MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145001	NC_008268	TCG	2	6	5651199	5651204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145002	NC_008268	TGC	2	6	5651214	5651219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145003	NC_008268	TGC	2	6	5651238	5651243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145004	NC_008268	CTG	2	6	5651249	5651254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145005	NC_008268	AGC	2	6	5651255	5651260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145006	NC_008268	GC	3	6	5651259	5651264	0 %	0 %	50 %	50 %	111022275
145007	NC_008268	ATC	2	6	5651282	5651287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022275
145008	NC_008268	CGA	2	6	5651335	5651340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145009	NC_008268	GAT	2	6	5651410	5651415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022275
145010	NC_008268	CGG	2	6	5651458	5651463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022275
145011	NC_008268	CGC	2	6	5651479	5651484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022275
145012	NC_008268	GGGT	2	8	5651523	5651530	0 %	25 %	75 %	0 %	111022275
145013	NC_008268	CGA	2	6	5651533	5651538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145014	NC_008268	GGT	2	6	5651548	5651553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022275
145015	NC_008268	ACG	2	6	5651556	5651561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022275
145016	NC_008268	CGG	2	6	5651647	5651652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022275
145017	NC_008268	CCG	2	6	5651709	5651714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022275
145018	NC_008268	GC	3	6	5651736	5651741	0 %	0 %	50 %	50 %	111022275
145019	NC_008268	GGC	2	6	5651756	5651761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022275
145020	NC_008268	CAA	2	6	5651794	5651799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145021	NC_008268	CG	3	6	5651816	5651821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145022	NC_008268	ACG	3	9	5651823	5651831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145023	NC_008268	CCGC	2	8	5651852	5651859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145024	NC_008268	CGA	2	6	5651892	5651897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145025	NC_008268	CGC	2	6	5651904	5651909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145026	NC_008268	GAG	2	6	5651947	5651952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145027	NC_008268	CGG	2	6	5651967	5651972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145028	NC_008268	ATC	2	6	5651995	5652000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145029	NC_008268	CAT	2	6	5652046	5652051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022276
145030	NC_008268	ACC	2	6	5652095	5652100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022276
145031	NC_008268	CAC	2	6	5652138	5652143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022276
145032	NC_008268	CGG	3	9	5652178	5652186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022276
145033	NC_008268	CGG	2	6	5652190	5652195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022276
145034	NC_008268	GCG	2	6	5652225	5652230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022276
145035	NC_008268	GTC	2	6	5652236	5652241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022276
145036	NC_008268	ACCG	2	8	5652307	5652314	25 %	0 %	25 %	50 %	111022276
145037	NC_008268	GCT	2	6	5652349	5652354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022276
145038	NC_008268	GTC	2	6	5652379	5652384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022276
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145040	NC_008268	GGC	2	6	5652457	5652462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022276
145041	NC_008268	ACGCG	2	10	5652493	5652502	20 %	0 %	40 %	40 %	111022276
145042	NC_008268	CGG	2	6	5652577	5652582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022276
145043	NC_008268	CTG	2	6	5652584	5652589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022276
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145045	NC_008268	CTG	2	6	5652647	5652652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022276
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145050	NC_008268	CAA	2	6	5652769	5652774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022276
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145058	NC_008268	TCGCC	2	10	5653231	5653240	0 %	20 %	20 %	60 %	111022276
145059	NC_008268	CGA	2	6	5653243	5653248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022276
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145065	NC_008268	CG	3	6	5653364	5653369	0 %	0 %	50 %	50 %	111022276
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145068	NC_008268	AACCG	2	10	5653418	5653427	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145069	NC_008268	GTG	2	6	5653459	5653464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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145073	NC_008268	TCGG	2	8	5653528	5653535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145074	NC_008268	GTC	2	6	5653551	5653556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145089	NC_008268	TCG	2	6	5653983	5653988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022277
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145100	NC_008268	TCGGC	2	10	5654377	5654386	0 %	20 %	40 %	40 %	111022277
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145106	NC_008268	TCG	2	6	5654665	5654670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145110	NC_008268	CG	3	6	5654815	5654820	0 %	0 %	50 %	50 %	111022278
145111	NC_008268	CGT	2	6	5654835	5654840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022278
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145115	NC_008268	CGGC	2	8	5654979	5654986	0 %	0 %	50 %	50 %	111022278
145116	NC_008268	CGC	3	9	5655024	5655032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022278
145117	NC_008268	GCGCTG	2	12	5655034	5655045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022278
145118	NC_008268	CGC	3	9	5655050	5655058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022278
