MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008268	GCG	2	6	233028	233033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017196
6002	NC_008268	ACATGC	2	12	233059	233070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111017196
6003	NC_008268	GCC	2	6	233130	233135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6004	NC_008268	CCG	2	6	233137	233142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6005	NC_008268	GCC	2	6	233201	233206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6006	NC_008268	CGC	3	9	233240	233248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6007	NC_008268	CGA	2	6	233312	233317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6008	NC_008268	AGA	2	6	233353	233358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017196
6009	NC_008268	CGC	2	6	233363	233368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6010	NC_008268	CGA	2	6	233369	233374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6011	NC_008268	CGCC	2	8	233432	233439	0 %	0 %	25 %	75 %	111017196
6012	NC_008268	CGA	2	6	233441	233446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6013	NC_008268	TCG	4	12	233467	233478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6014	NC_008268	GAC	2	6	233504	233509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6015	NC_008268	GCA	2	6	233519	233524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6016	NC_008268	TCGC	2	8	233532	233539	0 %	25 %	25 %	50 %	111017196
6017	NC_008268	TCG	2	6	233548	233553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6018	NC_008268	CGC	2	6	233636	233641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6019	NC_008268	GAA	2	6	233660	233665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017196
6020	NC_008268	CGT	2	6	233681	233686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6021	NC_008268	GTC	2	6	233687	233692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6022	NC_008268	GT	3	6	233704	233709	0 %	50 %	50 %	0 %	111017196
6023	NC_008268	GCC	2	6	233718	233723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6024	NC_008268	GAG	2	6	233745	233750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017196
6025	NC_008268	GCG	2	6	233758	233763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017196
6026	NC_008268	CGTG	2	8	233768	233775	0 %	25 %	50 %	25 %	111017196
6027	NC_008268	CCG	2	6	233791	233796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6028	NC_008268	CTGTCG	2	12	233850	233861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6029	NC_008268	GTG	2	6	233883	233888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017196
6030	NC_008268	GCGCA	2	10	233889	233898	20 %	0 %	40 %	40 %	111017196
6031	NC_008268	CGG	2	6	233902	233907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017196
6032	NC_008268	CGC	2	6	233972	233977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
6033	NC_008268	ATC	2	6	234024	234029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017196
6034	NC_008268	GC	3	6	234046	234051	0 %	0 %	50 %	50 %	111017196
6035	NC_008268	CTC	2	6	234128	234133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017196
6036	NC_008268	GAC	2	6	234137	234142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017196
6037	NC_008268	GAAC	2	8	234152	234159	50 %	0 %	25 %	25 %	111017196
6038	NC_008268	CGGAG	2	10	234220	234229	20 %	0 %	60 %	20 %	111017197
6039	NC_008268	GCG	2	6	234249	234254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017197
6040	NC_008268	ACC	2	6	234273	234278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017197
6041	NC_008268	GTA	2	6	234280	234285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017197
6042	NC_008268	GCG	2	6	234300	234305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017197
6043	NC_008268	ACG	2	6	234351	234356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017197
6044	NC_008268	CCGGA	2	10	234426	234435	20 %	0 %	40 %	40 %	111017197
6045	NC_008268	TGC	2	6	234441	234446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017197
6046	NC_008268	GTC	2	6	234549	234554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017197
6047	NC_008268	ACG	2	6	234565	234570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017197
6048	NC_008268	TCG	2	6	234597	234602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017197
6049	NC_008268	CGG	2	6	234628	234633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017197
6050	NC_008268	GCC	2	6	234683	234688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017197
6051	NC_008268	GAT	2	6	234689	234694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017197
6052	NC_008268	CGG	3	9	234769	234777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017197
6053	NC_008268	TCA	2	6	234793	234798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017197
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6055	NC_008268	CGGT	2	8	234856	234863	0 %	25 %	50 %	25 %	111017197
6056	NC_008268	CGGA	2	8	234891	234898	25 %	0 %	50 %	25 %	111017197
6057	NC_008268	CGA	2	6	234943	234948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017197
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6059	NC_008268	CGC	2	6	235018	235023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017197
6060	NC_008268	CGC	2	6	235100	235105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017197
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6063	NC_008268	GCA	2	6	235218	235223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017198
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6065	NC_008268	CGTG	2	8	235296	235303	0 %	25 %	50 %	25 %	111017198
6066	NC_008268	CG	3	6	235311	235316	0 %	0 %	50 %	50 %	111017198
6067	NC_008268	CGA	2	6	235368	235373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017198
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6085	NC_008268	GCG	2	6	235931	235936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017198
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6091	NC_008268	CCAC	2	8	236159	236166	25 %	0 %	0 %	75 %	111017199
