MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008268	AGC	2	6	399497	399502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017352
10003	NC_008268	GAC	2	6	399570	399575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017352
10004	NC_008268	CTCC	2	8	399584	399591	0 %	25 %	0 %	75 %	111017352
10005	NC_008268	CGTC	2	8	399624	399631	0 %	25 %	25 %	50 %	111017352
10006	NC_008268	TCG	2	6	399688	399693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017352
10007	NC_008268	GCC	2	6	399708	399713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017352
10008	NC_008268	CGG	3	9	399899	399907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017352
10009	NC_008268	CCG	2	6	399995	400000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017352
10010	NC_008268	GGCC	2	8	400007	400014	0 %	0 %	50 %	50 %	111017352
10011	NC_008268	CAC	2	6	400095	400100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_008268	CCA	2	6	400217	400222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_008268	CGG	2	6	400331	400336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017353
10014	NC_008268	GCT	2	6	400356	400361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017353
10015	NC_008268	GCGA	2	8	400389	400396	25 %	0 %	50 %	25 %	111017353
10016	NC_008268	TGA	2	6	400460	400465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017353
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10019	NC_008268	TCG	2	6	400487	400492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017353
10020	NC_008268	CGTC	2	8	400559	400566	0 %	25 %	25 %	50 %	111017353
10021	NC_008268	GAGT	2	8	400608	400615	25 %	25 %	50 %	0 %	111017353
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10025	NC_008268	GTCAC	2	10	400719	400728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10026	NC_008268	GCGCC	2	10	400758	400767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10027	NC_008268	CCA	2	6	400825	400830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017354
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10033	NC_008268	CTCG	2	8	401008	401015	0 %	25 %	25 %	50 %	111017354
10034	NC_008268	TCG	2	6	401142	401147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017354
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10037	NC_008268	GTCCG	2	10	401219	401228	0 %	20 %	40 %	40 %	111017354
10038	NC_008268	TCCG	3	12	401225	401236	0 %	25 %	25 %	50 %	111017354
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10056	NC_008268	GCCG	2	8	401875	401882	0 %	0 %	50 %	50 %	111017356
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10112	NC_008268	CCGA	2	8	404486	404493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_008268	CGC	2	6	404523	404528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017358
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10118	NC_008268	C	8	8	404666	404673	0 %	0 %	0 %	100 %	111017358
10119	NC_008268	TCG	2	6	404686	404691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017358
10120	NC_008268	ACG	2	6	404692	404697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017358
10121	NC_008268	CCA	2	6	404768	404773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017358
10122	NC_008268	CG	4	8	404774	404781	0 %	0 %	50 %	50 %	111017358
10123	NC_008268	GC	3	6	404805	404810	0 %	0 %	50 %	50 %	111017358
10124	NC_008268	GCGG	2	8	404880	404887	0 %	0 %	75 %	25 %	111017358
10125	NC_008268	CCGGAT	2	12	404921	404932	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017358
10126	NC_008268	GCCA	2	8	404938	404945	25 %	0 %	25 %	50 %	111017358
10127	NC_008268	AC	4	8	405003	405010	50 %	0 %	0 %	50 %	111017358
10128	NC_008268	TCC	2	6	405022	405027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017358
10129	NC_008268	CGG	2	6	405037	405042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_008268	CGC	2	6	405062	405067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_008268	TCCG	2	8	405080	405087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_008268	AAC	2	6	405186	405191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017359
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10134	NC_008268	CGA	2	6	405275	405280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017359
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10137	NC_008268	TGC	2	6	405403	405408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017359
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10143	NC_008268	CTG	2	6	405555	405560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10144	NC_008268	CGAT	2	8	405771	405778	25 %	25 %	25 %	25 %	111017360
10145	NC_008268	CGG	2	6	406062	406067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017360
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10166	NC_008268	AGT	2	6	406771	406776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10168	NC_008268	GC	4	8	406846	406853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10235	NC_008268	GAC	2	6	409139	409144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017362
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10237	NC_008268	GACC	2	8	409234	409241	25 %	0 %	25 %	50 %	111017362
10238	NC_008268	CCGGG	2	10	409387	409396	0 %	0 %	60 %	40 %	111017362
10239	NC_008268	ATCG	2	8	409433	409440	25 %	25 %	25 %	25 %	111017362
10240	NC_008268	CGG	3	9	409462	409470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017362
10241	NC_008268	GTG	2	6	409509	409514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017362
10242	NC_008268	GTGC	2	8	409578	409585	0 %	25 %	50 %	25 %	111017362
10243	NC_008268	TCG	2	6	409599	409604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017362
10244	NC_008268	GTG	2	6	409605	409610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017362
10245	NC_008268	TTC	2	6	409679	409684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017363
10246	NC_008268	TTGG	2	8	409706	409713	0 %	50 %	50 %	0 %	111017363
