MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
144001	NC_008268	CGGAA	2	10	5610200	5610209	40 %	0 %	40 %	20 %	111022232
144002	NC_008268	TGC	2	6	5610230	5610235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022232
144003	NC_008268	GC	3	6	5610273	5610278	0 %	0 %	50 %	50 %	111022232
144004	NC_008268	CGG	2	6	5610318	5610323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022232
144005	NC_008268	CGG	2	6	5610374	5610379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022232
144006	NC_008268	GGT	2	6	5610424	5610429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022233
144007	NC_008268	CG	3	6	5610430	5610435	0 %	0 %	50 %	50 %	111022233
144008	NC_008268	GCG	2	6	5610447	5610452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
144009	NC_008268	CGG	2	6	5610507	5610512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
144010	NC_008268	GCGTC	2	10	5610525	5610534	0 %	20 %	40 %	40 %	111022233
144011	NC_008268	TCG	2	6	5610543	5610548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144012	NC_008268	GTC	2	6	5610583	5610588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144013	NC_008268	ACG	2	6	5610596	5610601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144014	NC_008268	CGA	2	6	5610678	5610683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144015	NC_008268	CGG	2	6	5610684	5610689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
144016	NC_008268	GT	3	6	5610714	5610719	0 %	50 %	50 %	0 %	111022233
144017	NC_008268	CGT	2	6	5610745	5610750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144018	NC_008268	CCG	2	6	5610817	5610822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
144019	NC_008268	CCG	2	6	5610830	5610835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
144020	NC_008268	GGT	2	6	5610888	5610893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022233
144021	NC_008268	CGT	2	6	5610918	5610923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144022	NC_008268	CG	4	8	5610958	5610965	0 %	0 %	50 %	50 %	111022233
144023	NC_008268	ACG	2	6	5610968	5610973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144024	NC_008268	GGGC	2	8	5610975	5610982	0 %	0 %	75 %	25 %	111022233
144025	NC_008268	GC	3	6	5610996	5611001	0 %	0 %	50 %	50 %	111022233
144026	NC_008268	GAG	2	6	5611030	5611035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022233
144027	NC_008268	CGG	2	6	5611130	5611135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
144028	NC_008268	GCC	2	6	5611139	5611144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
144029	NC_008268	CGA	2	6	5611158	5611163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144030	NC_008268	GCT	2	6	5611179	5611184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144031	NC_008268	CTGGC	2	10	5611217	5611226	0 %	20 %	40 %	40 %	111022233
144032	NC_008268	TCG	2	6	5611265	5611270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144033	NC_008268	CGC	2	6	5611317	5611322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
144034	NC_008268	CTG	2	6	5611356	5611361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144035	NC_008268	TCG	2	6	5611380	5611385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
144036	NC_008268	GGCG	2	8	5611386	5611393	0 %	0 %	75 %	25 %	111022233
144037	NC_008268	CCG	2	6	5611394	5611399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
144038	NC_008268	GCT	2	6	5611455	5611460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144039	NC_008268	GCT	2	6	5611470	5611475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144040	NC_008268	CTAGAA	2	12	5611506	5611517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144041	NC_008268	CACTG	2	10	5611548	5611557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144042	NC_008268	CA	3	6	5611572	5611577	50 %	0 %	0 %	50 %	111022234
144043	NC_008268	TCG	2	6	5611704	5611709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144044	NC_008268	CCA	2	6	5611749	5611754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022234
144045	NC_008268	CCA	2	6	5611773	5611778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022234
144046	NC_008268	CGA	2	6	5611786	5611791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144047	NC_008268	CGA	2	6	5611804	5611809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144048	NC_008268	CG	3	6	5611837	5611842	0 %	0 %	50 %	50 %	111022234
144049	NC_008268	GTC	2	6	5611859	5611864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144050	NC_008268	GCGGCC	2	12	5611865	5611876	0 %	0 %	50 %	50 %	111022234
144051	NC_008268	TCG	2	6	5611893	5611898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144052	NC_008268	CGCCGA	2	12	5611921	5611932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022234
144053	NC_008268	GCG	2	6	5611943	5611948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022234
144054	NC_008268	GCC	2	6	5611949	5611954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022234
144055	NC_008268	CGC	3	9	5612008	5612016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022234
144056	NC_008268	CCGCG	2	10	5612017	5612026	0 %	0 %	40 %	60 %	111022234
144057	NC_008268	TGC	2	6	5612058	5612063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144058	NC_008268	CCG	2	6	5612094	5612099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022234
144059	NC_008268	GCCC	2	8	5612183	5612190	0 %	0 %	25 %	75 %	111022234
144060	NC_008268	GTG	2	6	5612264	5612269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022234
144061	NC_008268	CGG	2	6	5612301	5612306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022234
144062	NC_008268	ACG	2	6	5612334	5612339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144063	NC_008268	GC	3	6	5612341	5612346	0 %	0 %	50 %	50 %	111022234
144064	NC_008268	CGG	2	6	5612362	5612367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022234
144065	NC_008268	GCAG	2	8	5612378	5612385	25 %	0 %	50 %	25 %	111022234
144066	NC_008268	TAC	2	6	5612408	5612413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022234
