MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	TAG	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008209	GAA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008209	ATG	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008209	GACC	2	8	319	326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008209	ACG	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008209	CAC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008209	GAT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008209	ACA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008209	GCC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008209	CCG	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008209	GGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008209	CCAT	2	8	985	992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008209	GCA	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008209	CCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008209	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008209	CGC	2	6	1208	1213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008209	CCA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008209	AAAGAA	2	12	1280	1291	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008209	GTGACC	2	12	1293	1304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008209	TCA	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008209	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008209	CCAT	2	8	1467	1474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008209	TAT	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008209	T	6	6	1517	1522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008209	T	6	6	1539	1544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008209	T	8	8	1557	1564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008209	A	6	6	1642	1647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008209	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008209	CGG	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677422
30	NC_008209	GGCC	2	8	1872	1879	0 %	0 %	50 %	50 %	110677422
31	NC_008209	AAG	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677422
32	NC_008209	CGCA	2	8	1922	1929	25 %	0 %	25 %	50 %	110677422
33	NC_008209	CCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677422
34	NC_008209	CG	3	6	1984	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	110677422
35	NC_008209	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
36	NC_008209	AAC	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677422
37	NC_008209	CACGG	2	10	2077	2086	20 %	0 %	40 %	40 %	110677422
38	NC_008209	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
39	NC_008209	GAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677422
40	NC_008209	GAC	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
41	NC_008209	CAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677422
42	NC_008209	CTG	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
43	NC_008209	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
44	NC_008209	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
45	NC_008209	CCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
46	NC_008209	GACAAG	2	12	2836	2847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110677422
47	NC_008209	GA	3	6	2935	2940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008209	GCA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677423
49	NC_008209	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
50	NC_008209	CGC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
51	NC_008209	CCG	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
52	NC_008209	CG	3	6	3361	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	110677423
53	NC_008209	GTGC	2	8	3376	3383	0 %	25 %	50 %	25 %	110677423
54	NC_008209	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677423
55	NC_008209	TTCG	2	8	3452	3459	0 %	50 %	25 %	25 %	110677423
56	NC_008209	ATT	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677423
57	NC_008209	GCC	2	6	3482	3487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
58	NC_008209	GCC	2	6	3559	3564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
59	NC_008209	C	6	6	3563	3568	0 %	0 %	0 %	100 %	110677424
60	NC_008209	AAAGCC	2	12	3571	3582	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	110677424
61	NC_008209	CGC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
62	NC_008209	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
63	NC_008209	ATGA	2	8	3715	3722	50 %	25 %	25 %	0 %	110677424
64	NC_008209	CGG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
65	NC_008209	CGA	2	6	3804	3809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677424
66	NC_008209	GAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
67	NC_008209	GGGC	2	8	3987	3994	0 %	0 %	75 %	25 %	110677424
68	NC_008209	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
69	NC_008209	CA	3	6	4146	4151	50 %	0 %	0 %	50 %	110677424
70	NC_008209	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
71	NC_008209	CCG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
72	NC_008209	ATGG	2	8	4211	4218	25 %	25 %	50 %	0 %	110677424
73	NC_008209	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
74	NC_008209	GGTG	2	8	4311	4318	0 %	25 %	75 %	0 %	110677424
75	NC_008209	CTG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
76	NC_008209	GCG	2	6	4352	4357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
77	NC_008209	CGG	2	6	4380	4385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
78	NC_008209	CTGG	2	8	4449	4456	0 %	25 %	50 %	25 %	110677424
79	NC_008209	AAG	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
80	NC_008209	CATGC	2	10	4488	4497	20 %	20 %	20 %	40 %	110677424
81	NC_008209	CGA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
82	NC_008209	TTCC	2	8	4592	4599	0 %	50 %	0 %	50 %	110677425