145119	NC_008268	CGC	2	6	5655075	5655080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022278
145120	NC_008268	CGGT	2	8	5655103	5655110	0 %	25 %	50 %	25 %	111022278
145121	NC_008268	TCG	2	6	5655131	5655136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022278
145122	NC_008268	GTC	2	6	5655172	5655177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022278
145123	NC_008268	GGCGAG	2	12	5655178	5655189	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111022278
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145125	NC_008268	CTG	2	6	5655220	5655225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022278
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145223	NC_008268	CG	3	6	5658677	5658682	0 %	0 %	50 %	50 %	111022282
145224	NC_008268	TCT	2	6	5658763	5658768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022282
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145227	NC_008268	CAGGG	2	10	5658838	5658847	20 %	0 %	60 %	20 %	111022282
145228	NC_008268	CGA	2	6	5658866	5658871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022282
145229	NC_008268	GGC	2	6	5658886	5658891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022282
145230	NC_008268	TGG	2	6	5658928	5658933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022282
145231	NC_008268	CGG	2	6	5658959	5658964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022282
145232	NC_008268	GAC	2	6	5658996	5659001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022282
145233	NC_008268	GC	3	6	5659004	5659009	0 %	0 %	50 %	50 %	111022282
145234	NC_008268	GAG	2	6	5659020	5659025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022282
145235	NC_008268	ACC	2	6	5659101	5659106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022282
145236	NC_008268	GAG	2	6	5659164	5659169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022282
145237	NC_008268	CGA	2	6	5659193	5659198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022282
145238	NC_008268	GGA	2	6	5659214	5659219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022282
145239	NC_008268	GAC	2	6	5659314	5659319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022282
145240	NC_008268	GCCC	2	8	5659347	5659354	0 %	0 %	25 %	75 %	111022282
145241	NC_008268	CCA	2	6	5659389	5659394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022283
145242	NC_008268	TCG	2	6	5659425	5659430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145243	NC_008268	GCT	2	6	5659467	5659472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145244	NC_008268	GCC	2	6	5659506	5659511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022283
145245	NC_008268	TGC	2	6	5659613	5659618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145246	NC_008268	GGC	2	6	5659659	5659664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022283
145247	NC_008268	CGGT	2	8	5659679	5659686	0 %	25 %	50 %	25 %	111022283
145248	NC_008268	CTG	2	6	5659723	5659728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145249	NC_008268	GCG	2	6	5659759	5659764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022283
145250	NC_008268	GCT	2	6	5659767	5659772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145251	NC_008268	TCG	2	6	5659859	5659864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145252	NC_008268	CGG	3	9	5659875	5659883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022283
145253	NC_008268	TCG	2	6	5659889	5659894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145254	NC_008268	CTT	2	6	5659914	5659919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022283
145255	NC_008268	TCGCA	2	10	5660004	5660013	20 %	20 %	20 %	40 %	111022283
145256	NC_008268	GAT	2	6	5660031	5660036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022283
145257	NC_008268	CTG	2	6	5660056	5660061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145258	NC_008268	TGG	2	6	5660108	5660113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022283
145259	NC_008268	TCG	2	6	5660120	5660125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145260	NC_008268	CTG	2	6	5660185	5660190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145261	NC_008268	CGA	2	6	5660307	5660312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145262	NC_008268	CGGGCT	2	12	5660319	5660330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022283
145263	NC_008268	GC	3	6	5660333	5660338	0 %	0 %	50 %	50 %	111022283
145264	NC_008268	GTG	2	6	5660423	5660428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022283
145265	NC_008268	TCA	2	6	5660453	5660458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022283
145266	NC_008268	CTGGC	2	10	5660470	5660479	0 %	20 %	40 %	40 %	111022283
145267	NC_008268	AGC	2	6	5660495	5660500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145268	NC_008268	GGA	2	6	5660592	5660597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022283
145269	NC_008268	GCC	2	6	5660611	5660616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022283
145270	NC_008268	GCG	2	6	5660672	5660677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022283
145271	NC_008268	GGT	2	6	5660700	5660705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022283
145272	NC_008268	CGC	2	6	5660724	5660729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022283
145273	NC_008268	TCG	2	6	5660780	5660785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022283
145274	NC_008268	CGA	2	6	5660864	5660869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145275	NC_008268	GGC	2	6	5660977	5660982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022284
145276	NC_008268	CGGT	2	8	5661038	5661045	0 %	25 %	50 %	25 %	111022284
145277	NC_008268	CCAG	2	8	5661051	5661058	25 %	0 %	25 %	50 %	111022284
145278	NC_008268	TCG	2	6	5661104	5661109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022284
145279	NC_008268	CGAC	2	8	5661123	5661130	25 %	0 %	25 %	50 %	111022284
145280	NC_008268	CGG	2	6	5661147	5661152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022284
145281	NC_008268	CCG	2	6	5661163	5661168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022284
145282	NC_008268	CCT	2	6	5661213	5661218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022284
145283	NC_008268	CGA	2	6	5661243	5661248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022284
