MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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154002	NC_008268	ACG	2	6	6005733	6005738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154003	NC_008268	CGG	2	6	6005785	6005790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154004	NC_008268	AGC	2	6	6005837	6005842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154005	NC_008268	GTC	2	6	6005864	6005869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154006	NC_008268	GAC	2	6	6005882	6005887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154007	NC_008268	CGA	2	6	6005908	6005913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154008	NC_008268	CGAAT	2	10	6005932	6005941	40 %	20 %	20 %	20 %	111022548
154009	NC_008268	ATC	2	6	6006017	6006022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022548
154010	NC_008268	CGA	2	6	6006040	6006045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154011	NC_008268	CGG	3	9	6006067	6006075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154012	NC_008268	GAT	2	6	6006091	6006096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022548
154013	NC_008268	ACG	2	6	6006150	6006155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154014	NC_008268	CTCA	2	8	6006191	6006198	25 %	25 %	0 %	50 %	111022548
154015	NC_008268	TCG	2	6	6006213	6006218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154016	NC_008268	CAA	2	6	6006235	6006240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022548
154017	NC_008268	GGA	2	6	6006241	6006246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022548
154018	NC_008268	ACG	2	6	6006299	6006304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154019	NC_008268	ACCT	2	8	6006314	6006321	25 %	25 %	0 %	50 %	111022548
154020	NC_008268	GGC	2	6	6006337	6006342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154021	NC_008268	GGA	2	6	6006349	6006354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022548
154022	NC_008268	GGC	3	9	6006358	6006366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154023	NC_008268	CGG	2	6	6006369	6006374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154024	NC_008268	CCA	2	6	6006375	6006380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022548
154025	NC_008268	CGA	2	6	6006381	6006386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154026	NC_008268	GCGA	2	8	6006395	6006402	25 %	0 %	50 %	25 %	111022548
154027	NC_008268	CGT	2	6	6006411	6006416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154028	NC_008268	ACC	3	9	6006419	6006427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022548
154029	NC_008268	ACC	2	6	6006443	6006448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022548
154030	NC_008268	GGC	2	6	6006454	6006459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022548
154031	NC_008268	GCT	2	6	6006520	6006525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022548
154032	NC_008268	GCGG	2	8	6006626	6006633	0 %	0 %	75 %	25 %	111022548
154033	NC_008268	GCG	2	6	6006648	6006653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022549
154034	NC_008268	CTG	2	6	6006660	6006665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022549
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154036	NC_008268	TCCGG	2	10	6006711	6006720	0 %	20 %	40 %	40 %	111022549
154037	NC_008268	GGAC	2	8	6006722	6006729	25 %	0 %	50 %	25 %	111022549
154038	NC_008268	GCG	2	6	6006801	6006806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022549
154039	NC_008268	AGC	2	6	6006853	6006858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022549
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154041	NC_008268	GC	3	6	6006898	6006903	0 %	0 %	50 %	50 %	111022549
154042	NC_008268	TCC	3	9	6006918	6006926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022549
154043	NC_008268	GTC	2	6	6006983	6006988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022549
154044	NC_008268	TCG	2	6	6007047	6007052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022549
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154050	NC_008268	CG	3	6	6007171	6007176	0 %	0 %	50 %	50 %	111022549
154051	NC_008268	CGA	2	6	6007207	6007212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022549
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154053	NC_008268	GGC	2	6	6007268	6007273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022549
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154058	NC_008268	GTA	2	6	6007559	6007564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022549
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154065	NC_008268	AGC	2	6	6007712	6007717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022550
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154087	NC_008268	CGA	2	6	6008472	6008477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022551
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154099	NC_008268	TCG	2	6	6008991	6008996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022552
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154103	NC_008268	GC	3	6	6009119	6009124	0 %	0 %	50 %	50 %	111022552
154104	NC_008268	CGC	2	6	6009213	6009218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022552
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154114	NC_008268	AAG	2	6	6009641	6009646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022553
154115	NC_008268	CCA	2	6	6009660	6009665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022553
154116	NC_008268	ACC	2	6	6009668	6009673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022553
