MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_008268	GTG	2	6	662645	662650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017608
16503	NC_008268	CGC	2	6	662761	662766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017608
16504	NC_008268	TCA	2	6	662775	662780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017608
16505	NC_008268	ACG	2	6	662796	662801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16506	NC_008268	TCG	2	6	662805	662810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16507	NC_008268	CGC	2	6	662853	662858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017608
16508	NC_008268	GTC	2	6	662860	662865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16509	NC_008268	CGC	3	9	662869	662877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017608
16510	NC_008268	GCA	2	6	662899	662904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16511	NC_008268	CTT	2	6	662956	662961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017608
16512	NC_008268	CCG	2	6	662967	662972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017608
16513	NC_008268	GGA	2	6	663010	663015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017608
16514	NC_008268	CGA	2	6	663033	663038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16515	NC_008268	CAC	2	6	663115	663120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017608
16516	NC_008268	CGG	2	6	663214	663219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017608
16517	NC_008268	CGA	2	6	663265	663270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017608
16518	NC_008268	CGA	2	6	663307	663312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_008268	CACC	2	8	663396	663403	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16520	NC_008268	CAGA	2	8	663430	663437	50 %	0 %	25 %	25 %	111017609
16521	NC_008268	CTGGCC	2	12	663465	663476	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017609
16522	NC_008268	TCG	2	6	663502	663507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017609
16523	NC_008268	AGT	2	6	663539	663544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017609
16524	NC_008268	CGT	2	6	663566	663571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017609
16525	NC_008268	GAA	2	6	663719	663724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_008268	CGC	2	6	663872	663877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017610
16527	NC_008268	TCC	2	6	663901	663906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017610
16528	NC_008268	C	7	7	663947	663953	0 %	0 %	0 %	100 %	111017610
16529	NC_008268	CGT	2	6	663974	663979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017610
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16531	NC_008268	CGT	2	6	664029	664034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017610
16532	NC_008268	ACG	2	6	664042	664047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017610
16533	NC_008268	CGA	2	6	664079	664084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017610
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16535	NC_008268	CGG	2	6	664130	664135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017610
16536	NC_008268	TCG	2	6	664159	664164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017610
16537	NC_008268	CGA	2	6	664256	664261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017611
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16539	NC_008268	GATT	2	8	664308	664315	25 %	50 %	25 %	0 %	111017611
16540	NC_008268	CGC	3	9	664321	664329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017611
16541	NC_008268	GCT	2	6	664375	664380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017611
16542	NC_008268	GCA	2	6	664384	664389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017611
16543	NC_008268	CGA	2	6	664502	664507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017611
16544	NC_008268	ATCG	2	8	664538	664545	25 %	25 %	25 %	25 %	111017611
16545	NC_008268	CTG	2	6	664591	664596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017611
16546	NC_008268	TCG	2	6	664601	664606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017611
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16548	NC_008268	CG	3	6	664743	664748	0 %	0 %	50 %	50 %	111017612
16549	NC_008268	ACA	2	6	664770	664775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017612
16550	NC_008268	GAC	2	6	664794	664799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017612
16551	NC_008268	CGC	2	6	664833	664838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017612
16552	NC_008268	ACC	2	6	664868	664873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017612
16553	NC_008268	ATC	2	6	664966	664971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017612
16554	NC_008268	AGA	2	6	665045	665050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017612
16555	NC_008268	AGGC	2	8	665114	665121	25 %	0 %	50 %	25 %	111017612
16556	NC_008268	GGC	2	6	665152	665157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017612
16557	NC_008268	CTCG	2	8	665178	665185	0 %	25 %	25 %	50 %	111017612
16558	NC_008268	TCT	2	6	665225	665230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017612
16559	NC_008268	ACC	2	6	665231	665236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017612
16560	NC_008268	GGA	2	6	665262	665267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017612
16561	NC_008268	CTAC	2	8	665331	665338	25 %	25 %	0 %	50 %	111017612
16562	NC_008268	CA	3	6	665346	665351	50 %	0 %	0 %	50 %	111017612
16563	NC_008268	GCC	2	6	665356	665361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017612
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16567	NC_008268	CTG	2	6	665509	665514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017612
16568	NC_008268	GC	3	6	665544	665549	0 %	0 %	50 %	50 %	111017612
16569	NC_008268	CGA	2	6	665589	665594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017612
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16572	NC_008268	GGC	2	6	665684	665689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017612
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16586	NC_008268	GAG	2	6	666162	666167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017613
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16599	NC_008268	GCCGG	2	10	666753	666762	0 %	0 %	60 %	40 %	111017613
16600	NC_008268	GCG	3	9	666805	666813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017613
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16605	NC_008268	CTG	2	6	667062	667067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16606	NC_008268	CGG	2	6	667079	667084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16607	NC_008268	GACC	2	8	667097	667104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16608	NC_008268	GA	3	6	667145	667150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16609	NC_008268	TCC	2	6	667240	667245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16610	NC_008268	ACG	2	6	667246	667251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_008268	TCC	2	6	667299	667304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16612	NC_008268	CAG	2	6	667412	667417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16614	NC_008268	TGG	2	6	667488	667493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16615	NC_008268	ACGT	2	8	667565	667572	25 %	25 %	25 %	25 %	111017614
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16617	NC_008268	CCGA	2	8	667646	667653	25 %	0 %	25 %	50 %	111017614
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16738	NC_008268	CGC	3	9	672070	672078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017618
16739	NC_008268	CGA	2	6	672088	672093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017618
16740	NC_008268	GGC	2	6	672094	672099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017618
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16825	NC_008268	CCGC	2	8	675419	675426	0 %	0 %	25 %	75 %	111017621
16826	NC_008268	CGA	2	6	675467	675472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017621
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16841	NC_008268	TCGGG	2	10	675934	675943	0 %	20 %	60 %	20 %	111017622
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16845	NC_008268	CCT	2	6	676073	676078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017622
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16847	NC_008268	TCCC	2	8	676126	676133	0 %	25 %	0 %	75 %	111017622
16848	NC_008268	TCG	2	6	676138	676143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017622
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16851	NC_008268	CAC	2	6	676221	676226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16852	NC_008268	GCCC	2	8	676257	676264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16853	NC_008268	GAG	2	6	676275	676280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16854	NC_008268	GGGCGT	2	12	676284	676295	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16855	NC_008268	GAAC	2	8	676406	676413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16856	NC_008268	ACG	2	6	676426	676431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16979	NC_008268	GTG	2	6	681241	681246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017629
16980	NC_008268	GGCG	2	8	681302	681309	0 %	0 %	75 %	25 %	111017629
16981	NC_008268	CACC	2	8	681350	681357	25 %	0 %	0 %	75 %	111017629
16982	NC_008268	GCGGT	2	10	681358	681367	0 %	20 %	60 %	20 %	111017629
16983	NC_008268	TCG	2	6	681370	681375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017629
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16987	NC_008268	GTC	2	6	681513	681518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017629
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