MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145501	NC_008268	GC	3	6	5669653	5669658	0 %	0 %	50 %	50 %	111022292
145502	NC_008268	CGG	3	9	5669673	5669681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022292
145503	NC_008268	CGGG	2	8	5669703	5669710	0 %	0 %	75 %	25 %	111022292
145504	NC_008268	GCT	2	6	5669727	5669732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022292
145505	NC_008268	ACC	2	6	5669734	5669739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022292
145506	NC_008268	CAC	2	6	5669748	5669753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022292
145507	NC_008268	GAA	2	6	5669772	5669777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022292
145508	NC_008268	CGA	2	6	5669838	5669843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022292
145509	NC_008268	ATC	2	6	5669887	5669892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022292
145510	NC_008268	CGC	2	6	5669938	5669943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022292
145511	NC_008268	CGA	2	6	5669997	5670002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022292
145512	NC_008268	GCA	2	6	5670054	5670059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022292
145513	NC_008268	GGC	2	6	5670067	5670072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022292
145514	NC_008268	CTCG	2	8	5670135	5670142	0 %	25 %	25 %	50 %	111022292
145515	NC_008268	CTG	2	6	5670187	5670192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022292
145516	NC_008268	GCT	2	6	5670366	5670371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145517	NC_008268	TTC	2	6	5670376	5670381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145518	NC_008268	CCGT	2	8	5670383	5670390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145519	NC_008268	TCGCGG	2	12	5670448	5670459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022293
145520	NC_008268	GAT	2	6	5670467	5670472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022293
145521	NC_008268	GAT	2	6	5670542	5670547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022293
145522	NC_008268	TCA	2	6	5670586	5670591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022293
145523	NC_008268	TGA	2	6	5670685	5670690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022293
145524	NC_008268	CACC	2	8	5670695	5670702	25 %	0 %	0 %	75 %	111022293
145525	NC_008268	CCGT	2	8	5670711	5670718	0 %	25 %	25 %	50 %	111022293
145526	NC_008268	GTG	2	6	5670753	5670758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022293
145527	NC_008268	TCC	2	6	5670763	5670768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022293
145528	NC_008268	TCAG	2	8	5670769	5670776	25 %	25 %	25 %	25 %	111022293
145529	NC_008268	TCT	2	6	5670808	5670813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022293
145530	NC_008268	CAC	2	6	5670833	5670838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022293
145531	NC_008268	CGC	2	6	5670935	5670940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022293
145532	NC_008268	GAC	2	6	5670969	5670974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022293
145533	NC_008268	TCT	2	6	5670988	5670993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022293
145534	NC_008268	CAA	2	6	5671067	5671072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022293
145535	NC_008268	GCG	2	6	5671107	5671112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022293
145536	NC_008268	ACC	2	6	5671176	5671181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022294
145537	NC_008268	AGT	2	6	5671184	5671189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022294
145538	NC_008268	CGT	2	6	5671190	5671195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022294
145539	NC_008268	GCA	2	6	5671221	5671226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022294
145540	NC_008268	GGC	2	6	5671235	5671240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022294
145541	NC_008268	ACCG	2	8	5671269	5671276	25 %	0 %	25 %	50 %	111022294
145542	NC_008268	ACT	2	6	5671312	5671317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022294
145543	NC_008268	CGGCA	2	10	5671377	5671386	20 %	0 %	40 %	40 %	111022294
145544	NC_008268	TCGC	2	8	5671398	5671405	0 %	25 %	25 %	50 %	111022294
145545	NC_008268	CGG	2	6	5671433	5671438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022294
145546	NC_008268	ATG	2	6	5671491	5671496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022294
145547	NC_008268	TCG	2	6	5671516	5671521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022294
145548	NC_008268	CGT	2	6	5671609	5671614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022294
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145552	NC_008268	GGATG	2	10	5671678	5671687	20 %	20 %	60 %	0 %	111022294
145553	NC_008268	GGA	2	6	5671694	5671699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022294
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145555	NC_008268	CGTC	2	8	5671723	5671730	0 %	25 %	25 %	50 %	111022294
145556	NC_008268	GGTG	2	8	5671778	5671785	0 %	25 %	75 %	0 %	111022294
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145558	NC_008268	GTC	2	6	5671884	5671889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022294
