MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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167002	NC_008268	GCT	2	6	6503113	6503118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023007
167003	NC_008268	GGT	2	6	6503119	6503124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023007
167004	NC_008268	GGC	2	6	6503125	6503130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023007
167005	NC_008268	CGC	2	6	6503146	6503151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023007
167006	NC_008268	CTG	2	6	6503156	6503161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023007
167007	NC_008268	CAGGGC	2	12	6503194	6503205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111023007
167008	NC_008268	GGC	2	6	6503209	6503214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023007
167009	NC_008268	GGT	2	6	6503238	6503243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023007
167010	NC_008268	TGGCG	2	10	6503294	6503303	0 %	20 %	60 %	20 %	111023008
167011	NC_008268	GC	3	6	6503397	6503402	0 %	0 %	50 %	50 %	111023008
167012	NC_008268	GGT	2	6	6503419	6503424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023008
167013	NC_008268	CCG	3	9	6503435	6503443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023008
167014	NC_008268	GCT	2	6	6503475	6503480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023008
167015	NC_008268	CCGGG	2	10	6503501	6503510	0 %	0 %	60 %	40 %	111023008
167016	NC_008268	CGG	2	6	6503589	6503594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023008
167017	NC_008268	TCGCC	2	10	6503604	6503613	0 %	20 %	20 %	60 %	111023008
167018	NC_008268	GCA	2	6	6503629	6503634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023008
167019	NC_008268	TCG	2	6	6503636	6503641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023008
167020	NC_008268	GCAG	2	8	6503655	6503662	25 %	0 %	50 %	25 %	111023008
167021	NC_008268	CGG	2	6	6503694	6503699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023008
167022	NC_008268	TGCG	2	8	6503713	6503720	0 %	25 %	50 %	25 %	111023009
167023	NC_008268	GC	4	8	6503735	6503742	0 %	0 %	50 %	50 %	111023009
167024	NC_008268	CGA	2	6	6503789	6503794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
167025	NC_008268	CGT	2	6	6503802	6503807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023009
167026	NC_008268	GTC	2	6	6503869	6503874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023009
167027	NC_008268	ACG	3	9	6503887	6503895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
167028	NC_008268	GTC	2	6	6503919	6503924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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167030	NC_008268	CGA	2	6	6503966	6503971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
167031	NC_008268	CCG	2	6	6504007	6504012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023009
167032	NC_008268	TGA	2	6	6504014	6504019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023009
167033	NC_008268	CGC	2	6	6504080	6504085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023009
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167035	NC_008268	CGG	2	6	6504101	6504106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023009
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167041	NC_008268	TCCTC	2	10	6504269	6504278	0 %	40 %	0 %	60 %	111023009
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167053	NC_008268	CGA	2	6	6504644	6504649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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167069	NC_008268	TAG	2	6	6505301	6505306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167217	NC_008268	TTG	2	6	6511054	6511059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111023014
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167224	NC_008268	CGA	2	6	6511393	6511398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023014
167225	NC_008268	CGT	2	6	6511451	6511456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
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167227	NC_008268	GTG	2	6	6511566	6511571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023014
167228	NC_008268	CGA	2	6	6511601	6511606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023014
167229	NC_008268	CCG	2	6	6511624	6511629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
167230	NC_008268	CCG	2	6	6511676	6511681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
167231	NC_008268	CCG	2	6	6511780	6511785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
167232	NC_008268	TGT	2	6	6511792	6511797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111023014
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167242	NC_008268	GTG	2	6	6512111	6512116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023015
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167250	NC_008268	TGA	2	6	6512555	6512560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023016
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167294	NC_008268	TAC	2	6	6514209	6514214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023018
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167298	NC_008268	GTC	3	9	6514317	6514325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023018
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167301	NC_008268	CCG	2	6	6514411	6514416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023018
167302	NC_008268	TCG	2	6	6514417	6514422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023018
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167304	NC_008268	GCG	2	6	6514443	6514448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
167305	NC_008268	GCAC	2	8	6514575	6514582	25 %	0 %	25 %	50 %	111023019
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167324	NC_008268	GTC	2	6	6515497	6515502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023019
167325	NC_008268	GT	3	6	6515506	6515511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167326	NC_008268	CGCT	2	8	6515542	6515549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167327	NC_008268	GCC	2	6	6515628	6515633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167328	NC_008268	CGGCC	2	10	6515644	6515653	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167329	NC_008268	CGC	2	6	6515680	6515685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167330	NC_008268	GAG	2	6	6515815	6515820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167331	NC_008268	GGCCAT	2	12	6515823	6515834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167332	NC_008268	CAT	2	6	6515916	6515921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
167333	NC_008268	GAA	2	6	6515934	6515939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023020
167334	NC_008268	CAT	2	6	6515991	6515996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
167335	NC_008268	GGC	2	6	6516090	6516095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023020
167336	NC_008268	ATC	2	6	6516127	6516132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
167337	NC_008268	CGG	3	9	6516138	6516146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023020
167338	NC_008268	ACG	2	6	6516155	6516160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023020
167339	NC_008268	GTG	2	6	6516178	6516183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023020
167340	NC_008268	ACG	2	6	6516191	6516196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023020
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167449	NC_008268	CTCA	2	8	6520614	6520621	25 %	25 %	0 %	50 %	111023023
167450	NC_008268	ACC	2	6	6520666	6520671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023023
167451	NC_008268	CG	3	6	6520680	6520685	0 %	0 %	50 %	50 %	111023023
167452	NC_008268	GAG	2	6	6520722	6520727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023023
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167454	NC_008268	TCA	2	6	6520864	6520869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023023
167455	NC_008268	CGA	2	6	6520910	6520915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023023
167456	NC_008268	TCG	2	6	6520927	6520932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023023
167457	NC_008268	CGC	2	6	6520937	6520942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023023
167458	NC_008268	GAG	2	6	6520956	6520961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023023
167459	NC_008268	GAG	2	6	6520977	6520982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023023
167460	NC_008268	TCGCGG	2	12	6520990	6521001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111023023
167461	NC_008268	CCA	2	6	6521119	6521124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023023
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167465	NC_008268	CG	3	6	6521385	6521390	0 %	0 %	50 %	50 %	111023024
167466	NC_008268	TGC	2	6	6521420	6521425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
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167468	NC_008268	TCG	2	6	6521477	6521482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
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167473	NC_008268	ACC	2	6	6521662	6521667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023024
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167478	NC_008268	CGA	2	6	6521874	6521879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
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167480	NC_008268	GAC	2	6	6521977	6521982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
167481	NC_008268	CGCGC	2	10	6522020	6522029	0 %	0 %	40 %	60 %	111023024
167482	NC_008268	CGA	2	6	6522135	6522140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
167483	NC_008268	CGG	2	6	6522162	6522167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
167484	NC_008268	CCG	2	6	6522173	6522178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023024
167485	NC_008268	GCT	2	6	6522204	6522209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
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167488	NC_008268	TGC	2	6	6522299	6522304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
167489	NC_008268	CGA	2	6	6522315	6522320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
167490	NC_008268	CGGAGA	2	12	6522321	6522332	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111023024
167491	NC_008268	TGC	2	6	6522353	6522358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
167492	NC_008268	GGC	2	6	6522363	6522368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
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