MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
141501	NC_008268	ATG	2	6	5515508	5515513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022141
141502	NC_008268	GAC	2	6	5515540	5515545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022141
141503	NC_008268	GCA	2	6	5515584	5515589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141504	NC_008268	CGA	2	6	5515600	5515605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141505	NC_008268	TCG	2	6	5515647	5515652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141506	NC_008268	GT	3	6	5515657	5515662	0 %	50 %	50 %	0 %	111022142
141507	NC_008268	CGA	2	6	5515717	5515722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141508	NC_008268	TCC	2	6	5515806	5515811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022142
141509	NC_008268	CGG	2	6	5515837	5515842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022142
141510	NC_008268	GT	3	6	5516044	5516049	0 %	50 %	50 %	0 %	111022142
141511	NC_008268	AGC	2	6	5516085	5516090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141512	NC_008268	GCC	2	6	5516124	5516129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022142
141513	NC_008268	GCCG	2	8	5516134	5516141	0 %	0 %	50 %	50 %	111022142
141514	NC_008268	TGG	2	6	5516205	5516210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022142
141515	NC_008268	CGTC	2	8	5516211	5516218	0 %	25 %	25 %	50 %	111022142
141516	NC_008268	CACC	2	8	5516224	5516231	25 %	0 %	0 %	75 %	111022142
141517	NC_008268	GAC	2	6	5516244	5516249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022142
141518	NC_008268	TGCC	2	8	5516257	5516264	0 %	25 %	25 %	50 %	111022142
141519	NC_008268	TGG	2	6	5516354	5516359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022143
141520	NC_008268	GAGG	2	8	5516416	5516423	25 %	0 %	75 %	0 %	111022143
141521	NC_008268	AGG	2	6	5516426	5516431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022143
141522	NC_008268	AC	3	6	5516496	5516501	50 %	0 %	0 %	50 %	111022143
141523	NC_008268	GCA	2	6	5516547	5516552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022143
141524	NC_008268	GAA	2	6	5516593	5516598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022143
141525	NC_008268	CGC	2	6	5516658	5516663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022143
141526	NC_008268	CGC	2	6	5516779	5516784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022143
141527	NC_008268	ACG	2	6	5516844	5516849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022143
141528	NC_008268	CTG	2	6	5516914	5516919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022143
141529	NC_008268	CTC	2	6	5517004	5517009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022143
141530	NC_008268	CGG	2	6	5517015	5517020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022143
141531	NC_008268	GGGT	2	8	5517156	5517163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141532	NC_008268	G	6	6	5517188	5517193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141533	NC_008268	CGT	2	6	5517200	5517205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141534	NC_008268	CTG	2	6	5517211	5517216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141535	NC_008268	CGAA	2	8	5517248	5517255	50 %	0 %	25 %	25 %	111022144
141536	NC_008268	GGC	2	6	5517257	5517262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022144
141537	NC_008268	CGC	2	6	5517368	5517373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022144
141538	NC_008268	CGT	2	6	5517404	5517409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141539	NC_008268	GGA	2	6	5517410	5517415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022144
141540	NC_008268	CGT	2	6	5517467	5517472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141541	NC_008268	TCG	2	6	5517484	5517489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141542	NC_008268	CAA	2	6	5517557	5517562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022144
141543	NC_008268	CG	4	8	5517583	5517590	0 %	0 %	50 %	50 %	111022144
141544	NC_008268	CG	3	6	5517617	5517622	0 %	0 %	50 %	50 %	111022144
141545	NC_008268	GCC	2	6	5517624	5517629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022144
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141550	NC_008268	GC	3	6	5517753	5517758	0 %	0 %	50 %	50 %	111022144
141551	NC_008268	CTG	2	6	5517771	5517776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022144
141552	NC_008268	GC	3	6	5517798	5517803	0 %	0 %	50 %	50 %	111022144
141553	NC_008268	CGC	4	12	5517863	5517874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022144
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141555	NC_008268	TGG	2	6	5517957	5517962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022144
141556	NC_008268	CG	3	6	5517963	5517968	0 %	0 %	50 %	50 %	111022144
141557	NC_008268	CGC	3	9	5517993	5518001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022144