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145562	NC_008268	CCG	2	6	5671951	5671956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022294
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145581	NC_008268	GCG	2	6	5672466	5672471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022294
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145586	NC_008268	CAC	2	6	5672822	5672827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022295
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145588	NC_008268	GGT	2	6	5672900	5672905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022295
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145594	NC_008268	GC	3	6	5673176	5673181	0 %	0 %	50 %	50 %	111022295
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145598	NC_008268	GGCC	2	8	5673252	5673259	0 %	0 %	50 %	50 %	111022295
145599	NC_008268	TGG	2	6	5673289	5673294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022295
145600	NC_008268	TG	3	6	5673299	5673304	0 %	50 %	50 %	0 %	111022295
145601	NC_008268	CGA	2	6	5673335	5673340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022295
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145604	NC_008268	TTC	2	6	5673363	5673368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022295
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145606	NC_008268	TCG	2	6	5673448	5673453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022295
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145611	NC_008268	CGGCT	2	10	5673627	5673636	0 %	20 %	40 %	40 %	111022295
145612	NC_008268	GAC	2	6	5673705	5673710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022295
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145842	NC_008268	AC	3	6	5683961	5683966	50 %	0 %	0 %	50 %	111022302
145843	NC_008268	CCA	2	6	5683971	5683976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022302
145844	NC_008268	GTC	2	6	5683978	5683983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022302
145845	NC_008268	CGG	2	6	5684001	5684006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022302
145846	NC_008268	G	6	6	5684005	5684010	0 %	0 %	100 %	0 %	111022302
145847	NC_008268	CCG	2	6	5684022	5684027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022302
145848	NC_008268	CACCC	2	10	5684085	5684094	20 %	0 %	0 %	80 %	111022302
145849	NC_008268	GCG	2	6	5684132	5684137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022302
145850	NC_008268	CAC	3	9	5684187	5684195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022302
145851	NC_008268	CGA	2	6	5684196	5684201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022302
145852	NC_008268	CAC	2	6	5684244	5684249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022302
145853	NC_008268	GTC	2	6	5684261	5684266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022302
145854	NC_008268	CCG	2	6	5684267	5684272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022302
145855	NC_008268	TCCA	2	8	5684277	5684284	25 %	25 %	0 %	50 %	111022302
145856	NC_008268	CGA	2	6	5684286	5684291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022302
145857	NC_008268	CATCGG	2	12	5684336	5684347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022303
145858	NC_008268	CA	3	6	5684361	5684366	50 %	0 %	0 %	50 %	111022303
145859	NC_008268	GC	3	6	5684378	5684383	0 %	0 %	50 %	50 %	111022303
145860	NC_008268	TCG	2	6	5684395	5684400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022303
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145862	NC_008268	GCG	2	6	5684469	5684474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022303
145863	NC_008268	GGCAC	2	10	5684485	5684494	20 %	0 %	40 %	40 %	111022303
145864	NC_008268	TCC	2	6	5684506	5684511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022303
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145867	NC_008268	CCG	2	6	5684728	5684733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
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145869	NC_008268	CAC	2	6	5684747	5684752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022303
145870	NC_008268	TAC	2	6	5684772	5684777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022303
145871	NC_008268	CGG	3	9	5684783	5684791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022303
145872	NC_008268	CGC	2	6	5684816	5684821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
145873	NC_008268	GCT	2	6	5684963	5684968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022303
145874	NC_008268	GCC	2	6	5684988	5684993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
145875	NC_008268	CAC	2	6	5685011	5685016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022303
145876	NC_008268	GCGCC	2	10	5685050	5685059	0 %	0 %	40 %	60 %	111022303
145877	NC_008268	GTC	2	6	5685096	5685101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022303
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145879	NC_008268	GAG	2	6	5685153	5685158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022303
145880	NC_008268	CGC	2	6	5685161	5685166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
