MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008268	CA	3	6	439665	439670	50 %	0 %	0 %	50 %	111017390
11002	NC_008268	TGC	2	6	439682	439687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11003	NC_008268	GCC	2	6	439737	439742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017390
11004	NC_008268	GCA	2	6	439768	439773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11005	NC_008268	CCA	2	6	439885	439890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017390
11006	NC_008268	CCA	2	6	439915	439920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017390
11007	NC_008268	CCA	2	6	439945	439950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017390
11008	NC_008268	GC	3	6	439999	440004	0 %	0 %	50 %	50 %	111017390
11009	NC_008268	CAG	2	6	440072	440077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11010	NC_008268	GCC	2	6	440123	440128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017390
11011	NC_008268	CGA	2	6	440170	440175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11012	NC_008268	GTC	2	6	440184	440189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11013	NC_008268	AGA	2	6	440209	440214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017390
11014	NC_008268	CAC	2	6	440269	440274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017390
11015	NC_008268	AAC	2	6	440367	440372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017390
11016	NC_008268	AC	3	6	440433	440438	50 %	0 %	0 %	50 %	111017390
11017	NC_008268	CAG	2	6	440516	440521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11018	NC_008268	AC	3	6	440528	440533	50 %	0 %	0 %	50 %	111017390
11019	NC_008268	CGG	2	6	440626	440631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017390
11020	NC_008268	CAT	2	6	440636	440641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017390
11021	NC_008268	ATC	2	6	440649	440654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017390
11022	NC_008268	ACG	2	6	440655	440660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11023	NC_008268	CAG	2	6	440678	440683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11024	NC_008268	GCG	2	6	440709	440714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017390
11025	NC_008268	ATC	2	6	440814	440819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017391
11026	NC_008268	CAG	2	6	440966	440971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017391
11027	NC_008268	TTCG	2	8	440975	440982	0 %	50 %	25 %	25 %	111017391
11028	NC_008268	GGCC	2	8	441047	441054	0 %	0 %	50 %	50 %	111017391
11029	NC_008268	GCA	2	6	441146	441151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017391
11030	NC_008268	GCC	2	6	441293	441298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017391
11031	NC_008268	CAG	2	6	441302	441307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017391
11032	NC_008268	CCG	2	6	441372	441377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017391
11033	NC_008268	CGA	2	6	441379	441384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017391
11034	NC_008268	TTG	2	6	441417	441422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017391
11035	NC_008268	GCGATC	2	12	441432	441443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017391
11036	NC_008268	CGTC	2	8	441489	441496	0 %	25 %	25 %	50 %	111017391
11037	NC_008268	AGG	2	6	441523	441528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017391
11038	NC_008268	CA	3	6	441547	441552	50 %	0 %	0 %	50 %	111017391
11039	NC_008268	GAT	2	6	441581	441586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017391
11040	NC_008268	GCC	2	6	441626	441631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017391
11041	NC_008268	AGCA	2	8	441668	441675	50 %	0 %	25 %	25 %	111017391
11042	NC_008268	ACG	2	6	441816	441821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_008268	CG	3	6	441952	441957	0 %	0 %	50 %	50 %	111017392
11044	NC_008268	GTG	2	6	441979	441984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017392
11045	NC_008268	CGC	2	6	441987	441992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017392
11046	NC_008268	GC	3	6	441991	441996	0 %	0 %	50 %	50 %	111017392
11047	NC_008268	CGC	2	6	442045	442050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017392
11048	NC_008268	TACC	2	8	442061	442068	25 %	25 %	0 %	50 %	111017392
11049	NC_008268	GCC	2	6	442127	442132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017392
11050	NC_008268	CAA	2	6	442146	442151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017392
11051	NC_008268	CG	3	6	442181	442186	0 %	0 %	50 %	50 %	111017392
11052	NC_008268	TCA	2	6	442313	442318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017392
11053	NC_008268	GACC	2	8	442449	442456	25 %	0 %	25 %	50 %	111017392
11054	NC_008268	GTC	2	6	442470	442475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017392
11055	NC_008268	CGA	2	6	442485	442490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017392
11056	NC_008268	TC	3	6	442507	442512	0 %	50 %	0 %	50 %	111017392
11057	NC_008268	CGG	2	6	442608	442613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017392
11058	NC_008268	CGA	3	9	442634	442642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_008268	CCA	2	6	442667	442672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017393
11060	NC_008268	ACC	2	6	442678	442683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017393
