MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008209	GAC	2	6	1224941	1224946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678588
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24004	NC_008209	ACG	2	6	1225106	1225111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678588
24005	NC_008209	CG	3	6	1225110	1225115	0 %	0 %	50 %	50 %	110678588
24006	NC_008209	GCACCG	2	12	1225167	1225178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110678588
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24011	NC_008209	TCA	2	6	1225347	1225352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678588
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24013	NC_008209	CGG	2	6	1225413	1225418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678588
24014	NC_008209	TGG	2	6	1225454	1225459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678588
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24016	NC_008209	TAT	2	6	1225526	1225531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110678589
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24025	NC_008209	CAT	2	6	1226024	1226029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678589
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24100	NC_008209	GCG	2	6	1229385	1229390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24101	NC_008209	GC	3	6	1229523	1229528	0 %	0 %	50 %	50 %	110678592
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24115	NC_008209	CGT	2	6	1230174	1230179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678592
24116	NC_008209	CCG	2	6	1230245	1230250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678592
24117	NC_008209	GCCG	2	8	1230278	1230285	0 %	0 %	50 %	50 %	110678592
24118	NC_008209	GCC	3	9	1230492	1230500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678592
24119	NC_008209	GGCTGA	2	12	1230512	1230523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110678592
24120	NC_008209	GCC	2	6	1230541	1230546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678592
24121	NC_008209	GCC	2	6	1230583	1230588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678592
24122	NC_008209	ATT	2	6	1230597	1230602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110678592
24123	NC_008209	CGG	2	6	1230687	1230692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678592
24124	NC_008209	GC	4	8	1230709	1230716	0 %	0 %	50 %	50 %	110678592
24125	NC_008209	GTG	2	6	1230727	1230732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678592
24126	NC_008209	CGT	2	6	1230899	1230904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678593
24127	NC_008209	AGA	2	6	1230974	1230979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110678593
24128	NC_008209	CTT	2	6	1230987	1230992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110678593
24129	NC_008209	TCG	2	6	1231063	1231068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678593
24130	NC_008209	CA	3	6	1231121	1231126	50 %	0 %	0 %	50 %	110678593
24131	NC_008209	GGTC	2	8	1231130	1231137	0 %	25 %	50 %	25 %	110678593
24132	NC_008209	TGT	2	6	1231221	1231226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110678593
24133	NC_008209	GAT	2	6	1231250	1231255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678593
24134	NC_008209	CG	4	8	1231316	1231323	0 %	0 %	50 %	50 %	110678593
24135	NC_008209	GC	3	6	1231353	1231358	0 %	0 %	50 %	50 %	110678593
24136	NC_008209	A	6	6	1231360	1231365	100 %	0 %	0 %	0 %	110678593
24137	NC_008209	ATT	2	6	1231383	1231388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110678593
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24139	NC_008209	GCG	2	6	1231556	1231561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678593
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24142	NC_008209	CAC	2	6	1231709	1231714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678594
24143	NC_008209	GTGA	2	8	1231736	1231743	25 %	25 %	50 %	0 %	110678594
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24145	NC_008209	CGCT	2	8	1231801	1231808	0 %	25 %	25 %	50 %	110678594
24146	NC_008209	GC	3	6	1231822	1231827	0 %	0 %	50 %	50 %	110678594
24147	NC_008209	TCA	2	6	1231829	1231834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678594
24148	NC_008209	GC	3	6	1231880	1231885	0 %	0 %	50 %	50 %	110678594
24149	NC_008209	CGGG	2	8	1231916	1231923	0 %	0 %	75 %	25 %	110678594
24150	NC_008209	GAT	2	6	1231926	1231931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678594
24151	NC_008209	AATGTG	2	12	1231935	1231946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678594
24152	NC_008209	CGC	2	6	1231971	1231976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678594
24153	NC_008209	GC	3	6	1231984	1231989	0 %	0 %	50 %	50 %	110678594
24154	NC_008209	GAC	2	6	1232058	1232063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678594
