MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27117	NC_008268	CGC	2	6	1079263	1079268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018024
27118	NC_008268	TCA	2	6	1079296	1079301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018024
27119	NC_008268	GCC	2	6	1079315	1079320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018024
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27121	NC_008268	CGA	3	9	1079416	1079424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018024
27122	NC_008268	CGA	2	6	1079428	1079433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018024
27123	NC_008268	TGA	2	6	1079434	1079439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018024
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27130	NC_008268	CGA	2	6	1079755	1079760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018025
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27132	NC_008268	GCT	2	6	1079815	1079820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018025
27133	NC_008268	GA	3	6	1079837	1079842	50 %	0 %	50 %	0 %	111018025
27134	NC_008268	CGA	2	6	1079854	1079859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018025
27135	NC_008268	AGGCCG	2	12	1079951	1079962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111018025
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27137	NC_008268	TCA	2	6	1080027	1080032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018025
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27144	NC_008268	CCGG	2	8	1080245	1080252	0 %	0 %	50 %	50 %	111018025
27145	NC_008268	CGA	2	6	1080261	1080266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018025
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27152	NC_008268	TGA	2	6	1080446	1080451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018026
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27174	NC_008268	GTTC	2	8	1081436	1081443	0 %	50 %	25 %	25 %	111018026
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27179	NC_008268	TCC	2	6	1081548	1081553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018026
27180	NC_008268	CGT	2	6	1081569	1081574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018026
27181	NC_008268	GCC	2	6	1081679	1081684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27182	NC_008268	CCG	2	6	1081698	1081703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27183	NC_008268	CAGCGT	2	12	1081707	1081718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111018027
27184	NC_008268	CAG	2	6	1081844	1081849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018027
27185	NC_008268	TGA	2	6	1081885	1081890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018027
27186	NC_008268	TCGG	2	8	1081893	1081900	0 %	25 %	50 %	25 %	111018027
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27198	NC_008268	CG	3	6	1082348	1082353	0 %	0 %	50 %	50 %	111018027
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27202	NC_008268	GCG	2	6	1082445	1082450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018027
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27204	NC_008268	GC	3	6	1082484	1082489	0 %	0 %	50 %	50 %	111018027
27205	NC_008268	TCGAG	2	10	1082503	1082512	20 %	20 %	40 %	20 %	111018027
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27210	NC_008268	CGC	2	6	1082764	1082769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018028
27211	NC_008268	CGC	2	6	1082774	1082779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018028
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27214	NC_008268	CGG	2	6	1082847	1082852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018028
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27219	NC_008268	TCG	3	9	1082957	1082965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018028
27220	NC_008268	CCG	2	6	1082991	1082996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018028
27221	NC_008268	CGA	2	6	1083024	1083029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018028
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27223	NC_008268	GCG	2	6	1083074	1083079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018028
27224	NC_008268	GCC	3	9	1083116	1083124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018028
27225	NC_008268	GCC	2	6	1083130	1083135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018028
27226	NC_008268	CTC	2	6	1083154	1083159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018028
27227	NC_008268	GGA	2	6	1083172	1083177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018028
27228	NC_008268	CCAC	2	8	1083186	1083193	25 %	0 %	0 %	75 %	111018028
27229	NC_008268	GCG	2	6	1083224	1083229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018028
27230	NC_008268	AGC	3	9	1083236	1083244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018028
27231	NC_008268	ATC	2	6	1083251	1083256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018028
27232	NC_008268	TCAC	2	8	1083305	1083312	25 %	25 %	0 %	50 %	111018029
27233	NC_008268	GCC	2	6	1083346	1083351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018029
27234	NC_008268	CGA	2	6	1083422	1083427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27235	NC_008268	GAT	2	6	1083525	1083530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018029
27236	NC_008268	GCC	2	6	1083531	1083536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018029
27237	NC_008268	CCG	2	6	1083614	1083619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018029
27238	NC_008268	TCG	2	6	1083817	1083822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27239	NC_008268	TCC	3	9	1083850	1083858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018029
27240	NC_008268	GTG	2	6	1083898	1083903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018029
27241	NC_008268	CGA	2	6	1083947	1083952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27242	NC_008268	TCGCCG	2	12	1083967	1083978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111018029
27243	NC_008268	GC	3	6	1084021	1084026	0 %	0 %	50 %	50 %	111018029
27244	NC_008268	CAC	2	6	1084086	1084091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018029
27245	NC_008268	CGCC	2	8	1084103	1084110	0 %	0 %	25 %	75 %	111018029
27246	NC_008268	GGT	2	6	1084155	1084160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018029
27247	NC_008268	GGGC	2	8	1084181	1084188	0 %	0 %	75 %	25 %	111018029
27248	NC_008268	GAC	2	6	1084210	1084215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27249	NC_008268	GCGT	2	8	1084231	1084238	0 %	25 %	50 %	25 %	111018029
27250	NC_008268	TCG	2	6	1084276	1084281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27251	NC_008268	TCG	2	6	1084288	1084293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27252	NC_008268	GTG	2	6	1084341	1084346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018029
27253	NC_008268	TCG	2	6	1084402	1084407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27254	NC_008268	GTG	2	6	1084408	1084413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018029
27255	NC_008268	CGT	2	6	1084445	1084450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
