MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008148	G	6	6	98260	98265	0 %	0 %	100 %	0 %	108802948
3002	NC_008148	G	6	6	98308	98313	0 %	0 %	100 %	0 %	108802948
3003	NC_008148	C	6	6	98367	98372	0 %	0 %	0 %	100 %	108802948
3004	NC_008148	CGCC	2	8	98391	98398	0 %	0 %	25 %	75 %	108802948
3005	NC_008148	CGC	2	6	98405	98410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802948
3006	NC_008148	CCTCCC	2	12	98427	98438	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3007	NC_008148	TATT	2	8	98451	98458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008148	TTC	2	6	98500	98505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802949
3009	NC_008148	CTTC	2	8	98521	98528	0 %	50 %	0 %	50 %	108802949
3010	NC_008148	AGG	2	6	98599	98604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802949
3011	NC_008148	GGGA	2	8	98622	98629	25 %	0 %	75 %	0 %	108802949
3012	NC_008148	CAT	2	6	98648	98653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802949
3013	NC_008148	GGACGG	2	12	98669	98680	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108802949
3014	NC_008148	CGC	2	6	98723	98728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802949
3015	NC_008148	GGC	2	6	98786	98791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802949
3016	NC_008148	TGC	2	6	98797	98802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802949
3017	NC_008148	CGC	2	6	98834	98839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802949
3018	NC_008148	CCG	2	6	98840	98845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802949
3019	NC_008148	CGGC	2	8	98851	98858	0 %	0 %	50 %	50 %	108802949
3020	NC_008148	AGG	2	6	98878	98883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802949
3021	NC_008148	GAT	2	6	98891	98896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802949
3022	NC_008148	GAG	3	9	98919	98927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802949
3023	NC_008148	CGC	2	6	98945	98950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802949
3024	NC_008148	C	6	6	98959	98964	0 %	0 %	0 %	100 %	108802949
3025	NC_008148	CGC	2	6	99116	99121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802949
3026	NC_008148	CCGGG	2	10	99122	99131	0 %	0 %	60 %	40 %	108802949
3027	NC_008148	GTG	2	6	99132	99137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802949
3028	NC_008148	G	8	8	99143	99150	0 %	0 %	100 %	0 %	108802949
3029	NC_008148	AGC	3	9	99159	99167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802950
3030	NC_008148	CCG	2	6	99187	99192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802950
3031	NC_008148	CTCCAC	2	12	99233	99244	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108802950
3032	NC_008148	CCG	2	6	99249	99254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802950
3033	NC_008148	GGC	2	6	99299	99304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802950
3034	NC_008148	CGC	2	6	99305	99310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802950
3035	NC_008148	GGC	2	6	99311	99316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802950
3036	NC_008148	CCGGAG	2	12	99324	99335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802950
3037	NC_008148	CGCC	2	8	99346	99353	0 %	0 %	25 %	75 %	108802950
3038	NC_008148	C	6	6	99352	99357	0 %	0 %	0 %	100 %	108802950
3039	NC_008148	CCT	2	6	99487	99492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802950
3040	NC_008148	AGC	2	6	99555	99560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802950
3041	NC_008148	GC	3	6	99568	99573	0 %	0 %	50 %	50 %	108802950
3042	NC_008148	CG	3	6	99605	99610	0 %	0 %	50 %	50 %	108802950
3043	NC_008148	C	7	7	99611	99617	0 %	0 %	0 %	100 %	108802950
3044	NC_008148	CGCC	2	8	99640	99647	0 %	0 %	25 %	75 %	108802950
3045	NC_008148	CCCCGA	2	12	99817	99828	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108802950
3046	NC_008148	CCT	2	6	99880	99885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802950
3047	NC_008148	AGG	2	6	99897	99902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802950
3048	NC_008148	GAT	2	6	99963	99968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008148	TCT	2	6	99997	100002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008148	AAGG	2	8	100007	100014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008148	GAG	2	6	100159	100164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008148	TGG	2	6	100169	100174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008148	AGG	2	6	100194	100199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008148	GAG	2	6	100227	100232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008148	GCG	2	6	100247	100252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_008148	GGA	2	6	100268	100273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008148	GTGG	2	8	100304	100311	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008148	GCT	2	6	100316	100321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_008148	G	6	6	100330	100335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008148	GAG	3	9	100341	100349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008148	GAA	2	6	100370	100375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802951
3062	NC_008148	CGG	2	6	100416	100421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802951
3063	NC_008148	CGC	2	6	100429	100434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
3064	NC_008148	CCG	2	6	100459	100464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
3065	NC_008148	ACC	2	6	100481	100486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802951
