MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
150001	NC_008268	G	7	7	5853430	5853436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
150002	NC_008268	GCAC	2	8	5853446	5853453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150003	NC_008268	GCA	2	6	5853591	5853596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150004	NC_008268	GT	3	6	5853655	5853660	0 %	50 %	50 %	0 %	111022426
150005	NC_008268	GAC	2	6	5853667	5853672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022426
150006	NC_008268	GA	3	6	5853686	5853691	50 %	0 %	50 %	0 %	111022426
150007	NC_008268	G	7	7	5853718	5853724	0 %	0 %	100 %	0 %	111022426
150008	NC_008268	CCA	2	6	5853734	5853739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022426
150009	NC_008268	G	8	8	5853754	5853761	0 %	0 %	100 %	0 %	111022426
150010	NC_008268	TCG	2	6	5854003	5854008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150011	NC_008268	CGT	2	6	5854023	5854028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150012	NC_008268	CGG	2	6	5854073	5854078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022427
150013	NC_008268	GAC	2	6	5854110	5854115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150014	NC_008268	GCA	2	6	5854128	5854133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150015	NC_008268	CCAC	2	8	5854153	5854160	25 %	0 %	0 %	75 %	111022427
150016	NC_008268	ATC	2	6	5854161	5854166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022427
150017	NC_008268	CA	3	6	5854180	5854185	50 %	0 %	0 %	50 %	111022427
150018	NC_008268	CGG	2	6	5854246	5854251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022427
150019	NC_008268	GTCG	2	8	5854259	5854266	0 %	25 %	50 %	25 %	111022427
150020	NC_008268	GC	3	6	5854272	5854277	0 %	0 %	50 %	50 %	111022427
150021	NC_008268	ACT	2	6	5854303	5854308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022427
150022	NC_008268	GTC	2	6	5854360	5854365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150023	NC_008268	CGA	2	6	5854379	5854384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022427
150024	NC_008268	CTC	2	6	5854468	5854473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022428
150025	NC_008268	CGT	2	6	5854476	5854481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150026	NC_008268	CGC	2	6	5854545	5854550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022428
150027	NC_008268	CAT	2	6	5854656	5854661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022428
150028	NC_008268	GC	3	6	5854714	5854719	0 %	0 %	50 %	50 %	111022428
150029	NC_008268	CGT	2	6	5854734	5854739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150030	NC_008268	TG	3	6	5854751	5854756	0 %	50 %	50 %	0 %	111022428
150031	NC_008268	CGA	2	6	5854821	5854826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150032	NC_008268	TGGC	2	8	5854830	5854837	0 %	25 %	50 %	25 %	111022428
150033	NC_008268	GTC	2	6	5855002	5855007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150034	NC_008268	GAC	2	6	5855010	5855015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150035	NC_008268	TCG	2	6	5855093	5855098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150036	NC_008268	CGG	2	6	5855102	5855107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022428
150037	NC_008268	GC	3	6	5855108	5855113	0 %	0 %	50 %	50 %	111022428
150038	NC_008268	TCGG	2	8	5855119	5855126	0 %	25 %	50 %	25 %	111022428
150039	NC_008268	GGT	2	6	5855130	5855135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022428
150040	NC_008268	CCG	2	6	5855151	5855156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022428
150041	NC_008268	CGG	2	6	5855243	5855248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022428
150042	NC_008268	TCG	2	6	5855250	5855255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022428
150043	NC_008268	GCC	2	6	5855273	5855278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022428
150044	NC_008268	ACGCG	2	10	5855301	5855310	20 %	0 %	40 %	40 %	111022428
150045	NC_008268	GTG	2	6	5855332	5855337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022428
150046	NC_008268	AC	3	6	5855352	5855357	50 %	0 %	0 %	50 %	111022428
150047	NC_008268	CAC	2	6	5855366	5855371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022428
150048	NC_008268	GCACG	2	10	5855433	5855442	20 %	0 %	40 %	40 %	111022428
150049	NC_008268	CGAC	2	8	5855465	5855472	25 %	0 %	25 %	50 %	111022428
150050	NC_008268	CGG	2	6	5855475	5855480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022428
150051	NC_008268	GGC	2	6	5855535	5855540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022428
150052	NC_008268	CCTC	2	8	5855559	5855566	0 %	25 %	0 %	75 %	111022428
150053	NC_008268	CGG	2	6	5855571	5855576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022428
150054	NC_008268	CCG	2	6	5855579	5855584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022428
150055	NC_008268	GC	3	6	5855593	5855598	0 %	0 %	50 %	50 %	111022428
150056	NC_008268	GCG	2	6	5855812	5855817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022429
