MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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162002	NC_008268	GTG	2	6	6313594	6313599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022835
162003	NC_008268	AGC	2	6	6313639	6313644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022835
162004	NC_008268	CGTG	2	8	6313760	6313767	0 %	25 %	50 %	25 %	111022835
162005	NC_008268	GCG	2	6	6313828	6313833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022835
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162340	NC_008268	CGG	2	6	6325919	6325924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022843
162341	NC_008268	CGA	2	6	6325958	6325963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162342	NC_008268	GGT	2	6	6325977	6325982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022843
162343	NC_008268	CGG	3	9	6325985	6325993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022843
162344	NC_008268	CAT	2	6	6326007	6326012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022843
162345	NC_008268	TGCC	2	8	6326024	6326031	0 %	25 %	25 %	50 %	111022843
162346	NC_008268	GAT	2	6	6326043	6326048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022843
162347	NC_008268	GAC	2	6	6326052	6326057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162348	NC_008268	GGA	2	6	6326070	6326075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022843
162349	NC_008268	GCGG	2	8	6326085	6326092	0 %	0 %	75 %	25 %	111022843
162350	NC_008268	TGT	2	6	6326093	6326098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022843
162351	NC_008268	CGG	2	6	6326126	6326131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022843
162352	NC_008268	GGC	2	6	6326150	6326155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022843
162353	NC_008268	AGC	2	6	6326194	6326199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162354	NC_008268	GCA	2	6	6326216	6326221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162355	NC_008268	AGC	2	6	6326332	6326337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162356	NC_008268	GAT	2	6	6326445	6326450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022843
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162363	NC_008268	CGA	2	6	6326636	6326641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162364	NC_008268	CGG	2	6	6326702	6326707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022843
162365	NC_008268	GC	4	8	6326723	6326730	0 %	0 %	50 %	50 %	111022843
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162368	NC_008268	CGA	2	6	6326816	6326821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162369	NC_008268	GCC	2	6	6326884	6326889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022843
162370	NC_008268	GTG	2	6	6326893	6326898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022843
162371	NC_008268	GCC	2	6	6326938	6326943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022843
162372	NC_008268	GTC	2	6	6326963	6326968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162373	NC_008268	CGA	2	6	6326969	6326974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022843
162374	NC_008268	CTGA	2	8	6326991	6326998	25 %	25 %	25 %	25 %	111022843
162375	NC_008268	ACC	2	6	6327007	6327012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022843
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162380	NC_008268	CGGG	2	8	6327255	6327262	0 %	0 %	75 %	25 %	111022843
162381	NC_008268	GT	3	6	6327265	6327270	0 %	50 %	50 %	0 %	111022843
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162383	NC_008268	CTCG	2	8	6327409	6327416	0 %	25 %	25 %	50 %	111022844
162384	NC_008268	GTG	2	6	6327427	6327432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022844
162385	NC_008268	TGC	2	6	6327455	6327460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022844
162386	NC_008268	CCG	2	6	6327480	6327485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022844
162387	NC_008268	CG	3	6	6327518	6327523	0 %	0 %	50 %	50 %	111022844
162388	NC_008268	TCG	2	6	6327551	6327556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022844
162389	NC_008268	CGG	2	6	6327585	6327590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022844
162390	NC_008268	TGG	2	6	6327785	6327790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022844
162391	NC_008268	CCGGG	2	10	6327797	6327806	0 %	0 %	60 %	40 %	111022844
162392	NC_008268	CCGT	2	8	6327812	6327819	0 %	25 %	25 %	50 %	111022844
162393	NC_008268	CGCCGT	2	12	6327831	6327842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022844
162394	NC_008268	CGC	2	6	6327913	6327918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022845
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162397	NC_008268	AGGCG	2	10	6328065	6328074	20 %	0 %	60 %	20 %	111022845
162398	NC_008268	CGG	2	6	6328075	6328080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022845
162399	NC_008268	TGT	2	6	6328179	6328184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022845
162400	NC_008268	GC	3	6	6328224	6328229	0 %	0 %	50 %	50 %	111022845
162401	NC_008268	GTC	2	6	6328300	6328305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022845
