MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008268	TCGGTG	2	12	623417	623428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111017565
15502	NC_008268	GTCCC	2	10	623446	623455	0 %	20 %	20 %	60 %	111017565
15503	NC_008268	TCG	2	6	623525	623530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017565
15504	NC_008268	CGC	2	6	623541	623546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017565
15505	NC_008268	ACC	2	6	623557	623562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017565
15506	NC_008268	CAC	3	9	623617	623625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_008268	GAG	2	6	623638	623643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_008268	GGT	2	6	623689	623694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017566
15509	NC_008268	CGG	2	6	623702	623707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017566
15510	NC_008268	ACG	2	6	623797	623802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017566
15511	NC_008268	CGGC	2	8	623856	623863	0 %	0 %	50 %	50 %	111017566
15512	NC_008268	CA	3	6	623884	623889	50 %	0 %	0 %	50 %	111017566
15513	NC_008268	GATC	2	8	623899	623906	25 %	25 %	25 %	25 %	111017566
15514	NC_008268	GA	3	6	623924	623929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_008268	TAC	2	6	623953	623958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017567
15516	NC_008268	CGA	2	6	623978	623983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017567
15517	NC_008268	ACG	2	6	624003	624008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017567
15518	NC_008268	CGT	2	6	624057	624062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017567
15519	NC_008268	GCC	2	6	624088	624093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017567
15520	NC_008268	CGAT	2	8	624095	624102	25 %	25 %	25 %	25 %	111017567
15521	NC_008268	GGT	2	6	624126	624131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017567
15522	NC_008268	CA	4	8	624149	624156	50 %	0 %	0 %	50 %	111017567
15523	NC_008268	CGATC	2	10	624271	624280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15524	NC_008268	GGC	2	6	624281	624286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_008268	GCC	2	6	624311	624316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_008268	CCG	2	6	624396	624401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15527	NC_008268	CGG	2	6	624429	624434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_008268	GGA	2	6	624451	624456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_008268	GT	3	6	624496	624501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_008268	CTG	2	6	624576	624581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_008268	ACC	2	6	624649	624654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15532	NC_008268	CAG	3	9	624666	624674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_008268	ACGCC	2	10	624762	624771	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15534	NC_008268	CGCC	2	8	624782	624789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15535	NC_008268	CCG	2	6	624827	624832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_008268	GCA	2	6	624888	624893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_008268	GCC	2	6	624982	624987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_008268	CCG	2	6	624999	625004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_008268	TCC	2	6	625007	625012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15540	NC_008268	GGT	2	6	625063	625068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_008268	GC	4	8	625069	625076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15542	NC_008268	GGT	2	6	625096	625101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_008268	GCC	2	6	625205	625210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15544	NC_008268	CCGGG	2	10	625260	625269	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15545	NC_008268	CGC	2	6	625480	625485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15546	NC_008268	TCG	2	6	625509	625514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_008268	CCA	3	9	625539	625547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15548	NC_008268	CCGG	2	8	625585	625592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_008268	GCC	2	6	625625	625630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15550	NC_008268	CGC	3	9	625639	625647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15551	NC_008268	CGG	2	6	625669	625674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_008268	CGT	2	6	625694	625699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_008268	GAC	2	6	625700	625705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_008268	CGC	2	6	625778	625783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15555	NC_008268	GCG	2	6	625788	625793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_008268	CTG	2	6	625809	625814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_008268	CGA	2	6	625835	625840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_008268	TCG	2	6	625945	625950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_008268	ACC	2	6	625965	625970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15560	NC_008268	CCG	2	6	625997	626002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_008268	CCGA	2	8	626012	626019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_008268	GCC	2	6	626134	626139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15563	NC_008268	GCC	2	6	626188	626193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15564	NC_008268	CGACGG	2	12	626319	626330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_008268	ACCA	2	8	626344	626351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15566	NC_008268	CCG	2	6	626363	626368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15567	NC_008268	CAA	2	6	626403	626408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15568	NC_008268	AAC	2	6	626429	626434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_008268	ACG	2	6	626450	626455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_008268	CGT	2	6	626539	626544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_008268	TCG	2	6	626556	626561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_008268	CGA	2	6	626563	626568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_008268	GAT	2	6	626584	626589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_008268	CGC	2	6	626590	