MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008268	CGA	2	6	503381	503386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017446
12502	NC_008268	TCG	2	6	503403	503408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017446
12503	NC_008268	GTC	2	6	503451	503456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017446
12504	NC_008268	GCC	2	6	503476	503481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017446
12505	NC_008268	CGCTC	2	10	503569	503578	0 %	20 %	20 %	60 %	111017447
12506	NC_008268	CAT	2	6	503619	503624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017447
12507	NC_008268	GCC	2	6	503643	503648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017447
12508	NC_008268	GTC	2	6	503688	503693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017447
12509	NC_008268	GTGG	2	8	503859	503866	0 %	25 %	75 %	0 %	111017448
12510	NC_008268	TCG	2	6	503945	503950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017448
12511	NC_008268	GAAG	2	8	503978	503985	50 %	0 %	50 %	0 %	111017448
12512	NC_008268	GCC	2	6	504011	504016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017448
12513	NC_008268	CCG	2	6	504040	504045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017448
12514	NC_008268	ACG	2	6	504060	504065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017448
12515	NC_008268	TGC	2	6	504090	504095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017448
12516	NC_008268	CCT	2	6	504135	504140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017448
12517	NC_008268	ACG	2	6	504168	504173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017448
12518	NC_008268	ATG	2	6	504189	504194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017448
12519	NC_008268	TCG	2	6	504249	504254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017448
12520	NC_008268	CGG	2	6	504262	504267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017448
12521	NC_008268	GCTCG	2	10	504316	504325	0 %	20 %	40 %	40 %	111017448
12522	NC_008268	AAC	2	6	504372	504377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017448
12523	NC_008268	GC	3	6	504379	504384	0 %	0 %	50 %	50 %	111017448
12524	NC_008268	CCG	3	9	504405	504413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017448
12525	NC_008268	TGA	2	6	504415	504420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017448
12526	NC_008268	CTC	2	6	504452	504457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_008268	TTG	2	6	504510	504515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_008268	AGC	2	6	504649	504654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_008268	ATC	2	6	504706	504711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_008268	GCC	2	6	504759	504764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12531	NC_008268	AGT	2	6	504796	504801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_008268	CG	3	6	504818	504823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12533	NC_008268	TCGG	2	8	504835	504842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12534	NC_008268	AAG	2	6	504865	504870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_008268	CTC	2	6	504922	504927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017449
12536	NC_008268	CG	3	6	504972	504977	0 %	0 %	50 %	50 %	111017449
12537	NC_008268	GCG	3	9	504975	504983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017449
12538	NC_008268	ACG	2	6	504984	504989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017449
12539	NC_008268	CAA	2	6	505040	505045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017449
12540	NC_008268	TGA	2	6	505093	505098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017449
12541	NC_008268	CGA	2	6	505148	505153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017449
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12543	NC_008268	CCG	2	6	505179	505184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017449
12544	NC_008268	AGC	2	6	505188	505193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017449
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12547	NC_008268	CGA	2	6	505369	505374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017450
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12551	NC_008268	CCGGC	2	10	505668	505677	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12552	NC_008268	GTGG	2	8	505700	505707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_008268	ACC	2	6	505805	505810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017451
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12555	NC_008268	GCA	2	6	506058	506063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017451
12556	NC_008268	CGC	2	6	506078	506083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017451
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12560	NC_008268	GTG	2	6	506176	506181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017451
12561	NC_008268	GC	3	6	506219	506224	0 %	0 %	50 %	50 %	111017451
12562	NC_008268	GGGCG	2	10	506225	506234	0 %	0 %	80 %	20 %	111017451
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12567	NC_008268	GC	3	6	506333	506338	0 %	0 %	50 %	50 %	111017451
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12588	NC_008268	GTTC	2	8	507104	507111	0 %	50 %	25 %	25 %	111017452
12589	NC_008268	TCG	2	6	507113	507118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017452
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12594	NC_008268	CGGC	2	8	507227	507234	0 %	0 %	50 %	50 %	111017452
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12620	NC_008268	GCA	2	6	507996	508001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017452
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12740	NC_008268	GCG	2	6	512090	512095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
12741	NC_008268	GC	4	8	512107	512114	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
12742	NC_008268	GCG	2	6	512140	512145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
12743	NC_008268	GAC	2	6	512280	512285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
12744	NC_008268	CGC	2	6	512303	512308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
12745	NC_008268	ACG	2	6	512317	512322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
12746	NC_008268	CGAT	2	8	512326	512333	25 %	25 %	25 %	25 %	111017455
12747	NC_008268	GAG	2	6	512346	512351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017455
12748	NC_008268	CGATT	2	10	512355	512364	20 %	40 %	20 %	20 %	111017455
