MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008268	GGCT	2	8	19175	19182	0 %	25 %	50 %	25 %	111017033
502	NC_008268	GCA	2	6	19214	19219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
503	NC_008268	CACC	2	8	19246	19253	25 %	0 %	0 %	75 %	111017033
504	NC_008268	GAA	3	9	19274	19282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017033
505	NC_008268	CCA	2	6	19318	19323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017033
506	NC_008268	GCC	2	6	19365	19370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
507	NC_008268	CGG	2	6	19376	19381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017033
508	NC_008268	CGC	2	6	19384	19389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
509	NC_008268	GC	3	6	19388	19393	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
510	NC_008268	CGA	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
511	NC_008268	CAA	2	6	19477	19482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017033
512	NC_008268	TCG	2	6	19644	19649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
513	NC_008268	CTG	2	6	19673	19678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
514	NC_008268	ACT	2	6	19719	19724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017033
515	NC_008268	ACG	3	9	19725	19733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
516	NC_008268	TGG	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017033
517	NC_008268	CGC	2	6	19805	19810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
518	NC_008268	CCG	2	6	19869	19874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
519	NC_008268	ACC	2	6	19886	19891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017033
520	NC_008268	CGG	2	6	19950	19955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017033
521	NC_008268	CGCC	2	8	19986	19993	0 %	0 %	25 %	75 %	111017033
522	NC_008268	GAT	2	6	20005	20010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017033
523	NC_008268	CG	3	6	20023	20028	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
524	NC_008268	TTC	2	6	20030	20035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017033
525	NC_008268	GC	3	6	20053	20058	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
526	NC_008268	GCG	2	6	20088	20093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017033
527	NC_008268	TCG	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
528	NC_008268	CGA	2	6	20128	20133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
529	NC_008268	ACCCGC	3	18	20150	20167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111017033
530	NC_008268	GCT	2	6	20260	20265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
531	NC_008268	GCCG	2	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
532	NC_008268	CAA	2	6	20337	20342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017033
533	NC_008268	CGC	2	6	20357	20362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
534	NC_008268	ACCGGC	2	12	20386	20397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017033
535	NC_008268	CAC	2	6	20520	20525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008268	GCG	2	6	20590	20595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_008268	TGC	2	6	20606	20611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008268	CGAGC	2	10	20620	20629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
539	NC_008268	CGA	3	9	20697	20705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_008268	CTC	2	6	20710	20715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_008268	AC	3	6	20725	20730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_008268	CGCA	2	8	20749	20756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008268	GCC	2	6	20790	20795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_008268	CGA	2	6	20806	20811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008268	CGC	2	6	20927	20932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_008268	TGC	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008268	CCTA	2	8	21029	21036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_008268	AACC	2	8	21051	21058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008268	CCTCAC	2	12	21060	21071	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008268	GCC	2	6	21090	21095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_008268	CAA	2	6	21114	21119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008268	CGA	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008268	CAC	2	6	21139	21144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008268	ACC	2	6	21160	21165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_008268	CA	3	6	21182	21187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_008268	CTTC	2	8	21205	21212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_008268	GAG	3	9	21214	21222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008268	ACA	2	6	21256	21261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008268	GCG	2	6	21267	21272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008268	CCCA	2	8	21346	21353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
561	NC_008268	GCG	2	6	21389	21394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008268	CCT	2	6	21497	21502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_008268	ACA	2	6	21512	21517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008268	CGCC	2	8	21521	21528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
565	NC_008268	C	6	6	21527	21532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
566	NC_008268	ACA	2	6	21533	21538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008268	CG	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_008268	ACGACA	2	12	21557	21568	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008268	ACC	2	6	21574	21579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_008268	ACA	2	6	21587	21592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008268	CCGA	2	8	21594	21601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
572	NC_008268	CATC	2	8	21614	21621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008268	GTC	2	6	21740	21745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017034
574	NC_008268	CAC	2	6	21749	21754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017034
575	NC_008268	CGA	2	6	21823	21828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017034