24155	NC_008209	ATC	2	6	1232112	1232117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678594
24156	NC_008209	GC	3	6	1232260	1232265	0 %	0 %	50 %	50 %	110678594
24157	NC_008209	GCAT	2	8	1232314	1232321	25 %	25 %	25 %	25 %	110678594
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24159	NC_008209	CGG	2	6	1232411	1232416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678594
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24162	NC_008209	CCG	2	6	1232608	1232613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24163	NC_008209	CTC	2	6	1232627	1232632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24164	NC_008209	TGA	2	6	1232638	1232643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24165	NC_008209	GCGG	2	8	1232651	1232658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24166	NC_008209	TGG	2	6	1232731	1232736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678595
24167	NC_008209	GAT	2	6	1232762	1232767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678595
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24170	NC_008209	GGC	2	6	1232832	1232837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678595
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24183	NC_008209	TGC	2	6	1233397	1233402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678595
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24202	NC_008209	TGGG	2	8	1234201	1234208	0 %	25 %	75 %	0 %	110678595
24203	NC_008209	CGG	2	6	1234220	1234225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678595
24204	NC_008209	CTG	2	6	1234303	1234308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678595
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24215	NC_008209	CG	3	6	1234874	1234879	0 %	0 %	50 %	50 %	110678596
24216	NC_008209	AGGG	2	8	1235052	1235059	25 %	0 %	75 %	0 %	110678596
24217	NC_008209	CAA	2	6	1235170	1235175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110678597
24218	NC_008209	GAT	2	6	1235197	1235202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678597
24219	NC_008209	ATG	2	6	1235211	1235216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678597
24220	NC_008209	CCCGC	2	10	1235222	1235231	0 %	0 %	20 %	80 %	110678597
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24222	NC_008209	C	6	6	1235259	1235264	0 %	0 %	0 %	100 %	110678598
24223	NC_008209	AAG	2	6	1235270	1235275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110678598
24224	NC_008209	ACC	2	6	1235287	1235292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678598
24225	NC_008209	GGT	2	6	1235339	1235344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678598
24226	NC_008209	CAT	2	6	1235367	1235372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678598
24227	NC_008209	GTC	2	6	1235418	1235423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678598
24228	NC_008209	CGG	2	6	1235480	1235485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678598
24229	NC_008209	ATG	2	6	1235549	1235554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678598
24230	NC_008209	GTG	2	6	1235604	1235609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678598
24231	NC_008209	GCC	2	6	1235632	1235637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678598
24232	NC_008209	CTG	2	6	1235659	1235664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678598
24233	NC_008209	GAC	2	6	1235668	1235673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678598
24234	NC_008209	CCA	2	6	1235708	1235713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678598
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24249	NC_008209	TGG	2	6	1236586	1236591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678599
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24259	NC_008209	GC	3	6	1237084	1237089	0 %	0 %	50 %	50 %	110678599
24260	NC_008209	CGA	2	6	1237106	1237111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678599
24261	NC_008209	CG	3	6	1237135	1237140	0 %	0 %	50 %	50 %	110678599
24262	NC_008209	GATT	2	8	1237141	1237148	25 %	50 %	25 %	0 %	110678599
24263	NC_008209	GC	3	6	1237181	1237186	0 %	0 %	50 %	50 %	110678599
24264	NC_008209	CCGC	2	8	1237223	1237230	0 %	0 %	25 %	75 %	110678599
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24294	NC_008209	GC	5	10	1238941	1238950	0 %	0 %	50 %	50 %	110678601
24295	NC_008209	CGGT	2	8	1239032	1239039	0 %	25 %	50 %	25 %	110678601
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24297	NC_008209	GTCGCC	2	12	1239139	1239150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	110678601
24298	NC_008209	GCGG	2	8	1239155	1239162	0 %	0 %	75 %	25 %	110678601
24299	NC_008209	CGC	2	6	1239189	1239194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678601
24300	NC_008209	GGCT	2	8	1239244	1239251	0 %	25 %	50 %	25 %	110678601