626595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15575	NC_008268	CGA	2	6	626647	626652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_008268	CTG	2	6	626690	626695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_008268	CGGT	2	8	626722	626729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15578	NC_008268	ACT	2	6	626757	626762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15579	NC_008268	AGC	2	6	626819	626824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_008268	GTC	2	6	626877	626882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_008268	GTC	2	6	626884	626889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_008268	GCC	2	6	626935	626940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15583	NC_008268	CGA	2	6	626971	626976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_008268	ATC	2	6	626984	626989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15585	NC_008268	GC	3	6	627004	627009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15586	NC_008268	GT	3	6	627049	627054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_008268	CCG	2	6	627080	627085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15588	NC_008268	TTC	2	6	627134	627139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_008268	C	6	6	627139	627144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15590	NC_008268	GCT	2	6	627152	627157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_008268	CTAC	2	8	627209	627216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15592	NC_008268	GAA	2	6	627259	627264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_008268	GCG	2	6	627336	627341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_008268	CAGCG	2	10	627352	627361	20 %	0 %	40 %	40 %	111017568
15595	NC_008268	CGG	2	6	627380	627385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017568
15596	NC_008268	GC	4	8	627529	627536	0 %	0 %	50 %	50 %	111017568
15597	NC_008268	CGCGC	2	10	627539	627548	0 %	0 %	40 %	60 %	111017568
15598	NC_008268	GA	3	6	627575	627580	50 %	0 %	50 %	0 %	111017568
15599	NC_008268	AAC	2	6	627583	627588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017568
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15602	NC_008268	CGGTC	2	10	627651	627660	0 %	20 %	40 %	40 %	111017568
15603	NC_008268	CGG	2	6	627676	627681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017568
15604	NC_008268	ATCGG	2	10	627724	627733	20 %	20 %	40 %	20 %	111017568
15605	NC_008268	TCAC	2	8	627745	627752	25 %	25 %	0 %	50 %	111017569
15606	NC_008268	TGC	2	6	627762	627767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017569
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15608	NC_008268	TTC	2	6	627804	627809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017569
15609	NC_008268	CCAG	2	8	627846	627853	25 %	0 %	25 %	50 %	111017569
15610	NC_008268	CGA	2	6	627860	627865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017569
15611	NC_008268	CGGCG	2	10	627908	627917	0 %	0 %	60 %	40 %	111017569
15612	NC_008268	GCC	3	9	627995	628003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15613	NC_008268	GATGA	2	10	628065	628074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_008268	GAA	2	6	628109	628114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017570
15615	NC_008268	CGA	2	6	628199	628204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017570
15616	NC_008268	GGC	2	6	628236	628241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017570
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15619	NC_008268	CGC	2	6	628381	628386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017570
15620	NC_008268	GAC	2	6	628402	628407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_008268	GTT	2	6	628448	628453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_008268	CGC	2	6	628483	628488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15623	NC_008268	CAA	2	6	628510	628515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_008268	TGG	2	6	628523	628528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_008268	TGC	2	6	628529	628534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15626	NC_008268	GC	3	6	628560	628565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15627	NC_008268	CGT	2	6	628623	628628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15629	NC_008268	CA	3	6	628725	628730	50 %	0 %	0 %	50 %	111017571
15630	NC_008268	CA	3	6	628757	628762	50 %	0 %	0 %	50 %	111017571
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15869	NC_008268	TCG	3	9	637333	637341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017583
15870	NC_008268	ACC	2	6	637342	637347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017583
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15881	NC_008268	CGT	2	6	637637	637642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017583
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15977	NC_008268	CGA	2	6	640856	640861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017586
15978	NC_008268	TCGGCA	2	12	640882	640893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017586
15979	NC_008268	CCG	2	6	640901	640906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017586
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15982	NC_008268	TC	4	8	641063	641070	0 %	50 %	0 %	50 %	111017586
15983	NC_008268	ACG	2	6	641080	641085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017586
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15986	NC_008268	CGT	2	6	641219	641224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017586
15987	NC_008268	CGA	2	6	641227	641232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017586
15988	NC_008268	GCG	2	6	641379	641384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15989	NC_008268	TCG	3	9	641416	641424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017587
15990	NC_008268	GTG	3	9	641446	641454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017587
15991	NC_008268	GTC	2	6	641460	641465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017587
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15997	NC_008268	CTC	2	6	641809	641814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017588
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15999	NC_008268	GCC	2	6	641870	641875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017588
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