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6111	NC_008268	GCCG	2	8	237132	237139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_008268	CGC	2	6	237162	237167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_008268	TGG	2	6	237243	237248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_008268	TGCA	2	8	237626	237633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_008268	CAC	2	6	237717	237722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_008268	CCG	2	6	237826	237831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_008268	ATC	2	6	237912	237917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_008268	ACG	2	6	237953	237958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_008268	CAC	2	6	237980	237985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_008268	ATG	2	6	238009	238014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_008268	GGC	2	6	238088	238093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_008268	CCG	2	6	238124	238129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_008268	TCA	2	6	238153	238158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_008268	CGG	2	6	238170	238175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_008268	TCT	2	6	238179	238184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_008268	TGCA	2	8	238455	238462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_008268	GAG	2	6	238482	238487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_008268	CCCGG	2	10	238494	238503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6133	NC_008268	ACG	2	6	238658	238663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017202
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6142	NC_008268	GGC	2	6	238836	238841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017202
6143	NC_008268	GTC	2	6	238858	238863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017202
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6152	NC_008268	ACC	2	6	239352	239357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6153	NC_008268	ACACCG	2	12	239363	239374	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6154	NC_008268	CGG	2	6	239408	239413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017203
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6163	NC_008268	CGAT	2	8	239918	239925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6164	NC_008268	CGA	2	6	239942	239947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_008268	CGTC	2	8	240125	240132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6167	NC_008268	CCG	2	6	240231	240236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017204
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6174	NC_008268	G	6	6	240564	240569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6175	NC_008268	CACCC	2	10	240595	240604	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6176	NC_008268	GATC	2	8	240612	240619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6228	NC_008268	GTC	2	6	242975	242980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017207
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6232	NC_008268	TGCG	2	8	243181	243188	0 %	25 %	50 %	25 %	111017207
6233	NC_008268	CGG	2	6	243196	243201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017207
6234	NC_008268	GC	3	6	243207	243212	0 %	0 %	50 %	50 %	111017207
6235	NC_008268	CGAG	2	8	243259	243266	25 %	0 %	50 %	25 %	111017207
6236	NC_008268	GCC	3	9	243282	243290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017207
6237	NC_008268	CGCTG	2	10	243355	243364	0 %	20 %	40 %	40 %	111017207
6238	NC_008268	GAG	2	6	243406	243411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_008268	GC	3	6	243415	243420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6240	NC_008268	CGA	2	6	243440	243445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6241	NC_008268	AGG	2	6	243530	243535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017208
6242	NC_008268	GAC	2	6	243546	243551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017208
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6244	NC_008268	TGC	2	6	243768	243773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017208
6245	NC_008268	GCCGA	2	10	243779	243788	20 %	0 %	40 %	40 %	111017208
6246	NC_008268	CTT	2	6	243789	243794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017208
6247	NC_008268	CGA	2	6	243818	243823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6248	NC_008268	TG	3	6	243835	243840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_008268	CTC	2	6	243889	243894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017209
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6269	NC_008268	CTCA	2	8	244811	244818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6285	NC_008268	CG	3	6	245492	245497	0 %	0 %	50 %	50 %	111017210
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6356	NC_008268	CGAT	2	8	248535	248542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6357	NC_008268	GCAC	2	8	248568	248575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6358	NC_008268	ACC	2	6	248592	248597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6359	NC_008268	CG	3	6	248668	248673	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
6360	NC_008268	GC	3	6	248677	248682	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
6361	NC_008268	CGC	2	6	248704	248709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017213
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6363	NC_008268	ACCGA	2	10	248763	248772	40 %	0 %	20 %	40 %	111017213
6364	NC_008268	CTC	2	6	248786	248791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017213
6365	NC_008268	GCAC	2	8	248794	248801	25 %	0 %	25 %	50 %	111017213
6366	NC_008268	GAT	2	6	248884	248889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017213
6367	NC_008268	AGC	2	6	248976	248981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6368	NC_008268	CGA	2	6	249004	249009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6369	NC_008268	GGGT	2	8	249025	249032	0 %	25 %	75 %	0 %	111017213
6370	NC_008268	GTG	2	6	249036	249041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017213
6371	NC_008268	CGG	2	6	249081	249086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6372	NC_008268	TGCCT	2	10	249089	249098	0 %	40 %	20 %	40 %	111017213
6373	NC_008268	GC	3	6	249110	249115	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
6374	NC_008268	CGG	2	6	249122	249127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6375	NC_008268	CGT	2	6	249129	249134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6376	NC_008268	CG	3	6	249148	249153	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
6377	NC_008268	GGC	2	6	249166	249171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6378	NC_008268	C	6	6	249178	249183	0 %	0 %	0 %	100 %	111017213