83	NC_008209	AGC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
84	NC_008209	CGG	2	6	4685	4690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
85	NC_008209	GGTC	2	8	4699	4706	0 %	25 %	50 %	25 %	110677425
86	NC_008209	TCGATG	2	12	4720	4731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110677425
87	NC_008209	GGA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677425
88	NC_008209	CGCTGG	2	12	4902	4913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110677425
89	NC_008209	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677425
90	NC_008209	ACG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
91	NC_008209	T	6	6	5114	5119	0 %	100 %	0 %	0 %	110677425
92	NC_008209	GC	3	6	5168	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	110677425
93	NC_008209	CAG	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
94	NC_008209	GC	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	110677425
95	NC_008209	CGG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
96	NC_008209	GAC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
97	NC_008209	GCT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677425
98	NC_008209	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677425
99	NC_008209	CCGT	2	8	5516	5523	0 %	25 %	25 %	50 %	110677425
100	NC_008209	GAC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
101	NC_008209	CGCC	2	8	5643	5650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_008209	CG	3	6	5696	5701	0 %	0 %	50 %	50 %	110677426
103	NC_008209	G	6	6	5730	5735	0 %	0 %	100 %	0 %	110677426
104	NC_008209	CATG	2	8	5790	5797	25 %	25 %	25 %	25 %	110677426
105	NC_008209	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
106	NC_008209	ATT	2	6	5914	5919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677426
107	NC_008209	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677426
108	NC_008209	TTGC	2	8	6184	6191	0 %	50 %	25 %	25 %	110677426
109	NC_008209	TTC	2	6	6241	6246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677426
110	NC_008209	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
111	NC_008209	AC	3	6	6346	6351	50 %	0 %	0 %	50 %	110677427
112	NC_008209	A	7	7	6392	6398	100 %	0 %	0 %	0 %	110677427
113	NC_008209	A	6	6	6412	6417	100 %	0 %	0 %	0 %	110677427
114	NC_008209	CCA	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677427
115	NC_008209	GCCT	2	8	6491	6498	0 %	25 %	25 %	50 %	110677427
116	NC_008209	GC	3	6	6520	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	110677427
117	NC_008209	AAC	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677427
118	NC_008209	CCTGCT	2	12	6658	6669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	110677427
119	NC_008209	GCG	2	6	6718	6723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
120	NC_008209	GCG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
121	NC_008209	GT	3	6	6765	6770	0 %	50 %	50 %	0 %	110677427
122	NC_008209	GCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
123	NC_008209	GC	4	8	6801	6808	0 %	0 %	50 %	50 %	110677427
124	NC_008209	GTCC	2	8	6811	6818	0 %	25 %	25 %	50 %	110677427
125	NC_008209	CGG	2	6	6843	6848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
126	NC_008209	GCC	4	12	6917	6928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677427
127	NC_008209	GAT	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677427
128	NC_008209	C	6	6	7080	7085	0 %	0 %	0 %	100 %	110677427
129	NC_008209	GCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
130	NC_008209	CGA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677427
131	NC_008209	GGC	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
132	NC_008209	GGC	2	6	7297	7302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
133	NC_008209	GA	3	6	7449	7454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008209	GCA	2	6	7460	7465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008209	GCG	2	6	7547	7552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677428
136	NC_008209	ATG	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677428
137	NC_008209	C	7	7	7680	7686	0 %	0 %	0 %	100 %	110677428
138	NC_008209	GCTG	2	8	7789	7796	0 %	25 %	50 %	25 %	110677428
139	NC_008209	TGC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
140	NC_008209	ATC	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677428
141	NC_008209	CTG	2	6	7962	7967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
142	NC_008209	GC	3	6	8004	8009	0 %	0 %	50 %	50 %	110677428
143	NC_008209	CCGTGA	2	12	8022	8033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110677428
144	NC_008209	CG	3	6	8052	8057	0 %	0 %	50 %	50 %	110677428
145	NC_008209	GAC	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
146	NC_008209	GGC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
147	NC_008209	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
148	NC_008209	TCTT	2	8	8436	8443	0 %	75 %	0 %	25 %	110677429
149	NC_008209	CGC	2	6	8507	8512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
150	NC_008209	GC	5	10	8675	8684	0 %	0 %	50 %	50 %	110677429
151	NC_008209	TTCG	2	8	8732	8739	0 %	50 %	25 %	25 %	110677429
152	NC_008209	GGT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
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159	NC_008209	CGA	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
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164	NC_008209	CGG	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
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223	NC_008209	GC	3	6	12097	12102	0 %	0 %	50 %	50 %	110677431
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225	NC_008209	CAG	2	6	12151	12156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677431
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229	NC_008209	AAG	2	6	12337	12342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677431
230	NC_008209	GAT	2	6	12355	12360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677431