150057	NC_008268	TGC	2	6	5855842	5855847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022429
150058	NC_008268	CCGC	2	8	5855852	5855859	0 %	0 %	25 %	75 %	111022429
150059	NC_008268	TCGGGC	2	12	5855866	5855877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022429
150060	NC_008268	GTG	2	6	5855880	5855885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022429
150061	NC_008268	GACGG	2	10	5855922	5855931	20 %	0 %	60 %	20 %	111022429
150062	NC_008268	AC	3	6	5855945	5855950	50 %	0 %	0 %	50 %	111022429
150063	NC_008268	GTC	2	6	5855964	5855969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022429
150064	NC_008268	TCC	2	6	5856108	5856113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022430
150065	NC_008268	GCG	2	6	5856176	5856181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022430
150066	NC_008268	TCC	2	6	5856228	5856233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022430
150067	NC_008268	CCA	2	6	5856256	5856261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022430
150068	NC_008268	TCC	2	6	5856284	5856289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022430
150069	NC_008268	GAT	2	6	5856434	5856439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022430
150070	NC_008268	GC	3	6	5856485	5856490	0 %	0 %	50 %	50 %	111022430
150071	NC_008268	TCC	2	6	5856504	5856509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022430
150072	NC_008268	CCG	2	6	5856540	5856545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022430
150073	NC_008268	GC	3	6	5856642	5856647	0 %	0 %	50 %	50 %	111022430
150074	NC_008268	TG	3	6	5856693	5856698	0 %	50 %	50 %	0 %	111022430
150075	NC_008268	CG	4	8	5856741	5856748	0 %	0 %	50 %	50 %	111022430
150076	NC_008268	CG	3	6	5856792	5856797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150077	NC_008268	TCT	2	6	5856954	5856959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022431
150078	NC_008268	GCA	2	6	5856963	5856968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150079	NC_008268	TCG	3	9	5856989	5856997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150080	NC_008268	GC	3	6	5857041	5857046	0 %	0 %	50 %	50 %	111022431
150081	NC_008268	GCT	2	6	5857107	5857112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150082	NC_008268	ACCGG	2	10	5857285	5857294	20 %	0 %	40 %	40 %	111022431
150083	NC_008268	CAG	2	6	5857342	5857347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150084	NC_008268	CGT	3	9	5857383	5857391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150085	NC_008268	AGC	3	9	5857424	5857432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150086	NC_008268	GC	3	6	5857441	5857446	0 %	0 %	50 %	50 %	111022431
150087	NC_008268	CGA	2	6	5857452	5857457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150088	NC_008268	GCT	2	6	5857458	5857463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150089	NC_008268	GCA	2	6	5857464	5857469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150090	NC_008268	TGA	2	6	5857509	5857514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022431
150091	NC_008268	AGC	2	6	5857517	5857522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022431
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150095	NC_008268	GAG	2	6	5857687	5857692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022431
150096	NC_008268	CATCGT	2	12	5857699	5857710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111022431
150097	NC_008268	AC	3	6	5857722	5857727	50 %	0 %	0 %	50 %	111022431
150098	NC_008268	GTC	2	6	5857744	5857749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022431
150099	NC_008268	CG	3	6	5857798	5857803	0 %	0 %	50 %	50 %	111022431
150100	NC_008268	GCG	2	6	5857856	5857861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022431
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150102	NC_008268	TGG	2	6	5858013	5858018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022431
150103	NC_008268	TGCGG	2	10	5858031	5858040	0 %	20 %	60 %	20 %	111022431
150104	NC_008268	TGG	2	6	5858113	5858118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150105	NC_008268	CCG	2	6	5858127	5858132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150106	NC_008268	CGT	2	6	5858136	5858141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150107	NC_008268	CCCG	2	8	5858150	5858157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150108	NC_008268	GCC	2	6	5858166	5858171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150109	NC_008268	CGT	2	6	5858251	5858256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022432
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150114	NC_008268	CCG	2	6	5858360	5858365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022432
150115	NC_008268	ACGT	2	8	5858422	5858429	25 %	25 %	25 %	25 %	111022432
150116	NC_008268	CGACGG	2	12	5858439	5858450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111022432
150117	NC_008268	ACGGC	2	10	5858477	5858486	20 %	0 %	40 %	40 %	111022432
150118	NC_008268	GGA	2	6	5858529	5858534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022432