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24302	NC_008209	GC	3	6	1239320	1239325	0 %	0 %	50 %	50 %	110678601
24303	NC_008209	GGC	2	6	1239365	1239370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678601
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24305	NC_008209	CG	3	6	1239476	1239481	0 %	0 %	50 %	50 %	110678601
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24310	NC_008209	ATC	2	6	1239757	1239762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678601
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24312	NC_008209	CTGAT	2	10	1239797	1239806	20 %	40 %	20 %	20 %	110678601
24313	NC_008209	CGG	2	6	1239878	1239883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678601
24314	NC_008209	TGC	2	6	1239917	1239922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678601
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24318	NC_008209	TGC	2	6	1240082	1240087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678601
24319	NC_008209	ACA	2	6	1240181	1240186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110678601
24320	NC_008209	TCG	2	6	1240187	1240192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678601
24321	NC_008209	CGC	2	6	1240223	1240228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678601
24322	NC_008209	CGT	2	6	1240253	1240258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678601
24323	NC_008209	TA	3	6	1240369	1240374	50 %	50 %	0 %	0 %	110678602
24324	NC_008209	GCC	2	6	1240414	1240419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678602
24325	NC_008209	TGA	2	6	1240430	1240435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678602
24326	NC_008209	CGC	2	6	1240619	1240624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24327	NC_008209	GC	3	6	1240697	1240702	0 %	0 %	50 %	50 %	110678603
24328	NC_008209	CCG	2	6	1240775	1240780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
24329	NC_008209	GTC	2	6	1240830	1240835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678603
24330	NC_008209	AAC	2	6	1240836	1240841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110678603
24331	NC_008209	GCC	2	6	1240894	1240899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
24332	NC_008209	GAC	2	6	1240922	1240927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678603
24333	NC_008209	CCG	2	6	1241010	1241015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
24334	NC_008209	GTG	2	6	1241094	1241099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678603
24335	NC_008209	TGCT	2	8	1241107	1241114	0 %	50 %	25 %	25 %	110678603
24336	NC_008209	GCG	2	6	1241139	1241144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678603
24337	NC_008209	TCC	2	6	1241151	1241156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110678603
24338	NC_008209	TCG	2	6	1241224	1241229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678603
24339	NC_008209	TGTCG	2	10	1241247	1241256	0 %	40 %	40 %	20 %	110678603
24340	NC_008209	GC	3	6	1241302	1241307	0 %	0 %	50 %	50 %	110678603
24341	NC_008209	AGC	2	6	1241325	1241330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678603
24342	NC_008209	TTG	2	6	1241343	1241348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110678603
24343	NC_008209	GCC	2	6	1241366	1241371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
24344	NC_008209	AAT	2	6	1241384	1241389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110678603
24345	NC_008209	CGG	2	6	1241407	1241412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678603
24346	NC_008209	CGC	2	6	1241432	1241437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
24347	NC_008209	TCCGC	2	10	1241463	1241472	0 %	20 %	20 %	60 %	110678603
24348	NC_008209	GGC	2	6	1241488	1241493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678603
24349	NC_008209	CGAC	2	8	1241531	1241538	25 %	0 %	25 %	50 %	110678603
24350	NC_008209	CG	4	8	1241602	1241609	0 %	0 %	50 %	50 %	110678603
24351	NC_008209	CGGTT	2	10	1241683	1241692	0 %	40 %	40 %	20 %	110678603
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24353	NC_008209	CGC	2	6	1241747	1241752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678603
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24363	NC_008209	TA	3	6	1242465	1242470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24364	NC_008209	CAC	2	6	1242486	1242491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24376	NC_008209	TGC	2	6	1242907	1242912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678605
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24384	NC_008209	AAGA	2	8	1243101	1243108	75 %	0 %	25 %	0 %	110678605
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24473	NC_008209	CG	3	6	1247590	1247595	0 %	0 %	50 %	50 %	110678609
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