145881	NC_008268	CGG	2	6	5685167	5685172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022303
145882	NC_008268	CCA	2	6	5685190	5685195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022303
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145884	NC_008268	GCGCT	2	10	5685234	5685243	0 %	20 %	40 %	40 %	111022303
145885	NC_008268	CGA	2	6	5685275	5685280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022303
145886	NC_008268	GCC	2	6	5685306	5685311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
145887	NC_008268	GCC	2	6	5685399	5685404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022303
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145890	NC_008268	AACGC	2	10	5685532	5685541	40 %	0 %	20 %	40 %	111022303
145891	NC_008268	CACC	2	8	5685596	5685603	25 %	0 %	0 %	75 %	111022303
145892	NC_008268	CGG	2	6	5685683	5685688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022303
145893	NC_008268	CACC	2	8	5685725	5685732	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145894	NC_008268	CTGC	2	8	5685765	5685772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145895	NC_008268	GAT	2	6	5685804	5685809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145896	NC_008268	GAGCGA	2	12	5685818	5685829	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111022304
145897	NC_008268	CGA	2	6	5685845	5685850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022304
145898	NC_008268	GAC	2	6	5685885	5685890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022304
145899	NC_008268	TCG	2	6	5685904	5685909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022304
145900	NC_008268	CGA	2	6	5685935	5685940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022304
145901	NC_008268	ATC	3	9	5686032	5686040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022304
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145903	NC_008268	CTC	2	6	5686197	5686202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022304
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145921	NC_008268	CTGCAC	2	12	5686887	5686898	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111022304
145922	NC_008268	CAA	2	6	5686922	5686927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022304
145923	NC_008268	GCG	2	6	5686960	5686965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022304
145924	NC_008268	CGC	2	6	5687001	5687006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022304
145925	NC_008268	GACGC	2	10	5687009	5687018	20 %	0 %	40 %	40 %	111022304
145926	NC_008268	GCA	2	6	5687051	5687056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145927	NC_008268	CGC	2	6	5687127	5687132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022305
145928	NC_008268	CGC	2	6	5687136	5687141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022305
145929	NC_008268	GTG	3	9	5687158	5687166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022305
145930	NC_008268	CGG	2	6	5687181	5687186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022305
145931	NC_008268	GTT	2	6	5687187	5687192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022305
145932	NC_008268	CCA	2	6	5687195	5687200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022305
145933	NC_008268	CG	3	6	5687212	5687217	0 %	0 %	50 %	50 %	111022305
145934	NC_008268	TCG	2	6	5687234	5687239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022305
145935	NC_008268	CAC	2	6	5687244	5687249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022305
145936	NC_008268	CCA	2	6	5687250	5687255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022305
145937	NC_008268	CTG	2	6	5687269	5687274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022305
145938	NC_008268	GA	3	6	5687306	5687311	50 %	0 %	50 %	0 %	111022305
145939	NC_008268	GAT	2	6	5687328	5687333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022305
145940	NC_008268	CCAAC	2	10	5687343	5687352	40 %	0 %	0 %	60 %	111022305
145941	NC_008268	CAC	2	6	5687427	5687432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022305
145942	NC_008268	CCG	2	6	5687462	5687467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022305
145943	NC_008268	CGA	2	6	5687532	5687537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022305
145944	NC_008268	C	7	7	5687598	5687604	0 %	0 %	0 %	100 %	111022305
145945	NC_008268	GCT	2	6	5687616	5687621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022305
145946	NC_008268	TCG	4	12	5687627	5687638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022305
145947	NC_008268	ATC	2	6	5687740	5687745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022305
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145949	NC_008268	CGC	2	6	5687754	5687759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022305
145950	NC_008268	CAA	2	6	5687796	5687801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022305
145951	NC_008268	GCC	2	6	5687803	5687808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022305
145952	NC_008268	GAG	2	6	5687818	5687823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022305
145953	NC_008268	ACC	2	6	5687906	5687911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022305
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