MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008268	CGT	2	6	762828	762833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017727
19003	NC_008268	GAA	2	6	762838	762843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017727
19004	NC_008268	CGA	2	6	762924	762929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017727
19005	NC_008268	CGA	2	6	762946	762951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017727
19006	NC_008268	CGGTG	2	10	762994	763003	0 %	20 %	60 %	20 %	111017727
19007	NC_008268	GTT	2	6	763069	763074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017727
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19009	NC_008268	CGA	2	6	763174	763179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017727
19010	NC_008268	GA	3	6	763197	763202	50 %	0 %	50 %	0 %	111017727
19011	NC_008268	GGT	2	6	763216	763221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017727
19012	NC_008268	AGCC	2	8	763268	763275	25 %	0 %	25 %	50 %	111017727
19013	NC_008268	GAG	2	6	763301	763306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017727
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19015	NC_008268	GAG	2	6	763331	763336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017727
19016	NC_008268	GAG	2	6	763358	763363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017727
19017	NC_008268	GGA	2	6	763366	763371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017727
19018	NC_008268	GAG	2	6	763391	763396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017727
19019	NC_008268	GACGAG	2	12	763421	763432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111017727
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19026	NC_008268	CGAGG	2	10	763626	763635	20 %	0 %	60 %	20 %	111017727
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19109	NC_008268	CG	3	6	766654	766659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19111	NC_008268	C	6	6	766685	766690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19112	NC_008268	GACA	2	8	766767	766774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19113	NC_008268	CGATCT	2	12	766876	766887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19117	NC_008268	CA	3	6	766971	766976	50 %	0 %	0 %	50 %	111017735
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19242	NC_008268	TGA	2	6	772267	772272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017745
19243	NC_008268	GCC	2	6	772280	772285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017745
19244	NC_008268	GTC	2	6	772313	772318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
19245	NC_008268	CGG	2	6	772351	772356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017745
19246	NC_008268	AGT	2	6	772438	772443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017745
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19252	NC_008268	ATC	2	6	772566	772571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017745
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19254	NC_008268	CGCTTG	2	12	772602	772613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
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19265	NC_008268	CGG	2	6	772915	772920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017745
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19276	NC_008268	TCG	2	6	773256	773261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
19277	NC_008268	CGG	2	6	773268	773273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017745
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19292	NC_008268	GTC	2	6	774002	774007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
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19300	NC_008268	TCG	2	6	774225	774230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
19301	NC_008268	GCCGC	2	10	774317	774326	0 %	0 %	40 %	60 %	111017745
19302	NC_008268	CTT	2	6	774394	774399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017745
19303	NC_008268	GTC	2	6	774413	774418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017745
19304	NC_008268	CGGG	2	8	774434	774441	0 %	0 %	75 %	25 %	111017745
19305	NC_008268	TGG	2	6	774448	774453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017745
19306	NC_008268	CGG	2	6	774490	774495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19307	NC_008268	CGA	2	6	774528	774533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017746
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19331	NC_008268	GTC	2	6	775412	775417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017747
19332	NC_008268	CTG	2	6	775494	775499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017747
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19334	NC_008268	CAG	2	6	775550	775555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017747
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19336	NC_008268	TCG	2	6	775693	775698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017747
19337	NC_008268	CCTT	2	8	775773	775780	0 %	50 %	0 %	50 %	111017747
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19341	NC_008268	GGT	2	6	775884	775889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017748
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19347	NC_008268	GTCG	2	8	776041	776048	0 %	25 %	50 %	25 %	111017748
19348	NC_008268	TCC	2	6	776127	776132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017748
19349	NC_008268	GC	3	6	776140	776145	0 %	0 %	50 %	50 %	111017748
19350	NC_008268	GAC	2	6	776165	776170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017748
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19353	NC_008268	CGG	3	9	776335	776343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017748
19354	NC_008268	CGA	2	6	776359	776364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017748
19355	NC_008268	GGTT	2	8	776413	776420	0 %	50 %	50 %	0 %	111017748
19356	NC_008268	CGT	3	9	776482	776490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017748
19357	NC_008268	CCT	3	9	776518	776526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017748
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19481	NC_008268	CGG	2	6	781303	781308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017753
19482	NC_008268	TCG	2	6	781346	781351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017753
19483	NC_008268	CG	5	10	781432	781441	0 %	0 %	50 %	50 %	111017753
19484	NC_008268	TGC	2	6	781473	781478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017753
19485	NC_008268	ACTC	2	8	781524	781531	25 %	25 %	0 %	50 %	111017753
19486	NC_008268	ACTG	2	8	781532	781539	25 %	25 %	25 %	25 %	111017753
19487	NC_008268	CGAC	2	8	781651	781658	25 %	0 %	25 %	50 %	111017753
19488	NC_008268	TCGC	2	8	781728	781735	0 %	25 %	25 %	50 %	111017753
19489	NC_008268	CGA	2	6	781795	781800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017753
19490	NC_008268	TCAC	2	8	781858	781865	25 %	25 %	0 %	50 %	111017753
19491	NC_008268	TCG	2	6	781866	781871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017753
19492	NC_008268	ATC	2	6	782057	782062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017753
19493	NC_008268	CG	3	6	782075	782080	0 %	0 %	50 %	50 %	111017753
19494	NC_008268	CG	3	6	782130	782135	0 %	0 %	50 %	50 %	111017753
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19497	NC_008268	GAC	2	6	782189	782194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017753
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19500	NC_008268	CGT	2	6	782309	782314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017753

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