150119	NC_008268	AC	3	6	5858576	5858581	50 %	0 %	0 %	50 %	111022432
150120	NC_008268	GGA	2	6	5858586	5858591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022432
150121	NC_008268	CG	3	6	5858621	5858626	0 %	0 %	50 %	50 %	111022432
150122	NC_008268	CGG	2	6	5858655	5858660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
150123	NC_008268	GCT	2	6	5858664	5858669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022432
150124	NC_008268	CCG	2	6	5858708	5858713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022432
150125	NC_008268	GA	3	6	5858732	5858737	50 %	0 %	50 %	0 %	111022432
150126	NC_008268	GGT	2	6	5858850	5858855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022432
150127	NC_008268	CG	3	6	5858874	5858879	0 %	0 %	50 %	50 %	111022432
150128	NC_008268	ACCG	2	8	5858883	5858890	25 %	0 %	25 %	50 %	111022432
150129	NC_008268	TGA	2	6	5858915	5858920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022432
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150131	NC_008268	CGG	2	6	5859000	5859005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
150132	NC_008268	GGC	2	6	5859020	5859025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
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150134	NC_008268	CGG	2	6	5859063	5859068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
150135	NC_008268	TCCGG	2	10	5859069	5859078	0 %	20 %	40 %	40 %	111022432
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150139	NC_008268	GCGG	2	8	5859245	5859252	0 %	0 %	75 %	25 %	111022432
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150142	NC_008268	GGC	2	6	5859368	5859373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
150143	NC_008268	TTC	2	6	5859388	5859393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022432
150144	NC_008268	GGTG	2	8	5859441	5859448	0 %	25 %	75 %	0 %	111022432
150145	NC_008268	ACCG	2	8	5859499	5859506	25 %	0 %	25 %	50 %	111022432
150146	NC_008268	GTC	2	6	5859516	5859521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022432
150147	NC_008268	TTC	2	6	5859526	5859531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022432
150148	NC_008268	TGC	2	6	5859533	5859538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022432
150149	NC_008268	CCG	2	6	5859539	5859544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022432
150150	NC_008268	CGGGG	2	10	5859552	5859561	0 %	0 %	80 %	20 %	111022432
150151	NC_008268	CGG	2	6	5859596	5859601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022432
150152	NC_008268	CTGC	2	8	5859619	5859626	0 %	25 %	25 %	50 %	111022432
150153	NC_008268	CGG	2	6	5859638	5859643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150154	NC_008268	CGG	2	6	5859652	5859657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150155	NC_008268	CGG	3	9	5859698	5859706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022433
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150157	NC_008268	CGA	2	6	5859753	5859758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022433
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150198	NC_008268	CGA	2	6	5861379	5861384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022433
150199	NC_008268	GCC	2	6	5861394	5861399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022433
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150201	NC_008268	AAAC	2	8	5861642	5861649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150202	NC_008268	TGT	2	6	5861654	5861659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150203	NC_008268	CG	3	6	5861690	5861695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150204	NC_008268	GC	3	6	5861795	5861800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150205	NC_008268	CCG	2	6	5861927	5861932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022434
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150209	NC_008268	CGA	2	6	5862123	5862128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150210	NC_008268	TTCCG	2	10	5862160	5862169	0 %	40 %	20 %	40 %	111022434
150211	NC_008268	GC	3	6	5862204	5862209	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150212	NC_008268	GCA	2	6	5862215	5862220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150213	NC_008268	TCC	2	6	5862233	5862238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022434
150214	NC_008268	CGA	2	6	5862276	5862281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150215	NC_008268	CAC	2	6	5862307	5862312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022434
150216	NC_008268	CGG	2	6	5862374	5862379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022434
150217	NC_008268	CG	3	6	5862388	5862393	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150218	NC_008268	GTC	2	6	5862427	5862432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150219	NC_008268	GAA	2	6	5862433	5862438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022434
