MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
142501	NC_008268	TGA	2	6	5552254	5552259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022170
142502	NC_008268	CGT	2	6	5552290	5552295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022170
142503	NC_008268	TGG	2	6	5552362	5552367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022170
142504	NC_008268	GGC	2	6	5552393	5552398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022170
142505	NC_008268	CTT	2	6	5552402	5552407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022170
142506	NC_008268	CGGC	2	8	5552473	5552480	0 %	0 %	50 %	50 %	111022170
142507	NC_008268	ACG	2	6	5552514	5552519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022170
142508	NC_008268	CGC	2	6	5552536	5552541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022170
142509	NC_008268	GC	3	6	5552587	5552592	0 %	0 %	50 %	50 %	111022170
142510	NC_008268	CTT	2	6	5552600	5552605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022170
142511	NC_008268	GTCGGC	2	12	5552663	5552674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022170
142512	NC_008268	GCT	2	6	5552776	5552781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022170
142513	NC_008268	TCT	2	6	5552847	5552852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142514	NC_008268	TC	3	6	5552854	5552859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142515	NC_008268	TTA	2	6	5552900	5552905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142516	NC_008268	TCG	2	6	5552907	5552912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142517	NC_008268	CGA	3	9	5552969	5552977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022171
142518	NC_008268	CGTC	2	8	5552999	5553006	0 %	25 %	25 %	50 %	111022171
142519	NC_008268	GCC	2	6	5553041	5553046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022171
142520	NC_008268	CCA	2	6	5553059	5553064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022171
142521	NC_008268	ATC	2	6	5553066	5553071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022171
142522	NC_008268	CTC	2	6	5553204	5553209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022171
142523	NC_008268	GGC	2	6	5553210	5553215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022171
142524	NC_008268	CGC	2	6	5553251	5553256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022171
142525	NC_008268	CGG	2	6	5553323	5553328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022171
142526	NC_008268	CGG	2	6	5553334	5553339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022171
142527	NC_008268	ACGGCC	2	12	5553349	5553360	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022171
142528	NC_008268	AGT	2	6	5553362	5553367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022171
142529	NC_008268	CGC	2	6	5553422	5553427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022171
142530	NC_008268	ACG	2	6	5553478	5553483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022171
142531	NC_008268	GC	3	6	5553494	5553499	0 %	0 %	50 %	50 %	111022171
142532	NC_008268	GAG	2	6	5553597	5553602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022172
142533	NC_008268	GTT	2	6	5553612	5553617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022172
142534	NC_008268	CGT	2	6	5553624	5553629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142535	NC_008268	GTCCC	2	10	5553642	5553651	0 %	20 %	20 %	60 %	111022172
142536	NC_008268	GAC	2	6	5553652	5553657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142537	NC_008268	CGA	2	6	5553704	5553709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142538	NC_008268	GCG	2	6	5553750	5553755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022172
142539	NC_008268	CGC	2	6	5553965	5553970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022172
142540	NC_008268	CGG	2	6	5553974	5553979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022172
142541	NC_008268	GCC	2	6	5554044	5554049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022172
142542	NC_008268	AGT	2	6	5554121	5554126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022172
142543	NC_008268	CCG	2	6	5554142	5554147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022172
142544	NC_008268	TTC	2	6	5554156	5554161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022172
142545	NC_008268	CAT	2	6	5554167	5554172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022172
142546	NC_008268	CGG	2	6	5554205	5554210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022172
142547	NC_008268	CGA	2	6	5554229	5554234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142548	NC_008268	TGC	3	9	5554346	5554354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142549	NC_008268	CAG	2	6	5554377	5554382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142550	NC_008268	CGG	2	6	5554400	5554405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022172
142551	NC_008268	CCTGGC	2	12	5554427	5554438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022172
142552	NC_008268	ATG	2	6	5554450	5554455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022172
142553	NC_008268	CTG	2	6	5554515	5554520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142554	NC_008268	CGG	2	6	5554607	5554612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022172
142555	NC_008268	GCT	2	6	5554660	5554665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022172
142556	NC_008268	AGC	2	6	5554707	5554712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142557	NC_008268	GGC	2	6	5554714	5554719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142558	NC_008268	CTG	2	6	5554762	5554767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142559	NC_008268	CCG	2	6	5554818	5554823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142560	NC_008268	ACCGA	2	10	5554846	5554855	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142561	NC_008268	TGA	2	6	5554956	5554961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142562	NC_008268	GATC	2	8	5554965	5554972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142563	NC_008268	GTC	2	6	5555052	5555057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022173
142564	NC_008268	ACG	2	6	5555062	5555067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022173
142565	NC_008268	ACG	2	6	5555092	5555097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022173
