MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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152502	NC_008268	GTG	2	6	5948830	5948835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022495
152503	NC_008268	CCG	3	9	5948856	5948864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022495
152504	NC_008268	ACG	2	6	5948868	5948873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152505	NC_008268	ACC	3	9	5948892	5948900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022495
152506	NC_008268	ACC	3	9	5948919	5948927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022495
152507	NC_008268	GCC	3	9	5948939	5948947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022495
152508	NC_008268	ACG	3	9	5948949	5948957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152509	NC_008268	ACG	2	6	5948970	5948975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152510	NC_008268	TCG	2	6	5948977	5948982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152511	NC_008268	CTT	2	6	5949011	5949016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022495
152512	NC_008268	CGG	2	6	5949029	5949034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022495
152513	NC_008268	CAT	2	6	5949047	5949052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022495
152514	NC_008268	CGA	2	6	5949091	5949096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152515	NC_008268	GCC	2	6	5949104	5949109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022495
152516	NC_008268	ACG	2	6	5949160	5949165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152517	NC_008268	CGT	2	6	5949172	5949177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152518	NC_008268	GCG	2	6	5949211	5949216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022495
152519	NC_008268	CCG	2	6	5949238	5949243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022495
152520	NC_008268	GCA	2	6	5949274	5949279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152521	NC_008268	CCACGG	2	12	5949280	5949291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022495
152522	NC_008268	ACG	2	6	5949307	5949312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022495
152523	NC_008268	CCGG	2	8	5949383	5949390	0 %	0 %	50 %	50 %	111022496
152524	NC_008268	CCGA	2	8	5949418	5949425	25 %	0 %	25 %	50 %	111022496
152525	NC_008268	G	6	6	5949428	5949433	0 %	0 %	100 %	0 %	111022496
152526	NC_008268	CCG	2	6	5949485	5949490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022496
152527	NC_008268	CTG	2	6	5949511	5949516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022496
152528	NC_008268	CGG	2	6	5949519	5949524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022496
152529	NC_008268	CGC	2	6	5949529	5949534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022496
152530	NC_008268	TCG	2	6	5949575	5949580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022496
152531	NC_008268	GCC	3	9	5949593	5949601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022496
152532	NC_008268	ACG	2	6	5949635	5949640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022496
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152534	NC_008268	CGC	4	12	5949678	5949689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022496
152535	NC_008268	TCC	2	6	5949758	5949763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022496
152536	NC_008268	TCG	2	6	5949785	5949790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022496
152537	NC_008268	ACA	2	6	5949830	5949835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022496
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152541	NC_008268	CATG	2	8	5950011	5950018	25 %	25 %	25 %	25 %	111022496
152542	NC_008268	GC	4	8	5950112	5950119	0 %	0 %	50 %	50 %	111022497
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152550	NC_008268	ACT	2	6	5950242	5950247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022497
152551	NC_008268	CGC	2	6	5950302	5950307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022497
152552	NC_008268	GCCGTC	2	12	5950308	5950319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022497
152553	NC_008268	GC	3	6	5950334	5950339	0 %	0 %	50 %	50 %	111022497
152554	NC_008268	CAA	2	6	5950372	5950377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022497
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152561	NC_008268	CGA	2	6	5950627	5950632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022497
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152567	NC_008268	CGA	2	6	5950810	5950815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022497
152568	NC_008268	CGG	3	9	5950843	5950851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022497
152569	NC_008268	CG	3	6	5950885	5950890	0 %	0 %	50 %	50 %	111022497
152570	NC_008268	TGC	2	6	5950914	5950919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022497
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152572	NC_008268	CTGGG	2	10	5951064	5951073	0 %	20 %	60 %	20 %	111022497
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152574	NC_008268	GTCC	2	8	5951137	5951144	0 %	25 %	25 %	50 %	111022497
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152583	NC_008268	GCT	2	6	5951517	5951522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022498
152584	NC_008268	ACG	2	6	5951575	5951580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022498
152585	NC_008268	CCTC	2	8	5951615	5951622	0 %	25 %	0 %	75 %	111022498
152586	NC_008268	GGCCG	2	10	5951638	5951647	0 %	0 %	60 %	40 %	111022498
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152599	NC_008268	TCG	2	6	5952314	5952319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022498
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152601	NC_008268	GC	3	6	5952367	5952372	0 %	0 %	50 %	50 %	111022498
152602	NC_008268	GTC	2	6	5952385	5952390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022498
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152613	NC_008268	GCC	2	6	5952864	5952869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022499
