MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
155001	NC_008268	CG	3	6	6042232	6042237	0 %	0 %	50 %	50 %	111022577
155002	NC_008268	GGT	2	6	6042298	6042303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022577
155003	NC_008268	CGT	2	6	6042315	6042320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022577
155004	NC_008268	CGG	2	6	6042369	6042374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022577
155005	NC_008268	AGC	2	6	6042380	6042385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022577
155006	NC_008268	CA	3	6	6042440	6042445	50 %	0 %	0 %	50 %	111022578
155007	NC_008268	TCAC	2	8	6042449	6042456	25 %	25 %	0 %	50 %	111022578
155008	NC_008268	GCT	2	6	6042548	6042553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022578
155009	NC_008268	TCGCCG	2	12	6042556	6042567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022578
155010	NC_008268	CTC	2	6	6042576	6042581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022578
155011	NC_008268	CGC	2	6	6042611	6042616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022578
155012	NC_008268	GCG	2	6	6042670	6042675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022578
155013	NC_008268	GTG	2	6	6042729	6042734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022578
155014	NC_008268	CGC	2	6	6042737	6042742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022578
155015	NC_008268	TGG	2	6	6042765	6042770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022578
155016	NC_008268	CGC	2	6	6042785	6042790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022578
155017	NC_008268	ACC	3	9	6042836	6042844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022578
155018	NC_008268	CTTT	2	8	6042855	6042862	0 %	75 %	0 %	25 %	111022578
155019	NC_008268	CGG	2	6	6042914	6042919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155020	NC_008268	GAG	2	6	6042949	6042954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155021	NC_008268	TTC	2	6	6042955	6042960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155022	NC_008268	CAC	2	6	6042966	6042971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022579
155023	NC_008268	CGC	3	9	6042987	6042995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022579
155024	NC_008268	GGCA	2	8	6043038	6043045	25 %	0 %	50 %	25 %	111022579
155025	NC_008268	TCG	2	6	6043048	6043053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022579
155026	NC_008268	CCG	2	6	6043073	6043078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022579
155027	NC_008268	ACG	2	6	6043100	6043105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022579
155028	NC_008268	GCC	2	6	6043210	6043215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022579
155029	NC_008268	GCA	2	6	6043230	6043235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022579
155030	NC_008268	ACC	2	6	6043255	6043260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022579
155031	NC_008268	CAG	2	6	6043267	6043272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022579
155032	NC_008268	ATG	2	6	6043336	6043341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022579
155033	NC_008268	ATG	2	6	6043408	6043413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022579
155034	NC_008268	CAC	2	6	6043420	6043425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022579
155035	NC_008268	CAG	2	6	6043513	6043518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022579
155036	NC_008268	GCA	2	6	6043633	6043638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022580
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155044	NC_008268	CT	3	6	6043855	6043860	0 %	50 %	0 %	50 %	111022580
155045	NC_008268	ACGC	2	8	6043937	6043944	25 %	0 %	25 %	50 %	111022581
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155047	NC_008268	CG	3	6	6043972	6043977	0 %	0 %	50 %	50 %	111022581
155048	NC_008268	TCGCG	2	10	6044020	6044029	0 %	20 %	40 %	40 %	111022581
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155051	NC_008268	GCT	2	6	6044075	6044080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022581
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155068	NC_008268	CT	3	6	6044610	6044615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155069	NC_008268	GA	3	6	6044637	6044642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155070	NC_008268	TGA	2	6	6044644	6044649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155110	NC_008268	CATC	2	8	6045973	6045980	25 %	25 %	0 %	50 %	111022585
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155230	NC_008268	CGG	2	6	6050469	6050474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022590
155231	NC_008268	GGT	2	6	6050533	6050538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022590
155232	NC_008268	CGC	2	6	6050679	6050684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022590
155233	NC_008268	CGT	2	6	6050697	6050702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022590
155234	NC_008268	CGG	2	6	6050711	6050716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022590
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155238	NC_008268	TCA	2	6	6050780	6050785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022590
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155264	NC_008268	CGA	2	6	6051528	6051533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155265	NC_008268	GCAG	2	8	6051534	6051541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155266	NC_008268	TCGA	2	8	6051556	6051563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155267	NC_008268	ACC	2	6	6051607	6051612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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155269	NC_008268	C	6	6	6051693	6051698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155270	NC_008268	TCA	2	6	6051699	6051704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155272	NC_008268	TTCG	2	8	6051797	6051804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155273	NC_008268	GGGCG	2	10	6051947	6051956	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
155274	NC_008268	CGT	2	6	6051965	6051970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155276	NC_008268	GTC	2	6	6052026	6052031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155281	NC_008268	TGC	3	9	6052205	6052213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022592
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155291	NC_008268	CGT	2	6	6052570	6052575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022592
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155297	NC_008268	CCAC	2	8	6052857	6052864	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
155298	NC_008268	GGC	2	6	6052936	6052941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022593
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155325	NC_008268	GTGG	2	8	6054134	6054141	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
155326	NC_008268	GA	3	6	6054230	6054235	50 %	0 %	50 %	0 %	111022595
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155331	NC_008268	CGT	2	6	6054484	6054489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022595
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155338	NC_008268	GCG	2	6	6054768	6054773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022595
155339	NC_008268	CGA	2	6	6054790	6054795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022595
155340	NC_008268	ACG	2	6	6054844	6054849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022595
155341	NC_008268	CGG	2	6	6054879	6054884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022595
155342	NC_008268	CGG	2	6	6054932	6054937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155343	NC_008268	TGGA	2	8	6054968	6054975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
155344	NC_008268	CG	3	6	6055003	6055008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155345	NC_008268	GCA	2	6	6055018	6055023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022596
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155348	NC_008268	CGA	2	6	6055074	6055079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022596
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155353	NC_008268	G	6	6	6055455	6055460	0 %	0 %	100 %	0 %	111022597
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155459	NC_008268	GC	3	6	6060100	6060105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155460	NC_008268	TTCG	2	8	6060106	6060113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155461	NC_008268	CCA	2	6	6060149	6060154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155462	NC_008268	AGA	2	6	6060156	6060161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155463	NC_008268	CACT	2	8	6060164	6060171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
155464	NC_008268	CGT	3	9	6060215	6060223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155465	NC_008268	TCA	2	6	6060309	6060314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022602
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155467	NC_008268	CGA	2	6	6060407	6060412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022602
155468	NC_008268	GCT	2	6	6060545	6060550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022602
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155470	NC_008268	CAC	2	6	6060603	6060608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155471	NC_008268	GCG	2	6	6060644	6060649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155472	NC_008268	GTG	2	6	6060664	6060669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155473	NC_008268	TCGTG	2	10	6060670	6060679	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
155474	NC_008268	G	6	6	6060687	6060692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
155475	NC_008268	GC	3	6	6060703	6060708	0 %	0 %	50 %	50 %	111022603
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155481	NC_008268	CGAG	2	8	6060895	6060902	25 %	0 %	50 %	25 %	111022603
155482	NC_008268	CGAG	2	8	6060913	6060920	25 %	0 %	50 %	25 %	111022603
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155488	NC_008268	CG	3	6	6061127	6061132	0 %	0 %	50 %	50 %	111022603
155489	NC_008268	GAC	2	6	6061149	6061154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022603
155490	NC_008268	TGC	2	6	6061181	6061186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022603
155491	NC_008268	GCA	2	6	6061215	6061220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022603
155492	NC_008268	CCG	2	6	6061224	6061229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022603
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