MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
140001	NC_008268	CGG	2	6	5459992	5459997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022090
140002	NC_008268	CGT	2	6	5460001	5460006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022090
140003	NC_008268	AGC	2	6	5460009	5460014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022090
140004	NC_008268	GCC	2	6	5460047	5460052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022090
140005	NC_008268	GTTCG	2	10	5460149	5460158	0 %	40 %	40 %	20 %	111022090
140006	NC_008268	GTC	2	6	5460203	5460208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022090
140007	NC_008268	CGC	2	6	5460225	5460230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022090
140008	NC_008268	GCC	2	6	5460234	5460239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022090
140009	NC_008268	CGT	2	6	5460280	5460285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022090
140010	NC_008268	TGG	2	6	5460325	5460330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022090
140011	NC_008268	GGC	2	6	5460458	5460463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022090
140012	NC_008268	TCG	3	9	5460471	5460479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022090
140013	NC_008268	CTC	2	6	5460586	5460591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022091
140014	NC_008268	GTC	2	6	5460655	5460660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140015	NC_008268	CGT	2	6	5460675	5460680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140016	NC_008268	GAT	2	6	5460790	5460795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022091
140017	NC_008268	GCG	2	6	5460800	5460805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140018	NC_008268	CGG	2	6	5460833	5460838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140019	NC_008268	ATG	2	6	5460839	5460844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022091
140020	NC_008268	TTC	2	6	5460863	5460868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022091
140021	NC_008268	TCGCGG	2	12	5460912	5460923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022091
140022	NC_008268	CG	3	6	5460955	5460960	0 %	0 %	50 %	50 %	111022091
140023	NC_008268	CGA	2	6	5460993	5460998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140024	NC_008268	AGT	2	6	5461017	5461022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022091
140025	NC_008268	CGG	2	6	5461050	5461055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140026	NC_008268	GAT	2	6	5461069	5461074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022091
140027	NC_008268	ACC	2	6	5461078	5461083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022091
140028	NC_008268	GTC	3	9	5461168	5461176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140029	NC_008268	GGA	2	6	5461203	5461208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022091
140030	NC_008268	TGC	2	6	5461287	5461292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140031	NC_008268	CGA	2	6	5461302	5461307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140032	NC_008268	CGGCC	2	10	5461314	5461323	0 %	0 %	40 %	60 %	111022091
140033	NC_008268	CGG	2	6	5461329	5461334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140034	NC_008268	CGG	2	6	5461347	5461352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140035	NC_008268	CGG	2	6	5461356	5461361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022091
140036	NC_008268	CGT	2	6	5461374	5461379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022091
140037	NC_008268	TTG	2	6	5461466	5461471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022091
140038	NC_008268	TGA	2	6	5461529	5461534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140039	NC_008268	ATC	2	6	5461575	5461580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140040	NC_008268	GTC	2	6	5461589	5461594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140041	NC_008268	GAC	2	6	5461621	5461626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022092
140042	NC_008268	CG	3	6	5461643	5461648	0 %	0 %	50 %	50 %	111022092
140043	NC_008268	CGG	2	6	5461650	5461655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022092
140044	NC_008268	GGTCCT	2	12	5461719	5461730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022092
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140048	NC_008268	CGC	2	6	5461867	5461872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022092
140049	NC_008268	CGC	2	6	5461884	5461889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022092
140050	NC_008268	CGA	2	6	5461914	5461919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022092
140051	NC_008268	GC	3	6	5461927	5461932	0 %	0 %	50 %	50 %	111022092
140052	NC_008268	CGC	2	6	5461938	5461943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022092
140053	NC_008268	GC	4	8	5462037	5462044	0 %	0 %	50 %	50 %	111022092
140054	NC_008268	CTC	2	6	5462055	5462060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022093
140055	NC_008268	TCG	2	6	5462098	5462103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022093
140056	NC_008268	CAT	2	6	5462156	5462161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022093
140057	NC_008268	TCG	2	6	5462167	5462172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022093
140058	NC_008268	TGC	2	6	5462209	5462214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022093
140059	NC_008268	GCT	2	6	5462234	5462239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022093
140060	NC_008268	CGA	2	6	5462288	5462293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022093
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140063	NC_008268	CCG	3	9	5462419	5462427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022093
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140065	NC_008268	TCG	2	6	5462461	5462466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022093
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140067	NC_008268	TCGT	2	8	5462550	5462557	0 %	50 %	25 %	25 %	111022094
140068	NC_008268	GAA	2	6	5462568	5462573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022094
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140070	NC_008268	TGC	2	6	5462599	5462604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022094
140071	NC_008268	CAG	2	6	5462628	5462633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022094
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140088	NC_008268	CGC	2	6	5463152	5463157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022094
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140096	NC_008268	ATCA	2	8	5463447	5463454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140097	NC_008268	CGT	2	6	5463633	5463638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022095
140098	NC_008268	CG	3	6	5463669	5463674	0 %	0 %	50 %	50 %	111022095
140099	NC_008268	GCA	2	6	5463701	5463706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022095
140100	NC_008268	TAC	2	6	5463715	5463720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022095
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140108	NC_008268	GCA	2	6	5463979	5463984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022095
140109	NC_008268	CTG	2	6	5463991	5463996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022095
140110	NC_008268	TGC	2	6	5463998	5464003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022095
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140113	NC_008268	CCG	2	6	5464083	5464088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022095
140114	NC_008268	GCC	2	6	5464120	5464125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022095
140115	NC_008268	TGC	2	6	5464133	5464138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022095
140116	NC_008268	GTC	2	6	5464150	5464155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022095
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140228	NC_008268	CGTC	2	8	5468414	5468421	0 %	25 %	25 %	50 %	111022097
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140328	NC_008268	GC	3	6	5472409	5472414	0 %	0 %	50 %	50 %	111022103
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140341	NC_008268	CGT	2	6	5472981	5472986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022103
140342	NC_008268	ACG	2	6	5473026	5473031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022103
140343	NC_008268	GGAT	2	8	5473066	5473073	25 %	25 %	50 %	0 %	111022103
140344	NC_008268	CGGC	2	8	5473095	5473102	0 %	0 %	50 %	50 %	111022103
140345	NC_008268	AGC	2	6	5473144	5473149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022103
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140349	NC_008268	CTCGCG	2	12	5473247	5473258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022103
140350	NC_008268	GAG	2	6	5473259	5473264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022103
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140352	NC_008268	TGA	2	6	5473334	5473339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140353	NC_008268	GTC	2	6	5473354	5473359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140354	NC_008268	GGT	2	6	5473368	5473373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140355	NC_008268	TCA	2	6	5473389	5473394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140356	NC_008268	CTG	2	6	5473441	5473446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022104
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140358	NC_008268	CG	3	6	5473493	5473498	0 %	0 %	50 %	50 %	111022104
140359	NC_008268	GGC	2	6	5473511	5473516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022104
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140364	NC_008268	TCT	2	6	5473600	5473605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022104
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140396	NC_008268	TAC	2	6	5474841	5474846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022105
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140401	NC_008268	CCGG	2	8	5475022	5475029	0 %	0 %	50 %	50 %	111022105
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140431	NC_008268	CG	3	6	5476424	5476429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140432	NC_008268	TCG	2	6	5476430	5476435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140453	NC_008268	CGC	2	6	5476984	5476989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022107
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