142566	NC_008268	CGG	2	6	5555130	5555135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022173
142567	NC_008268	CGG	2	6	5555140	5555145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022173
142568	NC_008268	CGT	2	6	5555156	5555161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022173
142569	NC_008268	AGCG	2	8	5555198	5555205	25 %	0 %	50 %	25 %	111022173
142570	NC_008268	GATC	2	8	5555207	5555214	25 %	25 %	25 %	25 %	111022173
142571	NC_008268	TCG	2	6	5555236	5555241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022173
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142581	NC_008268	CG	3	6	5555457	5555462	0 %	0 %	50 %	50 %	111022173
142582	NC_008268	CGGCGC	2	12	5555483	5555494	0 %	0 %	50 %	50 %	111022173
142583	NC_008268	ACG	2	6	5555604	5555609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022173
142584	NC_008268	GCC	2	6	5555664	5555669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022173
142585	NC_008268	GTCG	2	8	5555717	5555724	0 %	25 %	50 %	25 %	111022173
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142591	NC_008268	CTG	2	6	5555919	5555924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022173
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142594	NC_008268	CGG	3	9	5556111	5556119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022174
142595	NC_008268	GAACT	2	10	5556151	5556160	40 %	20 %	20 %	20 %	111022174
142596	NC_008268	TCG	2	6	5556191	5556196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142597	NC_008268	GTC	2	6	5556214	5556219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142598	NC_008268	GTC	2	6	5556292	5556297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142599	NC_008268	CGT	2	6	5556318	5556323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142600	NC_008268	CGG	2	6	5556324	5556329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022174
142601	NC_008268	GCA	2	6	5556359	5556364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142602	NC_008268	CCA	2	6	5556371	5556376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022174
142603	NC_008268	TCGA	2	8	5556391	5556398	25 %	25 %	25 %	25 %	111022174
142604	NC_008268	GGCGG	2	10	5556435	5556444	0 %	0 %	80 %	20 %	111022174
142605	NC_008268	CAGCGG	2	12	5556453	5556464	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111022174
142606	NC_008268	GAC	2	6	5556481	5556486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022174
142607	NC_008268	GC	3	6	5556525	5556530	0 %	0 %	50 %	50 %	111022174
142608	NC_008268	CAA	2	6	5556564	5556569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022174
142609	NC_008268	GTCG	2	8	5556603	5556610	0 %	25 %	50 %	25 %	111022174
142610	NC_008268	CCCG	2	8	5556636	5556643	0 %	0 %	25 %	75 %	111022174
142611	NC_008268	CATCG	2	10	5556685	5556694	20 %	20 %	20 %	40 %	111022175
142612	NC_008268	CGGG	2	8	5556699	5556706	0 %	0 %	75 %	25 %	111022175
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142614	NC_008268	TGG	2	6	5556822	5556827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022175
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142728	NC_008268	GTT	2	6	5560568	5560573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022178
142729	NC_008268	CTG	2	6	5560587	5560592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022178
142730	NC_008268	GGA	2	6	5560598	5560603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022178
142731	NC_008268	GTC	2	6	5560634	5560639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022178
142732	NC_008268	GCT	2	6	5560661	5560666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022178
142733	NC_008268	GTGG	2	8	5560671	5560678	0 %	25 %	75 %	0 %	111022178
142734	NC_008268	TCG	2	6	5560738	5560743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022178
142735	NC_008268	CGGA	2	8	5560793	5560800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142736	NC_008268	TGG	2	6	5560835	5560840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022179
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142765	NC_008268	CGT	2	6	5561809	5561814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022180
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142782	NC_008268	GTG	2	6	5562600	5562605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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142825	NC_008268	G	6	6	5564228	5564233	0 %	0 %	100 %	0 %	111022182
142826	NC_008268	GCAG	2	8	5564317	5564324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142827	NC_008268	CGG	2	6	5564342	5564347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142828	NC_008268	CGCCGT	2	12	5564387	5564398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022183
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142830	NC_008268	GC	3	6	5564426	5564431	0 %	0 %	50 %	50 %	111022183
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142834	NC_008268	CGG	2	6	5564496	5564501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022183
142835	NC_008268	AACG	2	8	5564511	5564518	50 %	0 %	25 %	25 %	111022183
142836	NC_008268	GCGGGC	2	12	5564527	5564538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022183
142837	NC_008268	TGC	2	6	5564562	5564567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022183
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142841	NC_008268	CTG	2	6	5564772	5564777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022183
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142843	NC_008268	GCT	2	6	5564849	5564854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022183
142844	NC_008268	CGA	2	6	5564885	5564890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022183
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142959	NC_008268	TCG	2	6	5569754	5569759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022189
142960	NC_008268	GCA	2	6	5569761	5569766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022189
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142963	NC_008268	CTG	2	6	5569943	5569948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022190
142964	NC_008268	TCG	2	6	5569950	5569955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022190
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142999	NC_008268	CGCT	2	8	5571612	5571619	0 %	25 %	25 %	50 %	111022193
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