MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_008209	GATG	2	8	3244044	3244051	25 %	25 %	50 %	0 %	110680549
65003	NC_008209	TGT	2	6	3244089	3244094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110680549
65004	NC_008209	AC	3	6	3244107	3244112	50 %	0 %	0 %	50 %	110680549
65005	NC_008209	ATT	2	6	3244160	3244165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110680549
65006	NC_008209	CGC	2	6	3244188	3244193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680549
65007	NC_008209	CTC	2	6	3244218	3244223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110680549
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65009	NC_008209	GGC	2	6	3244278	3244283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680549
65010	NC_008209	TCC	2	6	3244375	3244380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110680549
65011	NC_008209	GGT	2	6	3244383	3244388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110680549
65012	NC_008209	TGA	2	6	3244403	3244408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680549
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65014	NC_008209	CGG	2	6	3244515	3244520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680549
65015	NC_008209	AAC	2	6	3244559	3244564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110680549
65016	NC_008209	C	6	6	3244594	3244599	0 %	0 %	0 %	100 %	110680549
65017	NC_008209	GC	3	6	3244617	3244622	0 %	0 %	50 %	50 %	110680549
65018	NC_008209	TGA	3	9	3244656	3244664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680549
65019	NC_008209	GCC	2	6	3244715	3244720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680549
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65030	NC_008209	TTG	2	6	3245263	3245268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65032	NC_008209	GATA	2	8	3245304	3245311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65033	NC_008209	GCT	2	6	3245315	3245320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65034	NC_008209	G	6	6	3245344	3245349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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65043	NC_008209	GATT	2	8	3246006	3246013	25 %	50 %	25 %	0 %	110680550
65044	NC_008209	TGCGG	2	10	3246016	3246025	0 %	20 %	60 %	20 %	110680550
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65046	NC_008209	A	7	7	3246216	3246222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65048	NC_008209	TCGCC	2	10	3246349	3246358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65049	NC_008209	GTT	2	6	3246385	3246390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65052	NC_008209	TGC	2	6	3246631	3246636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65053	NC_008209	C	6	6	3246652	3246657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65054	NC_008209	GAT	2	6	3246751	3246756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65055	NC_008209	CGG	2	6	3246783	3246788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65056	NC_008209	TCAG	2	8	3246810	3246817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65057	NC_008209	GGC	2	6	3246848	3246853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65058	NC_008209	TG	3	6	3246883	3246888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65059	NC_008209	CTT	2	6	3246954	3246959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65060	NC_008209	CAGAT	2	10	3246961	3246970	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65061	NC_008209	GTG	2	6	3246981	3246986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65064	NC_008209	CGC	2	6	3247036	3247041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65094	NC_008209	GCA	2	6	3248799	3248804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680553
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65121	NC_008209	GCC	2	6	3249642	3249647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680553
65122	NC_008209	CGC	2	6	3249650	3249655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680553
65123	NC_008209	CTG	2	6	3249674	3249679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680553
65124	NC_008209	GCA	2	6	3249744	3249749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680553
65125	NC_008209	TC	3	6	3249757	3249762	0 %	50 %	0 %	50 %	110680553
65126	NC_008209	GCC	2	6	3249849	3249854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680553
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65134	NC_008209	CGCGC	2	10	3250117	3250126	0 %	0 %	40 %	60 %	110680553
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65136	NC_008209	GCG	2	6	3250386	3250391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680553
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65140	NC_008209	CGC	2	6	3250665	3250670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680553
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65143	NC_008209	GC	3	6	3250760	3250765	0 %	0 %	50 %	50 %	110680554
65144	NC_008209	CGG	2	6	3250791	3250796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680554
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65155	NC_008209	GGGC	2	8	3251382	3251389	0 %	0 %	75 %	25 %	110680554
65156	NC_008209	AGCC	2	8	3251398	3251405	25 %	0 %	25 %	50 %	110680554
65157	NC_008209	GAC	2	6	3251513	3251518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680554
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65159	NC_008209	GCG	2	6	3251568	3251573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680554
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65162	NC_008209	TCTGC	2	10	3251892	3251901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65163	NC_008209	GCTG	2	8	3251964	3251971	0 %	25 %	50 %	25 %	110680555
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65168	NC_008209	GC	3	6	3252376	3252381	0 %	0 %	50 %	50 %	110680555
65169	NC_008209	CAG	2	6	3252436	3252441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680555