3066	NC_008148	CCT	2	6	100491	100496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802951
3067	NC_008148	AGA	2	6	100509	100514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802951
3068	NC_008148	ACC	2	6	100532	100537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802951
3069	NC_008148	CGC	2	6	100542	100547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
3070	NC_008148	CG	3	6	100578	100583	0 %	0 %	50 %	50 %	108802951
3071	NC_008148	CCT	2	6	100614	100619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802951
3072	NC_008148	CGGCCG	2	12	100628	100639	0 %	0 %	50 %	50 %	108802951
3073	NC_008148	AGC	2	6	100661	100666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802951
3074	NC_008148	GGT	2	6	100698	100703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802951
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3076	NC_008148	AGC	2	6	100769	100774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802951
3077	NC_008148	CGC	2	6	100818	100823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
3078	NC_008148	GCC	2	6	100826	100831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
3079	NC_008148	GCT	2	6	100848	100853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802951
3080	NC_008148	GGT	2	6	100867	100872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802951
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3082	NC_008148	CCA	2	6	100935	100940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802951
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3085	NC_008148	CGC	2	6	101049	101054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802951
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3089	NC_008148	CGGC	2	8	101111	101118	0 %	0 %	50 %	50 %	108802951
3090	NC_008148	TCC	2	6	101179	101184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3091	NC_008148	CCT	2	6	101189	101194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3092	NC_008148	CAG	2	6	101262	101267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802952
3093	NC_008148	GCC	2	6	101272	101277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802952
3094	NC_008148	CAG	2	6	101373	101378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802952
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3096	NC_008148	C	7	7	101442	101448	0 %	0 %	0 %	100 %	108802952
3097	NC_008148	ATG	2	6	101455	101460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802952
3098	NC_008148	CTC	2	6	101499	101504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3099	NC_008148	GTGG	2	8	101544	101551	0 %	25 %	75 %	0 %	108802952
3100	NC_008148	CCT	2	6	101552	101557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3101	NC_008148	GC	3	6	101589	101594	0 %	0 %	50 %	50 %	108802952
3102	NC_008148	GGT	2	6	101595	101600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802952
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3104	NC_008148	TGT	2	6	101636	101641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802952
3105	NC_008148	TGG	2	6	101675	101680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802952
3106	NC_008148	CCT	2	6	101699	101704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3107	NC_008148	TTG	2	6	101713	101718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802952
3108	NC_008148	TAG	2	6	101719	101724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802952
3109	NC_008148	CCT	2	6	101756	101761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3110	NC_008148	GCC	2	6	101832	101837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802952
3111	NC_008148	ACC	2	6	101848	101853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802952
3112	NC_008148	CCA	3	9	101858	101866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802952
3113	NC_008148	TCC	3	9	101872	101880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802952
3114	NC_008148	GGT	2	6	101904	101909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802952
3115	NC_008148	CTG	2	6	101937	101942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802952
3116	NC_008148	CT	4	8	102037	102044	0 %	50 %	0 %	50 %	108802953
3117	NC_008148	CCT	2	6	102081	102086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802953
3118	NC_008148	CCG	2	6	102096	102101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802953
3119	NC_008148	GCG	2	6	102185	102190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802953
3120	NC_008148	GCCGG	2	10	102193	102202	0 %	0 %	60 %	40 %	108802953
3121	NC_008148	CAC	2	6	102220	102225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802953
3122	NC_008148	CTC	2	6	102244	102249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802953
3123	NC_008148	CCG	2	6	102263	102268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802953
3124	NC_008148	CGG	3	9	102288	102296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802953
3125	NC_008148	CG	3	6	102316	102321	0 %	0 %	50 %	50 %	108802953
3126	NC_008148	CCT	2	6	102351	102356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802953
3127	NC_008148	GCG	2	6	102405	102410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802953
3128	NC_008148	TGA	2	6	102540	102545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802953
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3133	NC_008148	GCGCC	2	10	102691	102700	0 %	0 %	40 %	60 %	108802953
3134	NC_008148	CGG	2	6	102720	102725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802953