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152615	NC_008268	TCG	2	6	5952913	5952918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022499
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152686	NC_008268	CG	4	8	5955437	5955444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152687	NC_008268	GGA	2	6	5955463	5955468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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152717	NC_008268	TGG	2	6	5956752	5956757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022503
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152722	NC_008268	GGC	2	6	5956949	5956954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022503
152723	NC_008268	GAC	2	6	5956955	5956960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022503
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152726	NC_008268	GCG	2	6	5957041	5957046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022503
152727	NC_008268	CTG	2	6	5957051	5957056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022503
152728	NC_008268	GCA	2	6	5957062	5957067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022503
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152822	NC_008268	CTGT	2	8	5960393	5960400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152823	NC_008268	CGG	2	6	5960415	5960420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152824	NC_008268	GAC	2	6	5960434	5960439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152825	NC_008268	GCC	2	6	5960511	5960516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022506
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152827	NC_008268	CGC	2	6	5960585	5960590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022506
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152833	NC_008268	CGG	2	6	5960783	5960788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022506
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152837	NC_008268	CAC	2	6	5960949	5960954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022507
152838	NC_008268	TCG	2	6	5960956	5960961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022507
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152954	NC_008268	GC	3	6	5965752	5965757	0 %	0 %	50 %	50 %	111022512
152955	NC_008268	GCA	2	6	5965804	5965809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022512
152956	NC_008268	ACC	2	6	5965844	5965849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022512
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152958	NC_008268	GTC	2	6	5965913	5965918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022512
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152961	NC_008268	GC	3	6	5966040	5966045	0 %	0 %	50 %	50 %	111022512
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152965	NC_008268	CTCC	2	8	5966146	5966153	0 %	25 %	0 %	75 %	111022512
152966	NC_008268	CGA	2	6	5966164	5966169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022512
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152969	NC_008268	CGC	2	6	5966250	5966255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022512
152970	NC_008268	CCGG	2	8	5966261	5966268	0 %	0 %	50 %	50 %	111022512
152971	NC_008268	GCC	2	6	5966279	5966284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022512
152972	NC_008268	GCG	2	6	5966291	5966296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022512
152973	NC_008268	CGCGC	2	10	5966317	5966326	0 %	0 %	40 %	60 %	111022512
152974	NC_008268	TCG	2	6	5966352	5966357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022512
152975	NC_008268	AGG	2	6	5966358	5966363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022512
152976	NC_008268	CTG	2	6	5966372	5966377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022512
152977	NC_008268	CTCG	2	8	5966380	5966387	0 %	25 %	25 %	50 %	111022512
152978	NC_008268	GAC	2	6	5966399	5966404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022512
152979	NC_008268	GGA	2	6	5966443	5966448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152980	NC_008268	CGG	2	6	5966504	5966509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022513
152981	NC_008268	GGC	2	6	5966588	5966593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022513
152982	NC_008268	GTC	2	6	5966622	5966627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022513
152983	NC_008268	AGG	2	6	5966647	5966652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022513
152984	NC_008268	TGC	3	9	5966653	5966661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022513
152985	NC_008268	GCT	2	6	5966732	5966737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022513
152986	NC_008268	GGCG	2	8	5966820	5966827	0 %	0 %	75 %	25 %	111022514
152987	NC_008268	CTA	2	6	5966899	5966904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022514
152988	NC_008268	CAC	2	6	5966908	5966913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022514
152989	NC_008268	CGA	2	6	5966920	5966925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022514
152990	NC_008268	GGC	2	6	5966959	5966964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022514
152991	NC_008268	CCT	2	6	5967073	5967078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022514
152992	NC_008268	CCG	2	6	5967081	5967086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022514
152993	NC_008268	GC	3	6	5967257	5967262	0 %	0 %	50 %	50 %	111022514
152994	NC_008268	CCCG	2	8	5967267	5967274	0 %	0 %	25 %	75 %	111022514
152995	NC_008268	GAA	2	6	5967404	5967409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022515
152996	NC_008268	CAC	2	6	5967410	5967415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022515
152997	NC_008268	CAG	2	6	5967434	5967439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022515
152998	NC_008268	AGG	2	6	5967453	5967458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022515
152999	NC_008268	GCG	2	6	5967496	5967501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022515
153000	NC_008268	GGA	2	6	5967502	5967507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022515

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