MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008268	GTC	2	6	482592	482597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017430
12002	NC_008268	GGCT	2	8	482628	482635	0 %	25 %	50 %	25 %	111017430
12003	NC_008268	CGA	2	6	482708	482713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017430
12004	NC_008268	GCC	2	6	482787	482792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017430
12005	NC_008268	GGCA	2	8	482832	482839	25 %	0 %	50 %	25 %	111017430
12006	NC_008268	TCGA	2	8	482865	482872	25 %	25 %	25 %	25 %	111017430
12007	NC_008268	CTG	2	6	482955	482960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017430
12008	NC_008268	CTC	2	6	482982	482987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017430
12009	NC_008268	CCCCA	2	10	482997	483006	20 %	0 %	0 %	80 %	111017430
12010	NC_008268	CCA	2	6	483048	483053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017430
12011	NC_008268	GAG	2	6	483075	483080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017430
12012	NC_008268	TTC	2	6	483127	483132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017430
12013	NC_008268	CGGA	2	8	483191	483198	25 %	0 %	50 %	25 %	111017430
12014	NC_008268	CTG	2	6	483255	483260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017430
12015	NC_008268	AGG	2	6	483313	483318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_008268	GTT	2	6	483355	483360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017431
12017	NC_008268	TCCG	2	8	483368	483375	0 %	25 %	25 %	50 %	111017431
12018	NC_008268	TCG	2	6	483381	483386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017431
12019	NC_008268	GATC	2	8	483433	483440	25 %	25 %	25 %	25 %	111017431
12020	NC_008268	CTGG	2	8	483448	483455	0 %	25 %	50 %	25 %	111017431
12021	NC_008268	CGG	2	6	483502	483507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017431
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12024	NC_008268	CGA	2	6	483637	483642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017431
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12029	NC_008268	ACC	2	6	483746	483751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017431
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12033	NC_008268	GTT	2	6	483964	483969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017431
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12035	NC_008268	TCGGCA	2	12	484062	484073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017431
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12042	NC_008268	CGG	2	6	484417	484422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017431
12043	NC_008268	ATC	2	6	484445	484450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017431
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12045	NC_008268	CTCGT	2	10	484523	484532	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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12047	NC_008268	TCG	2	6	484815	484820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12048	NC_008268	GGGC	2	8	484831	484838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12049	NC_008268	GGTGG	2	10	484863	484872	0 %	20 %	80 %	0 %	111017432
12050	NC_008268	CGC	3	9	484903	484911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017432
12051	NC_008268	TCG	2	6	484977	484982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017432
12052	NC_008268	CGA	2	6	485002	485007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017432
12053	NC_008268	TCG	2	6	485028	485033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017432
12054	NC_008268	CCGG	2	8	485059	485066	0 %	0 %	50 %	50 %	111017432
12055	NC_008268	CCA	2	6	485129	485134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017432
12056	NC_008268	CGT	2	6	485155	485160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017432
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12114	NC_008268	CG	3	6	487563	487568	0 %	0 %	50 %	50 %	111017434
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12238	NC_008268	GCA	2	6	492033	492038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017436
12239	NC_008268	GAA	2	6	492070	492075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017436
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12246	NC_008268	GGCG	2	8	492409	492416	0 %	0 %	75 %	25 %	111017436
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12304	NC_008268	TGCG	2	8	494431	494438	0 %	25 %	50 %	25 %	111017437
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12337	NC_008268	CGG	2	6	496095	496100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017438
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12339	NC_008268	CGA	2	6	496181	496186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017438
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12341	NC_008268	GCGCG	2	10	496194	496203	0 %	0 %	60 %	40 %	111017438
12342	NC_008268	ACC	2	6	496210	496215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017438
12343	NC_008268	CAT	2	6	496320	496325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017438
12344	NC_008268	CGC	2	6	496352	496357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017438
12345	NC_008268	CTG	3	9	496440	496448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017438
12346	NC_008268	CTC	2	6	496499	496504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12347	NC_008268	ACC	2	6	496525	496530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12348	NC_008268	C	6	6	496602	496607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12349	NC_008268	CA	3	6	496638	496643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12350	NC_008268	AT	3	6	496644	496649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12351	NC_008268	CGG	2	6	496692	496697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017439
12352	NC_008268	GCG	2	6	496698	496703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017439
12353	NC_008268	CGC	2	6	496732	496737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017439
12354	NC_008268	ACCG	2	8	496766	496773	25 %	0 %	25 %	50 %	111017439
12355	NC_008268	TGCGC	2	10	497007	497016	0 %	20 %	40 %	40 %	111017439
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12357	NC_008268	GGC	3	9	497056	497064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017439
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12459	NC_008268	AGGC	2	8	501311	501318	25 %	0 %	50 %	25 %	111017444
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12472	NC_008268	TGT	2	6	501977	501982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12473	NC_008268	CGG	2	6	502158	502163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017445
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12478	NC_008268	TCGC	2	8	502421	502428	0 %	25 %	25 %	50 %	111017445
12479	NC_008268	CGG	2	6	502442	502447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017445
12480	NC_008268	CCG	3	9	502472	502480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017445
12481	NC_008268	GATG	2	8	502535	502542	25 %	25 %	50 %	0 %	111017445
12482	NC_008268	GAAG	2	8	502592	502599	50 %	0 %	50 %	0 %	111017445
12483	NC_008268	CTC	2	6	502614	502619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017445
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12486	NC_008268	CG	3	6	502763	502768	0 %	0 %	50 %	50 %	111017445
12487	NC_008268	TTC	2	6	502779	502784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017445
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