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3161	NC_008148	CTCGC	2	10	103548	103557	0 %	20 %	20 %	60 %	108802954
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3227	NC_008148	TGCCG	2	10	105920	105929	0 %	20 %	40 %	40 %	108802956
3228	NC_008148	GCAG	2	8	105953	105960	25 %	0 %	50 %	25 %	108802956
3229	NC_008148	AGC	2	6	105985	105990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
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3231	NC_008148	AGGA	2	8	106051	106058	50 %	0 %	50 %	0 %	108802956
3232	NC_008148	GAA	2	6	106110	106115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802956
3233	NC_008148	GGCC	2	8	106187	106194	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
3234	NC_008148	GCA	2	6	106244	106249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3235	NC_008148	GAG	2	6	106264	106269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802956
3236	NC_008148	GGC	2	6	106278	106283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802956
3237	NC_008148	ACG	2	6	106285	106290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3238	NC_008148	GGT	2	6	106313	106318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802956
3239	NC_008148	CCT	2	6	106364	106369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802956
3240	NC_008148	ACGC	2	8	106381	106388	25 %	0 %	25 %	50 %	108802956
3241	NC_008148	GCA	2	6	106403	106408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3242	NC_008148	CCAC	2	8	106466	106473	25 %	0 %	0 %	75 %	108802956
3243	NC_008148	TCA	2	6	106505	106510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802956
3244	NC_008148	AGC	2	6	106522	106527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802956
3245	NC_008148	CCA	2	6	106548	106553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802956
3246	NC_008148	CCGG	2	8	106605	106612	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
3247	NC_008148	GAG	2	6	106678	106683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802956
3248	NC_008148	GCCG	2	8	106688	106695	0 %	0 %	50 %	50 %	108802956
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3373	NC_008148	CCT	2	6	110670	110675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802959
3374	NC_008148	GAA	2	6	110827	110832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802959
3375	NC_008148	GAG	2	6	110891	110896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802959
3376	NC_008148	CCT	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802959
3377	NC_008148	GCT	2	6	110938	110943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802959
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3379	NC_008148	AG	3	6	110956	110961	50 %	0 %	50 %	0 %	108802959
3380	NC_008148	CG	3	6	110965	110970	0 %	0 %	50 %	50 %	108802959
3381	NC_008148	CAT	2	6	110998	111003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802959
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3385	NC_008148	CGGGG	2	10	111051	111060	0 %	0 %	80 %	20 %	108802959
3386	NC_008148	GCG	2	6	111084	111089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802959
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3389	NC_008148	GCT	2	6	111267	111272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802960
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3392	NC_008148	CGCC	2	8	111372	111379	0 %	0 %	25 %	75 %	108802960
3393	NC_008148	CGG	2	6	111413	111418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802960
3394	NC_008148	TCT	2	6	111419	111424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802960
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3402	NC_008148	ACC	2	6	111710	111715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802960
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3404	NC_008148	ACC	2	6	111752	111757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802960
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3417	NC_008148	CGG	2	6	112067	112072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802960
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3445	NC_008148	CGT	2	6	112640	112645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802961
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3452	NC_008148	GC	3	6	112738	112743	0 %	0 %	50 %	50 %	108802961
3453	NC_008148	GGGAG	2	10	112796	112805	20 %	0 %	80 %	0 %	108802961
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3455	NC_008148	GGGC	2	8	112834	112841	0 %	0 %	75 %	25 %	108802961
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3463	NC_008148	CCCGTC	2	12	113064	113075	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	108802961
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3487	NC_008148	CGC	2	6	113698	113703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802962
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3491	NC_008148	AG	3	6	113784	113789	50 %	0 %	50 %	0 %	108802962
3492	NC_008148	CCA	2	6	113825	113830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802963
3493	NC_008148	CGA	2	6	113838	113843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802963
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3496	NC_008148	GAG	2	6	113953	113958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802963
3497	NC_008148	GAG	2	6	113986	113991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802963
3498	NC_008148	ACC	2	6	114059	114064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802963
3499	NC_008148	CCG	2	6	114071	114076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802963
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