579	1132584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28543	NC_008268	ACC	2	6	1132608	1132613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018079
28544	NC_008268	TCA	2	6	1132618	1132623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018079
28545	NC_008268	CCG	2	6	1132673	1132678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28546	NC_008268	CGTT	2	8	1132738	1132745	0 %	50 %	25 %	25 %	111018079
28547	NC_008268	CGA	2	6	1132831	1132836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28548	NC_008268	GCA	3	9	1132837	1132845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28549	NC_008268	CGT	2	6	1132864	1132869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28550	NC_008268	GCC	2	6	1132872	1132877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28551	NC_008268	CAG	2	6	1132886	1132891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28552	NC_008268	CTC	2	6	1132994	1132999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018079
28553	NC_008268	GC	3	6	1133000	1133005	0 %	0 %	50 %	50 %	111018079
28554	NC_008268	CGC	2	6	1133045	1133050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018079
28555	NC_008268	CCTTC	2	10	1133131	1133140	0 %	40 %	0 %	60 %	111018079
28556	NC_008268	TGA	2	6	1133173	1133178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018079
28557	NC_008268	CGA	2	6	1133278	1133283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28558	NC_008268	GGGT	2	8	1133295	1133302	0 %	25 %	75 %	0 %	111018079
28559	NC_008268	AAG	2	6	1133310	1133315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018079
28560	NC_008268	GCTC	2	8	1133329	1133336	0 %	25 %	25 %	50 %	111018079
28561	NC_008268	GC	3	6	1133365	1133370	0 %	0 %	50 %	50 %	111018079
28562	NC_008268	CGT	2	6	1133383	1133388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018079
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28564	NC_008268	CGG	2	6	1133485	1133490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018079
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28569	NC_008268	CGA	2	6	1133560	1133565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018079
28570	NC_008268	TCT	3	9	1133755	1133763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018080
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28572	NC_008268	TCG	2	6	1133820	1133825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28573	NC_008268	CCA	2	6	1133842	1133847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018080
28574	NC_008268	GTA	2	6	1133903	1133908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018080
28575	NC_008268	GCC	2	6	1133930	1133935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018080
28576	NC_008268	CGA	2	6	1133944	1133949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28577	NC_008268	CGT	2	6	1133962	1133967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018080
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28579	NC_008268	CAG	2	6	1134026	1134031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28580	NC_008268	GAC	2	6	1134032	1134037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28581	NC_008268	GCC	2	6	1134044	1134049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018080
28582	NC_008268	CGT	2	6	1134053	1134058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28583	NC_008268	CTG	2	6	1134100	1134105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018080
28584	NC_008268	GGAC	2	8	1134113	1134120	25 %	0 %	50 %	25 %	111018080
28585	NC_008268	CCG	2	6	1134191	1134196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28586	NC_008268	GAA	2	6	1134212	1134217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28587	NC_008268	GAC	2	6	1134322	1134327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018081
28588	NC_008268	AC	3	6	1134326	1134331	50 %	0 %	0 %	50 %	111018081
28589	NC_008268	CGC	2	6	1134356	1134361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018081
28590	NC_008268	CCCG	2	8	1134368	1134375	0 %	0 %	25 %	75 %	111018081
28591	NC_008268	ACT	2	6	1134436	1134441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018081
28592	NC_008268	TCG	2	6	1134459	1134464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018081
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28595	NC_008268	CGC	2	6	1134543	1134548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018081
28596	NC_008268	CA	3	6	1134561	1134566	50 %	0 %	0 %	50 %	111018082
28597	NC_008268	AGC	2	6	1134585	1134590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28598	NC_008268	CGA	2	6	1134614	1134619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28599	NC_008268	CGT	2	6	1134637	1134642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28600	NC_008268	GCC	2	6	1134668	1134673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018082
28601	NC_008268	GCACGT	2	12	1134682	1134693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28602	NC_008268	CCG	2	6	1134799	1134804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018082
28603	NC_008268	GTC	2	6	1134848	1134853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28604	NC_008268	CG	3	6	1134865	1134870	0 %	0 %	50 %	50 %	111018082
28605	NC_008268	ACG	2	6	1134882	1134887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28606	NC_008268	TCC	2	6	1134891	1134896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018082
28607	NC_008268	CATC	2	8	1134901	1134908	25 %	25 %	0 %	50 %	111018082
28608	NC_008268	GAA	2	6	1134932	1134937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018082
28609	NC_008268	CCG	2	6	1134951	1134956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018082
28610	NC_008268	TTG	2	6	1134999	1135004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018082
28611	NC_008268	TCC	2	6	1135006	1135011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018082
28612	NC_008268	GCC	2	6	1135031	1135036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018082
28613	NC_008268	CTC	2	6	1135199	1135204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018082
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28615	NC_008268	TCG	2	6	1135242	1135247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28616	NC_008268	CGT	2	6	1135249	1135254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018082
28617	NC_008268	CTT	2	6	1135292	1135297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018082
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28623	NC_008268	GC	3	6	1135475	1135480	0 %	0 %	50 %	50 %	111018082
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28960	NC_008268	GCT	2	6	1149131	1149136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28961	NC_008268	TCG	2	6	1149143	1149148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28962	NC_008268	CTT	2	6	1149165	1149170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018093
28963	NC_008268	GGCG	2	8	1149269	1149276	0 %	0 %	75 %	25 %	111018093
28964	NC_008268	ATC	2	6	1149283	1149288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018093
28965	NC_008268	GCT	2	6	1149320	1149325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018093
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28967	NC_008268	AGC	2	6	1149349	1149354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28968	NC_008268	GGC	2	6	1149423	1149428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018093
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28970	NC_008268	GCG	2	6	1149475	1149480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018093
28971	NC_008268	GCT	2	6	1149509	1149514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28972	NC_008268	CGA	2	6	1149515	1149520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28973	NC_008268	TGC	2	6	1149555	1149560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018093
28974	NC_008268	CTT	2	6	1149579	1149584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018093
28975	NC_008268	CGA	2	6	1149668	1149673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018093
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28977	NC_008268	AGCA	2	8	1149807	1149814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28978	NC_008268	ATG	2	6	1149949	1149954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018094
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28982	NC_008268	ACG	2	6	1150060	1150065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018094
28983	NC_008268	AGC	2	6	1150129	1150134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018094
28984	NC_008268	GCC	2	6	1150248	1150253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28985	NC_008268	CGT	2	6	1150262	1150267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28986	NC_008268	GCG	2	6	1150345	1150350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018095
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28988	NC_008268	CGG	2	6	1150446	1150451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018095
28989	NC_008268	CGA	2	6	1150458	1150463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018095
28990	NC_008268	CGA	2	6	1150491	1150496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018095
28991	NC_008268	ATG	2	6	1150502	1150507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018095
28992	NC_008268	GTG	2	6	1150574	1150579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018095
28993	NC_008268	TCG	2	6	1150601	1150606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018095
28994	NC_008268	CGA	2	6	1150619	1150624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018095
28995	NC_008268	GC	3	6	1150659	1150664	0 %	0 %	50 %	50 %	111018095
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28998	NC_008268	CGT	2	6	1150752	1150757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018095
28999	NC_008268	GTC	3	9	1150768	1150776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018095
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