11061	NC_008268	CGG	2	6	442729	442734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
11062	NC_008268	CTG	2	6	442753	442758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11063	NC_008268	CGG	3	9	442764	442772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
11064	NC_008268	CAG	2	6	442816	442821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11065	NC_008268	GC	3	6	442827	442832	0 %	0 %	50 %	50 %	111017393
11066	NC_008268	ACGC	2	8	442844	442851	25 %	0 %	25 %	50 %	111017393
11067	NC_008268	CGAC	2	8	442874	442881	25 %	0 %	25 %	50 %	111017393
11068	NC_008268	GTC	2	6	442924	442929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11069	NC_008268	TCG	2	6	442955	442960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017393
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11071	NC_008268	CGA	2	6	443001	443006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11072	NC_008268	TGG	2	6	443033	443038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017393
11073	NC_008268	CG	3	6	443167	443172	0 %	0 %	50 %	50 %	111017393
11074	NC_008268	ACG	2	6	443210	443215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11075	NC_008268	CGG	2	6	443267	443272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
11076	NC_008268	CGG	2	6	443276	443281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
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11078	NC_008268	CGC	2	6	443304	443309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017393
11079	NC_008268	GC	3	6	443380	443385	0 %	0 %	50 %	50 %	111017393
11080	NC_008268	GCG	2	6	443429	443434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
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11082	NC_008268	GCG	2	6	443450	443455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017393
11083	NC_008268	ACG	2	6	443462	443467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11084	NC_008268	TGG	2	6	443483	443488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017393
11085	NC_008268	CGA	2	6	443496	443501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017393
11086	NC_008268	ACC	2	6	443520	443525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017393
11087	NC_008268	GCC	2	6	443642	443647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017394
11088	NC_008268	ATC	2	6	443666	443671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017394
11089	NC_008268	GTGC	2	8	443726	443733	0 %	25 %	50 %	25 %	111017394
11090	NC_008268	CAT	2	6	443747	443752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017394
11091	NC_008268	CGCCGG	2	12	443797	443808	0 %	0 %	50 %	50 %	111017394
11092	NC_008268	GCCCG	2	10	443827	443836	0 %	0 %	40 %	60 %	111017394
11093	NC_008268	TTC	2	6	443849	443854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017394
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11097	NC_008268	CTG	2	6	444125	444130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017394
11098	NC_008268	CGC	2	6	444142	444147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017394
11099	NC_008268	GTT	2	6	444169	444174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017394
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11101	NC_008268	CCG	2	6	444284	444289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_008268	CG	3	6	444295	444300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_008268	CCTC	2	8	444303	444310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11104	NC_008268	GCAG	2	8	444393	444400	25 %	0 %	50 %	25 %	111017395
11105	NC_008268	GAA	2	6	444419	444424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017395
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11107	NC_008268	TCG	2	6	444502	444507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11108	NC_008268	CG	3	6	444543	444548	0 %	0 %	50 %	50 %	111017395
11109	NC_008268	GTT	2	6	444608	444613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017395
11110	NC_008268	GACCG	2	10	444662	444671	20 %	0 %	40 %	40 %	111017395
11111	NC_008268	CGT	2	6	444709	444714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11112	NC_008268	CGA	2	6	444730	444735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11113	NC_008268	CCA	2	6	444765	444770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017395
11114	NC_008268	CTTC	2	8	444793	444800	0 %	50 %	0 %	50 %	111017395
11115	NC_008268	CGATGT	2	12	444802	444813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111017395
11116	NC_008268	CTG	2	6	444830	444835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11117	NC_008268	ACC	2	6	444924	444929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017395
11118	NC_008268	TCG	2	6	444930	444935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11119	NC_008268	TGCA	2	8	444990	444997	25 %	25 %	25 %	25 %	111017395
11120	NC_008268	GCA	2	6	445018	445023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11121	NC_008268	TGAT	2	8	445026	445033	25 %	50 %	25 %	0 %	111017395
11122	NC_008268	CGT	2	6	445039	445044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11123	NC_008268	GAT	2	6	445049	445054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017395
11124	NC_008268	CGC	2	6	445055	445060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017395
11125	NC_008268	ATG	2	6	445116	445121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017395
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11127	NC_008268	ACGTG	2	10	445150	445159	20 %	20 %	40 %	20 %	111017395
