MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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137004	NC_008268	GCCG	2	8	5346060	5346067	0 %	0 %	50 %	50 %	111022026
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137228	NC_008268	CTCG	2	8	5354759	5354766	0 %	25 %	25 %	50 %	111022033
137229	NC_008268	CGT	2	6	5354768	5354773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022033
137230	NC_008268	CGA	2	6	5354807	5354812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022033
137231	NC_008268	CAC	2	6	5354852	5354857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022033
137232	NC_008268	CG	3	6	5354873	5354878	0 %	0 %	50 %	50 %	111022033
137233	NC_008268	GCG	3	9	5354876	5354884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022033
137234	NC_008268	G	6	6	5354884	5354889	0 %	0 %	100 %	0 %	111022033
137235	NC_008268	GCC	2	6	5354901	5354906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022033
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137237	NC_008268	GCG	2	6	5354939	5354944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022033
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137241	NC_008268	CTG	2	6	5355135	5355140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022033
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137251	NC_008268	GGT	2	6	5355413	5355418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022033
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137256	NC_008268	TGC	2	6	5355622	5355627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022033
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137281	NC_008268	TCGA	2	8	5356291	5356298	25 %	25 %	25 %	25 %	111022034
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137285	NC_008268	CG	3	6	5356414	5356419	0 %	0 %	50 %	50 %	111022034
137286	NC_008268	TGA	2	6	5356622	5356627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022034
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137288	NC_008268	ACG	2	6	5356705	5356710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022034
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137291	NC_008268	GGC	2	6	5356998	5357003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022034
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137295	NC_008268	GAG	2	6	5357100	5357105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022034
137296	NC_008268	TCCTGG	2	12	5357135	5357146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137297	NC_008268	CTG	2	6	5357160	5357165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137298	NC_008268	GTC	2	6	5357322	5357327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022035
137299	NC_008268	GAG	2	6	5357331	5357336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022035
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137325	NC_008268	CGG	2	6	5358308	5358313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022035
137326	NC_008268	ACCA	2	8	5358402	5358409	50 %	0 %	0 %	50 %	111022035
137327	NC_008268	GC	3	6	5358415	5358420	0 %	0 %	50 %	50 %	111022035
137328	NC_008268	CGG	2	6	5358431	5358436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022035
137329	NC_008268	GAT	2	6	5358449	5358454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022035
137330	NC_008268	GC	3	6	5358455	5358460	0 %	0 %	50 %	50 %	111022035
137331	NC_008268	GC	4	8	5358489	5358496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137332	NC_008268	CTGCGG	2	12	5358522	5358533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022036
137333	NC_008268	GTC	2	6	5358562	5358567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022036
137334	NC_008268	CGG	2	6	5358615	5358620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022036
137335	NC_008268	GCT	2	6	5358624	5358629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022036
137336	NC_008268	CGT	2	6	5358652	5358657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022036
137337	NC_008268	CTT	2	6	5358736	5358741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022036
137338	NC_008268	CCG	2	6	5358755	5358760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022036
137339	NC_008268	GCT	2	6	5358804	5358809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022036
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137341	NC_008268	CGGG	2	8	5358868	5358875	0 %	0 %	75 %	25 %	111022036
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137455	NC_008268	TCG	2	6	5363362	5363367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022041
137456	NC_008268	CGA	2	6	5363438	5363443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022041
137457	NC_008268	CGCCGT	2	12	5363444	5363455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022041
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137459	NC_008268	TGA	2	6	5363504	5363509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022041
137460	NC_008268	TGG	2	6	5363545	5363550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022041
137461	NC_008268	GGT	2	6	5363562	5363567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022041
137462	NC_008268	CGA	2	6	5363582	5363587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022041
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137473	NC_008268	AGC	2	6	5363938	5363943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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137482	NC_008268	GCC	2	6	5364535	5364540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022042
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137484	NC_008268	GTC	2	6	5364604	5364609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022042
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137491	NC_008268	CGA	2	6	5364791	5364796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022043
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137499	NC_008268	CG	4	8	5365152	5365159	0 %	0 %	50 %	50 %	111022043
137500	NC_008268	ATCG	2	8	5365170	5365177	25 %	25 %	25 %	25 %	111022043

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