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65178	NC_008209	GTT	2	6	3252818	3252823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110680556
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65183	NC_008209	CG	3	6	3253093	3253098	0 %	0 %	50 %	50 %	110680556
65184	NC_008209	GCA	2	6	3253186	3253191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680556
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65188	NC_008209	CG	4	8	3253427	3253434	0 %	0 %	50 %	50 %	110680556
65189	NC_008209	ACGGT	2	10	3253480	3253489	20 %	20 %	40 %	20 %	110680556
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65191	NC_008209	AAAGTG	2	12	3253577	3253588	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	110680557
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65199	NC_008209	GC	3	6	3254080	3254085	0 %	0 %	50 %	50 %	110680557
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65205	NC_008209	GAT	2	6	3254418	3254423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680558
65206	NC_008209	CG	3	6	3254443	3254448	0 %	0 %	50 %	50 %	110680558
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65210	NC_008209	CACC	2	8	3254631	3254638	25 %	0 %	0 %	75 %	110680558
65211	NC_008209	TGC	2	6	3254721	3254726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680558
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65217	NC_008209	CGT	2	6	3255092	3255097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680558
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65220	NC_008209	CAA	2	6	3255512	3255517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110680559
65221	NC_008209	TCA	2	6	3255677	3255682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110680559
65222	NC_008209	CAT	2	6	3255719	3255724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110680559
65223	NC_008209	GGC	2	6	3255775	3255780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680559
65224	NC_008209	GAT	2	6	3255885	3255890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680559
65225	NC_008209	TCA	2	6	3256000	3256005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110680559
65226	NC_008209	ATG	2	6	3256066	3256071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680559
65227	NC_008209	TGAGC	2	10	3256212	3256221	20 %	20 %	40 %	20 %	110680559
65228	NC_008209	CTGC	2	8	3256232	3256239	0 %	25 %	25 %	50 %	110680559
65229	NC_008209	ATA	2	6	3256282	3256287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110680559
65230	NC_008209	GC	3	6	3256346	3256351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65231	NC_008209	GAT	2	6	3256450	3256455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110680560
65232	NC_008209	GCT	2	6	3256498	3256503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680560
65233	NC_008209	T	6	6	3256510	3256515	0 %	100 %	0 %	0 %	110680560
65234	NC_008209	CGG	2	6	3256537	3256542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680560
65235	NC_008209	CG	3	6	3256543	3256548	0 %	0 %	50 %	50 %	110680560
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65387	NC_008209	CGC	2	6	3264627	3264632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65471	NC_008209	CGT	2	6	3268376	3268381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680574
65472	NC_008209	GCA	2	6	3268504	3268509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680574
65473	NC_008209	GTCG	2	8	3268617	3268624	0 %	25 %	50 %	25 %	110680574
65474	NC_008209	GCCATG	2	12	3268786	3268797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110680574
65475	NC_008209	GTC	2	6	3268941	3268946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110680574
65476	NC_008209	CAT	2	6	3268964	3268969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110680574
65477	NC_008209	GC	3	6	3269032	3269037	0 %	0 %	50 %	50 %	110680574
65478	NC_008209	GC	3	6	3269099	3269104	0 %	0 %	50 %	50 %	110680574
65479	NC_008209	CG	3	6	3269132	3269137	0 %	0 %	50 %	50 %	110680574
65480	NC_008209	GC	3	6	3269143	3269148	0 %	0 %	50 %	50 %	110680574
65481	NC_008209	CGC	2	6	3269187	3269192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680574
65482	NC_008209	CGC	2	6	3269199	3269204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680574
65483	NC_008209	CGG	2	6	3269267	3269272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680574
65484	NC_008209	AAT	2	6	3269284	3269289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110680574
65485	NC_008209	GC	3	6	3269367	3269372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65486	NC_008209	GCG	2	6	3269478	3269483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680575
65487	NC_008209	TCC	2	6	3269582	3269587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110680575
65488	NC_008209	CGCC	2	8	3269601	3269608	0 %	0 %	25 %	75 %	110680575
65489	NC_008209	GC	3	6	3269617	3269622	0 %	0 %	50 %	50 %	110680575
65490	NC_008209	GGCT	2	8	3269693	3269700	0 %	25 %	50 %	25 %	110680575
65491	NC_008209	GGC	2	6	3269794	3269799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110680575
65492	NC_008209	CTT	3	9	3269982	3269990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110680575
65493	NC_008209	TCA	2	6	3270005	3270010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110680575
65494	NC_008209	GCA	2	6	3270041	3270046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680575
65495	NC_008209	CCG	3	9	3270048	3270056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680575
65496	NC_008209	CAG	2	6	3270127	3270132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110680575
65497	NC_008209	CCA	2	6	3270147	3270152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110680575
65498	NC_008209	C	6	6	3270173	3270178	0 %	0 %	0 %	100 %	110680575
65499	NC_008209	GC	4	8	3270188	3270195	0 %	0 %	50 %	50 %	110680575
65500	NC_008209	GCC	2	6	3270214	3270219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110680575

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