MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008209	GTC	2	6	512264	512269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677911
10002	NC_008209	TTC	2	6	512278	512283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677911
10003	NC_008209	GC	5	10	512308	512317	0 %	0 %	50 %	50 %	110677911
10004	NC_008209	CCTGC	2	10	512345	512354	0 %	20 %	20 %	60 %	110677911
10005	NC_008209	GCCA	2	8	512398	512405	25 %	0 %	25 %	50 %	110677911
10006	NC_008209	GGC	2	6	512445	512450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677911
10007	NC_008209	TGC	2	6	512459	512464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677911
10008	NC_008209	GCCT	2	8	512496	512503	0 %	25 %	25 %	50 %	110677911
10009	NC_008209	ACC	2	6	512608	512613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677911
10010	NC_008209	CCG	2	6	512617	512622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677911
10011	NC_008209	TGA	2	6	512675	512680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677911
10012	NC_008209	TGG	2	6	512705	512710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677911
10013	NC_008209	CAA	2	6	512824	512829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677912
10014	NC_008209	TCAG	2	8	512856	512863	25 %	25 %	25 %	25 %	110677912
10015	NC_008209	CCG	2	6	512896	512901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677912
10016	NC_008209	GGTC	2	8	512962	512969	0 %	25 %	50 %	25 %	110677912
10017	NC_008209	TCA	2	6	513030	513035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677912
10018	NC_008209	TGAT	2	8	513108	513115	25 %	50 %	25 %	0 %	110677912
10019	NC_008209	GCA	2	6	513148	513153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677912
10020	NC_008209	ATTG	2	8	513154	513161	25 %	50 %	25 %	0 %	110677912
10021	NC_008209	GC	3	6	513206	513211	0 %	0 %	50 %	50 %	110677912
10022	NC_008209	GC	3	6	513225	513230	0 %	0 %	50 %	50 %	110677912
10023	NC_008209	GTC	2	6	513233	513238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677912
10024	NC_008209	GGC	2	6	513287	513292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677912
10025	NC_008209	ACG	2	6	513369	513374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677912
10026	NC_008209	GC	3	6	513431	513436	0 %	0 %	50 %	50 %	110677912
10027	NC_008209	CCG	2	6	513469	513474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677912
10028	NC_008209	GGCCCC	2	12	513505	513516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677912
10029	NC_008209	TG	3	6	513527	513532	0 %	50 %	50 %	0 %	110677912
10030	NC_008209	CG	3	6	513585	513590	0 %	0 %	50 %	50 %	110677912
10031	NC_008209	CGA	2	6	513752	513757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677913
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10033	NC_008209	CCAGCG	2	12	513902	513913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110677913
10034	NC_008209	ATGG	2	8	514029	514036	25 %	25 %	50 %	0 %	110677913
10035	NC_008209	CGCGC	2	10	514046	514055	0 %	0 %	40 %	60 %	110677913
10036	NC_008209	GTC	2	6	514107	514112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677913
10037	NC_008209	GCC	3	9	514126	514134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677913
10038	NC_008209	GGGT	2	8	514300	514307	0 %	25 %	75 %	0 %	110677913
10039	NC_008209	TTC	2	6	514332	514337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677913
10040	NC_008209	GCC	2	6	514354	514359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677913
10041	NC_008209	GCA	2	6	514490	514495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677913
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10043	NC_008209	GAT	2	6	514653	514658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677913
10044	NC_008209	GC	4	8	514698	514705	0 %	0 %	50 %	50 %	110677913
10045	NC_008209	CGGTC	2	10	514761	514770	0 %	20 %	40 %	40 %	110677914
10046	NC_008209	GTG	2	6	514844	514849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677914
10047	NC_008209	CGCC	2	8	514876	514883	0 %	0 %	25 %	75 %	110677914
10048	NC_008209	GCC	2	6	514922	514927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677914
10049	NC_008209	GAT	2	6	514931	514936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677914
10050	NC_008209	TCA	2	6	515014	515019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677914
10051	NC_008209	CGGG	2	8	515068	515075	0 %	0 %	75 %	25 %	110677914
10052	NC_008209	CGC	2	6	515116	515121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677914
10053	NC_008209	CCAG	2	8	515239	515246	25 %	0 %	25 %	50 %	110677914
10054	NC_008209	CGAC	2	8	515272	515279	25 %	0 %	25 %	50 %	110677914
10055	NC_008209	CCGC	2	8	515325	515332	0 %	0 %	25 %	75 %	110677914
10056	NC_008209	GGCCTT	2	12	515405	515416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677914
10057	NC_008209	GTT	2	6	515455	515460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677914
10058	NC_008209	CGT	2	6	515476	515481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677914
10059	NC_008209	GAT	2	6	515558	515563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677914
10060	NC_008209	ATG	2	6	515590	515595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677914
10061	NC_008209	GTT	2	6	515676	515681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_008209	GAA	2	6	515696	515701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_008209	CGC	2	6	515808	515813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677915
10064	NC_008209	GCG	2	6	515822	515827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677915
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10068	NC_008209	TTC	2	6	516225	516230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677915
10069	NC_008209	CGG	2	6	516248	516253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677915
