MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
149001	NC_008268	TGC	2	6	5812957	5812962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022410
149002	NC_008268	CGA	2	6	5812976	5812981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022410
149003	NC_008268	CGA	2	6	5813078	5813083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022410
149004	NC_008268	GGCC	2	8	5813229	5813236	0 %	0 %	50 %	50 %	111022410
149005	NC_008268	TCG	2	6	5813346	5813351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149006	NC_008268	CTC	2	6	5813407	5813412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022411
149007	NC_008268	TTC	2	6	5813453	5813458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022411
149008	NC_008268	AGC	2	6	5813463	5813468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149009	NC_008268	CGC	2	6	5813488	5813493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022411
149010	NC_008268	CGG	2	6	5813503	5813508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022411
149011	NC_008268	CTG	2	6	5813609	5813614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149012	NC_008268	CTC	2	6	5813623	5813628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022411
149013	NC_008268	AGG	2	6	5813664	5813669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022411
149014	NC_008268	ACG	2	6	5813703	5813708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149015	NC_008268	CAT	2	6	5813734	5813739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022411
149016	NC_008268	CCG	2	6	5813755	5813760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022411
149017	NC_008268	C	6	6	5813826	5813831	0 %	0 %	0 %	100 %	111022411
149018	NC_008268	CGA	2	6	5813869	5813874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149019	NC_008268	CGC	2	6	5813879	5813884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022411
149020	NC_008268	CGA	2	6	5813947	5813952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149021	NC_008268	CCT	2	6	5813974	5813979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022411
149022	NC_008268	ACG	2	6	5813988	5813993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149023	NC_008268	CGA	2	6	5814030	5814035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149024	NC_008268	CGA	2	6	5814061	5814066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022411
149025	NC_008268	CTC	2	6	5814128	5814133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022411
149026	NC_008268	CCA	2	6	5814198	5814203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022411
149027	NC_008268	CGTCGA	2	12	5814385	5814396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022412
149028	NC_008268	CGG	2	6	5814420	5814425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022412
149029	NC_008268	CGC	2	6	5814478	5814483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022412
149030	NC_008268	AGG	2	6	5814513	5814518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022412
149031	NC_008268	CGC	2	6	5814580	5814585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022412
149032	NC_008268	GACCT	2	10	5814587	5814596	20 %	20 %	20 %	40 %	111022412
149033	NC_008268	TCA	2	6	5814609	5814614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022412
149034	NC_008268	CGG	2	6	5814642	5814647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022412
149035	NC_008268	CCGG	2	8	5814719	5814726	0 %	0 %	50 %	50 %	111022412
149036	NC_008268	TTC	2	6	5814759	5814764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022412
149037	NC_008268	CGACCG	2	12	5814820	5814831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022412
149038	NC_008268	CGA	2	6	5814957	5814962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022412
149039	NC_008268	TCA	2	6	5814972	5814977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022412
149040	NC_008268	ACG	2	6	5815044	5815049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022412
149041	NC_008268	CGC	2	6	5815061	5815066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022412
149042	NC_008268	CGG	2	6	5815090	5815095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022412
149043	NC_008268	CTGC	2	8	5815099	5815106	0 %	25 %	25 %	50 %	111022412
149044	NC_008268	TCC	2	6	5815170	5815175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022412
149045	NC_008268	ACA	2	6	5815185	5815190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022412
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149047	NC_008268	GCTC	2	8	5815222	5815229	0 %	25 %	25 %	50 %	111022412
149048	NC_008268	CGA	2	6	5815297	5815302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022412
149049	NC_008268	AAC	3	9	5815385	5815393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022412
149050	NC_008268	CGT	2	6	5815459	5815464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022412
149051	NC_008268	GACG	2	8	5815547	5815554	25 %	0 %	50 %	25 %	111022412
149052	NC_008268	GCG	2	6	5815583	5815588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022412
149053	NC_008268	CTGTG	2	10	5815656	5815665	0 %	40 %	40 %	20 %	111022413
149054	NC_008268	CGG	2	6	5815672	5815677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022413