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141606	NC_008268	CCG	2	6	5520113	5520118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141607	NC_008268	TC	3	6	5520157	5520162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141608	NC_008268	TGA	2	6	5520207	5520212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022147
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141610	NC_008268	GCT	2	6	5520274	5520279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141611	NC_008268	ACTC	2	8	5520304	5520311	25 %	25 %	0 %	50 %	111022147
141612	NC_008268	CGT	2	6	5520322	5520327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
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141614	NC_008268	TCG	2	6	5520375	5520380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141615	NC_008268	ACG	2	6	5520405	5520410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141616	NC_008268	AGA	2	6	5520411	5520416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022147
141617	NC_008268	TTCG	2	8	5520424	5520431	0 %	50 %	25 %	25 %	111022147
141618	NC_008268	GAG	2	6	5520494	5520499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022147
141619	NC_008268	CAA	2	6	5520517	5520522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111022147
141620	NC_008268	TGGA	2	8	5520524	5520531	25 %	25 %	50 %	0 %	111022147
141621	NC_008268	CCGA	2	8	5520533	5520540	25 %	0 %	25 %	50 %	111022147
141622	NC_008268	GACC	2	8	5520556	5520563	25 %	0 %	25 %	50 %	111022147
141623	NC_008268	GCA	2	6	5520573	5520578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141624	NC_008268	GTG	2	6	5520599	5520604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022147
141625	NC_008268	CGA	2	6	5520631	5520636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141626	NC_008268	CGT	3	9	5520673	5520681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141627	NC_008268	CAT	2	6	5520691	5520696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022147
141628	NC_008268	CCG	2	6	5520711	5520716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
141629	NC_008268	TCGG	2	8	5520764	5520771	0 %	25 %	50 %	25 %	111022147
141630	NC_008268	CTC	2	6	5520774	5520779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022147
141631	NC_008268	CGG	2	6	5520880	5520885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022147
141632	NC_008268	GCT	2	6	5520892	5520897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141633	NC_008268	AAG	2	6	5520902	5520907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022147
141634	NC_008268	ACG	2	6	5520942	5520947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141635	NC_008268	GCTG	2	8	5520951	5520958	0 %	25 %	50 %	25 %	111022147
141636	NC_008268	TC	3	6	5520987	5520992	0 %	50 %	0 %	50 %	111022147
141637	NC_008268	GGA	2	6	5520994	5520999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022147
141638	NC_008268	TAC	2	6	5521007	5521012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022147
141639	NC_008268	GAT	2	6	5521057	5521062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022147
141640	NC_008268	GC	3	6	5521084	5521089	0 %	0 %	50 %	50 %	111022147
141641	NC_008268	CGA	2	6	5521102	5521107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141642	NC_008268	GCC	2	6	5521137	5521142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
141643	NC_008268	CTT	2	6	5521168	5521173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022147
141644	NC_008268	CGA	2	6	5521267	5521272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141645	NC_008268	TGG	2	6	5521283	5521288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022147
141646	NC_008268	GCA	2	6	5521309	5521314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141647	NC_008268	GAC	2	6	5521430	5521435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141648	NC_008268	GCA	2	6	5521519	5521524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141649	NC_008268	GTC	2	6	5521549	5521554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141650	NC_008268	GCC	2	6	5521568	5521573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
141651	NC_008268	CCG	2	6	5521594	5521599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
141652	NC_008268	TCT	2	6	5521704	5521709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022147
141653	NC_008268	CGA	2	6	5521732	5521737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141654	NC_008268	TCG	2	6	5521791	5521796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141655	NC_008268	CGG	2	6	5521870	5521875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022147
141656	NC_008268	TGGACG	2	12	5521878	5521889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022147
141657	NC_008268	CGA	2	6	5521891	5521896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141658	NC_008268	CGA	2	6	5521900	5521905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141659	NC_008268	GTCGAC	2	12	5521916	5521927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141660	NC_008268	AGC	2	6	5522022	5522027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