576	NC_008268	CTCCG	2	10	21923	21932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
577	NC_008268	TG	3	6	21936	21941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008268	CGG	2	6	21943	21948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008268	CG	3	6	21982	21987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_008268	ACAT	2	8	22027	22034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_008268	CCT	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017035
582	NC_008268	TG	3	6	22050	22055	0 %	50 %	50 %	0 %	111017035
583	NC_008268	CCG	2	6	22074	22079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
584	NC_008268	ATC	2	6	22092	22097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017035
585	NC_008268	GTGA	2	8	22101	22108	25 %	25 %	50 %	0 %	111017035
586	NC_008268	ATG	2	6	22118	22123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017035
587	NC_008268	TGC	2	6	22202	22207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017035
588	NC_008268	GC	3	6	22238	22243	0 %	0 %	50 %	50 %	111017035
589	NC_008268	CTT	2	6	22279	22284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017035
590	NC_008268	CCG	2	6	22292	22297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
591	NC_008268	GCA	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017035
592	NC_008268	CGC	2	6	22511	22516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
593	NC_008268	AC	3	6	22525	22530	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
594	NC_008268	GCG	2	6	22608	22613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017035
595	NC_008268	ACC	2	6	22644	22649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017035
596	NC_008268	GAA	2	6	22685	22690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017035
597	NC_008268	TCGGCC	2	12	22706	22717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017035
598	NC_008268	GAC	2	6	22730	22735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017035
599	NC_008268	CGA	2	6	22756	22761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017035
600	NC_008268	TCG	2	6	22797	22802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017035
601	NC_008268	CCGC	2	8	22855	22862	0 %	0 %	25 %	75 %	111017035
602	NC_008268	ACCA	2	8	22935	22942	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
603	NC_008268	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
604	NC_008268	TCGGA	2	10	23039	23048	20 %	20 %	40 %	20 %	111017035
605	NC_008268	GGC	2	6	23068	23073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017035
606	NC_008268	GCG	2	6	23118	23123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017035
607	NC_008268	TGC	2	6	23156	23161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017035
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609	NC_008268	TCC	2	6	23273	23278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_008268	CAA	2	6	23368	23373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008268	ACCC	2	8	23378	23385	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
612	NC_008268	CAG	2	6	23390	23395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008268	CA	3	6	23406	23411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008268	CCGGC	2	10	23603	23612	0 %	0 %	40 %	60 %	111017036
615	NC_008268	GCC	2	6	23637	23642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017036
616	NC_008268	GGC	2	6	23651	23656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017036
617	NC_008268	TGT	2	6	23781	23786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017036
618	NC_008268	GA	3	6	23791	23796	50 %	0 %	50 %	0 %	111017036
619	NC_008268	GTGCG	2	10	23824	23833	0 %	20 %	60 %	20 %	111017036
620	NC_008268	GAC	2	6	23871	23876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017036
621	NC_008268	CGA	2	6	23907	23912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017036
622	NC_008268	TGCC	2	8	23930	23937	0 %	25 %	25 %	50 %	111017036
623	NC_008268	CCA	2	6	24073	24078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017036
624	NC_008268	CGG	2	6	24090	24095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017036
625	NC_008268	GCA	2	6	24171	24176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017036
626	NC_008268	CAC	2	6	24229	24234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017036
627	NC_008268	CGA	2	6	24255	24260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017036
628	NC_008268	GCG	2	6	24314	24319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017036
629	NC_008268	CCG	2	6	24329	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017036
630	NC_008268	ACG	2	6	24381	24386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017036
631	NC_008268	ACC	2	6	24395	24400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017036
632	NC_008268	GAG	3	9	24479	24487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008268	C	6	6	24515	24520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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637	NC_008268	CAG	2	6	24593	24598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_008268	CGC	2	6	24893	24898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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763	NC_008268	GCG	2	6	29803	29808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017045
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767	NC_008268	CGA	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017045
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769	NC_008268	CG	3	6	30283	30288	0 %	0 %	50 %	50 %	111017045
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774	NC_008268	CAGCG	2	10	30441	30450	20 %	0 %	40 %	40 %	111017045
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787	NC_008268	GTG	2	6	30837	30842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017046
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884	NC_008268	CGA	2	6	35226	35231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017050
885	NC_008268	TC	3	6	35232	35237	0 %	50 %	0 %	50 %	111017050
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887	NC_008268	GGGC	2	8	35306	35313	0 %	0 %	75 %	25 %	111017050
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1000	NC_008268	GTC	2	6	39946	39951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017055

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