6379	NC_008268	CGT	2	6	249235	249240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6380	NC_008268	CGG	2	6	249246	249251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6381	NC_008268	CGA	2	6	249262	249267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6382	NC_008268	TCG	2	6	249270	249275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6383	NC_008268	CGGCC	2	10	249288	249297	0 %	0 %	40 %	60 %	111017213
6384	NC_008268	TGG	2	6	249306	249311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017213
6385	NC_008268	CTG	2	6	249404	249409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6386	NC_008268	GAG	2	6	249410	249415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017213
6387	NC_008268	GT	3	6	249524	249529	0 %	50 %	50 %	0 %	111017213
6388	NC_008268	GTG	2	6	249564	249569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017213
6389	NC_008268	TGC	2	6	249672	249677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
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6391	NC_008268	GCG	2	6	249730	249735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6392	NC_008268	CGA	3	9	249736	249744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017213
6393	NC_008268	ACG	2	6	249758	249763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017213
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6395	NC_008268	CGGAG	2	10	249844	249853	20 %	0 %	60 %	20 %	111017213
6396	NC_008268	CGC	2	6	249880	249885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017213
6397	NC_008268	CGG	2	6	249903	249908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
6398	NC_008268	CGA	2	6	250049	250054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_008268	GTC	2	6	250074	250079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_008268	CGA	2	6	250095	250100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6401	NC_008268	TGG	2	6	250101	250106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_008268	GAG	2	6	250124	250129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_008268	TGCC	2	8	250184	250191	0 %	25 %	25 %	50 %	111017214
6404	NC_008268	TCGC	2	8	250223	250230	0 %	25 %	25 %	50 %	111017214
6405	NC_008268	TCTCGC	2	12	250266	250277	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	111017214
6406	NC_008268	CGAGT	2	10	250297	250306	20 %	20 %	40 %	20 %	111017214
6407	NC_008268	CGG	2	6	250329	250334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017214
6408	NC_008268	GACG	2	8	250338	250345	25 %	0 %	50 %	25 %	111017214
6409	NC_008268	CCG	2	6	250350	250355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017214
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6414	NC_008268	CAG	2	6	250500	250505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6417	NC_008268	GAT	2	6	250744	250749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017215
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6421	NC_008268	TCG	2	6	250824	250829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
6422	NC_008268	CCA	2	6	250840	250845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017215
6423	NC_008268	TCG	2	6	250863	250868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
6424	NC_008268	CGT	2	6	250890	250895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
6425	NC_008268	CCGG	3	12	250897	250908	0 %	0 %	50 %	50 %	111017215
6426	NC_008268	TCG	2	6	250914	250919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
6427	NC_008268	TCG	2	6	250940	250945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
6428	NC_008268	TGC	2	6	250992	250997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017215
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6432	NC_008268	GGC	2	6	251127	251132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6433	NC_008268	GCG	2	6	251157	251162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6434	NC_008268	ACCTC	2	10	251221	251230	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6435	NC_008268	CGG	2	6	251231	251236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6436	NC_008268	GGT	2	6	251295	251300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017216
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6439	NC_008268	GCGCCG	2	12	251389	251400	0 %	0 %	50 %	50 %	111017216
6440	NC_008268	ATC	2	6	251407	251412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017216
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6452	NC_008268	GCT	2	6	251941	251946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017217
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6472	NC_008268	GAT	2	6	252838	252843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017218
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6474	NC_008268	TGCC	2	8	252995	253002	0 %	25 %	25 %	50 %	111017218
6475	NC_008268	CGA	2	6	253086	253091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017218
6476	NC_008268	CTG	2	6	253138	253143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6477	NC_008268	AAG	2	6	253144	253149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6478	NC_008268	CAT	2	6	253182	253187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6479	NC_008268	GCA	2	6	253201	253206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6480	NC_008268	CGA	2	6	253249	253254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6481	NC_008268	AGGTC	2	10	253339	253348	20 %	20 %	40 %	20 %	111017219
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6483	NC_008268	CGG	2	6	253435	253440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017219
6484	NC_008268	ACCG	2	8	253454	253461	25 %	0 %	25 %	50 %	111017219
6485	NC_008268	CGG	2	6	253550	253555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017219
6486	NC_008268	TCC	2	6	253572	253577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017219
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6489	NC_008268	CG	3	6	253653	253658	0 %	0 %	50 %	50 %	111017219
6490	NC_008268	TCG	2	6	253659	253664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017219
6491	NC_008268	TC	3	6	253666	253671	0 %	50 %	0 %	50 %	111017219
6492	NC_008268	CGG	2	6	253694	253699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017219
6493	NC_008268	CGA	2	6	253711	253716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017219
6494	NC_008268	CGTG	2	8	253718	253725	0 %	25 %	50 %	25 %	111017219
6495	NC_008268	GC	3	6	253735	253740	0 %	0 %	50 %	50 %	111017219
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