141661	NC_008268	TCCC	2	8	5522039	5522046	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141662	NC_008268	TCG	2	6	5522096	5522101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141663	NC_008268	CGA	2	6	5522173	5522178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141664	NC_008268	TGCAGA	2	12	5522185	5522196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111022148
141665	NC_008268	GCC	3	9	5522253	5522261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
141666	NC_008268	GTG	2	6	5522322	5522327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022148
141667	NC_008268	CTG	2	6	5522385	5522390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
141668	NC_008268	CCA	2	6	5522425	5522430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022148
141669	NC_008268	CCG	2	6	5522437	5522442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
141670	NC_008268	CGT	2	6	5522459	5522464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
141671	NC_008268	TCG	2	6	5522479	5522484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
141672	NC_008268	CCA	2	6	5522491	5522496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022148
141673	NC_008268	CGT	2	6	5522510	5522515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
141674	NC_008268	CGC	2	6	5522522	5522527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
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141676	NC_008268	TCG	2	6	5522650	5522655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
141677	NC_008268	GC	3	6	5522696	5522701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141678	NC_008268	GAG	2	6	5522714	5522719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141679	NC_008268	GCG	2	6	5522746	5522751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141680	NC_008268	GCC	2	6	5522754	5522759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
141681	NC_008268	GGC	2	6	5522775	5522780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
141682	NC_008268	GGAC	2	8	5522785	5522792	25 %	0 %	50 %	25 %	111022149
141683	NC_008268	GCC	2	6	5522858	5522863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
141684	NC_008268	GGT	2	6	5522954	5522959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022149
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141691	NC_008268	CCA	2	6	5523292	5523297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022149
141692	NC_008268	TCG	2	6	5523312	5523317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
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141694	NC_008268	GCATCG	2	12	5523394	5523405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022149
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141698	NC_008268	GCG	2	6	5523486	5523491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
141699	NC_008268	CTG	2	6	5523519	5523524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
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141713	NC_008268	TCG	2	6	5524038	5524043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
141714	NC_008268	GC	3	6	5524047	5524052	0 %	0 %	50 %	50 %	111022149
141715	NC_008268	CGT	2	6	5524069	5524074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
141716	NC_008268	CGGC	2	8	5524081	5524088	0 %	0 %	50 %	50 %	111022149
141717	NC_008268	CCAC	2	8	5524165	5524172	25 %	0 %	0 %	75 %	111022149
141718	NC_008268	GCC	2	6	5524175	5524180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
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141720	NC_008268	C	6	6	5524228	5524233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141721	NC_008268	AGG	2	6	5524238	5524243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022150
141722	NC_008268	CGTG	2	8	5524273	5524280	0 %	25 %	50 %	25 %	111022150
141723	NC_008268	CGC	2	6	5524290	5524295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022150
141724	NC_008268	CGA	2	6	5524316	5524321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022150
141725	NC_008268	CGC	2	6	5524328	5524333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022150
141726	NC_008268	CAC	2	6	5524425	5524430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022150
141727	NC_008268	AGG	2	6	5524510	5524515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022150
141728	NC_008268	GGTGAC	2	12	5524521	5524532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022150
141729	NC_008268	GACGT	2	10	5524570	5524579	20 %	20 %	40 %	20 %	111022150
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141784	NC_008268	GTGCTC	2	12	5526528	5526539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
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141843	NC_008268	CTG	2	6	5528467	5528472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022154
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141936	NC_008268	GCG	3	9	5531160	5531168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022155
141937	NC_008268	CAG	2	6	5531231	5531236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022155