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237	NC_008209	A	6	6	12741	12746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_008209	AGT	2	6	12771	12776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
239	NC_008209	TG	3	6	12795	12800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
240	NC_008209	AAAT	2	8	12844	12851	75 %	25 %	0 %	0 %	110677432
241	NC_008209	CGA	2	6	12921	12926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677432
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253	NC_008209	GAA	2	6	13726	13731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677432
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255	NC_008209	TCC	2	6	13789	13794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677432
256	NC_008209	CAC	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_008209	CTG	2	6	13853	13858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008209	AAT	2	6	13948	13953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677433
259	NC_008209	GAC	2	6	13996	14001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677433
260	NC_008209	TCA	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677433
261	NC_008209	GTCCGG	2	12	14085	14096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110677433
262	NC_008209	CCG	2	6	14141	14146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677433
263	NC_008209	TGA	2	6	14160	14165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677433
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265	NC_008209	CAA	2	6	14214	14219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677433
266	NC_008209	CTG	2	6	14248	14253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677433
267	NC_008209	CGC	2	6	14320	14325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677433
268	NC_008209	CG	3	6	14329	14334	0 %	0 %	50 %	50 %	110677433
269	NC_008209	GAA	2	6	14371	14376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677433
270	NC_008209	CT	3	6	14392	14397	0 %	50 %	0 %	50 %	110677433
271	NC_008209	CG	3	6	14424	14429	0 %	0 %	50 %	50 %	110677433
272	NC_008209	CCG	2	6	14496	14501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677433
273	NC_008209	ATTC	2	8	14517	14524	25 %	50 %	0 %	25 %	110677433
274	NC_008209	CA	3	6	14562	14567	50 %	0 %	0 %	50 %	110677433
275	NC_008209	CGA	2	6	14574	14579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677433
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277	NC_008209	CA	3	6	14691	14696	50 %	0 %	0 %	50 %	110677433
278	NC_008209	CGT	2	6	14715	14720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677433
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282	NC_008209	CG	3	6	14820	14825	0 %	0 %	50 %	50 %	110677433
283	NC_008209	TTG	2	6	14920	14925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677434
284	NC_008209	CAA	2	6	14926	14931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677434
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286	NC_008209	TGC	2	6	15010	15015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677434
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288	NC_008209	TAT	2	6	15270	15275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677434
289	NC_008209	TGG	2	6	15278	15283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677434
290	NC_008209	GGC	2	6	15286	15291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
291	NC_008209	GGC	2	6	15293	15298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
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298	NC_008209	ACCT	2	8	15498	15505	25 %	25 %	0 %	50 %	110677434
299	NC_008209	CGG	2	6	15511	15516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
300	NC_008209	TCT	2	6	15520	15525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677434
301	NC_008209	CGG	4	12	15541	15552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
302	NC_008209	ACG	2	6	15558	15563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677434
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330	NC_008209	CACC	2	8	16916	16923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
331	NC_008209	GGTG	2	8	16951	16958	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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335	NC_008209	GC	3	6	17140	17145	0 %	0 %	50 %	50 %	110677435
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362	NC_008209	ATG	2	6	18358	18363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677436
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364	NC_008209	CAT	2	6	18426	18431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677436
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368	NC_008209	GAC	2	6	18646	18651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677436
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375	NC_008209	TCCA	2	8	19009	19016	25 %	25 %	0 %	50 %	110677436
376	NC_008209	CCCCG	2	10	19032	19041	0 %	0 %	20 %	80 %	110677436
377	NC_008209	CGG	2	6	19073	19078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677436
378	NC_008209	CAT	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677436
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380	NC_008209	CAG	2	6	19317	19322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677436
381	NC_008209	TCA	2	6	19357	19362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677436
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390	NC_008209	GCC	2	6	19789	19794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677436
391	NC_008209	CTC	2	6	19818	19823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677436
392	NC_008209	GC	3	6	19942	19947	0 %	0 %	50 %	50 %	110677436
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394	NC_008209	ACA	2	6	20014	20019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677436
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