MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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146504	NC_008268	AGC	2	6	5708680	5708685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022322
146505	NC_008268	GGGC	2	8	5708735	5708742	0 %	0 %	75 %	25 %	111022322
146506	NC_008268	CGT	2	6	5708747	5708752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022322
146507	NC_008268	GTC	2	6	5708778	5708783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022322
146508	NC_008268	G	6	6	5708846	5708851	0 %	0 %	100 %	0 %	111022322
146509	NC_008268	CCGTCG	2	12	5708860	5708871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022322
146510	NC_008268	GC	3	6	5708876	5708881	0 %	0 %	50 %	50 %	111022322
146511	NC_008268	CG	3	6	5708892	5708897	0 %	0 %	50 %	50 %	111022322
146512	NC_008268	CGC	2	6	5708942	5708947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022322
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146826	NC_008268	ACGG	2	8	5720325	5720332	25 %	0 %	50 %	25 %	111022336
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146830	NC_008268	GCAA	2	8	5720414	5720421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146831	NC_008268	TAT	2	6	5720465	5720470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146844	NC_008268	GCG	2	6	5720927	5720932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022338
146845	NC_008268	CGA	2	6	5720991	5720996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022338
146846	NC_008268	GCGA	2	8	5721007	5721014	25 %	0 %	50 %	25 %	111022338
146847	NC_008268	TGG	2	6	5721044	5721049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022338
146848	NC_008268	GTG	2	6	5721082	5721087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022338
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146850	NC_008268	CGG	2	6	5721149	5721154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022338
146851	NC_008268	CGG	2	6	5721184	5721189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022338
146852	NC_008268	CTACGG	2	12	5721210	5721221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022338
146853	NC_008268	GTT	2	6	5721243	5721248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022338
146854	NC_008268	CGT	2	6	5721249	5721254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022338
146855	NC_008268	TGA	2	6	5721257	5721262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022338
146856	NC_008268	GTC	2	6	5721277	5721282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022338
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146864	NC_008268	CCTC	2	8	5721473	5721480	0 %	25 %	0 %	75 %	111022338
146865	NC_008268	CGG	2	6	5721498	5721503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022338
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146869	NC_008268	GC	3	6	5721586	5721591	0 %	0 %	50 %	50 %	111022338
146870	NC_008268	CGG	2	6	5721601	5721606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022338
146871	NC_008268	CGC	2	6	5721657	5721662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022338
146872	NC_008268	GGT	2	6	5721672	5721677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022338
146873	NC_008268	CAC	2	6	5721712	5721717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022338
146874	NC_008268	AC	4	8	5721795	5721802	50 %	0 %	0 %	50 %	111022338
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146876	NC_008268	CGGT	2	8	5721869	5721876	0 %	25 %	50 %	25 %	111022338
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146881	NC_008268	TGG	2	6	5722008	5722013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022339
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146897	NC_008268	GC	3	6	5722502	5722507	0 %	0 %	50 %	50 %	111022339
146898	NC_008268	TGCC	2	8	5722542	5722549	0 %	25 %	25 %	50 %	111022339
146899	NC_008268	GGC	2	6	5722568	5722573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022339
146900	NC_008268	CGA	2	6	5722591	5722596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022339
146901	NC_008268	GCC	2	6	5722630	5722635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022339
146902	NC_008268	CGG	2	6	5722679	5722684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022339
146903	NC_008268	CGC	2	6	5722690	5722695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022339
146904	NC_008268	CAC	2	6	5722724	5722729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022339
146905	NC_008268	CAC	2	6	5722741	5722746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146906	NC_008268	GC	3	6	5722929	5722934	0 %	0 %	50 %	50 %	111022340
146907	NC_008268	GTG	2	6	5723021	5723026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022340
146908	NC_008268	CAG	2	6	5723051	5723056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022340
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146911	NC_008268	GGC	2	6	5723288	5723293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022340
146912	NC_008268	GCAC	2	8	5723353	5723360	25 %	0 %	25 %	50 %	111022340
146913	NC_008268	ATA	2	6	5723396	5723401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111022340
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146923	NC_008268	TCG	2	6	5723667	5723672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022340
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146944	NC_008268	CAG	2	6	5724359	5724364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022340
146945	NC_008268	CCG	2	6	5724434	5724439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022340
146946	NC_008268	GAGCC	2	10	5724512	5724521	20 %	0 %	40 %	40 %	111022340
146947	NC_008268	TCC	2	6	5724525	5724530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022340
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146951	NC_008268	GGC	2	6	5724647	5724652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022340
146952	NC_008268	GGC	2	6	5724683	5724688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022340
146953	NC_008268	GTC	2	6	5724701	5724706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022340
146954	NC_008268	GGC	2	6	5724797	5724802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022340
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