149055	NC_008268	TGA	2	6	5815709	5815714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022413
149056	NC_008268	CAT	2	6	5815746	5815751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022413
149057	NC_008268	GTG	2	6	5815808	5815813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022413
149058	NC_008268	ACG	2	6	5815817	5815822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022413
149059	NC_008268	CG	3	6	5815863	5815868	0 %	0 %	50 %	50 %	111022413
149060	NC_008268	ACG	2	6	5815892	5815897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022413
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149062	NC_008268	CACCC	2	10	5815964	5815973	20 %	0 %	0 %	80 %	111022413
149063	NC_008268	CCA	3	9	5815976	5815984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022413
149064	NC_008268	TCG	2	6	5816042	5816047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022413
149065	NC_008268	ACC	2	6	5816060	5816065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022413
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149069	NC_008268	TCG	2	6	5816281	5816286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022414
149070	NC_008268	GCT	2	6	5816297	5816302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022414
149071	NC_008268	CAC	2	6	5816327	5816332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022414
149072	NC_008268	CCA	2	6	5816425	5816430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022414
149073	NC_008268	CAC	2	6	5816444	5816449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022414
149074	NC_008268	CCGTG	2	10	5816457	5816466	0 %	20 %	40 %	40 %	111022414
149075	NC_008268	TAC	3	9	5816490	5816498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022414
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149081	NC_008268	CG	3	6	5816674	5816679	0 %	0 %	50 %	50 %	111022414
149082	NC_008268	CCG	2	6	5816795	5816800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022415
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149086	NC_008268	GGAGGT	2	12	5816904	5816915	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	111022415
149087	NC_008268	CGCC	2	8	5816946	5816953	0 %	0 %	25 %	75 %	111022415
149088	NC_008268	TCT	2	6	5816998	5817003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022415
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149090	NC_008268	TCG	2	6	5817076	5817081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149091	NC_008268	GACA	2	8	5817221	5817228	50 %	0 %	25 %	25 %	111022415
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149093	NC_008268	ATC	2	6	5817438	5817443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022415
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149096	NC_008268	TGG	2	6	5817534	5817539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022415
149097	NC_008268	ACG	2	6	5817543	5817548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149098	NC_008268	TGA	2	6	5817551	5817556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022415
149099	NC_008268	TCG	2	6	5817568	5817573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149100	NC_008268	TCG	2	6	5817580	5817585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149101	NC_008268	CGGA	2	8	5817623	5817630	25 %	0 %	50 %	25 %	111022415
149102	NC_008268	TGC	2	6	5817649	5817654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149103	NC_008268	TGG	2	6	5817675	5817680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022415
149104	NC_008268	CTA	2	6	5817689	5817694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022415
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149106	NC_008268	CAT	2	6	5817791	5817796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022415
149107	NC_008268	ACG	2	6	5817801	5817806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022415
149108	NC_008268	TGG	2	6	5817811	5817816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022415
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149110	NC_008268	TCT	2	6	5817961	5817966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022415
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149113	NC_008268	CGG	2	6	5818062	5818067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022415
149114	NC_008268	TTC	2	6	5818132	5818137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022416
149115	NC_008268	CGG	2	6	5818172	5818177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022416
149116	NC_008268	ATTGC	2	10	5818292	5818301	20 %	40 %	20 %	20 %	111022416
149117	NC_008268	GCC	2	6	5818341	5818346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022416
149118	NC_008268	GC	3	6	5818351	5818356	0 %	0 %	50 %	50 %	111022416
149119	NC_008268	CCG	2	6	5818358	5818363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022416
149120	NC_008268	GGC	2	6	5818380	5818385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022416
149121	NC_008268	ATC	2	6	5818454	5818459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022417
149122	NC_008268	CTGGA	2	10	5818469	5818478	20 %	20 %	40 %	20 %	111022417