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154217	NC_008268	CG	4	8	6013573	6013580	0 %	0 %	50 %	50 %	111022557
154218	NC_008268	GCGG	2	8	6013585	6013592	0 %	0 %	75 %	25 %	111022557
154219	NC_008268	CGAC	2	8	6013597	6013604	25 %	0 %	25 %	50 %	111022557
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154221	NC_008268	TCG	2	6	6013665	6013670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022557
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154228	NC_008268	CAG	2	6	6013814	6013819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022557
154229	NC_008268	GAC	2	6	6013883	6013888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022557
154230	NC_008268	GGC	2	6	6013904	6013909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022557
154231	NC_008268	CG	3	6	6013927	6013932	0 %	0 %	50 %	50 %	111022557
154232	NC_008268	CG	3	6	6013963	6013968	0 %	0 %	50 %	50 %	111022557
154233	NC_008268	GCC	3	9	6014108	6014116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022557
154234	NC_008268	CGA	2	6	6014137	6014142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022557
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154236	NC_008268	GCC	2	6	6014213	6014218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022557
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154239	NC_008268	GCG	2	6	6014311	6014316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022557
154240	NC_008268	CGA	2	6	6014320	6014325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022557
154241	NC_008268	CGG	2	6	6014335	6014340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022557
154242	NC_008268	CGA	3	9	6014377	6014385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022557
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154245	NC_008268	TCA	2	6	6014545	6014550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022557
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154249	NC_008268	CGA	2	6	6014676	6014681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154250	NC_008268	TCG	2	6	6014693	6014698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154251	NC_008268	G	6	6	6014700	6014705	0 %	0 %	100 %	0 %	111022558
154252	NC_008268	ACG	2	6	6014742	6014747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022558
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154255	NC_008268	CGA	2	6	6014826	6014831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154256	NC_008268	CTG	2	6	6014836	6014841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154257	NC_008268	GGT	2	6	6014868	6014873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022558
154258	NC_008268	GCC	2	6	6014917	6014922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022558
154259	NC_008268	CG	3	6	6014932	6014937	0 %	0 %	50 %	50 %	111022558
154260	NC_008268	CCG	2	6	6014990	6014995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022558
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154266	NC_008268	CGA	2	6	6015126	6015131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022558
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154274	NC_008268	TCG	2	6	6015392	6015397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154275	NC_008268	TCG	2	6	6015416	6015421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022558
154276	NC_008268	CG	3	6	6015477	6015482	0 %	0 %	50 %	50 %	111022558
154277	NC_008268	GTTCG	2	10	6015544	6015553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
154278	NC_008268	TGG	2	6	6015588	6015593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154279	NC_008268	AC	4	8	6015666	6015673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154280	NC_008268	AGG	2	6	6015679	6015684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154290	NC_008268	CA	3	6	6015997	6016002	50 %	0 %	0 %	50 %	111022559
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154342	NC_008268	ACG	2	6	6017572	6017577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022560
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154447	NC_008268	GTGGG	2	10	6022248	6022257	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
154448	NC_008268	TCGTGC	2	12	6022262	6022273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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154452	NC_008268	GCG	2	6	6022384	6022389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022564
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154454	NC_008268	TCG	2	6	6022491	6022496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022564
154455	NC_008268	CGC	2	6	6022531	6022536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022564
154456	NC_008268	CGG	2	6	6022567	6022572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022564
154457	NC_008268	TGTGC	2	10	6022609	6022618	0 %	40 %	40 %	20 %	111022564
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154481	NC_008268	CGTCGA	2	12	6023479	6023490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022564
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154483	NC_008268	CCG	2	6	6023512	6023517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022564
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154489	NC_008268	CGA	2	6	6023815	6023820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022565
154490	NC_008268	CA	3	6	6023901	6023906	50 %	0 %	0 %	50 %	111022565
154491	NC_008268	CGT	2	6	6023929	6023934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022565
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