162402	NC_008268	CAC	2	6	6328387	6328392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022845
162403	NC_008268	GAGAC	2	10	6328415	6328424	40 %	0 %	40 %	20 %	111022845
162404	NC_008268	GC	3	6	6328445	6328450	0 %	0 %	50 %	50 %	111022845
162405	NC_008268	GCG	2	6	6328558	6328563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022845
162406	NC_008268	GCCC	2	8	6328596	6328603	0 %	0 %	25 %	75 %	111022845
162407	NC_008268	GCG	2	6	6328604	6328609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022845
162408	NC_008268	ACG	2	6	6328620	6328625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022845
162409	NC_008268	CGCGA	2	10	6328643	6328652	20 %	0 %	40 %	40 %	111022845
162410	NC_008268	GTC	2	6	6328657	6328662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022845
162411	NC_008268	GGT	2	6	6328707	6328712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022845
162412	NC_008268	CAT	2	6	6328774	6328779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162413	NC_008268	CCA	2	6	6328874	6328879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022846
162414	NC_008268	CGA	2	6	6328907	6328912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022846
162415	NC_008268	GAC	2	6	6328998	6329003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022846
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162417	NC_008268	GAC	2	6	6329043	6329048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022846
162418	NC_008268	GCG	2	6	6329113	6329118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022846
162419	NC_008268	GC	3	6	6329165	6329170	0 %	0 %	50 %	50 %	111022846
162420	NC_008268	CAG	2	6	6329199	6329204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022846
162421	NC_008268	CGA	2	6	6329240	6329245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022846
162422	NC_008268	ACCCG	2	10	6329258	6329267	20 %	0 %	20 %	60 %	111022847
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162428	NC_008268	CGATGG	2	12	6329455	6329466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022847
162429	NC_008268	CGC	2	6	6329474	6329479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022847
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162435	NC_008268	GTGG	2	8	6329705	6329712	0 %	25 %	75 %	0 %	111022847
162436	NC_008268	TGG	2	6	6329768	6329773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162437	NC_008268	GC	3	6	6329886	6329891	0 %	0 %	50 %	50 %	111022848
162438	NC_008268	GCA	2	6	6330000	6330005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022848
162439	NC_008268	GCT	2	6	6330015	6330020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022848
162440	NC_008268	CGA	2	6	6330042	6330047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022848
162441	NC_008268	CG	3	6	6330090	6330095	0 %	0 %	50 %	50 %	111022848
162442	NC_008268	GT	3	6	6330203	6330208	0 %	50 %	50 %	0 %	111022848
162443	NC_008268	ACCG	2	8	6330250	6330257	25 %	0 %	25 %	50 %	111022848
162444	NC_008268	CGG	2	6	6330329	6330334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022848
162445	NC_008268	CGG	2	6	6330359	6330364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022848
162446	NC_008268	TGG	2	6	6330365	6330370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022848
162447	NC_008268	CGA	2	6	6330435	6330440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022848
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162449	NC_008268	GGC	2	6	6330541	6330546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022848
162450	NC_008268	GC	3	6	6330558	6330563	0 %	0 %	50 %	50 %	111022848
162451	NC_008268	CGG	2	6	6330576	6330581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022848
162452	NC_008268	CGA	2	6	6330582	6330587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022848
162453	NC_008268	GGT	2	6	6330597	6330602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022848
162454	NC_008268	CGG	2	6	6330621	6330626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022848
162455	NC_008268	TTG	2	6	6330640	6330645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022848
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162461	NC_008268	CGG	2	6	6330877	6330882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162462	NC_008268	GT	3	6	6330944	6330949	0 %	50 %	50 %	0 %	111022849
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162483	NC_008268	CGGA	2	8	6332017	6332024	25 %	0 %	50 %	25 %	111022849
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162487	NC_008268	CG	3	6	6332186	6332191	0 %	0 %	50 %	50 %	111022849
162488	NC_008268	TCC	2	6	6332223	6332228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022849
162489	NC_008268	GTC	2	6	6332252	6332257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022849
162490	NC_008268	TCC	2	6	6332274	6332279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022849
162491	NC_008268	CGG	2	6	6332320	6332325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022849
162492	NC_008268	TCG	2	6	6332331	6332336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022849
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