149123	NC_008268	GTGG	2	8	5818570	5818577	0 %	25 %	75 %	0 %	111022417
149124	NC_008268	CGGC	2	8	5818603	5818610	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149125	NC_008268	GC	3	6	5818639	5818644	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149126	NC_008268	TGA	2	6	5818705	5818710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022417
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149128	NC_008268	CGTGT	2	10	5818827	5818836	0 %	40 %	40 %	20 %	111022417
149129	NC_008268	GCC	2	6	5818850	5818855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022417
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149132	NC_008268	TCG	2	6	5818896	5818901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022417
149133	NC_008268	GCCG	2	8	5818982	5818989	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149134	NC_008268	CG	3	6	5818988	5818993	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149135	NC_008268	G	6	6	5819017	5819022	0 %	0 %	100 %	0 %	111022417
149136	NC_008268	TC	3	6	5819029	5819034	0 %	50 %	0 %	50 %	111022417
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149143	NC_008268	ATCG	2	8	5819381	5819388	25 %	25 %	25 %	25 %	111022417
149144	NC_008268	GCTG	2	8	5819389	5819396	0 %	25 %	50 %	25 %	111022417
149145	NC_008268	GCCC	2	8	5819482	5819489	0 %	0 %	25 %	75 %	111022417
149146	NC_008268	CG	3	6	5819494	5819499	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149147	NC_008268	AGT	2	6	5819527	5819532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022417
149148	NC_008268	GCA	2	6	5819574	5819579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022417
149149	NC_008268	TCG	2	6	5819670	5819675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022417
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149153	NC_008268	GTCGGC	2	12	5819966	5819977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022417
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149155	NC_008268	GC	3	6	5820044	5820049	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149156	NC_008268	CG	3	6	5820062	5820067	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
149157	NC_008268	CCA	4	12	5820106	5820117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022417
149158	NC_008268	C	6	6	5820132	5820137	0 %	0 %	0 %	100 %	111022417
149159	NC_008268	TGC	2	6	5820169	5820174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022417
149160	NC_008268	CGA	2	6	5820198	5820203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022417
149161	NC_008268	GTG	2	6	5820344	5820349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149162	NC_008268	ATT	2	6	5820366	5820371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149166	NC_008268	ACCG	2	8	5820648	5820655	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
149167	NC_008268	TGCC	2	8	5820656	5820663	0 %	25 %	25 %	50 %	111022418
149168	NC_008268	GGT	2	6	5820719	5820724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
149169	NC_008268	CGA	2	6	5820737	5820742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149172	NC_008268	ACT	2	6	5820886	5820891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022418
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149201	NC_008268	CGG	2	6	5822116	5822121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
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149208	NC_008268	CG	4	8	5822372	5822379	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
149209	NC_008268	ACG	2	6	5822389	5822394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149213	NC_008268	CTG	2	6	5822457	5822462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149220	NC_008268	GTC	2	6	5822773	5822778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149221	NC_008268	TCG	2	6	5822917	5822922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149222	NC_008268	ACC	2	6	5822986	5822991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
149223	NC_008268	TCG	2	6	5823001	5823006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149224	NC_008268	GTG	2	6	5823141	5823146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
149225	NC_008268	GCG	2	6	5823157	5823162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
149226	NC_008268	CGAC	2	8	5823163	5823170	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
149227	NC_008268	CGC	3	9	5823191	5823199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149228	NC_008268	CG	3	6	5823279	5823284	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
149229	NC_008268	CGT	2	6	5823299	5823304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149230	NC_008268	CG	3	6	5823315	5823320	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
149231	NC_008268	GAA	2	6	5823336	5823341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022418
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149233	NC_008268	TTC	2	6	5823402	5823407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022418
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149235	NC_008268	CTG	2	6	5823513	5823518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149236	NC_008268	GCC	2	6	5823519	5823524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149237	NC_008268	TTCGCG	2	12	5823536	5823547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149240	NC_008268	CGCC	2	8	5823652	5823659	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