11128	NC_008268	CA	3	6	445207	445212	50 %	0 %	0 %	50 %	111017395
11129	NC_008268	GAT	2	6	445388	445393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017395
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11131	NC_008268	CTG	2	6	445520	445525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11132	NC_008268	GCTGAC	2	12	445535	445546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017395
11133	NC_008268	GCT	2	6	445594	445599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017395
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11135	NC_008268	GCC	2	6	445805	445810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017395
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11143	NC_008268	GTT	2	6	446156	446161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017396
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11150	NC_008268	GCT	2	6	446381	446386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017396
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11194	NC_008268	CTC	2	6	447897	447902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11228	NC_008268	CCAT	2	8	449874	449881	25 %	25 %	0 %	50 %	111017399
11229	NC_008268	GT	3	6	449890	449895	0 %	50 %	50 %	0 %	111017399
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11238	NC_008268	GGA	2	6	450161	450166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017399
11239	NC_008268	TGA	2	6	450190	450195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017399
11240	NC_008268	TGCC	2	8	450254	450261	0 %	25 %	25 %	50 %	111017399
11241	NC_008268	GATC	2	8	450283	450290	25 %	25 %	25 %	25 %	111017399
11242	NC_008268	TGCCC	2	10	450307	450316	0 %	20 %	20 %	60 %	111017399
11243	NC_008268	GTC	2	6	450380	450385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017399
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11250	NC_008268	CGA	2	6	450817	450822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017400
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11255	NC_008268	CGG	2	6	450952	450957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017401
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11273	NC_008268	GACG	2	8	451510	451517	25 %	0 %	50 %	25 %	111017401
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11280	NC_008268	ACCTT	2	10	451793	451802	20 %	40 %	0 %	40 %	111017401
11281	NC_008268	GTC	2	6	451856	451861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11288	NC_008268	CGTC	2	8	452273	452280	0 %	25 %	25 %	50 %	111017403
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11343	NC_008268	GATT	2	8	454983	454990	25 %	50 %	25 %	0 %	111017405
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11348	NC_008268	TCGGCG	2	12	455082	455093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017405
11349	NC_008268	GTCGT	2	10	455154	455163	0 %	40 %	40 %	20 %	111017405
11350	NC_008268	GAT	2	6	455168	455173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017405
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11475	NC_008268	CGA	2	6	460050	460055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017411
11476	NC_008268	ACG	2	6	460127	460132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017411
11477	NC_008268	CAC	2	6	460140	460145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017411
11478	NC_008268	GGA	2	6	460146	460151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017411
11479	NC_008268	GCT	2	6	460241	460246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017412
11480	NC_008268	TCG	2	6	460317	460322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017412
11481	NC_008268	CGA	2	6	460343	460348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017412
11482	NC_008268	CCCG	2	8	460540	460547	0 %	0 %	25 %	75 %	111017412
11483	NC_008268	CTTC	2	8	460677	460684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11484	NC_008268	TGC	2	6	460685	460690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_008268	GGCG	2	8	460692	460699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11486	NC_008268	CGA	2	6	460712	460717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_008268	ATCG	2	8	460742	460749	25 %	25 %	25 %	25 %	111017413
11488	NC_008268	CAT	2	6	460829	460834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017413
11489	NC_008268	CAG	2	6	460841	460846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017413
11490	NC_008268	CAC	2	6	460877	460882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017413
11491	NC_008268	GCA	2	6	460888	460893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017413
11492	NC_008268	GGCC	2	8	460903	460910	0 %	0 %	50 %	50 %	111017413
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11494	NC_008268	ACG	2	6	461035	461040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017413
11495	NC_008268	CGAC	2	8	461059	461066	25 %	0 %	25 %	50 %	111017413
11496	NC_008268	CGAT	2	8	461077	461084	25 %	25 %	25 %	25 %	111017413
11497	NC_008268	CCG	2	6	461085	461090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017413
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11499	NC_008268	GAC	2	6	461114	461119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017413
11500	NC_008268	CGT	2	6	461176	461181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017413

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