MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_008268	CGG	2	6	418893	418898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017369
10503	NC_008268	GCGGCA	2	12	418935	418946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017369
10504	NC_008268	AGGT	2	8	418971	418978	25 %	25 %	50 %	0 %	111017369
10505	NC_008268	TCGTAC	2	12	419016	419027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111017369
10506	NC_008268	CG	3	6	419038	419043	0 %	0 %	50 %	50 %	111017369
10507	NC_008268	CGA	2	6	419068	419073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10508	NC_008268	AGC	2	6	419091	419096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10509	NC_008268	GGC	2	6	419147	419152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017369
10510	NC_008268	TCGACC	2	12	419172	419183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111017369
10511	NC_008268	GCA	2	6	419236	419241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10512	NC_008268	CGA	2	6	419269	419274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10513	NC_008268	AGGA	2	8	419318	419325	50 %	0 %	50 %	0 %	111017369
10514	NC_008268	GGC	2	6	419365	419370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017369
10515	NC_008268	TGC	2	6	419398	419403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10516	NC_008268	CGA	2	6	419461	419466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10517	NC_008268	GCCGC	2	10	419472	419481	0 %	0 %	40 %	60 %	111017369
10518	NC_008268	CAC	2	6	419530	419535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017369
10519	NC_008268	AAC	2	6	419544	419549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017369
10520	NC_008268	CAG	2	6	419558	419563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
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10523	NC_008268	TGG	2	6	419755	419760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017369
10524	NC_008268	TCG	2	6	419793	419798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10525	NC_008268	GC	3	6	419883	419888	0 %	0 %	50 %	50 %	111017369
10526	NC_008268	CCG	2	6	419896	419901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017369
10527	NC_008268	TCG	2	6	419904	419909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10528	NC_008268	TCGA	2	8	419946	419953	25 %	25 %	25 %	25 %	111017369
10529	NC_008268	C	6	6	419960	419965	0 %	0 %	0 %	100 %	111017369
10530	NC_008268	CGA	2	6	419977	419982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
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10533	NC_008268	CGT	2	6	420229	420234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10534	NC_008268	CGGCGT	2	12	420247	420258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017369
10535	NC_008268	CGA	2	6	420334	420339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017369
10536	NC_008268	CGT	2	6	420361	420366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
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10538	NC_008268	GCT	2	6	420465	420470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017369
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10540	NC_008268	GCG	2	6	420622	420627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_008268	CGC	2	6	420635	420640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10542	NC_008268	AGG	2	6	420652	420657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_008268	CAC	3	9	420673	420681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017370
10544	NC_008268	GC	3	6	420733	420738	0 %	0 %	50 %	50 %	111017370
10545	NC_008268	CCA	2	6	420787	420792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017370
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10547	NC_008268	CGT	2	6	420838	420843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017370
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10552	NC_008268	GC	3	6	420985	420990	0 %	0 %	50 %	50 %	111017370
10553	NC_008268	CTG	2	6	420998	421003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017370
10554	NC_008268	CGC	3	9	421027	421035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017370
10555	NC_008268	TCTCC	2	10	421155	421164	0 %	40 %	0 %	60 %	111017370
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10560	NC_008268	CGG	2	6	421543	421548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017370
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10617	NC_008268	CGTG	2	8	423556	423563	0 %	25 %	50 %	25 %	111017372
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10981	NC_008268	GTGA	2	8	438564	438571	25 %	25 %	50 %	0 %	111017389
10982	NC_008268	AGG	2	6	438651	438656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017389
10983	NC_008268	CGGT	2	8	438658	438665	0 %	25 %	50 %	25 %	111017389
10984	NC_008268	TCG	2	6	438666	438671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017389
10985	NC_008268	GTC	2	6	438692	438697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017389
10986	NC_008268	CG	3	6	438707	438712	0 %	0 %	50 %	50 %	111017389
10987	NC_008268	TCG	2	6	438726	438731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017389
10988	NC_008268	CG	3	6	438763	438768	0 %	0 %	50 %	50 %	111017389
10989	NC_008268	GAC	2	6	438803	438808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017389
10990	NC_008268	CGT	2	6	438823	438828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017389
10991	NC_008268	CCG	2	6	438847	438852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017389
10992	NC_008268	CGC	2	6	438883	438888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017389
10993	NC_008268	CAATG	2	10	439086	439095	40 %	20 %	20 %	20 %	111017389
10994	NC_008268	GAC	2	6	439219	439224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10995	NC_008268	TCAA	2	8	439306	439313	50 %	25 %	0 %	25 %	111017390
10996	NC_008268	GC	3	6	439334	439339	0 %	0 %	50 %	50 %	111017390
10997	NC_008268	CGC	2	6	439358	439363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017390
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10999	NC_008268	CTG	2	6	439542	439547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017390
11000	NC_008268	CCG	2	6	439609	439614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017390

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