MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
143001	NC_008268	TGGG	2	8	5571761	5571768	0 %	25 %	75 %	0 %	111022193
143002	NC_008268	CGA	2	6	5571876	5571881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022194
143003	NC_008268	CA	3	6	5571906	5571911	50 %	0 %	0 %	50 %	111022194
143004	NC_008268	CGAT	2	8	5571912	5571919	25 %	25 %	25 %	25 %	111022194
143005	NC_008268	GGA	2	6	5571922	5571927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022194
143006	NC_008268	CTC	2	6	5571941	5571946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022194
143007	NC_008268	GCC	2	6	5572027	5572032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022194
143008	NC_008268	GC	4	8	5572171	5572178	0 %	0 %	50 %	50 %	111022194
143009	NC_008268	TGC	2	6	5572179	5572184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022194
143010	NC_008268	CGA	2	6	5572234	5572239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022194
143011	NC_008268	GC	3	6	5572264	5572269	0 %	0 %	50 %	50 %	111022194
143012	NC_008268	GGT	2	6	5572305	5572310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022194
143013	NC_008268	TGC	2	6	5572332	5572337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022194
143014	NC_008268	GAG	2	6	5572385	5572390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022194
143015	NC_008268	GCG	2	6	5572408	5572413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022194
143016	NC_008268	GAT	2	6	5572441	5572446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022194
143017	NC_008268	GAG	2	6	5572475	5572480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022194
143018	NC_008268	CG	4	8	5572498	5572505	0 %	0 %	50 %	50 %	111022194
143019	NC_008268	CGC	2	6	5572517	5572522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022194
143020	NC_008268	CGG	2	6	5572576	5572581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022194
143021	NC_008268	CGGGC	2	10	5572625	5572634	0 %	0 %	60 %	40 %	111022194
143022	NC_008268	AGG	2	6	5572644	5572649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022194
143023	NC_008268	ACG	2	6	5572693	5572698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022194
143024	NC_008268	GAG	2	6	5572727	5572732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022194
143025	NC_008268	CGAC	2	8	5572745	5572752	25 %	0 %	25 %	50 %	111022194
143026	NC_008268	CG	3	6	5572757	5572762	0 %	0 %	50 %	50 %	111022194
143027	NC_008268	GGC	2	6	5572767	5572772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022194
143028	NC_008268	ACC	2	6	5572798	5572803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022195
143029	NC_008268	TCG	3	9	5572817	5572825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143030	NC_008268	AGG	2	6	5572865	5572870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022195
143031	NC_008268	GAG	2	6	5572876	5572881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022195
143032	NC_008268	CGT	3	9	5572884	5572892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143033	NC_008268	CG	3	6	5573019	5573024	0 %	0 %	50 %	50 %	111022195
143034	NC_008268	GGT	2	6	5573055	5573060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022195
143035	NC_008268	CA	3	6	5573081	5573086	50 %	0 %	0 %	50 %	111022195
143036	NC_008268	CGA	2	6	5573121	5573126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143037	NC_008268	ACC	2	6	5573128	5573133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022195
143038	NC_008268	CCGG	2	8	5573234	5573241	0 %	0 %	50 %	50 %	111022195
143039	NC_008268	CATTC	2	10	5573261	5573270	20 %	40 %	0 %	40 %	111022195
143040	NC_008268	GTC	2	6	5573317	5573322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143041	NC_008268	GTTC	2	8	5573346	5573353	0 %	50 %	25 %	25 %	111022195
143042	NC_008268	CGC	2	6	5573399	5573404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022195
143043	NC_008268	CCG	2	6	5573438	5573443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022195
143044	NC_008268	TGA	2	6	5573549	5573554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022195
143045	NC_008268	GCC	2	6	5573569	5573574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022195
143046	NC_008268	CTG	2	6	5573581	5573586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143047	NC_008268	GCAG	2	8	5573588	5573595	25 %	0 %	50 %	25 %	111022195
143048	NC_008268	CAT	2	6	5573637	5573642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022195
143049	NC_008268	GAC	2	6	5573755	5573760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143050	NC_008268	CGGC	2	8	5573807	5573814	0 %	0 %	50 %	50 %	111022195
143051	NC_008268	GCC	2	6	5573843	5573848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022195
143052	NC_008268	GTCGCG	2	12	5573902	5573913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022195
143053	NC_008268	CTT	2	6	5573925	5573930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022195
143054	NC_008268	ATG	2	6	5573935	5573940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022195
143055	NC_008268	GGC	2	6	5573956	5573961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022195
143056	NC_008268	TGA	2	6	5574023	5574028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022195
143057	NC_008268	GCGAC	2	10	5574035	5574044	20 %	0 %	40 %	40 %	111022195
143058	NC_008268	GC	3	6	5574057	5574062	0 %	0 %	50 %	50 %	111022195
143059	NC_008268	GC	3	6	5574065	5574070	0 %	0 %	50 %	50 %	111022195
143060	NC_008268	GGT	2	6	5574087	5574092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022195
143061	NC_008268	GGT	2	6	5574127	5574132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022195
143062	NC_008268	GCG	2	6	5574172	5574177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022195
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143065	NC_008268	TCGC	2	8	5574247	5574254	0 %	25 %	25 %	50 %	111022195
143066	NC_008268	GAC	2	6	5574265	5574270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022195
143067	NC_008268	CGT	2	6	5574384	5574389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022195
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143070	NC_008268	TTG	2	6	5574600	5574605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143071	NC_008268	CGG	2	6	5574698	5574703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022196
143072	NC_008268	GGT	2	6	5574714	5574719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022196
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143076	NC_008268	TGC	2	6	5574866	5574871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022196
143077	NC_008268	CGA	2	6	5574888	5574893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022196
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143082	NC_008268	GTC	2	6	5575072	5575077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022196
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143087	NC_008268	GCA	2	6	5575166	5575171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022196
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143091	NC_008268	CGA	2	6	5575380	5575385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022196
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143099	NC_008268	TCG	2	6	5575781	5575786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022196