12749	NC_008268	ACC	2	6	512436	512441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
12750	NC_008268	CGC	2	6	512449	512454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
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12753	NC_008268	CCGCC	2	10	512520	512529	0 %	0 %	20 %	80 %	111017455
12754	NC_008268	TCCGAT	2	12	512540	512551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111017455
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12759	NC_008268	TCG	2	6	512714	512719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
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12762	NC_008268	CGG	2	6	512781	512786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
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12771	NC_008268	CCA	2	6	513065	513070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
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12775	NC_008268	CAC	2	6	513189	513194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
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12798	NC_008268	CGG	2	6	513686	513691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
12799	NC_008268	TCG	2	6	513700	513705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
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12802	NC_008268	GCGGTA	2	12	513750	513761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017455
12803	NC_008268	TCG	2	6	513785	513790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
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12808	NC_008268	GTC	2	6	514047	514052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
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12811	NC_008268	GC	3	6	514125	514130	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
12812	NC_008268	CCGTC	2	10	514161	514170	0 %	20 %	20 %	60 %	111017455
12813	NC_008268	CGC	2	6	514171	514176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
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12822	NC_008268	CGGTT	2	10	514447	514456	0 %	40 %	40 %	20 %	111017455
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12829	NC_008268	CGG	2	6	514664	514669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
12830	NC_008268	CGA	2	6	514697	514702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
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12832	NC_008268	TGC	2	6	514891	514896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
12833	NC_008268	TGC	2	6	514912	514917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
12834	NC_008268	CGGAT	2	10	514935	514944	20 %	20 %	40 %	20 %	111017455
12835	NC_008268	TCGC	2	8	514961	514968	0 %	25 %	25 %	50 %	111017455
12836	NC_008268	ACCA	2	8	514989	514996	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
12837	NC_008268	CGG	2	6	515020	515025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
12838	NC_008268	GGGCAG	2	12	515042	515053	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111017455
12839	NC_008268	AC	3	6	515102	515107	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
12840	NC_008268	GT	3	6	515113	515118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12841	NC_008268	CCGC	2	8	515136	515143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12842	NC_008268	ACG	2	6	515152	515157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12843	NC_008268	CGA	2	6	515202	515207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12844	NC_008268	GAG	2	6	515222	515227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12845	NC_008268	ATC	2	6	515244	515249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017456
12846	NC_008268	CGG	2	6	515261	515266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017456
12847	NC_008268	ACA	2	6	515352	515357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017456
12848	NC_008268	GGA	2	6	515425	515430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017456
12849	NC_008268	GA	3	6	515461	515466	50 %	0 %	50 %	0 %	111017456
12850	NC_008268	CCG	2	6	515489	515494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017456
12851	NC_008268	CCGG	2	8	515498	515505	0 %	0 %	50 %	50 %	111017456
12852	NC_008268	CTCG	2	8	515579	515586	0 %	25 %	25 %	50 %	111017456
12853	NC_008268	CAA	2	6	515600	515605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017456
12854	NC_008268	GAG	2	6	515613	515618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017456
12855	NC_008268	CGC	2	6	515624	515629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017456
12856	NC_008268	TTC	2	6	515655	515660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017456
12857	NC_008268	ACC	2	6	515841	515846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017456
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12859	NC_008268	ACG	2	6	515875	515880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017456
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12979	NC_008268	GTT	2	6	520871	520876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017461
12980	NC_008268	CGA	2	6	520879	520884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017461
12981	NC_008268	TCGGCG	2	12	520941	520952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017461
12982	NC_008268	CGG	2	6	521023	521028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017461
12983	NC_008268	GT	3	6	521034	521039	0 %	50 %	50 %	0 %	111017461
12984	NC_008268	GCG	2	6	521099	521104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017461
12985	NC_008268	CGG	2	6	521185	521190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017461
12986	NC_008268	AGCGA	2	10	521328	521337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12987	NC_008268	CGGT	2	8	521364	521371	0 %	25 %	50 %	25 %	111017462
12988	NC_008268	TCG	2	6	521409	521414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017462
12989	NC_008268	TGGCGG	2	12	521430	521441	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111017462
12990	NC_008268	AGCGCG	2	12	521465	521476	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017462
12991	NC_008268	GTG	2	6	521528	521533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017462
12992	NC_008268	CGA	2	6	521565	521570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017462
12993	NC_008268	CGG	2	6	521585	521590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017462
12994	NC_008268	CGCCA	2	10	521633	521642	20 %	0 %	20 %	60 %	111017462
12995	NC_008268	GGC	2	6	521662	521667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017462
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