141938	NC_008268	AGC	2	6	5531250	5531255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022155
141939	NC_008268	AGG	2	6	5531280	5531285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022155
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141942	NC_008268	GCACG	2	10	5531365	5531374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141943	NC_008268	CAT	2	6	5531380	5531385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022156
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141945	NC_008268	CGG	2	6	5531445	5531450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022156
141946	NC_008268	GAT	2	6	5531455	5531460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022156
141947	NC_008268	CTG	2	6	5531480	5531485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141948	NC_008268	CGGCC	2	10	5531509	5531518	0 %	0 %	40 %	60 %	111022156
141949	NC_008268	CGT	2	6	5531590	5531595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141950	NC_008268	GGT	2	6	5531605	5531610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022156
141951	NC_008268	CTG	2	6	5531639	5531644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141952	NC_008268	TCG	2	6	5531664	5531669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141953	NC_008268	TGC	2	6	5531682	5531687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141954	NC_008268	TCGTG	2	10	5531697	5531706	0 %	40 %	40 %	20 %	111022156
141955	NC_008268	TCA	2	6	5531745	5531750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022156
141956	NC_008268	GTCCTG	2	12	5531759	5531770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141957	NC_008268	CTG	2	6	5531789	5531794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141958	NC_008268	CGT	2	6	5531824	5531829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141959	NC_008268	GTG	2	6	5531870	5531875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022156
141960	NC_008268	GCCGG	2	10	5531888	5531897	0 %	0 %	60 %	40 %	111022156
141961	NC_008268	CTCGCC	2	12	5531900	5531911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111022156
141962	NC_008268	TGG	2	6	5531934	5531939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022156
141963	NC_008268	TG	3	6	5531943	5531948	0 %	50 %	50 %	0 %	111022156
141964	NC_008268	GTC	2	6	5532052	5532057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141965	NC_008268	ACG	3	9	5532093	5532101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022156
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141968	NC_008268	GTG	2	6	5532167	5532172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022156
141969	NC_008268	CGATC	2	10	5532213	5532222	20 %	20 %	20 %	40 %	111022156
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141971	NC_008268	TCG	2	6	5532258	5532263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141972	NC_008268	GCC	2	6	5532278	5532283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022156
141973	NC_008268	C	6	6	5532282	5532287	0 %	0 %	0 %	100 %	111022156
141974	NC_008268	CTC	2	6	5532296	5532301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022156
141975	NC_008268	GCT	2	6	5532331	5532336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141976	NC_008268	TGCC	2	8	5532358	5532365	0 %	25 %	25 %	50 %	111022156
141977	NC_008268	CTG	2	6	5532386	5532391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
141978	NC_008268	AC	3	6	5532413	5532418	50 %	0 %	0 %	50 %	111022156
141979	NC_008268	TCGCCG	2	12	5532498	5532509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022156
141980	NC_008268	GC	3	6	5532561	5532566	0 %	0 %	50 %	50 %	111022156
141981	NC_008268	GCC	2	6	5532613	5532618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141982	NC_008268	ACG	2	6	5532627	5532632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141983	NC_008268	TCG	2	6	5532707	5532712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
141984	NC_008268	TGC	2	6	5532767	5532772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
141985	NC_008268	GGC	2	6	5532807	5532812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022157
141986	NC_008268	CGG	2	6	5532823	5532828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022157
141987	NC_008268	GTC	2	6	5532832	5532837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
141988	NC_008268	CGG	2	6	5532840	5532845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022157
141989	NC_008268	CTGC	2	8	5532856	5532863	0 %	25 %	25 %	50 %	111022157
141990	NC_008268	GCC	2	6	5532868	5532873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022157
141991	NC_008268	GAT	2	6	5532928	5532933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022157
141992	NC_008268	CTG	2	6	5532982	5532987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
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142000	NC_008268	ACC	2	6	5533235	5533240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022157

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