10070	NC_008209	ATG	2	6	516289	516294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677915
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10072	NC_008209	AAAG	2	8	516387	516394	75 %	0 %	25 %	0 %	110677915
10073	NC_008209	CGC	2	6	516402	516407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677915
10074	NC_008209	GTCG	2	8	516438	516445	0 %	25 %	50 %	25 %	110677915
10075	NC_008209	AAT	2	6	516446	516451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677915
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10083	NC_008209	GCG	3	9	516685	516693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677915
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10086	NC_008209	TGA	2	6	516773	516778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677915
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10091	NC_008209	TGGT	2	8	516910	516917	0 %	50 %	50 %	0 %	110677915
10092	NC_008209	TCG	2	6	516928	516933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677915
10093	NC_008209	TCT	2	6	517009	517014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677915
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10101	NC_008209	TGC	2	6	517455	517460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_008209	AATC	2	8	517502	517509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10103	NC_008209	CTT	2	6	517566	517571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677916
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10105	NC_008209	CAT	2	6	517634	517639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677916
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10107	NC_008209	CTT	2	6	517655	517660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677916
10108	NC_008209	AAATG	2	10	518016	518025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_008209	TTG	2	6	518060	518065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677917
10110	NC_008209	CG	3	6	518175	518180	0 %	0 %	50 %	50 %	110677917
10111	NC_008209	CG	3	6	518205	518210	0 %	0 %	50 %	50 %	110677917
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10113	NC_008209	CAT	2	6	518319	518324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677917
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10115	NC_008209	CCGC	2	8	518388	518395	0 %	0 %	25 %	75 %	110677917
10116	NC_008209	ACC	2	6	518401	518406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677917
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10118	NC_008209	ACCGAT	2	12	518632	518643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110677917
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10121	NC_008209	CGC	2	6	518746	518751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677917
10122	NC_008209	GAT	2	6	518752	518757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677917
10123	NC_008209	A	6	6	518884	518889	100 %	0 %	0 %	0 %	110677917
10124	NC_008209	GGCC	2	8	519016	519023	0 %	0 %	50 %	50 %	110677918
10125	NC_008209	GCG	2	6	519065	519070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677918
10126	NC_008209	CG	3	6	519210	519215	0 %	0 %	50 %	50 %	110677918
10127	NC_008209	CT	3	6	519250	519255	0 %	50 %	0 %	50 %	110677918
10128	NC_008209	CGA	2	6	519276	519281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677918
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10130	NC_008209	TCAGG	2	10	519312	519321	20 %	20 %	40 %	20 %	110677918
10131	NC_008209	CG	4	8	519341	519348	0 %	0 %	50 %	50 %	110677918
10132	NC_008209	GGC	2	6	519349	519354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677918
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10134	NC_008209	CATG	2	8	519416	519423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10135	NC_008209	GCA	2	6	519459	519464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677919
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10152	NC_008209	CGC	2	6	520034	520039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677919
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10176	NC_008209	AGG	2	6	521298	521303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10211	NC_008209	CGGT	2	8	522814	522821	0 %	25 %	50 %	25 %	110677923
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10230	NC_008209	GCT	2	6	523568	523573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677923
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10232	NC_008209	GCAAG	2	10	523670	523679	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10236	NC_008209	TGT	2	6	523819	523824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_008209	AAT	2	6	523850	523855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_008209	GATGC	2	10	523875	523884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10239	NC_008209	GAC	2	6	523889	523894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_008209	ACC	2	6	523900	523905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10241	NC_008209	TCTG	2	8	523949	523956	0 %	50 %	25 %	25 %	110677924
10242	NC_008209	GCT	2	6	523965	523970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677924
10243	NC_008209	GGC	2	6	523977	523982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677924
10244	NC_008209	G	6	6	524027	524032	0 %	0 %	100 %	0 %	110677924
10245	NC_008209	GAC	2	6	524097	524102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677924
10246	NC_008209	GAT	2	6	524165	524170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677924
10247	NC_008209	TGA	2	6	524191	524196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677924
10248	NC_008209	CGT	2	6	524228	524233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677924
10249	NC_008209	CCG	2	6	524422	524427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677924
10250	NC_008209	GGC	2	6	524463	524468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677924