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27258	NC_008268	GATCG	2	10	1084542	1084551	20 %	20 %	40 %	20 %	111018029
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27260	NC_008268	CGCC	2	8	1084565	1084572	0 %	0 %	25 %	75 %	111018029
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27262	NC_008268	CGA	2	6	1084604	1084609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018029
27263	NC_008268	GCG	2	6	1084618	1084623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018029
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27266	NC_008268	ACC	2	6	1084774	1084779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018029
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27268	NC_008268	CG	3	6	1084811	1084816	0 %	0 %	50 %	50 %	111018029
27269	NC_008268	AGTCG	2	10	1084821	1084830	20 %	20 %	40 %	20 %	111018029
27270	NC_008268	CGT	2	6	1084835	1084840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018029
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27272	NC_008268	GTG	2	6	1084876	1084881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018029
27273	NC_008268	CAT	2	6	1084902	1084907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27274	NC_008268	TCG	2	6	1084919	1084924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27275	NC_008268	TGCG	2	8	1084929	1084936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27276	NC_008268	CG	3	6	1085008	1085013	0 %	0 %	50 %	50 %	111018030
27277	NC_008268	CCT	2	6	1085026	1085031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018030
27278	NC_008268	TTC	2	6	1085054	1085059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018030
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27281	NC_008268	GCT	2	6	1085218	1085223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018030
27282	NC_008268	CCG	2	6	1085263	1085268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018030
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27284	NC_008268	CGAG	2	8	1085349	1085356	25 %	0 %	50 %	25 %	111018030
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27289	NC_008268	GCG	2	6	1085597	1085602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018031
27290	NC_008268	CGA	2	6	1085632	1085637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018031
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27292	NC_008268	CGA	2	6	1085709	1085714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018031
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27294	NC_008268	TCG	2	6	1085891	1085896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018031
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27297	NC_008268	GGA	2	6	1086352	1086357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27298	NC_008268	CAC	2	6	1086358	1086363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27299	NC_008268	TGA	2	6	1086364	1086369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018032
27300	NC_008268	ACG	2	6	1086376	1086381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018032
27301	NC_008268	AGC	2	6	1086424	1086429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018032
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27315	NC_008268	TCG	2	6	1087002	1087007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018033
27316	NC_008268	CG	3	6	1087006	1087011	0 %	0 %	50 %	50 %	111018033
27317	NC_008268	CTGA	2	8	1087039	1087046	25 %	25 %	25 %	25 %	111018033
27318	NC_008268	CGT	2	6	1087127	1087132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27319	NC_008268	GAA	2	6	1087153	1087158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018034
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27321	NC_008268	CGC	2	6	1087196	1087201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018034
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27326	NC_008268	AGT	2	6	1087321	1087326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018034
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27329	NC_008268	CCA	2	6	1087381	1087386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018034
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27331	NC_008268	CTT	2	6	1087513	1087518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018035
27332	NC_008268	GGC	2	6	1087558	1087563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018035
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27334	NC_008268	ATC	2	6	1087670	1087675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018035
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27337	NC_008268	CGAC	2	8	1087863	1087870	25 %	0 %	25 %	50 %	111018035
27338	NC_008268	CGGGC	2	10	1087920	1087929	0 %	0 %	60 %	40 %	111018035
27339	NC_008268	CGG	2	6	1087935	1087940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018035
27340	NC_008268	GC	3	6	1087967	1087972	0 %	0 %	50 %	50 %	111018035
27341	NC_008268	AGC	2	6	1087973	1087978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018035
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27343	NC_008268	CCG	2	6	1088040	1088045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018035
27344	NC_008268	CAC	2	6	1088053	1088058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018035
27345	NC_008268	TCG	2	6	1088114	1088119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018035
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27347	NC_008268	CAGC	2	8	1088142	1088149	25 %	0 %	25 %	50 %	111018035
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27462	NC_008268	CGA	2	6	1092620	1092625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018042
27463	NC_008268	TGG	2	6	1092671	1092676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018042
27464	NC_008268	CGGT	2	8	1092697	1092704	0 %	25 %	50 %	25 %	111018042
27465	NC_008268	GGC	2	6	1092737	1092742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018043
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27468	NC_008268	GC	3	6	1092798	1092803	0 %	0 %	50 %	50 %	111018043
27469	NC_008268	GTC	2	6	1092935	1092940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018043
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27473	NC_008268	AGC	2	6	1093074	1093079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018043
27474	NC_008268	GCGAAC	2	12	1093128	1093139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018043
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27483	NC_008268	CTCGGT	2	12	1093418	1093429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018043
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27485	NC_008268	ACG	2	6	1093459	1093464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018043
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27489	NC_008268	GCC	2	6	1093542	1093547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018043
27490	NC_008268	CG	3	6	1093653	1093658	0 %	0 %	50 %	50 %	111018043
27491	NC_008268	CGT	2	6	1093681	1093686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018043
27492	NC_008268	CGA	2	6	1093687	1093692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018043
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