MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
162501	NC_008268	CCGGG	2	10	6332796	6332805	0 %	0 %	60 %	40 %	111022849
162502	NC_008268	GAC	2	6	6332807	6332812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022849
162503	NC_008268	CGT	2	6	6332843	6332848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022849
162504	NC_008268	GTC	2	6	6332904	6332909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022849
162505	NC_008268	CAC	2	6	6332921	6332926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022849
162506	NC_008268	CGA	2	6	6332949	6332954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162507	NC_008268	GC	4	8	6332959	6332966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162508	NC_008268	CCA	2	6	6333019	6333024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162509	NC_008268	GAC	2	6	6333059	6333064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022850
162510	NC_008268	TCG	2	6	6333069	6333074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022850
162511	NC_008268	CGT	2	6	6333106	6333111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022850
162512	NC_008268	CTC	2	6	6333119	6333124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022850
162513	NC_008268	GGCAGT	2	12	6333135	6333146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022850
162514	NC_008268	GCC	2	6	6333218	6333223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022850
162515	NC_008268	GGCGGG	2	12	6333247	6333258	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	111022850
162516	NC_008268	ACG	2	6	6333344	6333349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022850
162517	NC_008268	TCC	2	6	6333351	6333356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022850
162518	NC_008268	CGAAC	2	10	6333358	6333367	40 %	0 %	20 %	40 %	111022850
162519	NC_008268	ACC	2	6	6333377	6333382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022850
162520	NC_008268	TTC	2	6	6333416	6333421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022850
162521	NC_008268	TGG	2	6	6333456	6333461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022850
162522	NC_008268	AGC	2	6	6333507	6333512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022850
162523	NC_008268	CGT	2	6	6333529	6333534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162524	NC_008268	GGTC	2	8	6333543	6333550	0 %	25 %	50 %	25 %	111022851
162525	NC_008268	GGCG	2	8	6333606	6333613	0 %	0 %	75 %	25 %	111022851
162526	NC_008268	CCGT	2	8	6333616	6333623	0 %	25 %	25 %	50 %	111022851
162527	NC_008268	GAA	2	6	6333652	6333657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022851
162528	NC_008268	CG	3	6	6333742	6333747	0 %	0 %	50 %	50 %	111022851
162529	NC_008268	GGC	2	6	6333778	6333783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022851
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162531	NC_008268	TGG	2	6	6333900	6333905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022851
162532	NC_008268	CGGC	2	8	6333914	6333921	0 %	0 %	50 %	50 %	111022851
162533	NC_008268	CGC	2	6	6333991	6333996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022851
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162535	NC_008268	GCC	2	6	6334040	6334045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022851
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162537	NC_008268	TCGT	2	8	6334075	6334082	0 %	50 %	25 %	25 %	111022851
162538	NC_008268	GCA	2	6	6334113	6334118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162539	NC_008268	CGA	2	6	6334137	6334142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022851
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162542	NC_008268	CG	3	6	6334262	6334267	0 %	0 %	50 %	50 %	111022851
162543	NC_008268	TCG	2	6	6334322	6334327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162544	NC_008268	CGC	2	6	6334365	6334370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022851
162545	NC_008268	GC	3	6	6334461	6334466	0 %	0 %	50 %	50 %	111022851
162546	NC_008268	CGA	2	6	6334467	6334472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162547	NC_008268	CTC	2	6	6334477	6334482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022851
162548	NC_008268	CCA	2	6	6334483	6334488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022851
162549	NC_008268	GTC	2	6	6334534	6334539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162550	NC_008268	CGT	2	6	6334545	6334550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162551	NC_008268	GTC	2	6	6334552	6334557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162552	NC_008268	ATC	2	6	6334562	6334567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022851
162553	NC_008268	GTCC	2	8	6334606	6334613	0 %	25 %	25 %	50 %	111022851
162554	NC_008268	CTC	2	6	6334639	6334644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022851
162555	NC_008268	CGG	2	6	6334666	6334671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022851
162556	NC_008268	CGT	2	6	6334680	6334685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162557	NC_008268	TCG	2	6	6334724	6334729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
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162559	NC_008268	GTC	3	9	6334897	6334905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162560	NC_008268	GACGG	2	10	6334928	6334937	20 %	0 %	60 %	20 %	111022851
162561	NC_008268	CG	3	6	6334957	6334962	0 %	0 %	50 %	50 %	111022851
162562	NC_008268	GGT	2	6	6334987	6334992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022851
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162566	NC_008268	TCGCA	2	10	6335115	6335124	20 %	20 %	20 %	40 %	111022851
162567	NC_008268	CAG	2	6	6335140	6335145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022851
162568	NC_008268	CG	3	6	6335195	6335200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162569	NC_008268	ATAC	2	8	6335207	6335214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162570	NC_008268	CCG	2	6	6335254	6335259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162571	NC_008268	GTG	2	6	6335289	6335294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162572	NC_008268	AGG	2	6	6335302	6335307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162573	NC_008268	GACT	2	8	6335360	6335367	25 %	25 %	25 %	25 %	111022852
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162575	NC_008268	GC	4	8	6335379	6335386	0 %	0 %	50 %	50 %	111022852
162576	NC_008268	AGCA	2	8	6335416	6335423	50 %	0 %	25 %	25 %	111022852
162577	NC_008268	CG	3	6	6335437	6335442	0 %	0 %	50 %	50 %	111022852
162578	NC_008268	GCT	2	6	6335452	6335457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022852
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162580	NC_008268	CG	3	6	6335485	6335490	0 %	0 %	50 %	50 %	111022852
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162585	NC_008268	CTGG	2	8	6335765	6335772	0 %	25 %	50 %	25 %	111022853
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162587	NC_008268	TCGA	2	8	6336024	6336031	25 %	25 %	25 %	25 %	111022854
162588	NC_008268	GCTG	2	8	6336112	6336119	0 %	25 %	50 %	25 %	111022854
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162599	NC_008268	ACG	2	6	6336613	6336618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022855
162600	NC_008268	GTC	2	6	6336621	6336626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022855
162601	NC_008268	GAAG	2	8	6336680	6336687	50 %	0 %	50 %	0 %	111022855
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162607	NC_008268	GC	3	6	6337089	6337094	0 %	0 %	50 %	50 %	111022855
162608	NC_008268	GAC	2	6	6337101	6337106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022855
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162610	NC_008268	CGGGA	2	10	6337257	6337266	20 %	0 %	60 %	20 %	111022855
162611	NC_008268	TCA	2	6	6337300	6337305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022855
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162615	NC_008268	CAC	2	6	6337457	6337462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022855
162616	NC_008268	CGA	2	6	6337490	6337495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022855
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162726	NC_008268	ACG	2	6	6341360	6341365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022859
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162845	NC_008268	CCG	3	9	6345857	6345865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022863
162846	NC_008268	CGT	2	6	6345870	6345875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022863
162847	NC_008268	CGC	2	6	6345892	6345897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022863
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162882	NC_008268	ATT	2	6	6347321	6347326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162884	NC_008268	GATA	2	8	6347459	6347466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162885	NC_008268	TCGA	2	8	6347477	6347484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162886	NC_008268	CG	3	6	6347513	6347518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162887	NC_008268	GGCCGC	2	12	6347585	6347596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162888	NC_008268	GCG	2	6	6347601	6347606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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162893	NC_008268	CGG	2	6	6347935	6347940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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