10251	NC_008209	GTT	2	6	524483	524488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677924
10252	NC_008209	CG	3	6	524535	524540	0 %	0 %	50 %	50 %	110677924
10253	NC_008209	GGT	2	6	524630	524635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677924
10254	NC_008209	TGGTG	2	10	524693	524702	0 %	40 %	60 %	0 %	110677924
10255	NC_008209	GCC	2	6	524745	524750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677924
10256	NC_008209	CTG	2	6	524826	524831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677924
10257	NC_008209	TGCGGA	2	12	524858	524869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110677924
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10264	NC_008209	GGC	2	6	525185	525190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677925
10265	NC_008209	GCG	3	9	525267	525275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677925
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10267	NC_008209	GGCG	2	8	525341	525348	0 %	0 %	75 %	25 %	110677925
10268	NC_008209	CTGATC	2	12	525423	525434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110677925
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10272	NC_008209	GCG	2	6	525714	525719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677925
10273	NC_008209	GGCG	2	8	525731	525738	0 %	0 %	75 %	25 %	110677925
10274	NC_008209	TGG	2	6	525862	525867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677925
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10280	NC_008209	CG	4	8	526137	526144	0 %	0 %	50 %	50 %	110677926
10281	NC_008209	GGC	2	6	526159	526164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677926
10282	NC_008209	CTGGG	2	10	526184	526193	0 %	20 %	60 %	20 %	110677926
10283	NC_008209	TGGTC	2	10	526195	526204	0 %	40 %	40 %	20 %	110677926
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10294	NC_008209	CGA	2	6	526779	526784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677926
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10300	NC_008209	GCT	2	6	526936	526941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677926
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10316	NC_008209	ACGCG	2	10	527729	527738	20 %	0 %	40 %	40 %	110677927
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10324	NC_008209	TGA	2	6	528186	528191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677928
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10327	NC_008209	GCTG	2	8	528464	528471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10328	NC_008209	TCG	2	6	528493	528498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10329	NC_008209	GCG	2	6	528544	528549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677929
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10332	NC_008209	GGGT	2	8	528647	528654	0 %	25 %	75 %	0 %	110677929
10333	NC_008209	CCG	2	6	528678	528683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677929
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10343	NC_008209	GAA	2	6	529256	529261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677929
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10346	NC_008209	A	6	6	529374	529379	100 %	0 %	0 %	0 %	110677929
10347	NC_008209	G	6	6	529395	529400	0 %	0 %	100 %	0 %	110677929
10348	NC_008209	GTGAT	2	10	529413	529422	20 %	40 %	40 %	0 %	110677929
10349	NC_008209	GAG	2	6	529654	529659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10350	NC_008209	GCGT	2	8	529709	529716	0 %	25 %	50 %	25 %	110677930
10351	NC_008209	GCA	2	6	529902	529907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677930
10352	NC_008209	TCGCG	2	10	529914	529923	0 %	20 %	40 %	40 %	110677930
10353	NC_008209	ATC	2	6	530065	530070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677930
10354	NC_008209	CG	3	6	530105	530110	0 %	0 %	50 %	50 %	110677930
10355	NC_008209	ATC	2	6	530176	530181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677930
10356	NC_008209	GCCT	2	8	530240	530247	0 %	25 %	25 %	50 %	110677930
10357	NC_008209	GCG	2	6	530257	530262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677930
10358	NC_008209	TGA	2	6	530325	530330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677930
10359	NC_008209	GCCT	2	8	530335	530342	0 %	25 %	25 %	50 %	110677930
10360	NC_008209	CTGG	2	8	530526	530533	0 %	25 %	50 %	25 %	110677930
10361	NC_008209	GC	4	8	530534	530541	0 %	0 %	50 %	50 %	110677930
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10363	NC_008209	GCCC	2	8	530672	530679	0 %	0 %	25 %	75 %	110677930
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10483	NC_008209	CCG	2	6	536614	536619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677936
10484	NC_008209	CCTG	2	8	536656	536663	0 %	25 %	25 %	50 %	110677936
10485	NC_008209	GTT	2	6	536778	536783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_008209	GGAA	2	8	536887	536894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_008209	TGGA	2	8	536936	536943	25 %	25 %	50 %	0 %	110677937
10488	NC_008209	CATGC	2	10	536990	536999	20 %	20 %	20 %	40 %	110677937
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10490	NC_008209	GAT	2	6	537094	537099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677937
10491	NC_008209	GCC	2	6	537137	537142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677937
10492	NC_008209	GC	3	6	537187	537192	0 %	0 %	50 %	50 %	110677937
10493	NC_008209	GGCGC	2	10	537201	537210	0 %	0 %	60 %	40 %	110677937
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10496	NC_008209	AC	3	6	537517	537522	50 %	0 %	0 %	50 %	110677937
10497	NC_008209	CCCTGA	2	12	537523	537534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	110677937
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10500	NC_008209	GCTG	2	8	537648	537655	0 %	25 %	50 %	25 %	110677937

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