143100	NC_008268	ACC	2	6	5575815	5575820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143101	NC_008268	AGGT	2	8	5575856	5575863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143102	NC_008268	CGA	2	6	5575945	5575950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022197
143103	NC_008268	TCG	2	6	5575959	5575964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022197
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143112	NC_008268	GTG	2	6	5576282	5576287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022197
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143114	NC_008268	TCG	2	6	5576331	5576336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022197
143115	NC_008268	CA	3	6	5576358	5576363	50 %	0 %	0 %	50 %	111022197
143116	NC_008268	CGG	2	6	5576432	5576437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022197
143117	NC_008268	GCG	2	6	5576487	5576492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022197
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143119	NC_008268	GAG	2	6	5576588	5576593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022197
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143126	NC_008268	ACG	2	6	5577011	5577016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022198
143127	NC_008268	CAG	2	6	5577034	5577039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022198
143128	NC_008268	ATG	3	9	5577088	5577096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022198
143129	NC_008268	GAG	2	6	5577121	5577126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022198
143130	NC_008268	CGA	2	6	5577132	5577137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022198
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143142	NC_008268	TGC	2	6	5577439	5577444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022199
143143	NC_008268	AGG	2	6	5577448	5577453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022199
143144	NC_008268	CGA	2	6	5577488	5577493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022199
143145	NC_008268	TGC	2	6	5577511	5577516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022199
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143148	NC_008268	CGC	2	6	5577626	5577631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022199
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143151	NC_008268	AGG	2	6	5577712	5577717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022199
143152	NC_008268	GGA	2	6	5577734	5577739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022199
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143154	NC_008268	CGA	2	6	5577848	5577853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022199
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143159	NC_008268	CGG	2	6	5578139	5578144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022199
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143163	NC_008268	TGA	2	6	5578252	5578257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022199
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143172	NC_008268	CTG	2	6	5578602	5578607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022199
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143175	NC_008268	CAG	2	6	5578707	5578712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022199
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143178	NC_008268	TTC	2	6	5578773	5578778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022199
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143195	NC_008268	ATC	2	6	5579466	5579471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022199
143196	NC_008268	CGA	2	6	5579477	5579482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022199
143197	NC_008268	CGG	2	6	5579498	5579503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022199
143198	NC_008268	CGC	2	6	5579578	5579583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022199
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143200	NC_008268	CG	3	6	5579739	5579744	0 %	0 %	50 %	50 %	111022199
143201	NC_008268	GAG	2	6	5579778	5579783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143202	NC_008268	GCG	2	6	5579807	5579812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022200
143203	NC_008268	CG	3	6	5579820	5579825	0 %	0 %	50 %	50 %	111022200
143204	NC_008268	GTG	2	6	5579852	5579857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022200
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143207	NC_008268	TCC	2	6	5579901	5579906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022200
143208	NC_008268	GGACG	2	10	5579911	5579920	20 %	0 %	60 %	20 %	111022200
143209	NC_008268	TCG	2	6	5579931	5579936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022200
143210	NC_008268	GCC	2	6	5579969	5579974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022200
143211	NC_008268	CAAC	2	8	5579988	5579995	50 %	0 %	0 %	50 %	111022200
143212	NC_008268	CGTC	2	8	5580057	5580064	0 %	25 %	25 %	50 %	111022200
143213	NC_008268	GTG	2	6	5580065	5580070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022200
143214	NC_008268	CGG	2	6	5580085	5580090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022200
143215	NC_008268	CCG	2	6	5580125	5580130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022200
143216	NC_008268	CAC	2	6	5580148	5580153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022200
143217	NC_008268	G	6	6	5580172	5580177	0 %	0 %	100 %	0 %	111022200
143218	NC_008268	CTG	2	6	5580188	5580193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022200
143219	NC_008268	ACG	3	9	5580210	5580218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022200
143220	NC_008268	ACG	2	6	5580242	5580247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022200
143221	NC_008268	GGT	2	6	5580250	5580255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022200
143222	NC_008268	CGG	2	6	5580268	5580273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022200
143223	NC_008268	GCG	2	6	5580296	5580301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022200
143224	NC_008268	TCG	2	6	5580330	5580335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022200
143225	NC_008268	CCGAGC	2	12	5580381	5580392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022200
143226	NC_008268	GC	3	6	5580395	5580400	0 %	0 %	50 %	50 %	111022200
143227	NC_008268	CGGT	2	8	5580411	5580418	0 %	25 %	50 %	25 %	111022200
143228	NC_008268	GC	3	6	5580429	5580434	0 %	0 %	50 %	50 %	111022200
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143341	NC_008268	TCG	2	6	5584321	5584326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022204
143342	NC_008268	CAC	2	6	5584338	5584343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022204
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143345	NC_008268	TCG	2	6	5584408	5584413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022204
143346	NC_008268	CG	3	6	5584428	5584433	0 %	0 %	50 %	50 %	111022204
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143455	NC_008268	GGT	2	6	5588714	5588719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022209
143456	NC_008268	GC	3	6	5588726	5588731	0 %	0 %	50 %	50 %	111022209
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