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10253	NC_008268	GTCC	2	8	409840	409847	0 %	25 %	25 %	50 %	111017363
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10255	NC_008268	GATC	2	8	409933	409940	25 %	25 %	25 %	25 %	111017363
10256	NC_008268	CGTTG	2	10	409972	409981	0 %	40 %	40 %	20 %	111017363
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10258	NC_008268	CTG	2	6	410054	410059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017363
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10274	NC_008268	CGGA	2	8	410759	410766	25 %	0 %	50 %	25 %	111017363
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10277	NC_008268	CGG	2	6	410911	410916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017363
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10281	NC_008268	GA	3	6	411042	411047	50 %	0 %	50 %	0 %	111017363
10282	NC_008268	GCGA	2	8	411050	411057	25 %	0 %	50 %	25 %	111017363
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10284	NC_008268	CTG	2	6	411077	411082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017363
10285	NC_008268	GAGATC	2	12	411128	411139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10286	NC_008268	GCCG	2	8	411146	411153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10287	NC_008268	GAA	2	6	411230	411235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10288	NC_008268	TCG	2	6	411287	411292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017364
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10292	NC_008268	ACG	2	6	411527	411532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017364
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10300	NC_008268	GCC	2	6	411664	411669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017364
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10303	NC_008268	TCC	2	6	411793	411798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017364
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10313	NC_008268	GA	3	6	412319	412324	50 %	0 %	50 %	0 %	111017365
10314	NC_008268	GTA	2	6	412360	412365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017365
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10333	NC_008268	GGCC	2	8	412983	412990	0 %	0 %	50 %	50 %	111017365
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10338	NC_008268	CGG	2	6	413191	413196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017365
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10341	NC_008268	CTGA	2	8	413421	413428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10342	NC_008268	GTG	2	6	413468	413473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10343	NC_008268	CA	3	6	413489	413494	50 %	0 %	0 %	50 %	111017366
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10347	NC_008268	CTG	2	6	413760	413765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017366
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10352	NC_008268	CAC	2	6	413921	413926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017366
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10360	NC_008268	CTG	2	6	414039	414044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017366
10361	NC_008268	CGC	2	6	414122	414127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017366
10362	NC_008268	CTG	2	6	414132	414137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017366
10363	NC_008268	CCTCGG	2	12	414140	414151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017366
10364	NC_008268	GCC	2	6	414153	414158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017366
10365	NC_008268	CCG	2	6	414187	414192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017366
10366	NC_008268	CGG	2	6	414215	414220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017366
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10377	NC_008268	CAT	2	6	414497	414502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017366
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10391	NC_008268	CGC	2	6	415109	415114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10392	NC_008268	G	6	6	415136	415141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10393	NC_008268	GC	3	6	415154	415159	0 %	0 %	50 %	50 %	111017367
10394	NC_008268	GCGTCG	2	12	415161	415172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017367
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10400	NC_008268	TGC	2	6	415305	415310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017367
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10403	NC_008268	CCATC	2	10	415436	415445	20 %	20 %	0 %	60 %	111017367
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10432	NC_008268	GGT	2	6	416407	416412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017367
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10466	NC_008268	TCGA	2	8	417687	417694	25 %	25 %	25 %	25 %	111017367
10467	NC_008268	GTCCC	2	10	417733	417742	0 %	20 %	20 %	60 %	111017367
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10471	NC_008268	TCG	2	6	417831	417836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017367
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10473	NC_008268	GTG	2	6	417909	417914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017367
10474	NC_008268	GA	3	6	417921	417926	50 %	0 %	50 %	0 %	111017367
10475	NC_008268	GTT	2	6	418027	418032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017368
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10477	NC_008268	GAC	2	6	418090	418095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017368
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10479	NC_008268	GCGG	2	8	418121	418128	0 %	0 %	75 %	25 %	111017368
10480	NC_008268	CGA	2	6	418133	418138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017368
10481	NC_008268	TGC	2	6	418225	418230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017368
10482	NC_008268	GAA	2	6	418236	418241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017368
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