150220	NC_008268	GC	3	6	5862442	5862447	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150221	NC_008268	CGA	2	6	5862515	5862520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150222	NC_008268	GC	3	6	5862551	5862556	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150223	NC_008268	AGC	2	6	5862568	5862573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150224	NC_008268	CGC	2	6	5862585	5862590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022434
150225	NC_008268	GACC	2	8	5862615	5862622	25 %	0 %	25 %	50 %	111022434
150226	NC_008268	GAC	2	6	5862697	5862702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150227	NC_008268	GTG	2	6	5862703	5862708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022434
150228	NC_008268	GCAC	2	8	5862727	5862734	25 %	0 %	25 %	50 %	111022434
150229	NC_008268	GGC	2	6	5862757	5862762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022434
150230	NC_008268	TCCGA	2	10	5862780	5862789	20 %	20 %	20 %	40 %	111022434
150231	NC_008268	TCGG	2	8	5862793	5862800	0 %	25 %	50 %	25 %	111022434
150232	NC_008268	TGA	2	6	5862824	5862829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022434
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150328	NC_008268	TGC	2	6	5866047	5866052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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150330	NC_008268	TGCC	2	8	5866094	5866101	0 %	25 %	25 %	50 %	111022434
150331	NC_008268	CGA	2	6	5866134	5866139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150332	NC_008268	GGCT	2	8	5866240	5866247	0 %	25 %	50 %	25 %	111022434
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150334	NC_008268	TGGCTG	2	12	5866295	5866306	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111022434
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150339	NC_008268	CTG	2	6	5866597	5866602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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150341	NC_008268	CG	3	6	5866683	5866688	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150342	NC_008268	GCC	2	6	5866699	5866704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022434
150343	NC_008268	CAC	2	6	5866720	5866725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022434
150344	NC_008268	ACG	2	6	5866751	5866756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150345	NC_008268	GTTG	2	8	5866776	5866783	0 %	50 %	50 %	0 %	111022434
150346	NC_008268	CGA	3	9	5866866	5866874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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150348	NC_008268	GCT	2	6	5866908	5866913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150349	NC_008268	CTG	2	6	5866918	5866923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150350	NC_008268	CCGCA	2	10	5866929	5866938	20 %	0 %	20 %	60 %	111022434
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150352	NC_008268	CTG	2	6	5867002	5867007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150353	NC_008268	GCT	2	6	5867016	5867021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150354	NC_008268	GAC	2	6	5867038	5867043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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150369	NC_008268	CG	4	8	5867808	5867815	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
150370	NC_008268	GTTC	2	8	5867847	5867854	0 %	50 %	25 %	25 %	111022434
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150372	NC_008268	CGT	2	6	5867970	5867975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150373	NC_008268	CG	3	6	5868016	5868021	0 %	0 %	50 %	50 %	111022434
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150417	NC_008268	TGC	2	6	5869931	5869936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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150440	NC_008268	GCGG	2	8	5870902	5870909	0 %	0 %	75 %	25 %	111022434
150441	NC_008268	G	6	6	5870920	5870925	0 %	0 %	100 %	0 %	111022434
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150443	NC_008268	ATCC	2	8	5871017	5871024	25 %	25 %	0 %	50 %	111022434
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150445	NC_008268	GCGTC	2	10	5871143	5871152	0 %	20 %	40 %	40 %	111022434
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150449	NC_008268	CGT	2	6	5871638	5871643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150450	NC_008268	CGCC	2	8	5871654	5871661	0 %	0 %	25 %	75 %	111022434
150451	NC_008268	GAACT	2	10	5871664	5871673	40 %	20 %	20 %	20 %	111022434
150452	NC_008268	TCG	3	9	5871703	5871711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022434
150453	NC_008268	GAT	2	6	5871735	5871740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022434
150454	NC_008268	TGG	2	6	5871767	5871772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022434
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150457	NC_008268	CAT	2	6	5871840	5871845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022434
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150461	NC_008268	CGA	2	6	5871888	5871893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022434
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