145284	NC_008268	CGC	2	6	5661250	5661255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022284
145285	NC_008268	CGC	2	6	5661291	5661296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022284
145286	NC_008268	GC	4	8	5661305	5661312	0 %	0 %	50 %	50 %	111022284
145287	NC_008268	CCG	2	6	5661387	5661392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022284
145288	NC_008268	CCT	2	6	5661402	5661407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022284
145289	NC_008268	AGT	2	6	5661420	5661425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022284
145290	NC_008268	GCG	2	6	5661463	5661468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022284
145291	NC_008268	GCG	2	6	5661494	5661499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022284
145292	NC_008268	GCC	2	6	5661515	5661520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022284
145293	NC_008268	CGAG	2	8	5661629	5661636	25 %	0 %	50 %	25 %	111022285
145294	NC_008268	GCA	2	6	5661672	5661677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022285
145295	NC_008268	ATC	2	6	5661692	5661697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022285
145296	NC_008268	TTC	2	6	5661719	5661724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022285
145297	NC_008268	ATGACC	2	12	5661864	5661875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111022285
145298	NC_008268	CCA	2	6	5661890	5661895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022286
145299	NC_008268	CG	3	6	5661900	5661905	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145300	NC_008268	CGAT	2	8	5661937	5661944	25 %	25 %	25 %	25 %	111022286
145301	NC_008268	TCG	2	6	5661949	5661954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145302	NC_008268	CTG	2	6	5661957	5661962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145303	NC_008268	TCC	2	6	5661997	5662002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022286
145304	NC_008268	CGA	2	6	5662037	5662042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145305	NC_008268	CG	3	6	5662089	5662094	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145306	NC_008268	TGC	2	6	5662114	5662119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145307	NC_008268	GTG	2	6	5662125	5662130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022286
145308	NC_008268	GC	3	6	5662202	5662207	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145309	NC_008268	TGC	2	6	5662222	5662227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145310	NC_008268	TCG	2	6	5662276	5662281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145311	NC_008268	GC	3	6	5662289	5662294	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145312	NC_008268	TCG	2	6	5662324	5662329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145313	NC_008268	CG	3	6	5662339	5662344	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145314	NC_008268	CGG	2	6	5662363	5662368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022286
145315	NC_008268	CGA	2	6	5662517	5662522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145316	NC_008268	GC	3	6	5662594	5662599	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145317	NC_008268	TGG	2	6	5662603	5662608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022286
145318	NC_008268	GCTCG	2	10	5662679	5662688	0 %	20 %	40 %	40 %	111022286
145319	NC_008268	GCT	2	6	5662697	5662702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145320	NC_008268	GTG	2	6	5662749	5662754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022286
145321	NC_008268	GCGG	2	8	5662891	5662898	0 %	0 %	75 %	25 %	111022286
145322	NC_008268	CCA	2	6	5662915	5662920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022286
145323	NC_008268	GGT	2	6	5662931	5662936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022286
145324	NC_008268	GAT	2	6	5663000	5663005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022286
145325	NC_008268	CCGG	2	8	5663021	5663028	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145326	NC_008268	TGG	2	6	5663107	5663112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022286
145327	NC_008268	CGG	2	6	5663138	5663143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022286
145328	NC_008268	CGA	2	6	5663186	5663191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145329	NC_008268	CGT	2	6	5663195	5663200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145330	NC_008268	CGG	2	6	5663206	5663211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022286
145331	NC_008268	GAG	2	6	5663241	5663246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022286
145332	NC_008268	ATC	2	6	5663307	5663312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022286
145333	NC_008268	GC	3	6	5663317	5663322	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145334	NC_008268	GC	3	6	5663334	5663339	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145335	NC_008268	TCG	2	6	5663365	5663370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022286
145336	NC_008268	GC	3	6	5663421	5663426	0 %	0 %	50 %	50 %	111022286
145337	NC_008268	CCG	2	6	5663428	5663433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022286
145338	NC_008268	GCC	2	6	5663462	5663467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022286
145339	NC_008268	GAG	2	6	5663491	5663496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022286
145340	NC_008268	GCC	2	6	5663593	5663598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022287
145341	NC_008268	CCG	2	6	5663622	5663627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022287
145342	NC_008268	CGT	2	6	5663643	5663648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022287
145343	NC_008268	CGGG	2	8	5663673	5663680	0 %	0 %	75 %	25 %	111022287
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145345	NC_008268	CGG	2	6	5663823	5663828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022287
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145438	NC_008268	ACT	2	6	5666982	5666987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022290
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145453	NC_008268	CG	3	6	5667665	5667670	0 %	0 %	50 %	50 %	111022290
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