MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008268	CGA	2	6	311540	311545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017260
8002	NC_008268	GCC	2	6	311634	311639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017260
8003	NC_008268	CGG	2	6	311655	311660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017260
8004	NC_008268	GCT	2	6	311698	311703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017261
8005	NC_008268	CGA	2	6	311704	311709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017261
8006	NC_008268	GGTC	2	8	311818	311825	0 %	25 %	50 %	25 %	111017261
8007	NC_008268	GC	3	6	311827	311832	0 %	0 %	50 %	50 %	111017261
8008	NC_008268	CCCTG	2	10	311885	311894	0 %	20 %	20 %	60 %	111017261
8009	NC_008268	CGTCG	2	10	311921	311930	0 %	20 %	40 %	40 %	111017261
8010	NC_008268	ATC	2	6	311945	311950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017261
8011	NC_008268	CCG	2	6	311952	311957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017261
8012	NC_008268	GCA	2	6	312042	312047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017261
8013	NC_008268	GAC	2	6	312065	312070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017261
8014	NC_008268	GGT	2	6	312082	312087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017261
8015	NC_008268	GCT	2	6	312111	312116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017262
8016	NC_008268	TCG	2	6	312161	312166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017262
8017	NC_008268	GAC	2	6	312256	312261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017262
8018	NC_008268	GCCAG	2	10	312282	312291	20 %	0 %	40 %	40 %	111017262
8019	NC_008268	GGT	2	6	312307	312312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017262
8020	NC_008268	GTC	2	6	312319	312324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017262
8021	NC_008268	GCG	4	12	312332	312343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017262
8022	NC_008268	TCGG	2	8	312365	312372	0 %	25 %	50 %	25 %	111017262
8023	NC_008268	CCG	2	6	312374	312379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017262
8024	NC_008268	TTC	2	6	312446	312451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017262
8025	NC_008268	GTT	2	6	312616	312621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017262
8026	NC_008268	GTC	2	6	312661	312666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017262
8027	NC_008268	GGC	2	6	312747	312752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017262
8028	NC_008268	GAT	2	6	312775	312780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017262
8029	NC_008268	CG	3	6	312784	312789	0 %	0 %	50 %	50 %	111017262
8030	NC_008268	CCG	3	9	312797	312805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017262
8031	NC_008268	GAA	2	6	312832	312837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017262
8032	NC_008268	CAC	2	6	312850	312855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017262
8033	NC_008268	GCG	2	6	312878	312883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017262
8034	NC_008268	TCT	2	6	312900	312905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017262
8035	NC_008268	GCC	2	6	312949	312954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017262
8036	NC_008268	AGGT	2	8	312962	312969	25 %	25 %	50 %	0 %	111017262
8037	NC_008268	TCT	2	6	312978	312983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017262
8038	NC_008268	CATC	2	8	313134	313141	25 %	25 %	0 %	50 %	111017262
8039	NC_008268	GATC	2	8	313169	313176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_008268	CCT	2	6	313273	313278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017263
8041	NC_008268	CCGG	2	8	313312	313319	0 %	0 %	50 %	50 %	111017263
8042	NC_008268	CGAT	2	8	313332	313339	25 %	25 %	25 %	25 %	111017263
8043	NC_008268	TGT	3	9	313344	313352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017263
8044	NC_008268	CGG	2	6	313371	313376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017263
8045	NC_008268	GCT	2	6	313402	313407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8046	NC_008268	GGC	2	6	313424	313429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017263
8047	NC_008268	CGAC	2	8	313447	313454	25 %	0 %	25 %	50 %	111017263
8048	NC_008268	CGGG	2	8	313466	313473	0 %	0 %	75 %	25 %	111017263
8049	NC_008268	TCG	2	6	313482	313487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8050	NC_008268	GC	3	6	313536	313541	0 %	0 %	50 %	50 %	111017263
8051	NC_008268	CGT	2	6	313542	313547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8052	NC_008268	CGGC	2	8	313568	313575	0 %	0 %	50 %	50 %	111017263
8053	NC_008268	CGC	2	6	313582	313587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017263
8054	NC_008268	TGC	2	6	313593	313598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8055	NC_008268	GGT	2	6	313614	313619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017263
8056	NC_008268	GCC	2	6	313628	313633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017263
8057	NC_008268	CGC	2	6	313681	313686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017263
8058	NC_008268	TGC	2	6	313695	313700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8059	NC_008268	GGC	2	6	313764	313769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017263
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8061	NC_008268	CGA	2	6	313888	313893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017263
8062	NC_008268	CCG	2	6	314092	314097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017263
8063	NC_008268	CCCTG	2	10	314169	314178	0 %	20 %	20 %	60 %	111017263
8064	NC_008268	CGA	2	6	314269	314274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_008268	AGA	2	6	314303	314308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_008268	GAA	2	6	314310	314315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_008268	CAG	2	6	314344	314349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017264
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8069	NC_008268	CGC	2	6	314485	314490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017264
8070	NC_008268	TCGC	2	8	314543	314550	0 %	25 %	25 %	50 %	111017264
8071	NC_008268	GAG	3	9	314584	314592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017264
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8080	NC_008268	CGA	2	6	314876	314881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017264
8081	NC_008268	TCG	2	6	314893	314898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017264
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8087	NC_008268	GAC	2	6	315091	315096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017264
8088	NC_008268	GCCG	2	8	315120	315127	0 %	0 %	50 %	50 %	111017264
8089	NC_008268	CGTA	2	8	315140	315147	25 %	25 %	25 %	25 %	111017264
8090	NC_008268	CGAA	2	8	315158	315165	50 %	0 %	25 %	25 %	111017264
8091	NC_008268	CGG	2	6	315201	315206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017264
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8096	NC_008268	CAG	2	6	315376	315381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017265
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8100	NC_008268	GTCGCG	2	12	315509	315520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017265
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8103	NC_008268	ACC	4	12	315662	315673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017265
8104	NC_008268	GC	3	6	315680	315685	0 %	0 %	50 %	50 %	111017265
8105	NC_008268	GCG	2	6	315820	315825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017265
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8110	NC_008268	CGATC	2	10	316077	316086	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8111	NC_008268	TGA	2	6	316095	316100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8121	NC_008268	CGA	2	6	316638	316643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017267
8122	NC_008268	CGA	2	6	316680	316685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017267
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8361	NC_008268	CA	3	6	326348	326353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8499	NC_008268	GTC	2	6	330957	330962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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