144067	NC_008268	CG	3	6	5612440	5612445	0 %	0 %	50 %	50 %	111022234
144068	NC_008268	CCT	2	6	5612458	5612463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022234
144069	NC_008268	TCG	2	6	5612496	5612501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144070	NC_008268	CA	3	6	5612516	5612521	50 %	0 %	0 %	50 %	111022234
144071	NC_008268	CGT	2	6	5612527	5612532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022234
144072	NC_008268	CGC	2	6	5612572	5612577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022234
144073	NC_008268	CCG	2	6	5612601	5612606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022234
144074	NC_008268	CGC	2	6	5612646	5612651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022235
144075	NC_008268	CCA	2	6	5612744	5612749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022235
144076	NC_008268	CGC	2	6	5612766	5612771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022235
144077	NC_008268	GCT	2	6	5612844	5612849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022235
144078	NC_008268	CAC	2	6	5612850	5612855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022235
144079	NC_008268	GCA	2	6	5612859	5612864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022235
144080	NC_008268	ACC	2	6	5612927	5612932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022235
144081	NC_008268	CCGG	2	8	5612946	5612953	0 %	0 %	50 %	50 %	111022235
144082	NC_008268	CCG	3	9	5612984	5612992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022235
144083	NC_008268	AACCTC	2	12	5613052	5613063	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	111022235
144084	NC_008268	ATC	2	6	5613071	5613076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022235
144085	NC_008268	CGC	2	6	5613297	5613302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022235
144086	NC_008268	CGT	2	6	5613330	5613335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022235
144087	NC_008268	GAC	2	6	5613367	5613372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022235
144088	NC_008268	GGC	2	6	5613390	5613395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022235
144089	NC_008268	TAG	2	6	5613409	5613414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022235
144090	NC_008268	TTCGA	2	10	5613446	5613455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144091	NC_008268	TCG	2	6	5613538	5613543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022236
144092	NC_008268	GC	3	6	5613547	5613552	0 %	0 %	50 %	50 %	111022236
144093	NC_008268	CGGC	2	8	5613603	5613610	0 %	0 %	50 %	50 %	111022236
144094	NC_008268	ATC	2	6	5613650	5613655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022236
144095	NC_008268	GCA	2	6	5613663	5613668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022236
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144097	NC_008268	CCG	2	6	5613720	5613725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144098	NC_008268	CGA	2	6	5613762	5613767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022236
144099	NC_008268	CGC	2	6	5613870	5613875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144100	NC_008268	CGC	2	6	5613882	5613887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144101	NC_008268	GGC	2	6	5613905	5613910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022236
144102	NC_008268	ACC	2	6	5613943	5613948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022236
144103	NC_008268	GAT	2	6	5614044	5614049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022236
144104	NC_008268	CGA	2	6	5614050	5614055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022236
144105	NC_008268	CGT	2	6	5614158	5614163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022236
144106	NC_008268	CCG	2	6	5614240	5614245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144107	NC_008268	CGC	2	6	5614290	5614295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144108	NC_008268	GGC	2	6	5614325	5614330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022236
144109	NC_008268	AAC	2	6	5614351	5614356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022236
144110	NC_008268	CGC	2	6	5614383	5614388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022236
144111	NC_008268	CGA	2	6	5614482	5614487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022236
144112	NC_008268	CCGA	2	8	5614489	5614496	25 %	0 %	25 %	50 %	111022236
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144114	NC_008268	CAC	3	9	5614645	5614653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022236
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144331	NC_008268	GC	3	6	5622863	5622868	0 %	0 %	50 %	50 %	111022244
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144333	NC_008268	ATC	2	6	5622912	5622917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022244
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144341	NC_008268	CGTC	2	8	5623348	5623355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144342	NC_008268	GTG	2	6	5623390	5623395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144343	NC_008268	GCC	2	6	5623412	5623417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022246
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144345	NC_008268	GC	3	6	5623504	5623509	0 %	0 %	50 %	50 %	111022246
144346	NC_008268	GCC	2	6	5623523	5623528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022246
144347	NC_008268	TCG	2	6	5623584	5623589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022246
144348	NC_008268	CGA	2	6	5623612	5623617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022246
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144364	NC_008268	CCTG	2	8	5624185	5624192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144365	NC_008268	TCC	2	6	5624223	5624228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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144419	NC_008268	GTACG	2	10	5627033	5627042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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