149241	NC_008268	TCG	3	9	5823673	5823681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149259	NC_008268	CGA	2	6	5824361	5824366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149334	NC_008268	CG	3	6	5827377	5827382	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
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149337	NC_008268	TGCGC	2	10	5827427	5827436	0 %	20 %	40 %	40 %	111022418
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149341	NC_008268	GCC	2	6	5827644	5827649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149342	NC_008268	GACCTG	2	12	5827686	5827697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149343	NC_008268	GAC	2	6	5827719	5827724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149344	NC_008268	TGC	2	6	5827807	5827812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149455	NC_008268	CCG	2	6	5832220	5832225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149456	NC_008268	TGC	2	6	5832232	5832237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149457	NC_008268	CGC	2	6	5832251	5832256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149458	NC_008268	CGC	2	6	5832287	5832292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149459	NC_008268	CGG	2	6	5832421	5832426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
149460	NC_008268	CGC	2	6	5832638	5832643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149461	NC_008268	GAG	2	6	5832651	5832656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022418
149462	NC_008268	TCG	2	6	5832679	5832684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149463	NC_008268	GCA	2	6	5832722	5832727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149464	NC_008268	CACTG	2	10	5832815	5832824	20 %	20 %	20 %	40 %	111022418
149465	NC_008268	GCC	2	6	5832828	5832833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149466	NC_008268	TGC	2	6	5832862	5832867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149467	NC_008268	GTC	2	6	5832909	5832914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149468	NC_008268	CGC	2	6	5832917	5832922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
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149470	NC_008268	CCA	2	6	5832990	5832995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
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149472	NC_008268	CGT	3	9	5833037	5833045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149473	NC_008268	TGC	2	6	5833048	5833053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149474	NC_008268	CG	3	6	5833178	5833183	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
149475	NC_008268	ACT	2	6	5833246	5833251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022418
149476	NC_008268	CCCT	2	8	5833275	5833282	0 %	25 %	0 %	75 %	111022418
149477	NC_008268	GCTGCC	2	12	5833283	5833294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022418
149478	NC_008268	ACCG	2	8	5833317	5833324	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
149479	NC_008268	CCG	2	6	5833357	5833362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149480	NC_008268	CAC	2	6	5833368	5833373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
149481	NC_008268	TGC	2	6	5833420	5833425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149482	NC_008268	CGC	2	6	5833427	5833432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149483	NC_008268	TGT	2	6	5833444	5833449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022418
149484	NC_008268	GAC	2	6	5833467	5833472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149485	NC_008268	CGA	2	6	5833517	5833522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149486	NC_008268	TCG	2	6	5833537	5833542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149487	NC_008268	CGC	2	6	5833598	5833603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149488	NC_008268	CGC	2	6	5833622	5833627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
149489	NC_008268	TCGG	2	8	5833686	5833693	0 %	25 %	50 %	25 %	111022418
149490	NC_008268	CTG	2	6	5833747	5833752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149491	NC_008268	GGCACC	2	12	5833791	5833802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022418
149492	NC_008268	GCG	2	6	5833840	5833845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
149493	NC_008268	CGGT	2	8	5833858	5833865	0 %	25 %	50 %	25 %	111022418
149494	NC_008268	CTG	2	6	5833935	5833940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
149495	NC_008268	TGC	2	6	5833945	5833950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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149498	NC_008268	TCGA	2	8	5833986	5833993	25 %	25 %	25 %	25 %	111022418
149499	NC_008268	AACGC	2	10	5834011	5834020	40 %	0 %	20 %	40 %	111022418
149500	NC_008268	CAC	2	6	5834044	5834049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418

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